la banque de données swiss-prot...

Encyclopédie informatisée des protéines

http://www.uniprot.org

La banque de donnLa banque de donnéées es SwissSwiss--ProtProthttp://[email protected]

1986-2009

Encyclopédie informatisée des protéines

http://www.uniprot.org


Qui sQui s’’en occupe ?en occupe ?

…pour entraîner des programmes informatiques capables de reconnaître des régions biologiquement importantes dans des séquences de protéines non caractérisées

(utiliser ce qui est connu pour orienter la recherche sur des protéines inconnues)

…pour identifier des protéinesdans des échantillons biologiques

(chercher des marqueurs de maladies, « drug design », etc…)

CC’’est quoi ?est quoi ?Swiss-Prot est une banque de connaissances sur les protprotééinesines créée en 1986.

Elle compte actuellement plus de 500’000 fiches (1 fiche par protéine) et est disponible sur internet.

Les protéines connues actuellement sont composées de 2 à 34’350 acides aminés.

Les chercheurs en laboratoire (académique et industriel)

…pour trouver des ressemblances entre les séquences de protéines

(étudier l’évolution des espèces, etc…)

Les bioinformaciens qui créent des programmes de visualisation, d’analyse et comparaison de

séquences, de prédiction, etc…

Une équipe de près de 200 biologistes et informaticiens au service de la communauté scientifique…Pour nous contacter: sp_com@isbPour nous contacter: [email protected]

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQK

RGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

L’insuline humaine…

Modélisation de la structure tridimensionnelle

Collaboration UniProtSuisse Grande-Bretagne USA

ÇÇa sert a sert àà quoi ?quoi ?

…à aider le chercheur en laboratoire ou le bioinformaticien en mettant à leur disposition une encyclopencyclopéédie informatisdie informatisééee de ce qui est connu sur les protéines

Qui peut lQui peut l’’utiliser ?utiliser ?

Tous ceux qui ont accès à internet (accès libre) http://www.uniprot.org

Le contenu de chaque fiche est la synthèse des informations extraites de la littérature scientifique et de l’utilisation d’outils bioinformatiques. Le tout est validé et régulièrement réactualisé par des biologistes.

Liste de publications scientifiques

Nom de la protéine

Informations taxonomiques

Liens vers des banques de données spécialisées

Mots-clés

Séquence en acides aminés

Informations biologiques

Une protéine peut avoir plusieurs noms… et parfois des noms rigolos: Zinedine, Pokemon, Cornichon, Tectonic, Prospero, Superman, KryptoniteCopine, Ken and Barbie, Cleopatra, Churchill…

Swiss-Prot contient des protéines provenant

de environ 11’000 espèces, de l’homme à la bactérie en

passant par le mammouth et les plantes.

Swiss-Prot possède des liens vers plus de 100

banques de données spécialisées. Plaque tournantePlaque tournante

de l’information biologique


http://www.expasy.org/

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Nous sommes à votre service

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Pour consulter Swiss-Prot:

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Nom de la protéine: Neuropeptide Neuropeptide GWaGWa

Informations taxonomiquesCommon cuttlefish (Seiche)

Séquence

Informations biologiquesRégule les contractions de l’oviducte.

Il s’agit de la plus petite protéine connue

Fiche no P83570

GW


Neuropeptide Neuropeptide GWaGWa


Nom de la protéine: OcytocineOcytocine

Informations taxonomiquesLapin

…existe aussi dans d’autres espèces

Séquence

Informations biologiquesFavorise les contractions de l’utérus,stimule l’expulsion du lait pendant la tétée,impliquée dans la régulation des rapports sociaux

Stimule les contractions de l’utérus au moment de l’accouchement

Fiche no P69043

CYIQNCPLG


OcytocineOcytocine


Nom de la protéine: InsulineInsuline

Informations taxonomiquesHomo sapiens (homme)

…existe aussi dans d’autres espèces…

Séquence

Informations biologiquesRégule le taux sanguin de sucre, en permetantl’entrée et le stockage du glucose (sucre) dans les cellules

Fiche no P01308

L’insuline est la première protéine à avoir été entièrement séquencée

(Frederick Sanger en 1955, prix Nobel en 1958)

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN


InsulineInsuline


Nom de la protéine: ErythropoiErythropoiéétinetine (EPO)(EPO)



Séquence

Informations biologiquesHormone impliquée dans la régulation de la synthèse des globules rouges…

…certains l’utilisent pour se doper

Fiche no P01588

MGVHECPAWLWLLLSLLSLP LGLPVLGAPPRLICDSRVLE RYLLEAKEAENITTGCAEHC SLNENITVPDTKVNFYAWKR MEVGQQAVEVWQGLALLSEA VLRGQALLVNSSQPWEPLQL HVDKAVSGLRSLTTLLRALG AQKEAISPPDAASAAPLRTI TADTFRKLFRVYSNFLRGKL KLYTGEACRTGDR


EPOEPO


Nom de la protéine: SexSex--determining region Y protein (SRY)determining region Y protein (SRY)



Séquence

Informations biologiquesResponsable de l’initiation de la différenciation sexuelle ‘mâle’:

…sans elle, il n’y aurait que des femmes….

Fiche no Q05066

MQSYASAMLSVFNSDDYSPAVQENIPALRRSSSFLCTESCNSKYQCETGENSKGNVQDRVKRPMNAFIVWSRDQRRKMALENPRMRNSEISKQLGYQWKMLTEAEKWPFFQEAQKLQAMHREKYPNYKYRPRRKAKMLPKNCSLLPADPASVLCSEVQLDNRLYRDDCTKATHSRMEHQLGHLPPINAASSPQQRD

RYSHWTKL


SRYSRY


Nom de la protéine: CytochromeCytochrome

Informations taxonomiquesMammouth

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la production d’énergie

Fiche no P92658

MTHIRKSHPLLKILNKSFIDLPTPSNISTWWNFGSLLGACLITQILTGLFLAMHYTPDTMTAFSSMSHICRDVNYGWIIRQLHSNGASIFFLCLYTHIGRNIYYGSYLYSETWNTGIMLLLITMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPYIGTDLVEWIWGGFSVDKATLNRFFALHFILPFTMIALAGVHLTFLHETGSNNPLGLTSDSDKIPFHPYYTIKDFLGLLILILFLLLLALLSPDMLGDPDNYMPADPLNTPLHIKPEWYFLFAYAILRSVPNKLGGVLALLLSILILGIMPLLHTSKHRSMMLRPLSQVLFWTLATDLLMLTWIGSQPVEYPYIIIGQMASILYFSIILAFLPIAGMIENYLIK

…la séquence de cette protéine est connue dans beaucoup d’espèces (~1250). Elle est souvent utilisée pour construire des arbres phylogénétiques (étude de l’évolution des espèces)


CytochromeCytochrome


Nom de la protéine: RubisCORubisCO

Informations taxonomiquesEpinard

…existe aussi dans d’autres espèces de plantes…

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la fabrication de

l’oxygène à partir de la lumière (photosynthèse).

…C’est la protéine la plus abondante sur notre planète . C’est aussi l’une des enzymes les plus paresseuses. Alors que la plupart des enzymes transforment 1000 molécules par seconde, Rubisco n’en modifie que 3 par seconde !

