O Jardim Botânico do Rio de Janeiro como provedor de informações de qualidade sobre a biodiversidade

vegetal brasileira

Eduardo DalcinInstituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro

Diretoria de PesquisasNúcleo de Computação Científica e Geoprocessamento

Brasília- Maio de 2012

Tópicos da Apresentação• O Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro• Diretoria de Pesquisa• Escola Nacional de Botânica Tropical• Rodriguésia• Coleções Científicas• Centro Nacional para Conservação da Flora (CNCFlora)• Lista de Espécies da Flora do Brasil• Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento• Sistemas de Informação sobbre Biodiversidade• Projeto REFLORA• Desenvolvimento de Sistemas• Infraestrutura computacional• O JBRJ e o SiB-Br

O Instituto de Pesquisas Jardim Botânico

• Criado em 1808 (204 anos de existência)• Autarquia do Ministério do Meio Ambiente (2001)• “...Promover, realizar e divulgar o ensino e as pesquisas

técnico-científicas sobre os recursos florísticos do Brasil, visando o conhecimento e a conservação da biodiversidade, bem como manter as coleções científicas sob sua responsabilidade, competindo-lhe, em especial, com as diretrizes das políticas nacionais de meio ambiente fixadas pelo Ministério do Meio Ambiente.”

Diretoria de Pesquisa• 52 Pesquisadores (51 Doutores)• Indicadores 2010

– 290 projetos de pesquisa• 17 Institucionais

– 334 artigos em periódicos– 104 capítulos de livros– 15 livros

Diretoria de Pesquisas do JBRJ Produção de Artigos 2005-2009

0

20

40

60

80

100

2005 2006 2007 2008 2009

Total deArtigos

Artigos noISI Web ofScience

• Rede Laboratorial– Botânica Estrutural– Sementes– Micologia– Cultivo de Algas – Biologia Molecular

• Credenciada junto a ANP

Diretoria de Pesquisa

Escola Nacional de Botânica Tropical

• Criada em 2001• Programa de Pós-graduação strictu sensu

reconhecido pelo MEC/CAPES• Programa de Pós-graduação lato sensu• 21 Docentes• 2003 – 2011

– 79 dissertações de mestrado– 25 teses de doutorado

• Áreas de concentração– Diversidade Vegetal– Ecologia de Ecossistemas Neotropicais

• Mestrado Profissional aprovado pela CAPES (2011)– Biodiversidade em Unidades de Conservação

http://www.jbrj.gov.br/enbt/

 Artigos 2006 2007 2008 2009 2010

Recebidos 61 93 97 158 192

Publicados 37 55 60 62 77

Recusados 12 41 37 34 49

Espécies novas 4 5 11 9 56

Português 31 45 51 53 52

Inglês 5 8 8 9 21

Espanhol 1 2 1 --- 7

tempo (meses) 20 12 10 9 6

RodriguésiaCriada em 1935, a Revista publica, trimestralmente, artigos científicos originais, de revisão, de opinião e notas científicas em diversas áreas da Biologia Vegetal (taxonomia, sistemática e evolução, fisiologia, fitoquímica, ultraestrutura, citologia, anatomia, palinologia, desenvolvimento, genética, biologia reprodutiva, ecologia, etnobotânica e filogeografia), bem como em História da Botânica e atividades ligadas a Jardins Botânicos.http://rodriguesia.jbrj.gov.br/

Coleções Científicas

• 550.000 amostras no Herbário– 6.000 typus– 20.000 fotos

• 7.000 amostras na Carpoteca• 8.200 amostras na Xiloteca• 30.000 amostras no Laminário• 5.298 amostras no

• Criado em 2008• Objetivos Gerais

– Coordenar a Lista de Espécies da Flora do Brasil– Coordenar a Lista Oficial de Espécies da Flora

Ameaçadas de Extinção– Elaborar Programa de Pesquisas e Conservação

em Ecossistemas de Montanhas do Brasil– Contribuir para o alcance das metas nacionais da

