mestrado em biologia aplicada

Mestrado em Biologia Aplicada

IDOrientador(a) (nome e

e‐mail)Título Descrição

Tipo de atividade

Número de vagas

ObservaçõesCoorientador(a) (nome e e‐mail)

22Adelaide [email protected]

Terapia fágica no controle da PSA do kivi.

O projeto tem como objetivo desenvolver um protocolo de terapia fágica para controlar a PSA do kiwi". A "PSA" é uma doença provocada por pela bactéria Pseudomonas syringae.

Prática; 1Carla [email protected]


Desenvolvimento de um protocolo de Terapia fágica com para inativar bactérias entéricas.

O projeto tem como objetivo desenvolver um protocolo de terapia fágica para controlar infeções por bactérias entéricas. Srão preparados suspensões fágicas com gama de hospedeiro alargado.



CoV2Clean‐ Descontaminação de superfícies na mitigação do SARS‐CoV‐2 por tratamento fotodinâmico.

O SARS‐CoV‐2 é transmitido através de superfícies contaminadas. O tratamento fotodinâmico utilizando compostos não tóxicos já aprovados, combinados com luz artificial/natural e o oxigénio do ar é uma alternativa eficaz para descontaminação de superfícies.

Prática; 1

Ana Peixoto [email protected]


Terapia fágica na depuração de bivalves (Phage therapy in the depuration of shellfish)

O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para descontaminar bivalves contaminados, empregando uma combinação de duas técnicas, terapia fágica e depuração.



Terapia fotodinãmica na depuração de bivalves (Photodynamic therapy in the depuration of shellfish).

O projeto tem como objetivo desenvolver um procedimento eficaz para descontaminar bivalves contaminados, empregando uma combinação de duas técnicas, terapia fotodinâmica e depuração.

Prática; 1

Ana Peixoto [email protected]

55Adília Pires ([email protected])

Avaliação do impacto da contaminação por metais: respostas comportamentais, fisiológicas e bioquímicas

O presente estudo pretende avaliar os efeitos da interação de contaminação por metais e do tipo de sedimentos em invertebrados marinhos. Os efeitos tóxicos serão essencialmente monitorizados ao nível comportamental (ex: mobilidade e preferência de sedimentos), fisiológico (ex: regeneração) e bioquímico (enzimas relacionadas com o stress oxidativo e danos nas membranas e proteínas). O trabalho inclui trabalho de campo e de laboratório.

Prática; 1 Cátia Venâncio

Mestrado em Biologia Aplicada of 34 Ano letivo 2021‐2022


Avaliação do efeito da interação de contaminantes em invertebrados marinhos ‐ respostas bioquímicas e proteómica

O presente estudo pretende avaliar os efeitos da interação de diferentes contaminantes em invertebrados marinhos. Os efeitos tóxicos serão essencialmente monitorizados ao nível bioquímico (ex: enzimas relacionadas com o stress oxidativo e danos nas membranas e proteínas) e expressão de proteínas (ex: metalotioninas).

Prática; 1Paulo Cardoso ([email protected])


Avaliação do efeito da interação de contaminantes e alterações climáticas em invertebrados marinhos ‐ respostas bioquímicas e perfis lipídicos

O presente estudo pretende avaliar os efeitos da exposição de invertebrados marinhos a sedimentos contaminados e alterações ambientais (ex: salinidade, temperatura). Serão avaliadas as respostas ao nível sub‐celular, por meio de marcadores bioquímicos (ex: enzimas relacionadas com o combate do stress oxidativo, danos nas membranas e proteínas, reservas de lípidos) e caracterização dos perfis lipídicos.

Prática; 1Paulo Cardoso ([email protected])


Transferência trófica de contaminantes ao longo da cadeia alimentar ‐ respostas bioquímicas e expressão genética

O presente estudo pretende avaliar a capacidade de transferência trófica e o potencial de biomagnificação de contaminantes (microplásticos e metais) entre espécies de diferentes níveis tróficos. Os efeitos tóxicos dos contaminantes serão monitorizados ao nível bioquímico (enzimas relacionadas com o stress oxidativo e danos nas membranas e proteínas) e expressão de genes (ex: genes alvo envolvidos na reparação do ADN, regeneração e metabolismo).

Prática; 1Miguel Oliveira ([email protected])

290Ana Cristina Esteves ([email protected])

Lipidómica de fungos filamentosos

O reino dos fungos inclui inúmeras espécies ainda desconhecidas. Os lípidos dos fungos filamentosos podem variar de 1‐80% do seu peso, dependendo da espécie e do seu estado metabólico. O lipidoma destas espécies ‐ os diversos lípidos que estas espécies produzem ‐ pode refletir alterações na produção de fatores de virulência, assim como de compostos com atividade biológica. Pretendemos caracterizar o lipidoma de fungos filamentosos e relacioná‐lo com a sua virulência ou o seu habitat.

