infraestrutura de dados, ferramentas computacionais e ... · a lista de espécies da flora do...

Centro de Referência em Informação Ambiental, CRIACentro de Referência em InformaCentro de Referência em Informaçção Ambiental, CRIAão Ambiental, CRIA

Papel do CRIA no desenvolvimento da Papel do CRIA no desenvolvimento da

Infraestrutura de dados, Infraestrutura de dados, ferramentas computacionais e ferramentas computacionais e serviserviçços web para a difusão de os web para a difusão de informainformaçção sobre a ão sobre a Biodiversidade BrasileiraBiodiversidade Brasileira

Porto Alegre, Agosto 2012Porto Alegre, Agosto 2012


EstatutoEstatuto

CRIACRIAOSCIPOSCIP08/12/200008/12/2000

InformaInformaçção ão sobre a sobre a Biodiversidade Biodiversidade BrasileiraBrasileira


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaççãoão

Correio Braziliense, 21 de julho de 2010



Correio Braziliense, 21 de julho de 2010

8 dicionários especializados em nomes científicos

2.4 milhões de nomes registrados

Nome científico de interesse:Stryphnodendron barbatimam (Barbatimão)


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– DicionDicionáários de nomes cientrios de nomes cientííficosficos

De acordo com os dicionários, o nome científico Stryphnodendron barbatimam não é mais aceito.

Novo nome aceito: Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– Conhecimento cientConhecimento cientíífico atual sobre a espfico atual sobre a espééciecie

A Lista de Espécies da Flora do Brasil contém informações atualizadas sobre mais de 40 mil nomes de espécies da flora brasileira. O JBRJ coordena o processo dinâmico de revisão da lista com a contribuição de mais de 450 especialistas atualizando e validando nomes através da Internet utilizando o sistema de informação desenvolvido e hospedado no CRIA.


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– Conhecimento cientConhecimento cientíífico atual sobre a espfico atual sobre a espééciecie

Status

Sinonímia

Vouchers

Forma de Vida

Endemismo

Domínio

Vegetação

Distribuição

Nomes comuns

Especialista


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– InformaInformaçção histão históórica disponrica disponíívelvel

Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville

Espécie descrita na obra Flora brasiliensis

Gravuras disponíveis


23 mil espécies descritas em 11 mil páginas3.800 desenhos detalhados



Espécie também coletada por Saint-Hilaire

Amostras depositadas em Paris

Imagens em alta resolução disponíveis noHerbário Virtual A. de Saint-Hilaire



Repatriação de dados do acervo do Museu Nacional de História Natural de Paris

Imagens em alta resolução de exsicatas e cadernos de campo



Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão -- PublicaPublicaççõesões

Dois sistemas de informação especializados em publicações científicas

Mais de 24 mil artigos disponíveis


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão -- PublicaPublicaççõesões


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão -- InteroperabilidadeInteroperabilidade

Dados de Espécimens

282 coleções biológicas conectadas

> 5,5 milhões de registros on-line


Sistemas de informaSistemas de informaçção de acesso pão de acesso púúblicoblico


speciesspeciesLink: desafiosLink: desafios

...e a mudan...e a mudançça de cultura na questão do controle e acesso aos dados.a de cultura na questão do controle e acesso aos dados.

Linux

MySQL

Col eção de

Mamíferos

Herbário

Coleção de

Peixes Coleção de

BactériasCol eção de

Anfíbios

programa

search

interface

Windows 98

Brahms

Windows XP

Access

Windows 7

SpecifyVista

Excel

usuários


• Software: Livre e/ou de código aberto

• Hardware: Intel based

• Protocolo de comunicação DiGIR/TAPIR

• Modelo internacional de dados Darwin Core

• Sistema on-line de acesso livre e aberto

• Autonomia plena às coleções com relação a escolha do

software de gerenciamento e a disponibilização dos dados

• spLinker: aplicativo para disponibilização dos dados

speciesspeciesLink: soluLink: soluçções adotadasões adotadas


• Independente de plataforma (java)

• Conecta-se praticamente em qualquer banco de dados

(também suporta arquivos texto)

