sismologia usp: infra estutura computacional para pesquisa

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Infra-estrutura computacional disponibilizada aos alunos e integrantes do grupo de Sismologia Centro de Sismologia da USP 31/03/14

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Seismology Computational Infrastructure @ University of São Paulo. This presentation shows all available computational infrastructure under continuous development to support seismological and geophysical research. You are welcome to contact us. Please check out graduate program: http://www.iag.usp.br/international/graduate-programmes-msc-phd

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Page 1: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Infra-estrutura computacional disponibilizada aos alunos e

integrantes do grupo de Sismologia

Centro de Sismologia da USP

31/03/14

Page 2: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Infra-estrutura Geral● Hardware:

– Sala de Alunos com 11 computadores

– Máquina de processamento

– Impressoras

– Scanner

● Serviços– Wiki

– Git (via Gitlab)

– Repositório Debian

● Software Sismologia:– SAC,

SeisComp3, SeisGram, PQL, Passcal, Seed Tools, Taup, SOD, Poet, ObsPy

● Softwares Padrões– GMT, Eclipse +

PyDev, LaTeX, libreoffice, gnuplot, octave ...

Page 3: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Autenticação e Homes

● Utilizamos LDAP– Autenticação unificada de contas

● Diretórios compartilhados via rede– Os seus mesmos arquivos em todas as

máquinas

● Instalação Padrão **– Os mesmos programas, nos mesmos

lugares em todas as máquinas !!!

** Para os computadores do LAB – Não conta a SeisApp

Page 4: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

O Seu diretório: /home_ad

● O seu home é compartilhado entre as máquinas,

● O caminho da sua pasta pessoal é /home_ad/USUÁRIO e não, /home/usuario como no caso de pastas pessoais não compartilhadas,

● Para facilitar, sempre que for fazer alguma transferência para seu home utilize ~ em vez do caminho completo. Ex.:

$ cp acorda_bruno.txt ~/Documents/

● Para o meu usuário ~ é na verdade /home_ad/jackson

Page 5: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Outras áreas de Uso Comum

Compartilhadas● Em todas as máquinas,

como o seu diretório pessoal existe um diretório:

/home_ad/area_comum

● Que é compartilhado entre todas as máquinas

Não Compartilhada● Para aplicações que

fazem um uso mais intenso de disco, e precisam de performace em cada máquina existe um diretório

/data

● Que pode ser usados por todos, mas é individual de cada máquina

Page 6: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Visão Geral

2 TB compartilhados por todos

(atualmente 8% utilizados)

Autenticação via LDAP (unificada entre serviços e

máquinas)

/data, disco local (todas as

máquinas do lab ~400GB)

Em fase de desativação, todos devem

migrar os seus dados

/datacom 10

TB

Page 7: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Problemas Comuns● Executar comandos como “Login Shell” automaticamente

para garantir que todas as configurações feitas por nós são carregadas:

● No terminal, click em:

● Edit → Profile Preferences → Aba Title and Command

● Selecionar: Run command as a login shell

Page 8: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Repositório Sismo - Lab

Page 9: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

seisApp

● Processador: 24 Core Intel Xeon X590 3.47GHz;

– Memória RAM: 96GB;

– Armazenamento: /data com 10TB;

– CentOS 6.4;

– Todos Apps da Borborema estão lá (pelo menos deveriam estar).

– O seu HOME da seisapp é o mesmo das máquinas do lab

● Para acessar a seisApp use o ssh:

ssh -Y seisapp

Page 10: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Wiki @ moho

http://moho.iag.usp.br/wiki

Page 11: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Gitlab @ SeisCode

http://seiscode.iag.usp.br/gitlab

Page 12: Sismologia USP: Infra Estutura Computacional para Pesquisa

Dúvidas e perguntas

● Jackson:– Email: [email protected]– Telefone: 3091-4773– Sala: B209 (IAG/USP)

● Bruno– Email: [email protected]– Telefone: ~Não Tem Ainda~– Sala: M02 – Prédio de

Materiais (IEE/USP)

● Bianchi:– Email: [email protected]– Telefone: 3091-4743– Sala: D-207 (IAG/USP)