estrutura das proteÍnas -...

32
ESTRUTURA DAS PROTEÍNAS

Upload: phungtu

Post on 08-Nov-2018

217 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

ESTRUTURA

DAS

PROTEÍNAS

Ligações

de

hidrogênio

Interações

hidrofóbicas e

hidrofílicas

Ligações dissulfeto

Interações

iônicas

Aminoácidos ligam-se por ligações

peptídicas = reação de condensação entre:

–OH do grupo carboxila de um aminoácido

–H do grupo amina do outro aminoácido

( liberação de uma molécula de água)

As cadeias laterais (radicais) dos

aminoácidos polimerizados livres

interagem entre si e com a água

Forças usadas para a manutenção

da estrutura tridimensional das

proteínas - conformação

Esqueleto polipeptídico

A conformação de uma proteína é fundamental para a

função que ela exerce

• Perda da conformação ou da

estrutura tridimensional da

proteína = perda da função e das

características naturais da molécula

4 níveis estruturais

Estrutura primária, secundária, terciária e quaternária

Como é a estrutura das proteínas???

Mantidas por:

•ligações covalentes (ligação peptídica e ligação dissulfeto

•forças fracas ( ligações de hidrogênio, interações

hidrofóbicas / hidrofílicas e iônicas

Estrutura primária

sequência linear

dos aminoácidos

unidos por ligações

peptídicas

Estrutura terciária

arranjo

tridimensional da

cadeia polipeptídica,

interações entre

aminoácidos mais

distantes

Estrutura secundária

conformação local de

alguns regiões da

cadeia polipeptídica

(-hélice, -pregueada

e dobras β)

Estrutura quaternária

arranjo tridimensional

de diferentes cadeias

polipeptídicas

Estrutura primária das proteínas

Seqüência de aminoácidos unidos por ligações peptídicas

Terminal amino e carboxila

Número variável de resíduos de aminoácidos

Tamanho diferentes das moléculas – número de resíduos

Composição

diferente de

aminoácidos

Sequencia de aminoácidos determinada pelo material genético do

organismo – comparação entre organismos

Através da análise da sequencia

dos aminoácidos de um proteína

pode-se avaliar a relação

evolutiva entre as espécies ou

comparar espécies similares

Estrutura secundária das proteínas

conformação em - hélice

conformação -pregueada

dobra

Mantida por ligações de hidrogênio

entre aminoácidos próximos

Conformação em -hélice

Arranjo tridimensional

que a cadeia polipeptídica

assume conformação

helicoidal ao redor de um

eixo imaginário

Mantida por ligações de

hidrogênio entre os grupos C=O

e o N-H da ligação peptídica

quatro resíduos subsequentes.

Cada volta da hélice inclui 3,6

resíduos de aminoácidos

O hidrogênio do carbono

fica para dentro da hélice

enquanto as cadeia laterais

ficam para o lado de fora

A presença de grupos grandes,

eletricamente carregados ou polares

ou de Pro e Gli desestabilizam a

estrutura da -hélice

Conformação -pregueada

Cadeia polipeptídica estende-se em zigzag e

podem estar arrumadas lado a lado formando um

estrutura chamada folhas pregueada

Folhas pregueada

Ligações de H são formadas entre as cadeias

adjacentes (C=O e o N-H da ligação peptídica)

Existem dois tipos de folhas pregueada

Paralelas – mesma orientação

das cadeias (terminal amino e

carboxílico)

Anti-Paralelas –orientação

oposta das cadeias (terminal

amino e carboxílico)

Proteínas globulares podem apresentar essas duas

estruturas, entretanto para ficar compacta a cadeia

deve apresentar dobras (representações)

-hélice +

Conformação

Conformação

-hélice

Dobras Elemento de conexão entre as regiões com

estrutura secundária diferentes ou não

Dobras compreende uma estrutura que causa uma volta

de 180º

Envolve 4 aminoácidos

Forma ligação de Hidrogênio entre oxigênio da carboxila do

primeiro resíduo com o H do grupo amina do quarto resíduo

Resíduos 2 e 3 não

participam de nenhuma

interação

Dobras são encontradas

normalmente na superfície

das proteínas – ligações de

H dos resíduos 2 e 3

(cadeia lateral) com a água

Estrutura terciária e

quaternária das proteínas

Grupo

Heme

Estrutura terciária - arranjo tridimensional da

cadeia peptídica estabilizado por interações entre

grupos de aminoácidos distantes

Estrutura quaternária - arranjo entre cadeias

polipeptídicas (subunidades) que constituem um

proteína ativa

Mantida por

interações fracas

(ligações de H,

ligações iônicas e

interações

hidrofóbicas) e /ou

ligações dissulfeto

entre resíduos

distantes na

própria molécula

ou das

subunidades.

