caracterizaÇÃo aprimorada de peptÍdeos e proteÍnas · • confirmação rápida e precisa de...
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Qualitative Compound Report
MS Spectrum
IRM Calibration Status Success DA Method BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Data File Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d Sample Name NewMyo-01Sample Type Sample Position P1-B-03
Comment IntProt
Instrument Name MH Instrument User Name wadminAcq Method Intact_MyoglobinNovartis.m Acquired Time 3/4/2014 2:08:13 PM
Intact Acq + Myo-DA
6200 series TOF/6500 series Q-TOF B.06.00 (B502)
Column2Sample Group
Protein Sequence
Mass
Mod Pro�le1
Custom
Column3
horse_myo.txt16951||| Phospho&OxA,B,C
S1
Column2Info.
Mod Pro�le
Protein Sequence 1
Mass1
Custom1
Stream NameWalkup Method Description
Acquisition SW Version
Column3
||| MyoMyoglobin2.psq16951test
Compound TableMass
16951.778Sequence Name
Myoglobin (horse)Target Mass
16951.6073MaxZ
18Z Count
13Fit Score
0
RuleIntact protein
Rule
Intact proteinUncertainty
0.05Signi�cance
100Algorithm
Peak Modeling Deconvolution# Hits
3Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.dDelta ppm
10.07Height
201650689MinZ
6
998.1704
Spectrum
Spectrum
AlgorithmPeak Modeling Deconvolution
Mass16951.778
Sequence NameMyoglobin (horse)
Target mass16951.6073
Delta ppm10.07
MinZ6
MaxZ18
Z Count13
Fit Score0
Uncertainty0.05
Signi�cance100
1131.15781211.88291305.02721413.69551542.1217
MS Spectrum Peak Listm/z
998.19891060.5234
Calc m/z
1060.49311131.12551211.84831304.98991413.65521542.0777
-28.54
z
1716151413
Di�(ppm)
-28.52-28.53
Abund
23654.564051.1
121533.45159260.59
-28.53
-28.53-28.53-28.53-28.53
98
1696.18481884.53792119.9793
1884.59172120.0398
1696.2332 -28.54-28.54
--- End Of Report ---
169176.91153094.25129325.84
76638.532788.913695.6
121110
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Software Agilent MassHunter BioConfirm
CARACTERIZAÇÃO APRIMORADA DE PEPTÍDEOS E PROTEÍNAS
2
VISLUMBRE MAIS CONFIANÇA EM SUA CARACTERIZAÇÃO DE PROTEÍNAS E PEPTÍDEOS
O sofisticado software Agilent MassHunter BioConfirm oferece mais confiança em suas análises de proteínas e peptídeos. Juntamente com os sistemas (LC/MS) de cromatografia líquida/espectrometria de massas de alto desempenho da Agilent, ele fornece uma solução inteligente para a rápida confirmação de peptídeos sintéticos e caracterização de proteínas e peptídeos. Agora é possível valorizar sua descoberta confirmando seus dados com confiança e facilidade.
SOFTWARE AGILENT MASSHUNTER BIOCONFIRM
O software BioConfirm oferece:• Confirmação rápida e precisa de proteínas• Análise de lote a lote mais fácil• Mapeamento abrangente
de peptídeos
3
Contagens vs. Massa deconvoluída (amu)
2.82.42.01.61.20.80.4
0
x106
3.22.82.42.01.61.20.80.4
0
x104
144600 144800 145000 145200 145400 145600
144783.28
144946.75
145106.77
145265.67
144582.58
144786.27
144947.23 145107.68
145268.27
145583.41
(a) Máximo
(b) Modelagem de pico
Fluxo de trabalho de proteínas intactas
DeconvolutarCombinar sequências de proteínas e prever PTMs
Gerar relatórios
Integrar e extrair com MSAdquirir dados
Qualitative Compound Report
MS Spectrum
IRM Calibration Status Success DA Method BioConfirmIntactProteinHighMass-Default.m
Data File Intact_MyoglobinNewMyo-010012.d Sample Name NewMyo-01Sample Type Sample Position P1-B-03
Comment IntProt
Instrument Name MH Instrument User Name wadminAcq Method Intact_MyoglobinNovartis.m Acquired Time 3/4/2014 2:08:13 PM
Intact Acq + Myo-DA
6200 series TOF/6500 series Q-TOF B.06.00 (B502)
Column2Sample Group
Protein Sequence
Mass
Mod Pro�le1
Custom
Column3
horse_myo.txt16951||| Phospho&OxA,B,C
S1
Column2Info.