Prática 2Maria do Rosário Domingues ([email protected])

14Ana Luísa Machado ([email protected])

Monitorização do impacto da espécie invasora Potamopyrgus antipodarum nos rios portugueses

O gastrópode Potamopyrgus antipodarum é uma das espécie invasora mais bem‐sucedida nos ecossistemas aquáticos. Neste trabalho serão analisadas comunidades de macroinvertebrados bentónicos recolhidas em rios invadidos por esta espécie e rios de referência, de forma a monitorizar os seus impactos na diversidade específica e funcional destas comunidades naturais. Ao mesmo tempo, serão também realizados ensaios in situ, que permitirão averiguar a sua influência ao nível das funções do ecossistema.

Prática; 2

Este trabalhado será realizado no âmbito do projeto “GoBig ‐ Alterações globais e Invasões Biológicas: Potamopyrgus antipodarum como caso de estudo”, financiado pela FCT (Ref. PTDC/CTA‐AMB/3702/2020).

João Pestana ([email protected])



Sensibilidade das populações de Potamopyrgus antipodarum a diferentes stressores

O gastrópode de água‐doce Potamopyrgus antipodarum é espécie invasora extremamente bem‐sucedida. De forma a prever a evolução da sua capacidade invasora em cenários de alterações globais, serão realizados diversos testes laboratoriais para averiguar a tolerância desta espécie a fatores ambientais como a temperatura e a salinidade, e a compostos como pesticidas ou moluscicidas. Serão analisados os efeitos de cada um dos stressores ao nível do crescimento, reprodução e fisiologia desta espécie.

Prática; 2

Este trabalhado será realizado no âmbito do projeto “GoBig ‐ Alterações globais e Invasões Biológicas: Potamopyrgus antipodarum como caso de estudo”, financiado pela FCT (Ref. PTDC/CTA‐AMB/3702/2020).

João Pestana ([email protected])


Impacte ecológico de efluente de ETAR em ecossistemas lóticos

Neste trabalho serão avaliadas as consequências de descarga de um efluente de uma estação de tratamento de águas residuais (ETAR) na região norte do País. Alterações na estrutura de comunidades de macroinvertebrados bentónicos em locais a montante e jusante do ponto de descarga do efluente serão avaliadas modo a aferir a qualidade ecológica destes ecossistemas aquáticos. Em paralelo, a análise da toxicidade do efluente será realizada recorrendo a testes de toxicidade com invertebrados aquáticos.

Prática; 1Envolve trabalho de campo ( saídas de campo aos locais de estudo)

João Pestana ( [email protected])

288Ana Marques ‐ [email protected]

Assessment of the toxic potential of personal care products on marine macroalgae

Marine macroalgae are a key group of primary producers with vital ecological roles for marine systems. Their constant exposure to contaminants and their lipid content makes them susceptible to lipophilic contaminants, such as Personal care products (PCPs). PCPs induce toxicity to aquatic biota constituting serious risks for macroalgae. Hence, growth inhibition, cell viability, oxidative stress, and genotoxicity parameters will be evaluated on Ulva rigida exposed to 3 PCPs.

Prática;Teórica;

1Cláudia Mieiro ‐ [email protected]


Evaluation of health‐promoting effects of two kiwi (Actinidia deliciosa) varieties in Drosophila melanogaster

Several studies have reported the health‐promoting properties of kiwi and two varieties of this fruit, showing distinct phytochemical profiles may reveal different beneficial effects. Thus, the influence of two kiwi (Actinidia deliciosa) varieties ‐ green and golden ‐ on the longevity and DNA protection and repair will be evaluated in the model organism Drosophila melanogaster.

Prática;Teórica;

1Mário Pacheco ‐ [email protected]



Evaluation of macroalgae potential on the mitigation of aquamedicines effects under an aquaculture context

Aqua‐medicines are used in aquaculture to treat diseases/parasites and may induce undesirable effects on the treated animals. In turn, macroalgae could be added to fish diets to mitigate those. The impact of two aqua‐medicines adopted in aquaculture and the potential protective effects of marine macroalgae will be evaluated in gilthead seabream (Sparus aurata). Specifically, cellular mechanisms related with the antioxidant system and DNA integrity promotion and repair will be approached.

Teórica;Prática;

1Patrícia Pereira ‐ [email protected]


The potential of marine macroalgae as functional foods after direct and indirect consumption

Marine macroalgae have been described as functional foods, due to their diverse beneficial effects, namely their anti‐inflammatory, antioxidant, genoprotective, neuroprotective, among others. The macroalgae potential to reinforce the antioxidant system and the DNA repair ability after direct consumption and the eventual indirect transference of these properties through algae‐fed fish will be evaluated in mice (Mus musculus).

