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Interpretação Interpretação brasileira de brasileira de genotipagem – genotipagem – Algoritmo Brasileiro Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

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Page 1: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

Interpretação brasileira Interpretação brasileira de genotipagem – de genotipagem – Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro

Anderson Alvarenga Pereira

Ministério da SaúdeDepartamento de DST/Aids e

Hepatites Virais

Page 2: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

IntroduçãoIntroduçãoContexto

◦Criação da Rede Nacional de Genotipagem – RENAGENO (2001).

23 Laboratórios.

◦Necessidade de criar um algoritmo próprio – (2003).

◦Oferecer recursos para os laboratórios da RENAGENO.

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Page 3: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

MotivaçãoMotivaçãoAumento da demanda por

exames de genotipagem.Demora na utilização dos

algoritmos públicos e privados.Necessidade de adequação a

realidade brasileira.◦Interpretação em português;◦Características locais da circulação

do HIV.

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Page 4: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

ObjetivosObjetivosValidar a qualidade das

sequências produzidas;Subtipar as sequências com

simplicidade e eficiência;Desenvolver o algoritmo baseado

nas regras do comitê da RENAGENO.ContaminaçãoContaminação SubtipoSubtipo

AlgoritmoAlgoritmoBrasileiroBrasileiro

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Page 5: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

DesafiosDesafiosConhecimentos avançados

envolvidos.◦Biológicos;◦Computacionais;◦Modelos matemáticos e estatísticos;◦Modelagem do conhecimento em

formação;◦Simplificação para o uso de não

especialistas;

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Page 6: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

Algoritmos de resistência à Algoritmos de resistência à drogasdrogas Baseado em Regras:

◦ Analisam a presença ou ausência de mutações específicas;

◦ Atribuem níveis de resistência a cada droga. Baseado em penalidades/score:

◦ Atribuem penalidades presença ou ausência de mutações específicas.

Público – Acesso livre via internet, mantido por universidades ou órgãos governamentais.◦ HIVdb – Universidade de Stanfort;◦ ANRS – Agence Nationale de Recherches Sur le

Sida;◦ Rega – Rega Institute;◦ Algoritmo Brasileiro.

Privados◦ Mantidos por empresas.

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Page 7: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

Diferença entre Diferença entre AlgoritmosAlgoritmosBaseado em Regras ou PenalidadesNíveis de resistência conferidos

◦ ANRS e REGA Sensível; Intermediário; Resistente.

◦ HIVdb Sensível; Potencial baixo nível de resistência; Baixo Nível de Resistência; Resistência intermédiária; Alto nível de resistência.

◦ Algoritmo Brasileiro Sensível; Intermediário; Resistente; NA (Não se aplica).

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Page 8: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

Diferença entre Diferença entre AlgoritmosAlgoritmosDrogas avaliadas pelo algoritmo;

◦Brasileiro = 22 drogas◦HIVdb e REGA = 13 drogas◦ANRS = 10 drogas

10 drogas estão nos 4 algoritmos;◦3TC, ABC, ATV/r, D4T, DDI, DRV,

EFV, NFV, SQV/r, TDFInterpretação da relação entre

mutações e resistência à droga.Resultados divergentes.

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Page 9: Interpretação brasileira de genotipagem – Algoritmo Brasileiro Anderson Alvarenga Pereira Ministério da Saúde Departamento de DST/Aids e Hepatites Virais

Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro Abrange as

características específicas do HIV no Brasil;

Baseado nas regras de resistência a drogas criadas pelo comitê da RENAGENO;

Maior quantidade de drogas avaliadas;

Entre 10.000 a 15.000 exames ano.

Validado pelo banco da RENAGENO com mais de 20.000 sequências.

Mais de 400 médicos de referência em genotipagem treinados para interpretar os laudos;

Página de acesso e resultado do Algoritmo Brasileiro de Genotipagemhttp://aids.gov.br/genotipagem

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Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro

Revisão periódica;Atualização sempre que

necessário;Processo de atualização:

◦Definição da regra pelo comitê;◦Desenvolvimento da nova versão;◦Teste da nova versão pelo comitê;◦Comparação do Impacto das versões;◦Treinamento dos médicos (MRG’s);◦Liberação da nova versão.

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