Mod Pro�le
Protein Sequence 1
Mass1
Custom1
Stream NameWalkup Method Description
Acquisition SW Version
Column3
||| MyoMyoglobin2.psq16951test
Compound TableMass
16951.778Sequence Name
Myoglobin (horse)Target Mass
16951.6073MaxZ
18Z Count
13Fit Score
0
RuleIntact protein
Rule
Intact proteinUncertainty
0.05Signi�cance
100Algorithm
Peak Modeling Deconvolution# Hits
3Data File
Intact_MyoglobinNewMyo-010012.dDelta ppm
10.07Height
201650689MinZ
6
998.1704
Spectrum
Spectrum
AlgorithmPeak Modeling Deconvolution
Mass16951.778
Sequence NameMyoglobin (horse)
Target mass16951.6073
Delta ppm10.07
MinZ6
MaxZ18
Z Count13
Fit Score0
Uncertainty0.05
Signi�cance100
1131.15781211.88291305.02721413.69551542.1217
MS Spectrum Peak Listm/z
998.19891060.5234
Calc m/z
1060.49311131.12551211.84831304.98991413.65521542.0777
-28.54
z
1716151413
Di�(ppm)
-28.52-28.53
Abund
23654.564051.1
121533.45159260.59
-28.53
-28.53-28.53-28.53-28.53
98
1696.18481884.53792119.9793
1884.59172120.0398
1696.2332 -28.54-28.54
--- End Of Report ---
169176.91153094.25129325.84
76638.532788.913695.6
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Espectros deconvoluídos. (a) Máxima entropia para espectro deconvoluído. (b) Modelagem de pico para espectro deconvoluído.
VISLUMBRE A CONFIRMAÇÃO PRECISA DE PROTEÍNAS
O BioConfirm fornece deconvolução clássica por entropia máxima e modelagem de pico otimizada (pMod) para determinar o peso molecular de proteínas intactas.
A deconvolução por entropia máxima fornece rápida resolução de massas, especialmente para misturas de proteínas simples. Para misturas de proteínas complexas, o algoritmo otimizado pMod remove artefatos do espectro e ajuda a resolver a sobreposição de picos, mesmo as sobreposições mais severas, fornecendo espectros mais limpos e medição de massas mais precisa. Isso permite a confirmação rápida de sequências e modificações de proteínas intactas.
O software BioConfirm oferece:• Confirmação rápida e precisa de proteínas• Análise de lote a lote mais fácil• Mapeamento abrangente
de peptídeos
4
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
7.26.66.05.44.84.23.63.02.41.81.20.6
0
x104
100 200 300 400 500 600 700 800 900 1,000 1,100
Fluxo de trabalho do mapeamento de peptídeos
Combinar sequências de proteínas e identificar PTMs
Visualizar cobertura da sequência
Gerar relatórios
Extrair compostosAdquirir dados
O BioConfirm fornece processamento aprimorado de dados de MS para mapeamento racionalizado e interpretação de dados.
VISLUMBRE UMA PODEROSA CAPACIDADE DE MAPEAMENTO DE PEPTÍDEOS
O BioConfirm identifica peptídeos e PTMs baseado em massas de peptídeos e íons produto (b, y, e íons imônio) nos espectros de MS/MS. Isto permite um processamento mais rápido e racionalizado de dados MS/MS para o mapeamento de peptídeos.
Atribuição de íon produto do espectro de MS/MS de peptídeos.