Prática;Teórica;

1Mário Pacheco ‐ [email protected]

268

Ana Marta GonçalvesE‐mail: [email protected]

Marine macroalgae: alternative recipes for a daily nutritional diet

Marine macroalgae have a high nutritional value, in addition to a low caloric value and low fat, with the presence of polysaccharides that behave as fibers with no caloric value. This work aims to determine the biochemical profile (fatty acids, carbohydrates and protein content) of macroalgae. The most nutritious macroalgae will be used to prepare pre‐cooked dishes based on rice, combining flavour and texture.

Prática;Teórica;

1Fernando Gonçalves ([email protected])

272


Seaweed based sustainable films and composites for food packaging

Marine macroalgae have a high content in polysaccharides (30‐50 %) that have been widely used in food industry, mainly as thickeners and stabilizers. In this work is proposed the use of seaweeds derived polysaccharides to develop composites for food packaging due to their biocompatibility, availability and gelling capacity, as well as its renewability and sustainability. Alginate, carrageenan, and agar extracted from algae will be used to produce biofilms. The physico‐chemical and mechanical properties of the fims will be evaluated.

Prática;Teórica;

1 Cláudia Nunes

275


Seaweeds a natural resource to food applications

As a way to suppress the nutritional needs of some diets, algae arise as a natural source of food that is wild and abundant with a fast growing index. This work aims to explore seaweeds sub‐products to sauces and soups and the preparation of natural products.

Prática;Teórica;

1 Cláudia Nunes


277


Impacto de microplásticos em sistemas de água doce

Este trabalho pretende avaliar os impactos (toxicidade e bioquímica) de microplásticos em distintas espécies aquáticas de água‐doce, cobrindo assim uma lacuna de conhecimento existente. O trabalho envolverá uma forte componente de campo e laboratorial.

Prática;Teórica;

1 Nelson Abrantes

278


Impacto dos incêndios florestais em perfis de ácidos gordos e hidratos de carbono de organismos aquáticos

Com este trabalho pretende‐se avaliar a toxicidade das cinzas de incêndios florestais nos perfis de ácidos gordos e de açúcares de espécies aquáticas.

Prática;Teórica;

1 Nelson Abrantes

279


Impacto dos incêndios florestais na transferência trófica em sistemas aquáticos

Este trabalho pretende avaliar o impacto de elutriados de cinzas de incêndios florestais em ácidos gordos, hidratos de carbono e proteina em organismos autotróficos e heterotróficos.

Prática;Teórica;

1 Isabel Campos

281


Efeitos individual e de mistura de compostos orgânicos na toxicidade e perfil bioquímico de espécies aquáticas

Primextra Gold TZ é o herbicida mais frequentemente aplicado na cultura de milho no Baixo Mondego, sendo constituído por dois princípios ativos: S‐metalocloro e terbutilazina. Este trabalho pretende avaliar os efeitos destes compostos individualmente e em mistura em espécies aquáticas não alvo.

Prática;Teórica;

1 Fátima Jesus

195Ângela [email protected]

Nano em tamanho, gigantes em problemas ambientais? Os NANOplásticos como vetores para outros contaminantes

A poluição por plásticos é uma das maiores ameaças para o nosso planeta. Uma vez no meio ambiente, o plástico transforma‐se em partículas mais pequenas como os nanoplásticos (NPs). Acredita‐se que os NPs possam ser um relevante vetor para outros contaminantes ambientais. Este tema tem como objetivo avaliar a toxicidade de misturas de contaminantes, que incluem NPs, usando espécies modelo em ecotoxicologia. Vários parâmetros serão avaliados tais como sobrevivência, reprodução e stress oxidativo.

Prática; 2Vera [email protected]

206Ângela [email protected]

Será que dois é sempre maior que um? Os (NANO)plásticos como vetores de outros contaminantes ambientais

A poluição por plásticos é uma das maiores ameaças ao planeta Terra. No meio ambiente, os plásticos fragmentam, podendo chegar a partículas tão pequenas como os nanoplásticos (NPs). Sabe‐se que os NPs podem interagir com outros contaminantes ambientais, alterando as suas toxicidades. Objetivo do tema: Investigar a toxicidade de misturas de NPs com outros contaminantes usando espécies modelo em ecotoxicologia. Vários parâmetros serão avaliados como sobrevivência, reprodução e sub‐celulares.

Prática; 2Rita [email protected]


108Ângela Cunha [email protected]

Photodynamic inactivation of olive tree pathogen Pseudomonas savastanoi with natural and synthetic photosensitizers

Pseudomonas savastanoi is the causative agent of the olive knot disease. The bacterium can survive as epiphytic, and behave as an opportunistic pathogen. The disease is difficult to control and the prevention involves maily the application of bactericides, like copper or antibiotics, that are costly and have undesirable environmental impacts. The objetive of this work is to develop a photodynamic inactivation protocol to reduce microbial load on the leaf surface and specifically inactivate P. savastanoi. The work will be supported by project HALIUS ‐ Halotolerant rhizobacteria for enhanced tolerance of Olea europaea to saline stress and infection (PTDC/BIA‐MIC/3157/2020).

