aula programa genes
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Genes
Cristiano LemesCristiano Lemes
AnálisesAnálises
• Análise de Variância Análise de Variância
• Comparação de MédiasComparação de Médias
• Parcelas SubdivididasParcelas Subdivididas
• Experimentos FatoriaisExperimentos Fatoriais
• Correlações Correlações
Análise de VariânciaAnálise de Variância
O objetivo da análise de variância é avaliar se as diferenças O objetivo da análise de variância é avaliar se as diferenças observadas entre as médias das amostras são estatisticamente observadas entre as médias das amostras são estatisticamente significantes. significantes.
Teste FTeste F
Aceitar ou rejeitar H0Aceitar ou rejeitar H0
- Tabular os dados no Excel;- Tabular os dados no Excel;
- Usar - Usar PONTOPONTO no lugar de no lugar de VÍRGULAVÍRGULA para separar as para separar as casas decimais (Ctrl + L ou em configurações locais);casas decimais (Ctrl + L ou em configurações locais);
- De preferência organizar as análises em planilhas do - De preferência organizar as análises em planilhas do mesmo arquivo;mesmo arquivo;
-Abrir o programa genes;Abrir o programa genes;
-Clicar emClicar em Entrada de DadosEntrada de Dados;;
- Clicar em- Clicar em NovoNovo para colar os dados tabulados no Excelpara colar os dados tabulados no Excel
-- Copiar Copiar os dados tabulados no Excel os dados tabulados no Excel
- No Genes, - No Genes, ColarColar os dados copiados do Excel; os dados copiados do Excel;
- Retirar o espaço do último valor colado; - Retirar o espaço do último valor colado;
-- Salvar Salvar arquivo com nome adequado. arquivo com nome adequado.
- Salvar os dados dentro da - Salvar os dados dentro da Pasta GenesPasta Genes;;
- É preferível criar pastas para armazenar os - É preferível criar pastas para armazenar os dados a serem analisados.dados a serem analisados.
- Após salvar os dados o Genes voltará para essa página;- Após salvar os dados o Genes voltará para essa página;
- Clicar em - Clicar em SairSair no canto direito superior da barra de no canto direito superior da barra de ferramentas. ferramentas.
- Após clicar em Sair, volta-se a página principal do Genes- Após clicar em Sair, volta-se a página principal do Genes
- O primeiro passo é rodar a - O primeiro passo é rodar a Análise de VariânciaAnálise de Variância de de acordo com o delineamento do experimento como esta acordo com o delineamento do experimento como esta exemplificado acima.exemplificado acima.
- - AbrirAbrir o arquivo de dados a ser analisado o arquivo de dados a ser analisado
- Clicar em - Clicar em Abrir ArquivoAbrir Arquivo como é demonstrado acima como é demonstrado acima
- Dentro da pasta Genes, clicar em - Dentro da pasta Genes, clicar em AbrirAbrir a a pasta dos pasta dos DadosDados
- Abrir o arquivo a ser analisado- Abrir o arquivo a ser analisado
- Após abrir os dados eles aparecerão desta forma;- Após abrir os dados eles aparecerão desta forma;
- Em seguida clicar em - Em seguida clicar em SairSair
O arquivo de dados O arquivo de dados a ser analisado foi a ser analisado foi
abertoaberto
Próximo passo: Próximo passo: Clicar em Clicar em
Declaração de Declaração de ParâmetrosParâmetros
Ver o arquivo do Excel para declarar quantas Ver o arquivo do Excel para declarar quantas variáveis estarão sendo analisadas variáveis estarão sendo analisadas
Número de genótipos ou Número de genótipos ou tratamentos tratamentos
correspondem a 1correspondem a 1aa coluna coluna do arquivo de dadosdo arquivo de dados Número de blocos ou Número de blocos ou
repetições repetições correspondem a 2correspondem a 2aa
Por fim, clicar em Por fim, clicar em RetornarRetornar
Digitar o nome das Digitar o nome das variáveis em ordem variáveis em ordem
Clicar em fim de Clicar em fim de dadosdados
Por último, clicar em Por último, clicar em Fim de DadosFim de Dados e em e em
seguida em seguida em RetornarRetornar
Clicar em Clicar em ANOVAANOVA para para completar a completar a
análise análise
Ampliar FonteAmpliar FonteExportar Exportar p/ Excelp/ Excel
Exportar Exportar p/ Wordp/ Word
Menor que 0.05 para ser Menor que 0.05 para ser significativosignificativo
- Marcar os arquivos de saída da - Marcar os arquivos de saída da ANOVA;ANOVA;
- Clicar no local indicado pela seta - Clicar no local indicado pela seta para processá-las ; para processá-las ;
-Rodar as pressuposições;-Rodar as pressuposições;
-Caso necessário fazer a transformação dos dados;Caso necessário fazer a transformação dos dados;-Se os testes de normalidade forem significantes Se os testes de normalidade forem significantes
Após rodar as pressuposições é possível ver a distribuição Após rodar as pressuposições é possível ver a distribuição gráfica de cada variável na curva normal gráfica de cada variável na curva normal
Freqüência esperada Freqüência esperada
Freqüência observada Freqüência observada
Comparação de Médias Comparação de Médias
- - Serve como um complemento para o estudo da análise de variância Serve como um complemento para o estudo da análise de variância
-Fazendo apenas o teste de “f” (teste que mostra se existe diferença Fazendo apenas o teste de “f” (teste que mostra se existe diferença entre as médias dos tratamentos) não podemos indicar qual o melhor entre as médias dos tratamentos) não podemos indicar qual o melhor tratamento. tratamento.
