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LGN 5799 - SEMINÁRIOS EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas Departamento de Genética Avenida Pádua Dias, 11 - Caixa Postal 83, CEP: 13400-970 - Piracicaba - São Paulo - Brasil Telefone: (0xx19) 3429-4250 / 4125 / 4126 - Fax: (0xx19) 3433-6706 - http://www.genetica.esalq.usp.br/semina.php A BIOTECNOLOGIA NO MELHORAMENTO DA CANA-DE-AÇÚCAR Aluno: João Fernando Bortoleto Orientador: Antonio Vargas de Oliveira Figueira

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Page 1: Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de ... · Introgressão e identificação de QTLs Estreita base genética Marcas ligadas a genes de interesse (Erianthus arundinaceous)

LGN 5799 - SEMINÁRIOS EMGENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS

Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas

Departamento de GenéticaAvenida Pádua Dias, 11 - Caixa Postal 83, CEP: 13400-970 - Piracicaba - São Paulo - Brasil

Telefone: (0xx19) 3429-4250 / 4125 / 4126 - Fax: (0xx19) 3433-6706 - http://www.genetica.esalq.usp.br/semina.php

A BIOTECNOLOGIA NO MELHORAMENTO DA CANA-DE-AÇÚCAR

Aluno: João Fernando BortoletoOrientador: Antonio Vargas de Oliveira Figueira

Page 2: Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de ... · Introgressão e identificação de QTLs Estreita base genética Marcas ligadas a genes de interesse (Erianthus arundinaceous)

SUMÁRIO

introduçãobiotecnologianovas abordagensdesafios e perspectivasconsiderações finais

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INTRODUÇÃO

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INTRODUÇÃOaspectos socioeconômicos

1532: Grandes Navegações

Preço do açúcar Monocultura Grande propriedade Escravidão 1630: Invasão

holandesa Decadência

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INTRODUÇÃOaspectos socioeconômicos

Crise do petróleo 1975: Programa Nacional do Ácool

(Proácool) Crise de 1989

Uso de álcool na gasolina

Brasil: maior produtor

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INTRODUÇÃOaspectos socioeconômicos

Safra 2006/07 R$ 41 bilhões 3,65% PIB

420 milhões ton 5,82 milhões ha

30 milhões ton

17,5 bilhões L

Unicamp/CTC/Procana

60% da produção

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INTRODUÇÃO

Divisão Magnoliophyta

Classe Liliopsida

Ordem Poales

Família Poaceae

Gênero Saccharum

Espécies: S. barberi, S. edule, S. officinarum, S. robustum, S. sinense, S. spontaneum

taxonomia

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INTRODUÇÃOtaxonomia

S. officinarum S. spontaneum

híbrido

Saccharum spp.

INTRODUÇÃO

Grande produtividade, melhor capacidade de enraizamento e resistência a doenças

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S. officinarum2n=80; X=10

S. spontaneum2n=48-128; X=8

2n=808X=80

octaplóide

2n=8010X=80

decaplóide

INTRODUÇÃOgenoma D´Hont et al., 1998

18S-5,6S-25S

5S

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INTRODUÇÃOgenoma

S. officinarum2n=8X=80

S. spontaneum2n=6-16X=48-128

híbrido

Saccharum spp.2n=100-130

INTRODUÇÃO

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INTRODUÇÃOgenoma

S. officinarum

S. spontaneum

D´Hont et al., 1996

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Poliploidia e aneuploidia 15-20%: genoma de S.

spontaneum Menos de 5%: cromossomos

translocados

INTRODUÇÃOgenoma Grivet e Arruda, 2002

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1. Célula somática (2C)2. Célula gamética (1C)3. Conjunto monoplóide

INTRODUÇÃOgenoma

Genoma grande: 7440 Mpb Octaplóide (S. officinarum)

930 Mpb Maior que gameta do sorgo: 760

Mpb Duas vezes maior que gameta do

arroz: 430 Mpb

Grivet e Arruda, 2002

Cana-de-açúcar(Saccharum officinarum)

Sorgo(Sorghum bicolor)

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INTRODUÇÃOmelhoramento

www.ctcanavieira.com.brpmgca.dbv.cca.ufscar.br

www.iac.sp.gov.br/Centros/CentroCANA/PRINCIPAL.htm

Necessidade de integração do melhoramento convencional e

molecular para superar o desafio de manter a indústria lucrativa no futuro

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BIOTECNOLOGIA

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por quê?