Prática; 1Amparo Faustino [email protected]

117Ângela Cunha [email protected]

Characterization of bacterial biofilms on maritime structures

Microbial biofilms developing on the surface of immersed maritime structures induce deterioration and are the cause of important economic losses. The work will involve monitoring the experimental bacterial colonization of metallic materials and the characterization of changes in the material related with biofilm development and composition. The work represents an opportunity of interdisciplinary training integrating knowledge on life and material sciences.

Prática; 1João Tedim [email protected]

248Artur Alves ‐ [email protected]

Caracterização de fungos associados a larvas de Tenebrio molitor.

Isolar e identificar fungos associados a larvas de Tenebrio molitor usadas para produzir rações para animais. Caracterizar o potencial patogénico e micotoxigénico dos diferentes fungos identificados.

Prática; 1 [email protected]

212Bruno Guimarães, [email protected]

Pode o efeito de contaminantes a longo prazo ser detetado após curtas exposições?

Os organismos podem estar expostos aos contaminantes durante longos períodos de tempo, seja porque os contaminantes são persistentes ou porque são libertados continuamente. Estudos de longa exposição (tais como multigeração) exigem muitos recursos, pelo que o objectivo é tentar correlacionar os efeitos dos contaminantes após curta exposição com os efeitos de longas exposições.

Prática;Teórica;

2Mónica Amorim, [email protected]

215Bruno Guimarães, [email protected]

Poderão as nanopartículas de hydroxyapatite ser usadas para diminuir o impacto de outas nanopartículas para invertebrados de solo?

Embora as nanopartículas (NPs) de hydroxyapatite (HA) sejam usadas na medicina (por exemplo para regeneração óssea), foi demonstrada a sua capacidade de remediação de solo contaminado com outros compostos, como por exemplo outras nanopartículas. O objectivo deste trabalho é determinar se as NPs de HA podem reduzir a toxicidade de outras NPs em estudos ecotoxicológicos com invertebrados de solo.

Prática;Teórica;



26 Bruno Nunes

Efeitos combinados de fármacos e microplásticos em enguias

A contaminação aquática actual permite constatar a presença em simultâneo de várias classes de poluentes, cujos efeitos se combinam e podem resultar num aumento da toxicidade em organismos expostos. Com este trabalho, pretende‐se estudar os efeitos combinados de fármacos de utilização e humana e microplásticos, no peixe enguia europeia (Anguilla anguilla) com especial enfoque para efeitos ao nível bioquímico (processos de destoxificação, metabolismo) e comportamental.

Prática; 1 Miguel Oliveira

27 Bruno Nunes

Análise de microplásticos e parafinas em organismos aquáticos

A presença ambiental de microplásticos representa actualmente um desafio toxicológico para organismos marinhos. No entanto, as propostas de novos materiais para substituição dos microplásticos utilizados em exfoliantes não estão ainda devidamente estudadas. Assim, este projecto visa estudar os efeitos tóxicos de microplásticos e parafinas de origem natural em organismos marinhos, com uma abordagem de biomarcadores.

Prática; 1 Miguel Oliveira

29Bruno Nunes [email protected]

Estudo dos efeitos de antifúngicos de uso agrícola e dermocosmético em anfíbios e fungos infecciosos

Este projecto pretende avaliar os efeitos comparativos decorrentes da exposição a doses ecologicamente relevantes de dois compostos antifúngicos, o ciproconazol (uso agrícola) e piritionato de zinco (uso dermocosmético), no anfíbio Xenopus laevis e no fungo Saprolegnia australis , de modo a avaliar o risco que o seu uso e ulterior libertação para o meio ambiente poderá ter nas duas espécies preconizadas. Serão utilizadas ferramentas bioquímicas para avaliação dos efeitos toxicológicos e para possível identificação dos mecanismos tóxico envolvidos.

Prática; 1Isabel Lopes [email protected]


Uso de assinaturas estruturais, morfológicas e químicas de otólitos para estudo do da estrutura populacional, padrões de migração e conectividade de habitats e peixes

Pretende‐se com este trabalho usar as propriedades esclerocronológicas, morfológicas e químicas de otólitos de peixes comercais da costa portuguesa para estudo da sua estrutura populacional, padrões de migração e conectividade de habitats.

