aula de engenharia genética sobre enzimas de restrição

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Enzimas de Restrição Profª Drª Marta F. Bastos

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Health & Medicine


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Page 1: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

Profª Drª Marta F. Bastos

Page 2: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• São proteínas que aumentam a velocidade das reações químicas

• Na ausência destas, diversas reações químicas do metabolismo celular não ocorreriam

Enzimas

Page 3: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 4: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

AL

GA

RIS

MO

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 5: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 6: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 7: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 8: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Histórico

• Avery, MacLeod, McCarty (1944) demonstraram a transformação de uma cepa avirulenta de Streptococcus

penumoniae;

• DNA como elemento transformante

Page 9: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição - Histórico

• Watson & Crick (1953):propõem o modelo da dupla

hélice de DNA, baseados nos

resultados de difração de raioX de Franklin & Wilkins.

Page 10: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Procurar um gene dentro de um genoma humano é

comparável a procurar uma pessoa sem sobrenome

em uma casa sem endereço em uma rua

desconhecida em uma cidade não identificada de um

país estrangeiro.

Solange Farah

Enzimas de Restrição- Histórico

Page 11: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Estudos em Microbiologia sugeriam que bactériasapresentavam mecanismos de defesa para proteção

contra infecções virais.

Enzimas de Restrição- HISTÓRICO

Page 12: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- HISTÓRICO

Page 13: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- HISTÓRICO

• Arber (1962): microscopia eletrônica de bactérias E. coli

e bacteriófagos Lambda fornecem a primeira evidência daexistência de enzimas que restringem o crescimento viral

devido ao reconhecimento e a quebra do DNA estranho.Arber & Linn. DNA modification and restriction. Ann Rev Biochem, 1969 .

• Smith & Wilcox (1970): enzimas que cortam DNA em

Haemophilus influenzae.

Por que o DNA bacteriano também não é clivado?

Page 14: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

• Metilação do DNA bacteriano

Page 15: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- HISTÓRICO

• Nathans & Smith (1975): purificação das enzimas por métodos de cromatografia e digestão do DNA de SV40.

Eletroforese

Page 16: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- DEFINIÇÃO

• São enzimas que atuam como tesouras químicas

cortando DNA em seqüências específicas.

Page 17: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Tipo I: reconhece específicas sequências de DNA

porém cortam em locais que podem estar a 1000 pb

de distância do sítio de reconhecimento da enzima;

Ex: EcoAI GAGNNNNNNNGTCA

EcoKI AACNNNNNNGTGC

StySPI AACNNNNNNGTRC

Enzimas de Restrição - TIPOS

Page 18: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Tipo II: que reconhece e corta diretamente dentro do

sítio de reconhecimento;

Ex: EcoRI G/AATTC

BalI TGG/CCA

PstI CTGCA/G

Enzimas de Restrição - TIPOS

Page 19: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Tipo III: Corte a 24-26 pb a jusante da sequência de

reconhecimento que é assimétrica e de 5 a 7 pb

Ex: EcoP151 CAGCAG

EcoPI AGACC

HinfIII CGAAT

Enzimas de Restrição - TIPOS

Page 20: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição tipo II

Page 21: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição
Page 22: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Estrutura heterodimérica

Enzimas de Restrição

Page 23: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Importância do íon Magnésio para o reconhecimento específico

Enzimas de Restrição

Page 24: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Produtos comercializados

Page 25: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Produtos comercializados

Page 26: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

Page 27: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

Page 28: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• Reconhecem e cortam o DNA em pontos específicos,

geralmente em seqüências de 4 a 8 pares de bases,

chamados palíndromos.

Enzimas de Restrição- DEFINIÇÃO

RADAR ARARA ANA

5’-GAATTC-3’3’-CTTAAG-5’

Page 29: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- NOMENCLATURA

• Nome da enzima é a abreviação do nome da espécie

bacteriana do qual foi isolada.

- 1ª letra: Maiúscula e representa o gênero

- Duas outras letras: representam a espécie

- Outras letras indicam a linhagem ou cepa bacteriana

- Algarismos romanos indicam a ordem da descoberta

Page 30: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- NOMENCLATURA

Microorganismo EnzimaSítio de

reconhecimento

Page 31: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

• Tipos de extremidades formadas após digestão

Extremidades cegas

Page 32: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

• Tipos de extremidades formadas após digestão

Extremidades coesivas

Page 33: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Microorganismo EnzimaSítio de

reconhecimentoExtremidades

Enzimas de Restrição

Page 34: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição

Page 35: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Aplicações

• Clonagem Molecular

Page 36: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

- Mutações dentro de sítios de restrição altera o

tamanho dos fragmentos gerados e assim a posição

das bandas na eletroforese .

- A existência de diversidade genética em uma

população é denominada polimorfismo, porém

mutações podem causar doenças e algumas podem

ser detectadas por RFLP.

Enzimas de Restrição- Aplicações

• RFLP (Restriction fragment length polymorphism)

Page 37: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• RFLP- Detecção de Mutações

Enzimas de Restrição- Aplicações

Page 38: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• RFLP- Genotipagem

Enzimas de Restrição- Aplicações

Page 39: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

• RFLP- Genotipagem

Enzimas de Restrição- Aplicações

Fig. 1. Restriction fragments obtained by digestion with Hinf I and Hae III of PCR’s amplicom using

primers PM2 lower and PM2 upper and template DNA of reference strains ATCC 33270, HG 1467

and HG1259 and some clinical isolates (26, 36, 243 and 583). (MM – molecular marker 100bp –

Fermentas).(a) profiles not expected and observed during the tests.

Page 40: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Mapas de Restrição

Page 41: Aula de Engenharia Genética sobre Enzimas de restrição

Enzimas de Restrição- Mapas de Restrição

ATIVIDADE

O tratamento de uma molécula de DNA com tamanho de 8

kb com a endonuclease de restrição EcoRI resulta em dois

fragmentos: de 3 e 5 Kb. A digestão da mesma molécula com

Hin DIII gera os fragmentos de 1,5 e 6,5 Kb. Finalmente, a digestão

com as duas enzimas resulta em fragmentos de 1,5, 3 e 3,5.

Desenhe o mapa de restrição, indicando os sítios de clivagem de

EcoRI e HinDIII.