GSPC/CDB

Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento

• (Re)Criado em Abril de 2010• Atribuições:

– Realizar a administração de dados científicos da Diretoria de Pesquisas do JBRJ – DIPEQ;

– Coordenar o desenvolvimento de uma estrutura de suporte à modelagem computacional aplicada à biodiversidade;

– Desenvolver e implementar as atividades relacionadas com a mineração de dados;

– Desenvolver e implementar a prestação de serviços de geoprocessamento como apoio à pesquisa científica;

– Propor ao Diretor de Pesquisas programas de capacitação permanente nas áreas de bancos de dados para a biodiversidade, geoprocessamento, modelagem computacional, análise, visualização, mineração e qualidade de dados, além de supervisionar a execução de tais programas;

– Propor ao Diretor da DIPEQ a realização de acordos e parcerias com outras instituições, objetivando o desenvolvimento de projetos relacionados com as atividades do núcleo e o atendimento das demandas da DIPEQ nesta área.

Sistemas de Informação sobre Biodiversidade no JBRJ

JABOT

• 2003• Coleções

Científicas

Lista da Flora do Brasil

• 2009• Desenvolvido e

hospedado pelo CRIA

Espécies Ameaçadas(CNCFlora)

• 2010• Catálogo de

Metadados• Avaliação de Risco

de Extinção• Avaliação de Status

de Conservação

JABOT

Lista de Espécie da Flora do Brasil

Sistema CNCFlora

Catálogo de

Metadados

Referência Bibliográficas

Contatos(especialistas)

Taxon

Locais

Expedições

Recursos deInformação

Endereços Web

Conhecimento Sistematizado

Lista de Spp. Ameaçadas

Apresentações

Documentos

Dados Estruturados

Eventos

Vídeos

Imagens

Software

Lista doBrasil Planos de

Ação

PortfólioDe Espécies

Sistema de Espécies

Ameaçadas

JABOT(Coleções

Científicas)

Lista de Espécies da

Flora do Brasil

Sistema do CNCFlora

Situação Atual

Novo cenário institucional - 2011

• Lista oficial de espécies da flora brasileira (2008/2009)– MMA/PROBIO II

• Lista oficial das espécies ameaçadas da extinção da flora brasileira (2008/2009)– MMA/PROBIO II

• Lista da flora do Rio de Janeiro (2010)– FAPERJ

• Herbário Virtual “autenticado” das plantas repatriadas (K e P) – Projeto REFLORA - 2011– CNPq– NATURA– FAPERJ

Muséum National d’Histoire NaturelleParis

Royal Botanic Gardens , KewLondres

Jardim Botânico do Rio de Janeiro

Plantas do Brasil: Resgate Histórico e Herbário Virtual para oConhecimento e Conservação da Flora Brasileira

“REFLORA”

Objetivo Geral

O projeto tem como objetivo a construção de um Herbário Virtual de acesso público, abrangendo as amostras coletadas no território brasileiro, nos séculos 18, 19 e 20 (até 1970), e que estão depositadas nos herbários Royal Botanic Gardens, Kew e do Muséum National d’Histoire Naturelle de Paris.

Componentes

Captura de Dados

Adequação da Infraestrutura

Desenvolvimento de Sistemas• JABOT 2 – Herbário Virtual

Manipulação e Tratamento de Dados

Banco de dados textual

Banco de imagens

Herbário Virtual

Outros herbários virtuais e agregadores

Em números

Instituição No. de imagens ~ em TB (x 200MB)

JBRJ 550.000 104,8

KEW 40.000 7,6

Paris 280.000 53,4

TOTAL 870.000 165,8

Desenvolvimento

Infraestrutura

Parcerias Envolvidas

POLI

Desenvolvimento“JABOT2”

Núcleo Taxonômico

ColeçõesCientíficas

Espécies Ameaçadas

Floras(RJ, BR,

etc.)

JABOT2

Consulta

AtualizaçãoE validação

Serviços

Conservação(Espécies Ameaçadas)

Taxonomia(Floras)

Testemunhos(Coleções)

JABOT2

Arquitetura Orientada a Serviços

Núcleo Taxonômico

ColeçõesCientíficas

Espécies Ameaçadas

Floras(RJ, BR, etc.)