Fiche no P00875

MSPQTETKAS VEFKAGVKDY KLTYYTPEYE TLDTDILAAF RVSPQPGVPP EEAGAAVAAE SSTGTWTTVW TDGLTNLDRY KGRCYHIEPV AGEENQYICY VAYPLDLFEE GSVTNMFTSI VGNVFGFKAL RALRLEDLRI PVAYVKTFQG PPHGIQVERD KLNKYGRPLL GCTIKPKLGL SAKNYGRAVY ECLRGGLDFT KDDENVNSQP FMRWRDRFLF CAEALYKAQA ETGEIKGHYL NATAGTCEDM MKRAVFAREL GVPIVMHDYL TGGFTANTTL SHYCRDNGLL LHIHRAMHAV IDRQKNHGMH FRVLAKALRL SGGDHIHSGT VVGKLEGERD ITLGFVDLLR DDYTEKDRSR GIYFTQSWVS TPGVLPVASG GIHVWHMPAL TEIFGDDSVL QFGGGTLGHP WGNAPGAVAN RVALEACVQA RNEGRDLARE GNTIIREATK WSPELAAACE VWKEIKFEFP AMDTV


RubisCORubisCO


Nom de la protéine: ToxineToxine botuliniquebotulinique (BOTOX)(BOTOX)

Informations taxonomiquesClostridium botulinum (Bactérie)

Séquence

Informations biologiquesInhibiteur de la libération d’un neurotransmetteur (acétylcholine).

Utilisée en cosmétique pour paralyser les muscles de l’expression (lifting).

Fiche no P10845

PFVNKQFNYK DPVNGVDIAY IKIPNVGQMQ PVKAFKIHNK IWVIPERDTF TNPEEGDLNPPPEAKQVPVS YYDSTYLSTD NEKDNYLKGV TKLFERIYST DLGRMLLTSI VRGIPFWGGSTIDTELKVID TNCINVIQPD GSYRSEELNL VIIGPSADII QFECKSFGHE VLNLTRNGYGSTQYIRFSPD FTFGFEESLE VDTNPLLGAG KFATDPAVTL AHELIHAGHR LYGIAINPNRVFKVNTNAYY EMSGLEVSFE ELRTFGGHDA KFIDSLQENE FRLYYYNKFK DIASTLNKAKSIVGTTASLQ YMKNVFKEKY LLSEDTSGKF SVDKLKFDKL YKMLTEIYTE DNFVKFFKVLNRKTYLNFDK AVFKINIVPK VNYTIYDGFN LRNTNLAANF NGQNTEINNM NFTKLKNFTGLFEFYKLLCV RGIITSKTKS LDKGYNKALN DLCIKVNNWD LFFSPSEDNF TNDLNKGEEITSDTNIEAAE ENISLDLIQQ YYLTFNFDNE PENISIENLS SDIIGQLELM PNIERFPNGKKYELDKYTMF HYLRAQEFEH GKSRIALTNS VNEALLNPSR VYTFFSSDYV KKVNKATEAAMFLGWVEQLV YDFTDETSEV STTDKIADIT IIIPYIGPAL NIGNMLYKDD FVGALIFSGAVILLEFIPEI AIPVLGTFAL VSYIANKVLT VQTIDNALSK RNEKWDEVYK YIVTNWLAKVNTQIDLIRKK MKEALENQAE ATKAIINYQY NQYTEEEKNN INFNIDDLSS KLNESINKAMININKFLNQC SVSYLMNSMI PYGVKRLEDF DASLKDALLK YIYDNRGTLI GQVDRLKDKVNNTLSTDIPF QLSKYVDNQR LLSTFTEYIK NIINTSILNL RYESNHLIDL SRYASKINIGSKVNFDPIDK NQIQLFNLES SKIEVILKNA IVYNSMYENF STSFWIRIPK YFNSISLNNEYTIINCMENN SGWKVSLNYG EIIWTLQDTQ EIKQRVVFKY SQMINISDYI NRWIFVTITNNRLNNSKIYI NGRLIDQKPI SNLGNIHASN NIMFKLDGCR DTHRYIWIKY FNLFDKELNEKEIKDLYDNQ SNSGILKDFW GDYLQYDKPY YMLNLYDPNK YVDVNNVGIR GYMYLKGPRGSVMTTNIYLN SSLYRGTKFI IKKYASGNKD NIVRNNDRVY INVVVKNKEY RLATNASQAGVEKILSALEI PDVGNLSQVV VMKSKNDQGI TNKCKMNLQD NNGNDIGFIG FHQFNNIAKLVASNWYNRQI ERSSRTLGCS WEFIPVDDGW GERPL


BOTOXBOTOX


Nom de la protéine: VitellogVitellogééninenine

Informations taxonomiquesPoulet

…existe aussi dans d’autres espèces d’oiseaux…

Séquence

Informations biologiquesPrincipal constituant du jaune d’oeuf

Fiche no P87498

MRGLISALVL TLVGSQHLNY QPDFGENKVY TYNYESILFS GIPEKGLART GIRIRSEVEISGIGPKLCLI RIHSIEAAEY NGIWPTSSFS RSLKLTQALT GQLSIPIKFE YSNGHVGNLMAPDSVSDDGL NIYRGILNIL ELSLKKMQHS YSIQEAGIGG ICNTTYAIQE NKKANLVDVTKSKDLNSCEE KVQVVTGSAY TQPCQTCQQR NKNSRATATY NYKIKYTHNE AVITQAEVEEVHQFTPFHEI TGGNAIVEAR QKLALIEVQK QVAEVPPKEF QKRGSLQYQF GSELLQLPVHLFKIKDVERQ IEERLQDLVE TTYEQLPSDA PAKALKLMHL LRAANEENYE SVWKQFSSRPAYRRYLLDLL PAAASHRSLR FLRHKMERQE LTNWEIAQTV LVALHSSSPT QEVMEEATLIVKKHCPRSSS VLRKVCLLSY ASLCHKRCSS PYSCSECLQV FHVFAGEALG KSNIEEVLLALKALGNVGHP ASIKHIKKFL PGYAAGASEL PLKVHETAVM ALKSIGMRDP QMVQAITLEIFLNHKIHPRI RMLAAVVLLE TKPGLPILMI LVDAVLKEPS MQVASFIYSH LRALGRSTAPDLQMMASACR MAVRALSPKF DRSGYQFSKV FRFSMFKEFL MSGLAAKYFV LNNAGSLIPTMAVSQLRTHF LGRVADPIEV GIAAEGLQEM FVRGYSPDKD WETNYDFREI LKKLSDWKALPRDKPFASGY LKMFGQELLF GRLDKDTLQN VLQVWYGPDE KIPSIRRLIS SLQTGIGRQWTKALLLSEIR CIVPTCVGFP METSFYYSSV TKVAGNVQAQ ITPSPRSDFR LTELLNSNVRLRSKMSLSMA KHMTFVIGIN TNMIQAGLEA HTKVNAHVPV NVVATIQMKE KSIKAEIPPCKEETNLIIVS SKTFAVTRNI EDLAASKMTP VLLPEAVPDI MKMSFDSDSA SGETDNIRDRQSVEDVSSGN SFSFGHPSSG KEPFIQSMCS NASTFGVQVC IEKKSVHAAF IRNVPLYNAIGEHALRMSFK PVYSDVPIEK IQVTIQAGDQ APTKMVRLVT FEDPERQESS RKEVMKRVKKILDDTDNQAT RNSRSSSSSA SSISESSEST TSTPSSSDSD NRASQGDPQI NLKSRQSKANEKKFYPFGDS SSSGSSSSSS SSSSSSSDSS SSSRSSSSSD SSSSSSSSSS SSSSKSKSSSRSSKSNRSSS SSNSKDSSSS SSKSNSKGSS SSSSKASGTR QKAKKQSKTT SFPHASAAEGERSVHEQKQE TQSSSSSSSR ASSNSRSTSS STSSSSESSG VSHRQWKQDR EAETKRVKSQFNSHSSYDIP NEWETYLPKV YRLRFRSAHT HWHSGHRTSS SSSSSSSESG SSHSNSSSSDSSSRRSHMSD SSSSSSSHRH GEKAAHSSRR SPTSRAASAH HRPGSSLTRE RNFLGDVIPPGITIVAQAVR SDNRNQGYQA TAYVRSDAAK VDVQLVVVQL AETNWKACAD AVILPLKAQARMRWGKECRD YRIAALATTG QMARKLAVQL KVQWGIIPSW IKKTSTALMR YVPGVALVLGFSEAHQRNPS RELIVRAVAT SPRSIDTVIK VPGVTLYYQG LRVPFTLALG ASSSSYETRDITAWNFLPEI ASQIAQEDQS TCEVSKGDFK TFDRMSFTCS FNKSCNVVVA QDCTEHPKFIITTRKVDHQS LSREVHINTS SANITICPAA DSSLLVTCNK ESVLSDSGVS EYEKDNIKIYKNGKTVIVEA PIHGLKNVNF DGEILKVTVA SWMRGKTCGV CGNNDREKHN ELLMPNHKLAHSCSAFVHSW VLLEETCSGG CKLQRRYVKL NRNPTIDGEE STCYSVDPVL KCMKDCTPIEKTSVKVGFHC FPKATAVSLL EWQRSSDKKS ASEDVVESVD ADIDCTCTGD CS