Prática; 1 Alberto Correia



Assessing the effect of the sorption of pharmaceuticals to microplastics on aquatic organisms under laboratory controlled‐experiments

Following a systemic approach for the prevention of the release of harmful substances, there is a growing interest by the scientific community and public harness about plastics and pharmaceuticals in the aquatic environment. Currently the EU directive guidelines on plastics and pharmaceuticals, set them as priority pollutants, and highly recommend the assessment of the state of the environment and the impact pathway of freshwater and marine pollution resulting from these emerging environmental stressors. Adsorption of organic pollutants, including pharmaceuticals, onto microplastics has been already reported in a few studies, indicating the potential of these particles to serve as vectors of pollutants. The former investigations, however, have been conducted under environmentally unrealistic conditions. Here we intent to make laboratorial controlled experiments to investigate the adsorption of pharmaceuticals usually found in the aquatic compartment (e.g. paracetamol, diclofenac, and others) under environmentally relevant conditions (e.g. ng/to L to ug/L) on commonly found plastic materials (e.g. polymers) and their combined effects (e.g. biomarkers) on aquatic test organisms (e.g. fish and bivalves).

Prática; 1 Alberto Correia


Eficácia de processos avançados de oxidação no tratamento de efluentes ricos em fármacos

Os processos de oxidação avançada (Advanced oxidation Processes – AOP) são metodologias altamente promissoras na área do tratamento de efluentes principalmente no que respeita à remoção de compostos como fármacos para os quais os procedimentos atualmente disponiveis nas ETARS têm uma eficácia limitada. Assim, neste tema iremos usar como modelo experimental o peixe zebra (Danio rerio) para estudar a eficácia dos AOPs na degradação de fármacos recorrendo para o efeito à avaliação da toxicidade do efluente e à análise química dos compostos e seus metabolitos no efluente antes e depois do tratamento.

Prática; 1Inês Domingues, [email protected]

259Catarina Marques ([email protected])

Efeito de extratos de plantas em peixes de produção aquícola num sistema piloto

Análise de efeitos bioquímicos provocados por extratos naturais em peixes, como estratégias sustentáveis no combate a doenças que surgem em sistemas de produção aquícola intensiva.

Prática;Teórica;

1Inês Domingues ([email protected])



The impact of stimulatory substances on bivalves

Analysis of biochemical responses of bivalves exposed to environmentally‐relevant levels of stimulatory substances, which are emerging contaminants currently detected in different environmental compartments of marine ecosystems that may affect bivalves production.

Prática;Teórica;

1Rosa Freitas ([email protected])


Impacto de extratos naturais no microbioma de peixes de produção aquícola

Ensaios piloto com vista à análise da influência de extratos naturais na estrutura do microbioma de peixes de elevado valor económico em explorações aquícolas.

Prática;Teórica;

1


Alternative strategies for the potential diagnosis or treatment of human cancer

This work will explore options based on biotechnological approaches for the diagnosis or treatment of different human cancer types.

Prática;Teórica;

1

59Cláudia [email protected]

The impact of personal care products in oysters´ aquaculture: a metabolic approach

Personal care products (PCPs) comprise several classes of daily used substances such as disinfectants, fragrances, preservatives, and UV filters. They are persistent, bioactive, bioaccumulate and biomagnify, raising concern about their potential toxic effects both in humans and in wildlife. The long‐term effects of PCPs on the metabolism of the Pacific oyster (Crassostrea gigas) will be evaluated, aiming to identify possible toxic effects that can jeopardize aquaculture production.

Prática; 1Ana [email protected]


The effects of organic solvents as vehicle agents in ecotoxicity tests: the Pacific oyster case study

Low concentrations of organic solvents are used in laboratory toxicity tests as delivery vehicles for chemicals that are not miscible in water. Despite that the levels of solvent are regulated, studies focusing on the sub‐lethal effects of these compounds in organisms such as bivalves are still lacking. A range of sub‐lethal effects (oxidative stress, bioenergetics and neurotoxicity) of the Pacific oyster will be evaluated by testing different concentrations of the 3 most used organic solvents.

Prática; 1Mário [email protected]



Oysters susceptibility to emergent contaminants: comparative DNA sensitivity of triploids versus diploids

The induction of triploidy is widely used in aquaculture of molluscs such as Pacific oyster (Crassostrea gigas), as they have higher growth rates and flesh quality than the natural diploids. At present, there is no information on the susceptibility of oyster to emerging contaminants (eg. sunscreens, disinfectants), whose increasing presence in marine waters impel assessing the impact on DNA. This will allow comparing triploids vs diploids DNA susceptibility and predicting impacts to aquaculture.