Tanto as proteínas fibrosas como as globulares

podem se associar para desempenhar uma função

biológica (estrutura quaternária)

Monomérica – uma unidade

Oligomérica – poucas subunidades (dímero, trímero,

tetrâmero...)

Multímero – proteína ou complexo proteico formado

por muitas subunidades polipeptídicas

Unidades de repetição - protômeros

Quanto ao número de subunidades as proteínas podem ser:

Hemoglobina – tetrâmero (quatro unidades) duas cadeias e duas cadeias

Pode ser considerada

um dímero de dois

protômeros

(unidade repetitiva)

RUBISCO

8 cadeias pequenas

8 cadeias grandes

Oligômero (16 cadeias

ou 8 protômeros)

Virus do mosaico do

Tabaco - cápsula de

proteínas - Multímero

Com relação à estrutura e sua função biológica

as proteínas podem ainda ser classificadas em

Fibrosas e Globulares

Proteínas Fibrosas

Função – estrutural, suporte e proteção

Cadeias longas e folhas

Tipo simples de estrutura secundária

Caracterizadas por proporcionar resistência e

flexibilidades às estruturas onde ocorrem

São insolúveis em água

Estruturas principais:

• α – Queratinas

• Colageno

• Fibroina

Cabelo, unhas,

cascos, chifres, lã,

penas e camada

externa pele.

Rica em resíduos

hidrofóbicos

(Ala, Val, Leu, Ile, Met e Phe)

Arranjo similar - formam

estruturas superenoveladas

que se agrupam formando

filamentos

Interações hidrofóbicas entre

cadeias laterais dos

aminoácidos e ligações

dissulfeto mantem a estrutura

Monômero

Dímero enovelado

Protofibrila

Fibrila

Filamento

Um fio de cabelo é

formado por

muitos filamentos

α – Queratinas

Estrutura secundária – hélice

orientada para a direita

Colágeno Tendões, cartilagens,

córnea, matriz orgânica

ossos

3 resíduos de aminoácidos que se

repetem Gly-X-Pro ou Gly-X-HyPro

(X qualquer aminoácido)

Estrutura secundaria em hélice

voltada para a esquerda

Estrutura quaternária 3 cadeias

enroladas

Formam fibrilas - estrutura mantidas

por algumas ligações covalentes não

habituais (Lys – HyLis ou His)

Gelatina – derivada do colágeno –

baixo valor nutricional humano pelos

aminoácidos que a constituem

Fibroína

Fios de seda e teia de aranha

Estrutura secundária - β - pregueada

Rica em Ala e Gly - cadeias lateais pequenas e empacotamento

dos grupos R

Fibras são

camadas de folhas

β antiparalelas

arranjadas

densamente

Estrutura mantida

por ligações de

hidrogênio

Proteínas Globulares

Função – enzimas, reguladoras, transporte e de defesa

Cadeias esféricas ou globulares

Diversos tipos de estrutura secundária

Cadeia polipeptídica se dobra formando uma estrutura

compacta - diversas estruturas e funções

Grupos hidrofóbicos interior e hidrofílicos exterior –

pontes H com a água - solúveis

Diversidade estrutural

Mioglobina Imunoglobulina

Amilase salivar

RUBISCO

• Aumento de temperatura;

• Extremos de pH;

• Solventes orgânicos miscíveis com a água (etanol e acetona);

• Solutos (uréia); Sais (sulfato de amônio);

• Exposição da proteína a detergentes;

• Agitação mecânica vigorosa da solução proteica até formação

abundante de espuma.

Estrutura proteína esta relacionada com sua conformação

Conformação é em grande parte determinada pelas

interações fracas entre as cadeias laterais (R) dos

aminoácidos

Forças que possam influenciar forças mantem estrutura

das proteínas podendo mudar sua conformação

Perda da estrutura tridimensional = desnaturação

Perda da conformação de uma proteína = perda função

e características (solubilidade)