VitellogVitellogééninenine


Nom de la protéine: CollagCollagèènene

Informations taxonomiquesHomo sapiens (homme et …femme)


Séquence

Informations biologiquesProtéine de soutien de la peau, de l’os, du cartilage…

Perd de son élasticité avec l’âge…C’est la protéine la plus abondante des vertébrés…

Fiche no P02458

MIRLGAPQSL VLLTLLVAAV LRCQGQDVRQ PGPKGQKGEP GDIKDIVGPK GPPGPQGPAGEQGPRGDRGD KGEKGAPGPR GRDGEPGTLG NPGPPGPPGP PGPPGLGGNF AAQMAGGFDEKAGGAQLGVM QGPMGPMGPR GPPGPAGAPG PQGFQGNPGE PGEPGVSGPM GPRGPPGPPGKPGDDGEAGK PGKAGERGPP GPQGARGFPG TPGLPGVKGH RGYPGLDGAK GEAGAPGVKGESGSPGENGS PGPMGPRGLP GERGRTGPAG AAGARGNDGQ PGPAGPPGPV GPAGGPGFPGAPGAKGEAGP TGARGPEGAQ GPRGEPGTPG SPGPAGASGN PGTDGIPGAK GSAGAPGIAGAPGFPGPRGP PDPQGATGPL GPKGQTGKPG IAGFKGEQGP KGEPGPAGPQ GAPGPAGEEGKRGARGEPGG VGPIGPPGER GAPGNRGFPG QDGLAGPKGA PGERGPSGLA GPKGANGDPGRPGEPGLPGA RGLTGRPGDA GPQGKVGPSG APGEDGRPGP PGPQGARGQP GVMGFPGPKGANGEPGKAGE KGLPGAPGLR GLPGKDGETG AEGPPGPAGP AGERGEQGAP GPSGFQGLPGPPGPPGEGGK PGDQGVPGEA GAPGLVGPRG ERGFPGERGS PGAQGLQGPR GLPGTPGTDGPKGASGPAGP PGAQGPPGLQ GMPGERGAAG IAGPKGDRGD VGEKGPEGAP GKDGGRGLTGPIGPPGPAGA NGEKGEVGPP GPAGSAGARG APGERGETGP PGTSGIAGPP GADGQPGAKGEQGEAGQKGD AGAPGPQGPS GAPGPQGPTG VTGPKGARGA QGPPGATGFP GAAGRVGPPGSNGNPGPPGP PGPSGKDGPK GARGDSGPPG RAGEPGLQGP AGPPGEKGEP GDDGPSGAEGPPGPQGLAGQ RGIVGLPGQR GERGFPGLPG PSGEPGQQGA PGASGDRGPP GPVGPPGLTGPAGEPGREGS PGADGPPGRD GAAGVKGDRG ETGAVGAPGA PGPPGSPGPA GPTGKQGDRGEAGAQGPMGP SGPAGARGIQ GPQGPRGDKG EAGEPGERGL KGHRGFTGLQ GLPGPPGPSGDQGASGPAGP SGPRGPPGPV GPSGKDGANG IPGPIGPPGP RGRSGETGPA GPPGNPGPPGPPGPPGPGID MSAFAGLGPR EKGPDPLQYM RADQAAGGLR QHDAEVDATL KSLNNQIESIRSPEGSRKNP ARTCRDLKLC HPEWKSGDYW IDPNQGCTLD AMKVFCNMET GETCVYPNPANVPKKNWWSS KSKEKKHIWF GETINGGFHF SYGDDNLAPN TANVQMTFLR LLSTEGSQNITYHCKNSIAY LDEAAGNLKK ALLIQGSNDV EIRAEGNSRF TYTALKDGCT KHTGKWGKTVIEYRSQKTSR LPIIDIAPMD IGGPEQEFGV DIGPVCFL


CollagCollagèènene


Nom de la protéine: TitineTitine

Informations taxonomiquesHomo sapiens (homme et …femme)