JBRJ

IPNI

The Plant List

KEW

etc...

BiotaFAPESP

ServiçoFlorestalBrasileiro

Infraestrutura Computacional

• Processamento• Armazenagem• Conectividade

Infraestrutura Computacional Compartilhada*

• 10 Servidores arquitetura “Blade Servers”– “Lâminas” com 72GB de RAM e 12 núcleos (Xeon

2.93Ghz)

* Parceria com o MuMA - Recursos do BNDES

Infraestrutura Computacional Compartilhada

• Unidade de Armazenamento (“NAS”)– FAS3240 Cluster com 100TB líquidos (exp. 715TB)– 1TB FlashCache– Centro de Distribuição de Dados do SINAPAD

DIPEQ

Museu BotânicoCTIC

“Anel Coletor”24 Fibras ÓticasVelocidade 10Gbits/seg (atual 100Mbits/seg)

LNCC

Internet

Internet

Cenário atual e oportunidades• Listas oficiais

– Espécies da flora– Espécies ameaçadas

• Herbário Virtual (REFLORA)– Infraestrutura– Desenvolvimento– Parcerias estratégicas

• LNCC• PESC/COPPE

• Formalização do Núcleo de Computação Científica e Geoprocessamento– 2 doutores– 1 doutorando– 2 técnicos– 3 bolsistas

• 1 mestre• 1 doutor• 1 graduando

• Instituição reconhece como estratégico a produção, gestão e divulgação de informação de qualidade sobre biodiversidade

Otimizar a utilização dos

recursos

Mapa Estratégico do JBRJDesenvolver ações para a conservação

da biodiversidade e dos acervoscientífico e histórico-cultural...

Sociedade

Processos Internos

Aprendizado e Crescimento

FinançasAmpliar a dotação

orçamentária

Aperfeiçoar as edificações do

JBRJ

Ampliar a captação de recursos externos

Melhorar a qualidadedos gastos

Melhorar a infra-estrutura de TI e

segurança da informação

Promover a transformação da cultura

organizacional

Aumentar a eficiência dos

processos

Intensificar atividades científicas e culturaisno Museu do Meio Ambiente, Espaço

Tom Jobim...

Ampliar a receita própria

Promover a integração entre as diversas linhas de ações

institucionais

Promover ações paratornar a instituição um

qualificado provedor de dados de biodiversidade

Ampliar a ofertade cursos de pós-

graduaçãoe extensão

Difundir o conhecimento científico relacionada à

biodiversidade, com ênfase na flora

Formar recursos humanos em Botânica e ciências

correlatas

Gerar conhecimento científico relacionado

à flora nativa

Subsidiar a formulação ea execução das políticas

públicas de meio ambiente

Melhorar a avaliação do PPG (ENBT)

na CAPES

Conservar e ampliar acervo científico e histórico-cultural

Possuir quadro de pessoal comprometido e adequado

quantitativa e qualitativamente

O JBRJ e o SiB-Br

SiB-Br

Fauna

Lista de Espécies

Registro de Testemunhos

Conhecimento Sistematizado

Flora

Lista de Espécies

Registro de Testemunhos

Conhecimento Sistematizado

Ambientais

Clima Solo

Socioeconômicos

Uso da Terra Desmatamento Demografia Uso da Biodiversidade

O JBRJ e o SiB-Br

SiB-Br

Fauna

Lista de Espécies

Registro de Testemunhos

Conhecimento Sistematizado

Flora

Lista de Espécies

Registro de Testemunhos

Conhecimento Sistematizado

Ambientais

Clima Solo

Socioeconômicos

Uso da Terra Desmatamento Demografia Uso da Biodiversidade

Preparado para o Futuro

Compromisso com o passado

Instituto de PesquisasJardim Botânico do Rio de Janeiro

Eduardo Dalcinedalcin@jbrj.gov.br