• Oferece controle completo

sobre os dados

• Baixo tráfego de rede

• Possibilidade de filtrar

dados sensíveis

speciesspeciesLink: programa Link: programa spspLinkerLinker


speciesspeciesLink: padrão de dados Darwin CoreLink: padrão de dados Darwin Core


Banco de

dados da

coleção

Expedição

N° catálogo

Armário

Família

Espécie

Gênero

País

Localidade

Habitat

Observação

Ma

pe

am

en

to d

os

cam

po

s

Mo

de

lo d

e d

ad

os

Da

rwin

Co

re catalog number

genus

family

species

country

notes

Registros

on-line

Filtro para dados sensíveis

Acesso livre e aberto a dados

não sensíveis

locality

spspLinker: mapeamento dos campos Linker: mapeamento dos campos


indicadoresindicadores

data cleaningdata cleaning

network managernetwork manager

Análise dos dadosAnálise dos dados Serviços WebServiços Web

mapCRIAmapCRIA

Provedor TAPIRProvedor TAPIR

imagensimagens

Requisições

externas

Requisições

externas

MobotMobot

IndexadorIndexador

………MNHNMNHNMNHN JBRJJBRJ

Servidores RegionaisServidores Regionais

Repositório CentralRepositório Central

Coleções com

provedores

Coleções com

provedores

Coleções sem

provedores

Coleções sem

provedores

TAPIR/DiGIR

spLinker

TAPIR

NYBGNYBG SmithsonianSmithsonian


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– LocalizaLocalizaçção geogrão geográáfica das colefica das coleçções participantesões participantes


• página de busca

• networkManager

• geoLoc

• infoXY

• spOutlier

• conversor

• speciesMapper

• dataCleaning

speciesspeciesLink: ferramentasLink: ferramentas


Acesso Acesso àà informainformaçção: onde buscar?ão: onde buscar?


Acesso Acesso àà informainformaçção: o quê buscar?ão: o quê buscar?


Acesso Acesso àà informainformaçção: resultado resumidoão: resultado resumido

. . .. . .


Acesso Acesso àà informainformaçção: resultado detalhadoão: resultado detalhado


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão -- InteroperabilidadeInteroperabilidade

Mapas de distribuição podem ser produzidos on-the-fly através do serviço map@cria


Acesso Acesso àà informainformaçção: resultado em mapasão: resultado em mapas


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– FeedbackFeedback aos parceiros aos parceiros –– Limpeza de dadosLimpeza de dados

Relatórios gerados diariamente visando apoiar a melhoria da qualidade dos dados nas coleçõesintegrantes da rede


FeedbackFeedback aos parceirosaos parceiros

Verificação de inconsistências

• nomes• datas• dados geográficos


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– Uso dos dados Uso dos dados -- IndicadoresIndicadores

Indicadores são produzidos diariamente como subsídio para análises e tomada de decisão


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– Uso dos dados Uso dos dados -- IndicadoresIndicadores


Sistema CRIA de informaSistema CRIA de informaçção ão –– Uso dos dados Uso dos dados –– Modelagem preditivaModelagem preditiva

os dados são disponibilizados em formatos adequados para gerar modelos de distribuição potencial de espécies


Modelagem para 162 espécies arbóreas do cerrado com mais de 30 pontos de ocorrência: presente e 2 cenários futuros considerando mudanças climáticas

Distribuição potencial no presente

1% aumento anual de CO2

0.5% aumento anual de CO2

hotspot

Uso dos dados: modelagemUso dos dados: modelagem


Uso da modelagem para validar listas de espécies em extinção

Byrsonima subterranea Brad. & Mark. (Malpighiaceae)

Espécie considerada extinta pela lista da flora ameaçada de extinção no estado de São Paulo (SMA-SP 1997)




Uso da modelagem para auxiliar na localização da espécie

Modelo: similaridade ambiental

Validação do modelo no campo:quatro novas ocorrênciasda espécie

Layers: fragmentos de Cerrado e tipo de solo


Ano 2007 2008 2009 2010 2011 2012* Crescimento

No. Registros online 2.131.278 2.939.987 3.551.813 4.012.333 4.889.678 5.546.206 160%

Registros visualizados (download) 2.742.558 14.310.948 20.211.348 92.546.559 256.496.993 164.417.678 5.895%

Visualizados/Totais 1,3 4,9 5,7 23,1 52,5 29,6

Acesso aos dados


ParceriasParcerias

Parceiros nacionaisParceiros nacionais

Financiadores e patrocinadoresFinanciadores e patrocinadores Parceiros internacionaisParceiros internacionais


Arquitetura

OBRIGADO !

Vanderlei Canhos <[email protected]>

CRIA www.cria.org.br

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