Genoma complexo: estrutura e recombinação Base genética estreita Baixa fertilidade Susceptibilidade a doenças e pragas Longo ciclo de seleção para produção de

cultivares de elite

BIOTECNOLOGIA

dificuldades no

melhoramento

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progressos

Genômica Cultura de células e

tecidos Transformação genética

de cultivares Desenvolvimento de

mapas genéticos Diagnóstico molecular de

patógenos Estudo das bases

moleculares do acúmulo de sacarose

BIOTECNOLOGIA

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genômica

Técnicas de sequenciamento

eficientes SUCEST (The Sugarcane

EST Project) Mais de 260.000

sequências expressas Vários tecidos e estágios

de desenvolvimento Ao menos 90% das ESTs

de cana-de-açúcar anotadas

BIOTECNOLOGIAVettore et al., 2003

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cultivo in vitro

Micropropagação Multiplicação

clonal Meristemas apical

e axilar Regeneração

direta: estabilidade genética e fenotípica

Lakshmanan et al., 2006

BIOTECNOLOGIA

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cultivo in vitro

Embriogênese somática Tipo de calo Tecidos foliares (meristemas) Idade e posição do explante 2,4-D (ácido 2,4-diclorofenoxiacético) Transformação genética

Cidade et al., 2006Niaz e Quraishi, 2002

BIOTECNOLOGIA

Snyman et al., 1996

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cultivo in vitro

Outras aplicações Conservação de germoplasma

Produção de plantas sadias para plantio comercial

BIOTECNOLOGIA

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Tecnologias iniciais Polietilenoglicol (PEG): primeiros calos transgênicos Eletroporação: calos com estabilidade do transgene

protoplastos

Dificuldades na

regeneração

transformação genéticaBIOTECNOLOGIA

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Agrobacterium

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Gelvin, 2005

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Agrobacterium Desarmamento de cepas

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

Brasileiro e Carneiro, 1998

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Agrobacterium Vetores binários

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

Brasileiro e Carneiro, 1998

Komori et al., 2007

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Agrobacterium Construção de vetores por recombinação

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Komori et al., 2007

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Agrobacterium Vetores superbinários

Komari et al., 1996

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

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Agrobacterium Marcador visual: β-glucuronidase (GUS) Calos

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Arencibia et al., 1998

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Agrobacterium Plantas resistentes a BASTA Frequência de transformação: 35%

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Enríquez-Obregón et al., 1998

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Agrobacterium Marcador visual: proteína verde fluorescente (GFP) Seleção de linhagens transgênicas

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Elliott et al., 1998

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Agrobacterium Gemas axilares Elevada eficiência de

transformação:50% Plantas resistentes a

BASTA

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Manickavasagam et al., 2004

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Agrobacterium Tipo de cepa Dependência de genótipo Prevenção de morte celular Calos jovens e regeneráveis Tecidos foliares jovens pré-induzidos à embriogênese

somática Gemas axilares

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

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Biobalística Método mais amplamente explorado

www.bio-rad.com

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

membrana carreadora

câmara de gásem alta pressão

tela de retenção

membranade ruptura

micropartículascélulas-alvo

prateleira

aparato de lançamento

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Biobalística

BIOTECNOLOGIAtransformação genética Bower e Birch, 1992

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Biobalística Brasil: plantas resistentes a herbicida, broca da

cana-de-açúcar e com acúmulo de prolina

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

Christensen e Quail, 1996 Falco et al., 2000

Christensen e Quail, 1996 Falco e Silva-Filho, 2003

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Biobalística Disponibilidade de

equipamento Método de alta

aplicabilidade e versatilidade

BIOTECNOLOGIAtransformação genética

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DESAFIOS E PERSPECTIVAStransgênicos Lakshmanan et al., 2005