5
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
1.050.9
0.750.6
0.450.3
0.150
x102
100 400 700 1,000 1,300 100 400 700 1,000 1,300
Contagens vs. Massa/Carga (m/z)
0.8
0.5
0.2
-0.1
x102
0.8
0.5
0.2
-0.1
x102
300 450 600 750 900 1050 1,200 1,350 1,500 1,650
Contagens vs. Massa deconvoluída (amu)
2.4
1.8
1.2
0.6
0
-0.6
-1.2
-1.8
-2.4
-3.0
-3.6
x103
147100 1474000 147700 148000 148300 148600 148900
VISLUMBRE UMA COMPARAÇÃO FÁCIL DE LOTE A LOTE
O BioConfirm fornece uma comparação visual fácil entre amostras, permitindo a análise rápida de lote a lote em níveis de proteínas e peptídeos.
A funcionalidade do gráfico espelhado permite a comparação rápida e confiável de duas amostras, assim como dois lotes de uma proteína projetada ou biossimilares, uma parte essencial da análise biofarma-cêutica. As amostras podem ser alternadas de forma rápida no gráfico espelhado, sem reprocessamento dos dados.
Monitoramento de biossimilares e variação de lote a lote comparando amostras e referências rapidamenteO módulo de análise comparativa facilita a identificação e visualização das diferenças entre os dois lotes de dados para fácil inspeção. As amostras podem ser comparadas com uma referência utilizando cromatogramas, MS, e espectros de MS/MS. Gráfico espelhado de duas proteínas projetadas.
Resultados de comparação do espectro de MS/MS.
Resultados de comparação do espectro de MS.
6
Fluxo de trabalho de glicanos de anticorpos monoclonais
Extrair compostosPesquisar banco de dados e identificar glicanos
Calcular porcentagem e gerar relatório
Adquirir dados
N
VISLUMBRE A ANÁLISE DE GLICANOS DE mAb DE FORMA RÁPIDA E PRECISA
O BioConfirm permite aos usuários identificar e visualizar precisamente estruturas de glicanos em suas amostras de anticorpos monoclonais usando o PCD (Personal Compound Database, banco de dados de compostos pessoais) de glicanos da Agilent e modificações predefinidas de glicanos abrangentes. Usando o mAb-Glyco Chip da Agilent, os clientes obtêm um fluxo de trabalho abrangente para análises de glicanos incluindo hardware, software, e consumíveis. Um completo fluxo de trabalho que inclui desglicosilação on-chip de anticorpos monoclonais, assim como o enriquecimento, a separação cromatográfica e a detecção dos glicanos clivados. Todas as atividades, incluindo o processamento de dados usando o BioConfirm, podem ser concluídas em menos de 15 minutos.
O BioConfirm fornece um fluxo de trabalho fácil e efetivo para a análise de glicanos de anticorpos monoclonais.
7
Envio de amostras em três passos fáceis
Inserir informações da amostra
Colocar vial no ALS (amostrador automático de líquidos)
Relatórios entregues à caixa de entrada de e-mails
Login
1 2 3
VISLUMBRE UMA ANÁLISE DE ACOMPANHAMENTO PARA USUÁRIOS INEXPERIENTES
O BioConfirm é parte da solução MassHunter Walkup da Agilent.
O MassHunter Walkup fornece uma interface fácil de usar, que oferece aos usuários iniciantes a capacidade de analisar amostras de proteínas e peptídeos em três passos fáceis com um mínimo de treinamento. Os usuários não precisam se preocupar com condições de espectrometria de massas complexas; em vez disso, podem executar suas amostras com a aquisição e métodos de processamento de dados. Os resultados são enviados diretamente aos seus e-mails.
Saiba mais www.agilent.com/chem/masshunter
Encontre um centro de atendimento local ao cliente Agilent www.agilent.com/chem/contactus
Brasil 0800-728-1405 [email protected]
Europa [email protected]
Ásia-Pacífico [email protected]
Somente para uso em pesquisas. As informações, descrições e especificações nesta publicação estão sujeitas a mudanças sem aviso prévio. A Agilent Technologies não será responsável por erros contidos neste documento ou por danos incidentais ou consequenciais em relação ao fornecimento, desempenho ou uso deste material.
© Agilent Technologies, Inc., 2014 Publicado nos Estados Unidos, 07 de abril de 2014 5991-3643PTBR