-Neste caso, é necessário aplicar um teste de comparação de médias Neste caso, é necessário aplicar um teste de comparação de médias dos tratamentos, daí então podendo concluir qual o melhor dos tratamentos, daí então podendo concluir qual o melhor tratamentotratamento..
- Página principal do Genes- Página principal do Genes
Estatística experimentaisEstatística experimentaisComparações entre Médias Comparações entre Médias Tukey, Ducan, Tukey, Ducan, SNK, Dunnet, Teste T entre outros.SNK, Dunnet, Teste T entre outros.
Procurar o arquivo de Médias a ser analisadoProcurar o arquivo de Médias a ser analisado
Clicar no local indicado pela seta acima para Clicar no local indicado pela seta acima para encontrar o arquivo das médiasencontrar o arquivo das médias
Abrir o arquivo Abrir o arquivo
EnsaioNacionalCoberturaEnsaioNacionalCoberturamed med == Arquivo de MédiasArquivo de Médias
EnsaioNacionalCoberturaEnsaioNacionalCoberturacre cre == covariância residual = covariância residual = QMEQME
4 colunas = Médias das quatro 4 colunas = Médias das quatro variáveis para cada genótipovariáveis para cada genótipo
7 linhas = 7 Genótipos 7 linhas = 7 Genótipos
Por último, clicar em Por último, clicar em sairsair
Clicar em declaração de parâmetrosClicar em declaração de parâmetros
Declarar os parâmetros solicitados Declarar os parâmetros solicitados
Ver Ver GL do ResíduoGL do Resíduo na saída da ANOVA na saída da ANOVA
Abrir o arquivo que contem o QME= creAbrir o arquivo que contem o QME= cre
Após sair da declaração de parâmetros clicando Após sair da declaração de parâmetros clicando em em RetornarRetornar, clicar em , clicar em ProcessarProcessar
1°- Médias 1°- Médias organizadas em organizadas em
ordem crescente.ordem crescente.
2°- Médias 2°- Médias organizadas de organizadas de acordo com a acordo com a
ordem de entrada ordem de entrada dos tratamentosdos tratamentos
Colar os rótulos e montar as tabelas Colar os rótulos e montar as tabelas
Parcelas SubdivididasParcelas SubdivididasXX
FatorialFatorial
Quando usar um ou o outro delineamenento?Quando usar um ou o outro delineamenento?
Quais são as diferenças ?Quais são as diferenças ?
- Parcela Subdividida: Parcela Subdividida: Em cada bloco as Em cada bloco as subparcelas são sorteadas dentro da parcelasubparcelas são sorteadas dentro da parcela Guamirim BRS 208 Pampeano nível 1 nível 3 nível 4 nível 2 nível 2 nível 1 nível 4 nível 3 nível 3 nível 2 nível 1 nível 4 Pampeano Guamirim BRS 208 nível 2 nível 4 nível 3 nível 1 nível 3 nível 1 nível 2 nível 4 nível 4 nível 2 nível 3 nível 1 BRS 208 Pampeano Guamirim nível 3 nível 2 nível 1 nível 4 nível 3 nível 1 nível 2 nível 4 nível 1 nível 3 nível 4 nível 2
Fatorial: Fatorial: Aleatorização de todos os fatoresAleatorização de todos os fatores Guam 208 Pamp Pamp Guam 208 208 Pamp Guam 208 Pamp Guam nível 1 nível 3 nível 4 nível 2 nível 2 nível 1 nível 4 nível 3 nível 3 nível 2 nível 1 nível 4
Rodar ANOVA para delineamento fatorial e Rodar ANOVA para delineamento fatorial e parcela subdividida para comparar GLs.parcela subdividida para comparar GLs.