Prática; 1Sofia [email protected]

19Daniela [email protected]

Compilação de dados ecológicos, toxicológicos e moleculares relativos a cianobactérias formadoras de blooms em território português

A ocorrência de blooms de cianobactérias tem aumentado ao nível global, com impactos nos ecossistemas aquáticos e riscos para a saúde pública. O presente projeto pretende compilar dados da ocorrência de cianobactérias formadoras de blooms em Portugal nos últimos 50 anos, com ênfase nas últimas 2 décadas. A recolha de dados (ecológicos, toxicológicos e moleculares) será baseada em dados disponíveis online nos motores de busca científicos. O objetivo final será analisar estatisticamente os dados recolhidos e detectar tendências que possam dar pistas da evolução destes blooms ao longo das últimas décadas e para um futuro próximo no território português. Os dados recolhidos irão também sustentar uma plataforma online com dados georeferrenciados já existente. Este trabalho permite que a maior parte da investigação não seja presencial, uma vez que envolve maioritariamente pesquisa em interfaces digitais.

Teórica; 3

Este trabalho permite que a maior parte da investigação não seja presencial, uma vez que envolve maioritariamente pesquisa em interfaces digitais.


9Diana Madeira, [email protected]

Marine heat waves in intertidal environments: molecular and trait plasticity as determinants of thermal tolerance in goby fish

Intertidal communities are particularly vulnerable to extreme climatic events associated with climate change. The objective of this thesis is to study how marine heatwaves are shaping sand goby and common goby fish physiology, at molecular and phenotypic levels, to infer on the species tolerance and thermal adaptation ability. The workplan is based on a integrative approach combining a range of techniques including field work, animal experiments, molecular biology (gene expression and protein abundance) & bioinformatics, respirometry and critical thermal maximum assays.

Prática; 1

The workplan is to be developed at University of Aveiro (ECOMARE) and NOVA School of Science and Technology (flexible, can be adjusted following COVID regulations). The student will be able to develop skills on a wide range of techniques and interact with two different teams. The workplan is supported by the project ExtremeOceans (PTDC/BIA‐BMA/1494/2020) funded by FCT.

Carolina Madeira, [email protected]

130

Diana Marina Gomes de Campos ([email protected])

Pode a temperatura influenciar a toxicidade dos filtros UV?

BP3 é um composto presente nos protetores solares frequentemente detetado nos ecossistemas aquáticos. As suas concentrações nestes ecossistemas são geralmente mais elevadas durante os meses de verão mas a sua presença mantêm‐se ao longo de todo o ano. Assim sendo o objetivo deste estudo é avaliar se a toxicidade da BP3 é alterada com a variação da temperatura. Para tal ensaios laboratoriais serão feitos utilizando o inseto aquático Chironomus riparius.

Prática; 1João Luís Teixeira Pestana ([email protected])

132

Diana Marina Gomes de Campos ([email protected])

Avaliação dos efeitos ecotoxicológicos de filtros UV na planária de água doce Girardia tigrina

Os filtros UV são frequentemente detetados nos ecossistemas de água doce constituindo assim um risco para os organismos que aí habitam. Este trabalho tem como objetivo avaliar os efeitos da BP3 e do 4‐MBC (dois dos filtros UV mais utilizados em protetores solares) em parâmetros de história de vida (ex., crescimento, reprodução) e respostas bioquímicas, em planárias de água doce ‐ Girardia tigrina.

Prática; 1João Luís Teixeira Pestana ([email protected])

76

Diana Pinto ([email protected]), Departamento de Química, UA

Assessment of phytochemical potential versus ecophysiology of halophytes from Ria de Aveiro

In response to different conditions of salt and waterlogging stress, many halophytes produce secondary metabolites with medicinal potential, among others. The objective of this work is to perform the phytochemical characterization of one or more halophytes subjected to different habitat conditions and evaluate some biological activity, such as antioxidant.

Prática; 2

Helena Silva ([email protected]), Departamento de Biologia, UA


236Diogo Cardoso ‐ [email protected]

A comida do futuro: Risco de contaminação química em insetos comestíveis.

Este projeto tem como objetivo compreender e avaliar a possível transferência / acumulação de contaminantes (ex. metais, PAHS, fármacos) em espécies de insetos usados para alimentação humana e animal. Este tema contempla uma vasta gama de ensaios de bioacumulação, expondo as larvas de inseto a substrato contaminado, avaliando assim de que forma os insetos poderão acumular esses mesmos contaminantes.

Prática; 1Susana Loureiro ‐ [email protected]

241Diogo Cardoso ([email protected])

Avaliação ecotoxicológica de lamas resultantes do tratamento de águas residuais

Uso de ferramentas ecotoxicológicas com o intuito de avaliar a aplicabilidade das lamas resultantes de processos de tratamento de águas residuais em solos agrícolas. Neste tema, o aluno irá realizar uma bateria de ensaios ecotoxicológicos com organismos modelo de modo a avaliar a sua possível toxicidade para organismos de solo. Trabalho no âmbito do projeto NETA: Novas Estratégias no Tratamento de Águas‐Residuais.