Características engenheiradas Sistemas repórter ou de

seleção Resistência a herbicidas Resistência a doenças Resistência a pragas Modificações

metabólicas e produtos alternativos

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NOVAS ABORDAGENS

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas

Produtos alternativos com alto valor agregado Competitividade e sustentabilidade 100 proteínas recombinantes já produzidas

em plantas Proteínas virais Vacinas Peptídeos antimicrobianos Fármacos Anticorpos Compostos industriais

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas

Por que a cana-de-açúcar? Crescimento Biomassa Fixação de carbono Sistema de armazenamento Propagação vegetativa Cultivo

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Fator estimulante de colônias de macrófagos granulócitos humanos (GM-CSF)

Aplicações clínicas Acúmulo limitado a 0,02% do total de proteínas

solúveis em plantas sob condições de campo Ainda inviável economicamente

NOVAS ABORDAGENSbiofábricas Wang et al., 2005

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas McQualter et al., 2005

corismato piruvato-liase

4-hidroxicinamoil-CoA-hidratase/liase

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Ácido p-hidróxi-benzóico(pHBA)

Biopolímero Até 7,3% do peso seco das

folhas e 1,5% do colmo Sem anormalidades no

crescimento e desenvolvimento

NOVAS ABORDAGENSbiofábricas McQualter et al., 2005

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas

Poli-3-hidroxibutirato (PHB) Produto biodegradável 1,88% do peso seco das folhas 0,004% do peso seco do colmo Sem prejuízos ao crescimento e

desenvolvimento

Petrasovits et al., 2007

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas Petrasovits et al., 2007

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NOVAS ABORDAGENSbiofábricas Chong et al., 2007

sorbitol-6-fosfato desidrogenase

glicoquisane

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Sorbitol Acoplamento com

intermediários do metabolismo de sacarose

120 mg/g de peso seco da folha (61% dos açúcares solúveis)

10 mg/g peso seco do caule Comprometimento do

crescimento Acúmulo de níveis

expressivos

NOVAS ABORDAGENSbiofábricas Chong et al., 2007

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DESAFIOS E PESPERCTIVAS

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Pontos-chave Promotores

Otimização de codons Técnica de transformação

Uso de chaperonas Endereçamento de produtos

para organelas Transformação de

cloroplastos

DESAFIOS E PERSPECTIVAStransgênicos/biofábricas

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DESAFIOS E PERSPECTIVASmarcadores moleculares

Origem da cana-de-açúcar comercial “Complexo Saccharum”: Saccharum, Miscanthus,

Erianthus, Sclerostachya e Narenga Hibridação? Altamente contrastantes

Diversidade e identificação de variedades Altamente heterozigótica (porção do genoma de S.

spontaneum) SSR para identificação de cultivares

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DESAFIOS E PERSPECTIVASmarcadores moleculares Grivet e Arruda, 2002

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DESAFIOS E PERSPECTIVASmarcadores moleculares

Introgressão e identificação de QTLs Estreita base genética Marcas ligadas a genes de interesse (Erianthus

arundinaceous) RAPD, RFLP, SSR ---> SNPs e DArT Busca de QTLs Melhoria de ferramentas biométricas

Marcadores moleculares para diagnóstico Ácidos nucléicos Diversas doenças Dependência dos avanços genômicos

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Aumento da biomassa x aumento daconcentração de sacarose Estratégia?

Manipulação de enzimas sacarose fosfato sintase (SPS) e invertases (INV) Sucesso limitado

Bases moleculares do balanço metabólico Crescimento x armazenamento

DESAFIOS E PERSPECTIVASacúmulo de sacarose

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CONSIDERAÇÕES FINAIS

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Potencial dos programas genômicos

Estrutura, função e interação de genes

Revolução na biotecnologia

Melhoramento molecular ilimitado

CONSIDERAÇÕES FINAIS

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