Séquence

Informations biologiquesProtéine responsable de l’élasticité

des muscles…C’est la plus grande protéine connue

Fiche no Q8WZ42

MTTQAPTFTQ PLQSVVVLEG STATFEAHIS GFPVPEVSWF RDGQVISTST LPGVQISFSDGRAKLTIPAV TKANSGRYSL KATNGSGQAT STAELLVKAE TAPPNFVQRL QSMTVRQGSQVRLQVRVTGI PTPVVKFYRD GAEIQSSLDF QISQEGDLYS LLIAEAYPED SGTYSVNATNSVGRATSTAE LLVQGEEEVP AKKTKTIVST AQISESRQTR IEKKIEAHFD ARSIATVEMVIDGAAGQQLP HKTPHRIPPK PKSRSPTPPS IAAKAQLARQ QSPSPIRHSP SPVRHVRAPTPSPVRSVSPA ARISTSPIRS VRSPLLMRKT QASTVATGPE VPPPWKQEGY VASSSEAEMRETTLTTSTQI RTEERWEGRY GVQEQVTISG AAGAAASVSA SASYAAEAVA TGAKEVKQDADKSAAVATVV AAVDMARVRE PVISAVEQTA QRTTTTAVHI QPAQEQVRKE AEKTAVTKVVVAADKAKEQE LKSRTKEVIT TKQEQMHVTH EQIRKETEKT FVPKVVISAA KAKEQETRISEEITKKQKQV TQEAIRQETE ITAASMVVVA TAKSTKLETV PGAQEETTTQ QDQMHLSYEKIMKETRKTVV PKVIVATPKV KEQDLVSRGR EGITTKREQV QITQEKMRKE AEKTALSTIAVATAKAKEQE TILRTRETMA TRQEQIQVTH GKVDVGKKAE AVATVVAAVD QARVREPREPGHLEESYAQQ TTLEYGYKER ISAAKVAEPP QRPASEPHVV PKAVKPRVIQ APSETHIKTTDQKGMHISSQ IKKTTDLTTE RLVHVDKRPR TASPHFTVSK ISVPKTEHGY EASIAGSAIATLQKELSATS SAQKITKSVK APTVKPSETR VRAEPTPLPQ FPFADTPDTY KSEAGVEVKKEVGVSITGTT VREERFEVLH GREAKVTETA RVPAPVEIPV TPPTLVSGLK NVTVIEGESVTLECHISGYP SPTVTWYRED YQIESSIDFQ ITFQSGIARL MIREAFAEDS GRFTCSAVNEAGTVSTSCYL AVQVSEEFEK ETTAVTEKFT TEEKRFVESR DVVMTDTSLT EEQAGPGEPAAPYFITKPVV QKLVEGGSVV FGCQVGGNPK PHVYWKKSGV PLTTGYRYKV SYNKQTGECKLVISMTFADD AGEYTIVVRN KHGETSASAS LLEEADYELL MKSQQEMLYQ TQVTAFVQEPKVGETAPGFV YSEYEKEYEK EQALIRKKMA KDTVVVRTYV EDQEFHISSF EERLIKEIEYRIIKTTLEEL LEEDGEEKMA VDISESEAVE SGFDLRIKNY RILEGMGVTF HCKMSGYPLPKIAWYKDGKR IKHGERYQMD FLQDGRASLR IPVVLPEDEG IYTAFASNIK GNAICSGKLYVEPAAPLGAP TYIPTLEPVS RIRSLSPRSV SRSPIRMSPA RMSPARMSPA RMSPARMSPGRRLEETDESQ LERLYKPVFV LKPVSFKCLE GQTARFDLKV VGRPMPETFW FHDGQQIVNDYTHKVVIKED GTQSLIIVPA TPSDSGEWTV VAQNRAGRSS ISVILTVEAV EHQVKPMFVE



TitineTitine


Nom de la protéine: TPIS (TPIS (TriosephosphateTriosephosphate isomisomééraserase))

Informations taxonomiquesMaïs

Séquence

Informations biologiquesProtéine impliquée dans le métabolisme du sucre

…C’est une protéine essentielle à tous les organismes vivants

Fiche no P12863

MAPSRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIA VAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEF VDIINAKQ



TPISTPIS


Nom de la protéine: Hormone de Hormone de croissancecroissance

Informations taxonomiquesHomo sapiens

Séquence

Informations biologiques…fait grandir les enfants…

…les 7 nains de Blanche-Neige n’en ont certainement pas eu assez….

Fiche no P01241

MATGSRTSLL LAFGLLCLPW LQEGSAFPTI PLSRLFDNAM LRAHRLHQLA FDTYQEFEEAYIPKEQKYSF LQNPQTSLCF SESIPTPSNR EETQQKSNLE LLRISLLLIQ SWLEPVQFLRSVFANSLVYG ASDSNVYDLL KDLEEGIQTL MGRLEDGSPR TGQIFKQTYS KFDTNSHNDDALLKNYGLLY CFRKDMDKVE TFLRIVQCRS VEGSCGF



Hormone de Hormone de croissance croissance (Somatotropine)(Somatotropine)


Nom de la protéine: MetRSMetRS

((MethionylMethionyl--tRNAtRNA synthetasesynthetase))

Informations taxonomiquesGrenouille

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la biosynthèse des autres protéines.

…indispensable à la Vie, présente chez tous les organismes vivants….

Fiche no Q6PF21

MKLFVGEGNP QGVKVLAAAA LWAQHVQIDR LQQEEKIVPF MSQPRLPVLD LENGNYLFLS NAICRYFYLS SGHDMCDLSN QWLEWEAAEL QPALSAALYA HVVQGKKKED VMATISASLKHLDQSLAGKS SPYLIKDALT VVDIVVWGSI YPLIVDASNL PEEMASLKRW FQNVSQLEQC QKAASSLLKD KGSSVFKPFL QKQPAPITPP GKSVCKEQEG EDMPSLSEED IQAAAEAWAK

EPWKCIKGNQ QEQKRAGTVT GVAVNMAALL SIMLHPYMPT ISSVIQEQLL MPQESKVLTT DFCCCLQSGH QIGNVSPLFQ KLENDQIESL RKRFGGGQVK TESKVSPSQE APEQQAPKASGPERVKELMQ ELEKQGNHVR ELKGKKAEKS VIDPEVQKLL ALKKELALAE GKSPDPPTQK GKKKK



MetRSMetRS


Nom de la protéine: HistoneHistone H4H4

Informations taxonomiquesBoeuf

Séquence

Informations biologiques…importante pour la structure des chromosomes…

Fiche no P62803

MSGRGKGGKGL GKGGAKRHRK VLRDNIQGIT KPAIRRLARR GGVKRISGLI YEETRGVLKVFLENVIRDAV TYTEHAKRKT VTAMDVVYAL KRQGRTLYGF GG



Histone H4Histone H4


Nom de la protéine: ATPA (ATP ATPA (ATP synthasesynthase alpha chain)alpha chain)

Informations taxonomiquesVer

(petit ver composé d’environ 1000 cellules)

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la production d’énergie dans les mitochondries…

Fiche no Q9XXK1

MLSKRIVTAL NTAVKVQNAG IATTARGMAG ASGSEVSKIL EERILGTETG INLEETGKVLSIGDGIARVY GLKNIQAEEM VEFDSGIKGM AMNLDVDNVG VVVFGNDKVI REGDIVKRTGAIVDVPVGDG LLGRVVDALG NPIDGKGPIA NARRSRVEVK APGIIPRLSV REPMVTGVKAVDSLVPIGRG QRELIIGDRQ TGKTAIAIDT IINQKRFNDA GDDKKKLFCI YVAVGQKRSTVAQIVKRLTD AGAMDYTIVV SATASDAAPL QFLAPYSGCA MGEHFRDNGK HALIIFDDLSKQAVAYRQMS LLLRRPPGRE AYPGDVFYLH SRLLERAAKM NNSLGGGSLT ALPVIETQAGDVSAYIPTNV ISITDGQIFL ETELFYKGVR PAINVGLSVS RVGSAAQTKA MKQVAGSMKLELAQYREVAA FAQFGSDLDA STQQLLNRGV RLTELLKQGQ YVPMGIEEQV GVIYAGVKGYLDKVDPSAIT KFEKEFLAHL RSSQQALLKT IREEGQISPQ TDAQLKDVVV NFLATFKP



ATPAATPA


Nom de la protéine: HHéémoglobinemoglobine (HBB)(HBB)


Séquence

Informations biologiquesTransporte l’oxygène dans le sang…Notre corps produit 4 à 5 milliards de protéines "hémoglobine" par heure !

Fiche no P68871

MVHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST PDAVMGNPKVKAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP ENFRLLGNVL VCVLAHHFGKEFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH


Le changement E -> V àcette position conduit àl’anémie falciforme, àdes globules rouges en

forme de faucille


HHéémoglobinemoglobine


Nom de la protéine: MRP8MRP8

(ATP(ATP--binding cassette transporter subbinding cassette transporter sub--family C member 11 de son petit nom !)family C member 11 de son petit nom !)


Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la qualité (grasse ou sèche) de la cire d’oreille, entre autres…

Fiche no Q96J66

MTRKRTYWVP NSSGGLVNRG IDIGDDMVSG LIYKTYTLQD GPWSQQERNP EAPGRAAVPP

WGKYDAALRT MIPFRPKPRF PAPQPLDNAG LFSYLTVSWL TPLMIQSLRS RLDENTIPPLSVHDASDKNV QRLHRLWEEE VSRRGIEKAS VLLVMLRFQR TRLIFDALLG ICFCIASVLGPILIIPKILE YSEEQLGNVV HGVGLCFALF LSECVKSLSF SSSWIIN QRT AIRFRAAVSSFAFEKLIQFK SVIHITSGEA ISFFTGDVNY LFEGVCYGPL VLITCAS LVI CSISSYFIIGYTAFIAILCY LLVFPLAVFM TRMAVKAQHH TSEVSDQRIR VTSEVLTCIK LIKMYTWEKPFAKIIEDLRR KERKLLEKCG LVQSLTSITL FIIPTVATAV WVLIHTS LKL KLTASMAFSMLASLNLLRLS VFFVPIAVKG LTNSKSAVMR FKKFFLQESP VFYVQTLQDP SKALVFEEATLSWQQTCPGI VNGALELERN GHASEGMTRP RDALGPEEEG NSLGPELHKI NLVVSKGMMLGVCGNTGSGK SSLLSAILEE MHLLEGSVGV QGSLAYVPQQ AWIVSGNIRE NILMGGAYDKARYLQVLHCC SLNRDLELLP FGDMTEIGER GLNLSGGQKQ RISLARAVYS DRQIYLLDDPLSAVDAHVGK HIFEECIKKT LRGKTVVLVT HQLQYLEFCG QIILLENGKI CENGTHSELMQKKGKYAQLI QKMHKEATSD MLQDTAKIAE KPKVESQALA TSLEESLNGN AVPEHQLTQEEEMEEGSLSW RVYHHYIQAA GGYMVSCIIF FFVVLIVFLT IFSFWWLSYW LEQGSGTNSSRESNGTMADL GNIADNPQLS FYQLVYGLNA LLLICVGVCS SGIFTKVTRK ASTALHNKLFNKVFRCPMSF FDTIPIGRLL NCFAGDLEQL DQLLPIFSEQ FLVLSLMVIA VLLIVSVLSPYILLMGAIIM VICFIYYMMF KKAIGVFKRL ENYSRSPLFS HILNSLQ GLS SIHVYGKTEDFISQFKRLTD AQNNYLLLFL SSTRWMALRL EIMTNLVTLA VALFVAFGIS STPYSFKVMAVNIVLQLASS FQATARIGLE TEAQFTAVER ILQYMKMCVS EAPLHMEGTS CPQGWPQHGEIIFQDYHMKY RDNTPTVLHG INLTIRGHEV VGIVGRTGSG KSSLGMALFR LVEPMAGRILIDGVDICSIG LEDLRSKLSV IPQDPVLLSG TIRFNLDPFD RHTDQQIWDA LERTFLTKAISKFPKKLHTD VVENGGNFSV GERQLLCIAR AVLRNSKIIL IDEATASIDM ETDTLIQRTIREAFQGCTVL VIAHRVTTVL NCDHILVMGN GKVVEFDRPE VLRKKPGSLF AALMATATSSLR



MRP8MRP8


Nom de la protéine: KKéératineratine


Séquence

Informations biologiquesConstituant principal des cheveux et des ongles…

Fiche no Q14532

MTSSCCVTNN LQASLKSCPR PASVCSSGVN CRPELCLGYV CQPMACLPSV CLPTTFRPAS CLSKTYLSSS CQAASGISGS MGPGSWYSEG AFNGNEKETM QFLNDRLASY LTRVRQLEQENAELESRIQE ASHSQVLTMT PDYQSHFRTI DQLQQKILCT KAENARMVVN IDNAKLAADD FRAKYEAELA MRQLVEADIN GLRRILDDLT LCKADLEAQV ESLKEELMCL KKNHEEEVGSLRCQLGDRLN IEVDAAPPVD LTRVLEEMRC QYEAMVEANR RDVEEWFNMQ MEELNQQVAT SSEQLQNYQS DIIDLRRTVN TLEIELQAQH SLRDSLENTL TESEARYSSQ LAQMQCMITNVEAQLAEIRA ELERQNQEYQ VLLDVRARLE GEINTYRSLL ESEDCKLPCN PCSTPSCTTC VPSPCVTRTV CVPRTVGMPC SPCPQGRY



KKéératineratine


Nom de la protéine: AnticorpsAnticorps ((IgGIgG) )

Informations taxonomiquesSouris

Séquence

Informations biologiquesProtéine du système immunitaire que participe à la défense de l’organisme…Cette protéine est contituée de plusieurs chaînes.

Fiche no P01868

…AKTTPPSVYP LAPGSAAQTN SMVTLGCLVK GYFPEPVTVT WNSGSLSSGV HTFPAVLQSD LYTLSSSVTV PSSPRPSETV TCNVAHPASS TKVDKKIVPR DCGCKPCICT VPEVSSVFIFPPKPKDVLTI TLTPKVTCVV VDISKDDPEV QFSWFVDDVEVHTAQTQPRE EQFNSTFRSV SELPIMHQDW LNGKEFKCRV NSAAFPAPIE KTISKTKGRP KAPQVYTIPP PKEQMAKDKVSLTCMITDFF PEDITVEWQW NGQPAENYKN TQPIMNTNGS YFVYSKLNVQ KSNWEAGNTF TCSVLHEGLH NHHTEKSLSH SPGK



IgGIgG


Nom de la protéine: ZinedineZinedine

Informations taxonomiquesHomo Sapiens

Séquence

Informations biologiquesProtéine-relais pour le passage des signaux dans la cellule…

Fiche no Q9NRL3

MMEERAAAAV AAAASSCRPL GSGAGPGPTG AAPVSAPAPG PGPAGKGGGG GGSPGPTAGPEPLSLPGILH FIQHEWARFE AEKARWEAER AELQAQVAFL QGERKGQENL KTDLVRRIKMLEYALKQERA KYHKLKFGTD LNQGEKKADV SEQVSNGPVE SVTLENSPLV WKEGRQLLRQYLEEVGYTDT ILDMRSKRVR SLLGRSLELN GAVEPSEGAP RAPPGPAGLS GGESLLVKQIEEQIKRNAAG KDGKERLGGS VLGQIPFLQN CEDEDSDEDD ELDSVQHKKQ RVKLPSKALVPEMEDEDEED DSEDAINEFD FLGSGEDGEG APDPRRCTVD GSPHELESRR VKLQGVLADLRDVDGLPPKV TGPPPGTPQP RPHEDVFIMD TIGGGEVSLG DLADLTVTND NDLSCDLSDSKDAFKKTWNP KFTLRSHYDG IRSLAFHHSQ SALLTASEDG TLKLWNLQKA VTAKKNAALDVEPIHAFRAH RGPVLAVAMG SNSEYCYSGG ADACIHSWKI PDLSMDPYDG YDPSVLSHVLEGHGDAVWGL AFSPTSQRLA SCSADGTVRI WDPSSSSPAC LCTFPTASEH GVPTSVAFTSTEPAHIVASF RSGDTVLYDM EVGSALLTLE SRGSSGPTQI NQVVSHPNQP LTITAHDDRGIRFLDNRTGK PVHSMVAHLD AVTCLAVDPN GAFLMSGSHD CSLRLWSLDN KTCVQEITAHRKKHEEAIHA VACHPSKALI ASAGADALAK VFV