Prática; 1Susana Loureiro ([email protected])


Development and optimization of population‐level ecotoxicological experiments

Folsomia candida is a standard model organism in ecotoxicology. However, the guideline does not comply with the ecotoxicological state‐of‐the‐art in terms of predicting effects under long‐term dynamic exposures and use in ecological and ecotoxicological modeling. This theme aims at developing bioassays for studying the temporal dynamics in F. candida populations. Specifically, the sampling times, population size and extraction techniques will be refined, towards versatile population experiments.

Prática;Teórica;

1Susana Loureiro ([email protected])

143

Doutora Patrícia Alexandra Oliveira Pereira Kowalski ([email protected])

Unveiling the neurotoxicity of ionic liquids in a “nobelized worm” model (Caenorhabditis elegans)

Ionic liquids (IL) are organic salts with a wide range of industrial applications, considered “environmentally friendly”, though only a few studies assessed their biological effects including in human‐related models. In collaboration with Centro de Química Estrutural of the Faculty of Sciences of the University of Lisbon and under the project ILGerants that aims to search new IL working fluids for refrigeration, this work will investigate IL neurotoxicity in Caenorhabditis elegans by evaluating behavior and biochemical endpoints related to oxidative stress and neurodegeneration.

Prática; 1

Professor Doutor Mário Guilherme Garcês Pacheco ([email protected])

145


Toxicity evaluation of sunscreen products in bivalves through a multidimensional approach

The effects of sunscreen products in bivalves have been scarcely studied. This proposal aims to investigate the toxicokinetics of oxybenzone (an active ingredient of sunscreen products) in a bivalve of high commercial relevance (Donax trunculus), while addressing its toxicity mechanisms.

Prática; 1



147


Neuroprotective effects of a macroalgae‐enriched diet against mercury neurotoxicity in fish

The hypothesis that a macroalgae‐enriched diet can mitigate the neurotoxic effects of mercury in fish triggered this proposal. Brain biochemical and morphological condition will be assessed, together with fish behaviour. An inorganic mercury form was selected for this study, considering the previous findings of the research group on its neurotoxicity in fish.

Prática; 1


149


Investigating the collateral effects of wildfires in freshwater fish

Considering the poor knowledge of the wildfires impact on freshwater systems, this thesis will look for alterations of fish biochemical profile and behaviour upon exposure to ashes from several burned areas.

Prática; 1Doutora Isabel Campos ([email protected])

150


Biochemical effects of mercury in the saltmarsh plant Halimione portulacoides in climate change scenarios

The Minamata Convention recognizes mercury (Hg) as a global contaminant. In this context, it is relevant to clarify the role of marsh plants (e.g. Halimione portulacoides) on the uptake, accumulation and emission of Hg to the atmosphere, as well as the toxico‐dynamic mechanisms of Hg (biochemical/physiological responses). This research will comprise the accumulation of Hg forms in various plant tissues, as well as the analysis of antioxidant defenses and evaluation of oxidative damage. The work aims to produce crucial information to understand the role of marsh plants in the Hg cycle.

Prática; 1Doutora Joana Luísa Pereira ([email protected])

230


Estudo comparativo da neurotoxicidade de mercúrio orgânico e inorgânico em neurónios: será que a forma química importa?

O cérebro humano é um orgão‐alvo de mercúrio (Hg), sendo que os efeitos do metilmercúrio estão particularmente bem estudados por oposição à toxicidade do mercúrio divalente. Os estudos comparativos disponíveis em neurónios apresentam, por vezes, conclusões contraditórias quanto à forma mais tóxica de Hg. Este projeto de Mestrado pretende contribuir para clarificar esta questão em neurónios humanos através da avaliação de vários parâmetros de citotoxicidade e genotoxicidade em células neuronais.

Prática; 1Doutora Helena Oliveira ([email protected])


296Eduardo Ferreira ([email protected])

Do dry‐stone walls have a role on biodiversity conservation? An assessment based on amphibian community data

Dry‐stone walls are ubiquitous elements on the humanized Mediterranean agricultural landscapes. These walls have been recently classified by UNESCO as an Intangible Heritage of Humanity, but the evidence on the important role of these structures have on biodiversity and ecological connectivity is still anecdotal. With this work, we aim to assess the role of dry‐stone walls using amphibian communities as models for the characterization of biodiversity and connectivity patterns.

Prática;Teórica;

1

Este projeto inclui a realização de pelo menos 4 saídas de campo, na Primavera e Outono, com duração aproximada de 10‐12 dias cada, que serão fisicamente exigentes.This project includes at least 4 field trips, in spring and autumn, lasting approximately 10‐12 days each, which will be physically demanding.

53Felisa Rey ([email protected])

Optimization of farming process of two Sacoglossa sea slug species & decoding the role of lipids in these photosynthetic animals using Lipidomics

Sacoglossa sea slugs sequester functional chloroplasts (kleptoplasts) from macroalgal food, obtaining energy through heterotrophic and autotrophic pathways.This project aims to optimize the cultivation process of two species of Sacoglossa sea slugs under laboratorial conditions and characterize the changes occurring in their lipidome throughout their life cycle, using modern LC‐MS lipidomic approaches and GC‐MS. The identification of lipidomic profiles will open new perspectives about this endosymbiosis relationship.