Há diferença nos GL do erro na analise da variânciaHá diferença nos GL do erro na analise da variância
Fatorial SimplesFatorial Simples
Parcelas Subdivididas Parcelas Subdivididas
GL= n-1
SQ=
QM= SQ do tratamento GL do tratamento F = QM do Tratamento QM do erro do exper.
Copiar os dados do Excel para o Genes Copiar os dados do Excel para o Genes
Não esquecer de retirar o último espaço Não esquecer de retirar o último espaço
Salvar o arquivo Salvar o arquivo
Na página principal do Genes, seguir os passos Na página principal do Genes, seguir os passos demonstrados acima demonstrados acima
Após abrir a janela da ANOVA subdividida Após abrir a janela da ANOVA subdividida
Clicar no local indicado para abrir o arquivo que Clicar no local indicado para abrir o arquivo que será analisadoserá analisado
Clicar em Declaração Clicar em Declaração de Parâmetrosde Parâmetros
Subparcela = Níveis de manejoSubparcela = Níveis de manejo
Parcela = Genótipos Parcela = Genótipos
Em seguida clicar no 1° modelo para obter a ANOVAEm seguida clicar no 1° modelo para obter a ANOVA
Interpretar a Interpretar a ANOVAANOVA
Após exportar ANOVA par ao Excel selecionar as Após exportar ANOVA par ao Excel selecionar as matrizes disponíveis e Processá-lasmatrizes disponíveis e Processá-las
Na página inicial selecionar a opção Comparação Na página inicial selecionar a opção Comparação de Médiasde Médias
Fator1x Fator 2 Fator1x Fator 2 Genótipo x Nível Genótipo x Nível
Abrir o arquivo de medias a ser analisado Abrir o arquivo de medias a ser analisado
MANEJOQUALiMANEJOQUALimga mga = médias genótipoXambiente= médias genótipoXambiente
Revisar o arquivo das médias e em seguida clicar em sair Revisar o arquivo das médias e em seguida clicar em sair
Após abrir o arquivo, declarar os parâmetros Após abrir o arquivo, declarar os parâmetros
Abrir os QMR para o erro A e erro BAbrir os QMR para o erro A e erro B
Fator 1: Genótipo, número de efeitos =8 genótiposFator 1: Genótipo, número de efeitos =8 genótipos
Fator 2: Nível, número de efeitos = 4 níveis Fator 2: Nível, número de efeitos = 4 níveis
GL Resíduo: GL Resíduo: Olhar na Olhar na ANOVAANOVA
Uma tabela de saída Uma tabela de saída para a Comp. de Médias para a Comp. de Médias
de cada fatorde cada fator
Montar as tabelas no Excel Montar as tabelas no Excel
Comp. Médias entre NíveisComp. Médias entre Níveis
Comp. Médias entre GenótiposComp. Médias entre Genótipos
Correlação Correlação - - Existe correlação entre duas variáveis quando a Existe correlação entre duas variáveis quando a alteração sofrida por uma delas é acompanhada por alteração sofrida por uma delas é acompanhada por modificações na outra.modificações na outra.
- - Seleção indireta no melhoramento de plantasSeleção indireta no melhoramento de plantas - caracteres de dificuldade medição ou identificação- caracteres de dificuldade medição ou identificação
Definir estratégias de seleção para as gerações seguintes;Definir estratégias de seleção para as gerações seguintes;
Verificar se os caracteres tendem a permanecer associados Verificar se os caracteres tendem a permanecer associados durante os sucessivos ciclos de seleção. durante os sucessivos ciclos de seleção.