ZinedineZinedine


Nom de la protéine: CollagCollagèènene

Informations taxonomiquesTyrannosaure

Séquence

Informations biologiquesC’est la plus vieille séquence de protéine connue…Extraite des tissus mous d’un fossile agé de 68 millions d’années retrouvé dans le Montana (USA)…

Fiche no P0C2W2

GATGAPGIAGAPGFPGARGAPGPQGPAGAPGPKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGVQGPPGPQGPR XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGAAGPPGATGFP GAAGRXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGVVGLPGQR

Les bouts de séquence manquants sont représentés par de s X (par homologie avec des séquences de collagène d’autre sespèces). Séquence ‘similaire’ à celle du poulet




CollagCollagèènene

Nom de la protéine: FlavanoneFlavanone 77--OO--glucoside 2''glucoside 2''--OO--wwwwww--LL--rhamnosyltransferaserhamnosyltransferase

Informations taxonomiquesPamplemousse

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans la fabrication d’une molécule, la naringine, responsable de l’amertume de certains fruits, comme les agrumes et en particulier des fruits qui ne sont pas mûrs…

Fiche no Q8GVE3

MDTKHQDKPS ILMLPWLAHG HIAPHLELAK KLSQKNFHIY FCSTPNNLQS FGRNVEKNFSSSIQLIELQL PNTFPELPSQ NQTTKNLPPH LIYTLVGAFE DAKPAFCNIL ETLKPTLVMY DLFQPMAAEA AYQYDIAAIL FLPLSAVACS FLLHNIVNPS LKYPFFESDY QDRESKNINYFLHLTANGTL NKDRFLKAFE LSCKFVFIKT SREIESKYLD YFPSLMGNEI IPVGPLIQEPTFKVDDTKIM DWLSQKEPRS VVYASFGSEY FPSTDEIHDI AIGLLLTEVN FIWAFRLHPDEKMTIEEALP QGFAEEIERN NKGMIVQGWV PQAKILRHGS IGGFLSHCGW GSVVEGMVFGVPIIGVPMAY EQPSNAKVVV DNGMGMVVPR DKINQRLGGE EVARVIKHVV LQEEAKQIRRKANEISESMK KIGDAQMSVV VEKLLQLVKK SE

…existe aussi dans d’autres agrumes…



FlavanoneFlavanone 77--OO--glucoside 2''glucoside 2''--OO--betabeta--LL--rhamnosyltransferaserhamnosyltransferase

Nom de la protéine: MyostatineMyostatine

Informations taxonomiquesBœuf

Séquence

Informations biologiquesRégulateur de la masse musculaire…en son absence, les muscles se développent de façon excessive…Cette protéine est très intéressante pour les producteurs de viande bovine, entre autre…

Fiche no O18836

MQKLQISVYIYLFMLIVAGPVDLNENSEQKENVEKEGLCNACLWRENTTSSRLEAIKIQI LSKLRLETAPNISKDAIRQLLPKAPPLLELIDQFDVQRDASSDGSLEDDDYHARTETVIT MPTESDLLTQVEGKPKCCFFKFSSKIQYNKLVKAQLWIYLRPVKTPATVFVQILRLIKPM KDGTRYTGIRSLKLDMNPGTGIWQSIDVKTVLQNWLKQPESNLGIEIKALDENGHDLAVT FPEPGEDGLTPFLEVKVTDTPKRSRRDFGLDCDEHSTESRCCRYPLTVDFEAFGWDWIIA PKRYKANYCSGECEFVFLQKYPHTHLVHQANPRGSAGPCCTPTKMSPINMLYFNGEGQII YGKIPAMVVDRCGCS




MyostatinMyostatin

…

Nom de la protéine: OstOstééocalcineocalcine

Informations taxonomiquesBison des steppes*

Séquence

Informations biologiquesProtéine de l’os

Retrouvée dans l’os d’un bison fossilisé(conservé dans du permafrost) vieux de 55.6 milles années environ.

Fiche no P83489

…YLDHGLGAPAPYPDPLEPKREVCELNPDCDELADHIGFQEAYRRFYGPV…

…* espèce éteinte

Existe aussi chez d’autres espèces…



OstOstééocalcineocalcine

Nom de la protéine: CornichonCornichon

Informations taxonomiquesMouche

Séquence


S’associe avec la protéine ‘Gurken’(concombre en allemand). Impliquée dans la formation de l’embryon.

Fiche no P49858

MAFNFTAFTYIVALIGDAFLIFFAIFHVIAFDELKTDYKNPIDQCNSLNPLVLPEYLLHI FLNLLFLFCGEWFSLCINIPLIAYHIWRYKNRPVMSGPGLYDPTTVLKTDTLYRNMREGW IKLAVYLISFFYYIYGMVYSLIST



CornichonCornichon

Nom de la protéine: SupermanSuperman

Informations taxonomiquesArabette des dames

Séquence


Impliquée dans la formation et le développement de la fleur.

Fiche no Q38895

MERSNSIELRNSFYGRARTSPWSYGDYDNCQQDHDYLLGFSWPPRSYTCSFCKREFRSAQ ALGGHMNVHRRDRARLRLQQSPSSSSTPSPPYPNPNYSYSTMANSPPPHHSPLTLFPTLS PPSSPRYRAGLIRSLSPKSKHTPENACKTKKSSLLVEAGEATRFTSKDACKILRNDEIIS LELEIGLINESEQDLDLELRLGFA



SupermanSuperman

Nom de la protéine: TectonicTectonic

Informations taxonomiquesSouris

Séquence


Impliquée dans la formation du système nerveux lors de l’embryogenèse.

Fiche no Q8BZ64

MGSRGLPPLLLVLLNCYTSSSTQVIAIPAAATPAVTKEDLNSTKATPTTLQPSLSPRTPG TPRAPERSGPRPTPVTDVAALCVCDLLPAQCDVNCCCDPDCSPADFSIFSACSVPVVTGD RQFCSQKAAFYSMNLTADPPHRDFKLIDQINPSVFCIHISNYKPALSFANPEVPDENNFD RLMQTSGGFTLSAESAVPSTAASDGPQPTKYEYGAPLQTAGASSGSFLKLPSPLTSSLCA DQNPAAFLVSQAFECSRRVDIEQCEGMEALSMAHYSSPAILRVPNSMTQVSIKIQSVMYR SLNHTLTQLEGHGVLRPSLVSTGQDRLCSNVVLQVKYSLLYTATGQIHEAGLSLVLGTLS SAVSLLQQKFEIHFIQHGTKPVPLSGNPGYRVGLPLAAGFQPQKGSGIIQTTNRQGQFTI LRSTSQQDCLASEGLRTPVLFGYNVQSGCQLRLTGTIPCGLLAQKVQDLLRGQAFPDYVA AFGNSRAQDVQDWVPVHFVTYSSNMKGSCQLPVALAIEVKWTKYGSLLNPQARIVNVTAQ LVSVPEPLPGPERTVVISTAVTFVDVSAPAEAGFRAPPTINARLPFSFFFPFV


existe aussi chez d’autres espèces…


TectonicTectonic

Nom de la protéine: Timeless (Timeless (‘‘Hors du tempsHors du temps’’))

Informations taxonomiquesHomme

Séquence


Impliquée dans la régulation de notre rythme circadien.

Fiche no Q9UNS1

MGSRGLPPLLLVLLNCYTSSSTQVIAIPAAATPAVTKEDLNSTKATPTTLQPSLSPRTPG TPRAPERSGPRPTPVTDVAALCVCDLLPAQCDVNCCCDPDCSPADFSIFSACSVPVVTGD RQFCSQKAAFYSMNLTADPPHRDFKLIDQINPSVFCIHISNYKPALSFANPEVPDENNFD RLMQTSGGFTLSAESAVPSTAASDGPQPTKYEYGAPLQTAGASSGSFLKLPSPLTSSLCA DQNPAAFLVSQAFECSRRVDIEQCEGMEALSMAHYSSPAILRVPNSMTQVSIKIQSVMYR SLNHTLTQLEGHGVLRPSLVSTGQDRLCSNVVLQVKYSLLYTATGQIHEAGLSLVLGTLS SAVSLLQQKFEIHFIQHGTKPVPLSGNPGYRVGLPLAAGFQPQKGSGIIQTTNRQGQFTI LRSTSQQDCLASEGLRTPVLFGYNVQSGCQLRLTGTIPCGLLAQKVQDLLRGQAFPDYVA AFGNSRAQDVQDWVPVHFVTYSSNMKGSCQLPVALAIEVKWTKYGSLLNPQARIVNVTAQ LVSVPEPLPGPERTVVISTAVTFVDVSAPAEAGFRAPPTINARLPFSFFFPFV


existe aussi chez d’autres espèces…


TimelessTimeless

…

Nom de la protéine: Adagio (Adagio (‘‘ZeitlupeZeitlupe’’ = = ‘‘ralentiralenti’’))

Informations taxonomiquesArabette des dames

Séquence


Impliquée dans la régulation du rythme journalier en fonction de la lumière.

Fiche no Q94BT6

MEWDSGSDLSADDASSLADDEEGGLFPGGGPIPYPVGNLLHTAPCGFVVTDAVEPDQPII YVNTVFEMVTGYRAEEVLGGNCRFLQCRGPFAKRRHPLVDSMVVSEIRKCIDEGIEFQGE LLNFRKDGSPLMNRLRLTPIYGDDDTITHIIGIQFFIETDIDLGPVLGSSTKEKSIDGIY SALAAGERNVSRGMCGLFQLSDEVVSMKILSRLTPRDVASVSSVCRRLYVLTKNEDLWRR VCQNAWGSETTRVLETVPGAKRLGWGRLARELTTLEAAAWRKLSVGGSVEPSRCNFSACA VGNRVVLFGGEGVNMQPMNDTFVLDLNSDYPEWQHVKVSSPPPGRWGHTLTCVNGSNLVV FGGCGQQGLLNDVFVLNLDAKPPTWREISGLAPPLPRSWHSSCTLDGTKLIVSGGCADSG VLLSDTFLLDLSIEKPVWREIPAAWTPPSRLGHTLSVYGGRKILMFGGLAKSGPLKFRSS DVFTMDLSEEEPCWRCVTGSGMPGAGNPGGVAPPPRLDHVAVNLPGGRILIFGGSVAGLH SASQLYLLDPTEDKPTWRILNIPGRPPRFAWGHGTCVVGGTRAIVLGGQTGEEWMLSELH ELSLASYLT


existe aussi chez d’autres espèces de plantes…


AdagioAdagio

…

…

Nom de la protéine: ClockClock‘‘Circadian Circadian locomoterlocomoter output cycles protein kaputoutput cycles protein kaput’’

Informations taxonomiquesPoulet

Séquence


Impliquée dans la régulation du rythme circadien. Exprimée dans la rétine.

Fiche no Q8QGQ6

MFFTISTHKMSSIADRNDGSIFDGLVEEDDKDKAKRVSRNKSEKKRRDQFNVLIKELGSM LPGNARKMDKSTVLQKSIDFLRKHKEITAQSDASEIRQDWKPTFLSNEEFTQLMLEALDG FFLAIMTDGNIIYVSESVTPLLEHLPSDLVDQSVFNFIPEGEHSEIYKILSSHLLESDSL TPEYLKSKNQLEFCCHMLRGTIDPKEQPTYEYVKFIGNFKCLNNVPNSAHNGFEGTIQRS HRPSYEDKVCFIATVRLATPQFIKEMCTVEEPNEEFTSRHSLEWKFLFLDHRAPPIIGYL PFEVLGTSGYDYYHVDDLDNLAKCHEHLMQYGKGKSCYYRFLTKGQQWIWLQTHYYITYH QWNSRPEFIVCTHTVVSYAEVRAERRRELGIEESLPEIKADKSQDSGSDNHINTVSLKEA LERFDTSPTPSASSRSSRKSSHTAVSDHSSTPTKMTVDTSTPPRQSLSAHEKSTQRRSSL SSQSLSSQSLGQPVTQPTMSQPATLQLQSSMSQPVFQFSAQLGAMQHLKDQLEQRTRMIE ANIHRQQEELRKIQEQLQIVHGQGLQLSSGPCVPKIHRTDVTVPEMFLQQSTSGLNFSSV QLTSGNSSSVQQLAPGNMQGQVVQTNQTQSGMNTGHTSTPHMIQQQPLQSSASQHNQQNV LSGHGQQSSLAGQSQNTVSTPLYNTMVISQPTAGNVVQVPSSLPQNNNQNAAAVTTFTQD RQIRFSQGQQLVTKLVTAPVACGAVMVPSTMFMGQVVTAYPTFAAQQQQPQTLPVTQQQQ QQQQQSQQDQQQQQQQLTAVQQPAQPQLTQHPQQFLQTSRLLHGNQSAQLILSAAFPLQQ STFTQSHHQQHQPQQQQLSRHRTDKMTDPSKAQPQ


existe aussi chez d’autres espèces …


ClockClock

…

Nom de la protéine: Frequency ClockFrequency Clock

Informations taxonomiquesChampignon

Séquence


Impliquée dans la stabilité du rythme circadien (en fonction de la lumière et de la température).