X
Y
XY
X
YX
Y
Coeficiente de Correlação simples (de Pearson)mede o grau de relação linear entre X e Y
( , )
( )* ( )
Cov X Yr
Var X Var Y=
( ) ( )
( ) ( )1
2 2
1 1
n
i ii
n n
i ii i
X X Y Yr
X X Y Y
=
= =
− −=
− −
∑
∑ ∑
1 1r− ≤ ≤
1 1 1
2 2
2 2
1 1 1 1
n n n
i i i ii i i
n n n n
i i i ii i i i
n X Y X Y
n X X n Y Y
= = =
= = = =
−=
− − ÷ ÷
∑ ∑ ∑
∑ ∑ ∑ ∑
r = 0,9 r = 0,3 r = 0
r = - 0,9
Tipos de CorrelaçãoTipos de Correlação
Tabela 1 – Classificação dos coeficientes de correlação de Tabela 1 – Classificação dos coeficientes de correlação de acordo com sua magnitude.acordo com sua magnitude.
Valor Correlaçãor = 0 nula0 < | r| ≤ 0.30 fraca0,30 < | r| ≤ 0,60 média0,60 < | r| ≤ 0,90 forte0,90 < | r| ≤ 1 fortíssima| r| = 1 perfeita
Magnitude da correlaçãoMagnitude da correlação
Significância pelo teste T de acordo com o grau de liberdade.Significância pelo teste T de acordo com o grau de liberdade.
Salvar arquivo no Genes Salvar arquivo no Genes
Rodar ANOVA para cada tratamento CF e SF Rodar ANOVA para cada tratamento CF e SF
Salvar a matriz das médias Salvar a matriz das médias
Para rodar as correlações entrar em Estatísticas Para rodar as correlações entrar em Estatísticas Descritivas na pagina inicial do GenesDescritivas na pagina inicial do Genes
Escolher a opção correlação de PearsonEscolher a opção correlação de Pearson
Abrir a matriz das médias CF Abrir a matriz das médias CF
- Em declaração de parâmetros declarar o número de - Em declaração de parâmetros declarar o número de variáveis variáveis
- Não por nada em código de valores perdidos - Não por nada em código de valores perdidos
Processar, e dar uma nome para a matriz de Processar, e dar uma nome para a matriz de saída conforme está acima saída conforme está acima
Abrir a matriz saída das correlações Abrir a matriz saída das correlações CFlemesCFlemes
Selecionar para isso a opção ‘todos tipos de arquivos’Selecionar para isso a opção ‘todos tipos de arquivos’
Exportar par ao Excel Exportar par ao Excel
Encontrar o menor de valor de Encontrar o menor de valor de correlação significativocorrelação significativo
Montar tabela e pôr os rótulos Montar tabela e pôr os rótulos
Deletar valores redundantesDeletar valores redundantes
Fazer o mesmo para o tratamento Fazer o mesmo para o tratamento sem fungicida.sem fungicida.
Abrir a matriz saída das correlações Abrir a matriz saída das correlações SFlemesSFlemes
Exportar isso para o Excel e fazer as formatações Exportar isso para o Excel e fazer as formatações necessárias.necessárias.
Formatar os dados e juntá-los numa Formatar os dados e juntá-los numa mesma tabelamesma tabela
** Valores significativos 5% de probabilidade pelo teste T, por GL= n-2Valores significativos 5% de probabilidade pelo teste T, por GL= n-2
Tabela1: Valores de correlações de Pearson entre 7 caracteres morfológicos avaliados em 14 Tabela1: Valores de correlações de Pearson entre 7 caracteres morfológicos avaliados em 14 cultivares de aveia branca sendo na diagonal superior tratamento com fungicida e na diagonal cultivares de aveia branca sendo na diagonal superior tratamento com fungicida e na diagonal inferior sem fungicida, Pato Branco 2008. inferior sem fungicida, Pato Branco 2008.
Caracteres REND PH PMG Estatura Fer.Col Fer.Fol. Man.Fol.
REND 1.000 -0.024 0.019 0.417 -0.516 -0.021 -0.149
PH 0.855* 1.000 0.030 -0.723* 0.314 -0.083 -0.146
PMG 0.429 0.298 1.000 -0.080 -0.312 -0.434 0.177
Estatura 0.584* 0.709* 0.320 1.000 -0.474 -0.221 0.181
Fer.Col -0.491 -0.584* 0.191 -0.402 1.000 0.032 0.074
Fer.Fol. 0.133 0.758* 0.078 0.570* -0.022 1.000 -0.480
Man.Fol. -0.063 0.450 0.314 -0.080 0.238 0.412 1.000