Fiche no Q01115

MSDLKSKRRNAPSLAQHTYPRRVSPENSVTLRHHRLARDASLQANSSRSQAATSSPRRNS SDESHDTGQSDANKWFDQSNLNPTANYDSNAMDVDPPFYQRESESSNEGGKIPYHGGSVP MLKPTVTHSSSADDYRSVIDDLTVEIQRLKEELKRYKQFGSDVMKNEKLFEIKVHGLPKR KKRELEATLRDFAASLAGTSSTDMASSHKKKSSRHMNRMQSSASGSMSKHASSSAGSHSR PVDSAYASMSTGPNSSGTSLNRPSMSARARTSEQKVENYLRDIPEGLYPRHMIMTEKERK KLIVRRLEQIFTGKMVRGANTSNSYQVNSGLTPVTHDGQSGKAAGLHQPPSLKAPPINVE NIEPAREARILPADNMKKSRSRDNESTSNSNQDQTESGGKTANSGSGSNTSPPIAPPPEQ RPTRPLDLDPHRTQVPSENMEYLRHLGLVPPELLPDSNDLEGDVAPDADGWIHLNLLCNL AQLHILNVTPDFIRSAVNEKSTKFQLSRDGRKVRWRGGLDGTRFSSDSSGDNSQSPVGDE TDSSSKNGQRKKRKVVTADGQTTSAPSSKEASKYDRQISQSSDSFHYKPLFAHHPSSHET SLDTGSSYGPPEESAQGDSRWGLSGSGGTSQRKKRRVDGAIVYYSGAPFCTDLSGDPGDA GVDSQTGGISPATYMQNAGQAQAKAEARAEKGKVPPKAVRMVPIRSQSGSFLPHRPLTAF SPSTEDVPMSDVDEAIALEDDIEMEFPWSDSQQYLEVRPLEPSGLGGVLPDDNFMVVVTT KRPHGMEPGEKTPALGRTKSDETTRTTDSIVNLLASMSTSGNENMPAGRPVLHKTGNIEI EYLSGRIKRLNPVPLPPPAIFFPPFSSTSSYNSELDLGSDADDDESSEEFMSRRANPHQS DNEYPDDVDITSGDEVGEEPDDELAPTDDDEEMESAGDEGGASRGRAAGPRSARPSLPSG KSAGHRAVRRTGSLAATAGGEESGYSSSAEES



FrequencyFrequency ClockClockproteinprotein

…

Nom de la protéine: ‘‘Period circadianPeriod circadian’’

Informations taxonomiquesDrosophila (mouche)

Séquence

Informations biologiquesImpliquée dans le rythme sommeil-veille et le rythme du chant nuptial (qui permet la reconnaissance entre espèces)

Fiche no P07663

MEGGESTEST HNTKVSDSAY SNSCSNSQSQ RSGSSKSRLS GSHSSGSSGY GGKPSTQASSSDMIIKRNKD KSRKKKKNKG AGQGAGQAQT LISASTSLEG RDEEKPRPSG TGCVEQQICRELQDQQHGED HSEPQAIEQL QQEEEEDQSG SESEADRVEG VAKSEAAQSF PIPSPLSVTIVPPSMGGCGG VGHAAGLDSG LAKFDKTWEA GPGKLESMTG VGAAAAGTGQ RGERVKEDSFCCVISMHDGI VLYTTPSITD VLGYPRDMWL GRSFIDFVHL KDRATFASQI TTGIPIAESRGSVPKDAKST FCVMLRRYRG LKSGGFGVIG RPVSYEPFRL GLTFREAPEE ARPDNYMVSNGTNMLLVICA TPIKSSYKVP DEILSQKSPK FAIRHTATGI ISHVDSAAVS ALGYLPQDLIGRSIMDFYHH EDLSVMKETY ETVMKKGQTA GASFCSKPYR FLIQNGCYVL LETEWTSFVNPWSRKLEFVV GHHRVFQGPK QCNVFEAAPT CKLKISEEAQ SRNTRIKEDI VKRLAETVSRPSDTVKQEVS RRCQALASFM ETLMDEVSRA DLKLELPHEN ELTVSERDSV MLGEISPHHDYYDSKSSTET PPSYNQLNYN ENLLRFFNSK PVTAPAELDP PKTEPPEPRG TCVSGASGPMSPVHEGSGGS GSSGNFTTAS NIHMSSVTNT SIAGTGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGNGTNSGT GTGTASSSKG GTAAIPPVTL TESLLNKHNDEMEKFMLKKH RESRGRTGEK SKKSANDTLK MLEYSGPGHG IKRGGSHSWE GEANKPKQQLTLGTDAIKGA AGSAGGAVGT GGVGSGGAGV AGGGGSGTGV AGTPEGRATT TSGTGTPGGAGGGGGAGAAA AAGASSSVGS STPGPSSYPT CTQNINLWPP FSVGITPPVH STHTAMAQSSFSSAGLFPTF YYIPASLTPT SPTRSPRMHK HPHKGGTDMP TTSQQAAAAA AQAMPLQYMAGVMYPHPSLF YTHPAAAAAT AMMYQPMPFP GMANALQIPE RPLGSQSAYN KSVYTTTPASMTKKVPGAFH SVTTPAQVQR PSSQSASVKT EPGSSAAVSD PCKKEVPDSS PIPSVMGDYNSDPPCSSSNP ANNKKYTDSN GNSDDMDGSS FSSFYSSFIK TTDGSESPPD TEKDPKHRKLKSMSTSESKI MEHPEEDQTQ HGDG


PeriodPeriod circadiancircadian


Nom de la protéine: ProtProtééineine ribosomaleribosomale L5 L5

Informations taxonomiquesBactérie (E.coli)

Séquence

Informations biologiquesProtéine qui fait partie d’un assemblage de protéines appeléribosome, impliqué dans la fabrication des protéines(à la vitesse de 8 acides aminés / secondes !)

Fiche no P62399

MAKLHDYYKDE VVKKLMTEFN YNSVMQVPRV EKITLNMGVG EAIADKKLLD NAAADLAAISGQKPLITKAR KSVAGFKIRQ GYPIGCKVTL RGERMWEFFE RLITIAVPRI RDFRGLSAKSFDGRGNYSMG VREQIIFPEI DYDKVDRVRG LDITITTTAK SDEEGRALLA AFDFPFRK


Protéine en cours de fabrication par un ribosome...

un ribosome...


ProtProtééine ine ribosomale L5ribosomale L5


Nom de la protéine: KlothoKlotho

Informations taxonomiquesHomme et femme

Séquence


Protéine dont 2 variations sont associées avec une durée de vie plus ou moins longue.Du nom de la déesse grecque Klotho qui tissait le fil de la vie.

Fiche no Q9UEF7

MPASAPPRRPRPPPPSLSLLLVLLGLGGRRLRAEPGDGAQTWARFSRPPAPEAAGLFQGT FPDGFLWAVGSAAYQTEGGWQQHGKGASIWDTFTHHPLAPPGDSRNASLPLGAPSPLQPA TGDVASDSYNNVFRDTEALRELGVTHYRFSISWARVLPNGSAGVPNREGLRYYRRLLERL…DFVLGWFAKPVFIDGDYPES MKNNLSSILPDFFFFTESEK…KGTADFFALCCCCFGPTLSFQLLDPHMKFRQLE…



ou Vou S

KlothoKlotho


ou V

ou S

Nom de la protéine: PrestinePrestine

Informations taxonomiquesRat

Séquence


Protéine impliquée dans l’amplification du son dans l’oreille interne. Elle travaille très rapidement, d’où son nom.

Fiche no Q9EPH0

MDHAEENEIPAETQKYLVERPIFSHPVLQERLHVKDKVTDSIGDKLKQAFTCTPKKVRNI IYMFLPITKWLPAYKFKEYVLGDLVSGISTGVLQLPQGLAFAMLAAVPPVFGLYSSFYPV IMYCFFGTSRHISIGPFAVISLMIGGVAVRLVPDDIVIPGGVNATNGTEARDALRVKVAM SVTLLSGIIQFCLGVCRFGFVAIYLTEPLVRGFTTAAAVHVFTSMLKYLFGVKTKRYSGI….



PrestinePrestine


(…)

la banque de données swiss-prot...

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