Prática; 1Paulo Cartaxana ([email protected])

82 Glória Catarina Pinto

Comparison of the Physiological and Microbiome profile of cultivated Olive plants under salt stress: Portuguese Traditional versus intensive‐related cultivars

Olive is considered as a moderately salt tolerant plant, however, tolerance to salt is cultivar‐dependent. In this work, saline stress (NaCl) will be induced in two young olive cultivars: “Picual” recently introduced as a key player in Portuguese intensive plantations and the traditional, Portuguese olive “Galega”. The effects of salt stress on growth and physiological parameters will be assessed. We also aim, for the first time, to unravel the structure of belowground bacterial communities by high‐throughput sequencing. We will explore the constitutive traits and the responses imposed by salt stress that may explain adaptability. The identification of the stress adaptability of the cultivars currently used in plantations will allow the design of more sustainable crop production strategies.

Prática; 1

This work plant will be supported by recently approved project: HALIUS ‐ Rizobactérias halotolerantes para aumento da tolerância de Olea europaea ao stresse salino e à infecção (PTDC/BIA‐MIC/3157/2020). The master student will be integrated in a multidisciplinary and international team

Maria Ângela Cunha


224Helena [email protected]

Nanopartículas para terapia do melanoma por entrega dirigida de fármacos

O melanoma é a forma mais agressiva de cancro da pele. Este trabalho tem como objetivo a utilização de nanopartículas carregadas com resveratrol, um composto naturalmente presente em vários alimentos, para o tratamento do melanoma. Este trabalho irá envolver a preparação das nanopartículas, a cultura de células de melanoma in vitro e a análise de vários parâmetros de citotoxicidade e genotoxicidade. Este trabalho será desenvolvido no âmbito do projeto HOTsPOT.

Prática; 1Ana Luisa Silva [email protected]

225Helena [email protected]

Nanopartículas para terapia do osteossarcoma por entrega dirigida de fármacos

O osteossarcoma é o tipo mais comum de tumor maligno do osso. O resveratrol é um composto fenólico, naturalmente presente em vários alimentos, que apresenta propriedades benéficas para a saúde. Este trabalho tem como objetivo a utilização de nanopartículas carregadas com resveratrol para o tratamento do osteossarcoma em modelos in vitro. Este trabalho irá envolver a preparação das nanopartículas, a cultura de células in vitro e a análise de vários parâmetros de citotoxicidade e genotoxicidade.

Prática; 1

Barbara [email protected]

104

Helena Silva ([email protected]), Departamento de Biologia UA

Contribution to the monitoring of Ria de Aveiro saltmarsh vegetation using innovative remote sensing and hydrodynamic tools

The aim of this work is to investigate the relation between salt marshvegetation and hydrodynamic conditions by combining field data with innovative remote sensing and hydrodynamic tools. This work comprises field work activities for the identification of salt marshvegetation and its integration in a geographic information system (GIS). Vegetation data will be intersected with local hydrodynamic variables in order to identify the hydrodynamic conditions to which the different plants are subjected. These results will be essential to assess and forecast salt marsh stability in face of future scenarios, namely dredging activities and climate induced mean sea level rise.

Prática; 1

Carina Lopes ([email protected]), Departamento de Física, UA

227Heliana Teixeira ([email protected])

Percepção dos impactos de uma espécie exótica invasora pela comunidade piscatória da Ria de Aveiro

Este estudo tem como objectivo investigar o conhecimento e a percepção dos impactos negativos causados por duas espécies exóticas invasoras pela comunidade de pescadores e mariscadores que desempenham a sua actividade na Ria de Aveiro. O estudo será baseado num questionário estruturado, realizado em modo entrevista presencial. O aluno deverá participar da realização dos questionários no terreno, no tratamento estatístico dos dados recolhidos e na escrita e discussão dos resultados obtidos.

Prática;Teórica;

1

Este trabalho será realizado na Universidade de Aveiro e em regime de co‐orientação com as investigadoras Dr. Heliana Teixeira (CESAM ‐ UAVR) e Dr. Adriana Ressurreição do (CCMAR ‐ UAlg).

Adriana Ressurreição



Avaliação da neurotoxicidade de pontos quânticos de grafeno no peixe zebra

Os pontos quânticos de grafeno (graphen quantum dots) são nanopartículas de grafeno com propriedades muito apelativas para novas utilizações na área da biologia, electrónica e ambiente. Neste tema será pesquisada a influência de pontos quânticos de grafenos em parâmetros comportamentais (locomoção) e bioquímicos (colinesterase) em larvas de peixe zebra (Danio rerio). Esta avaliação é imprescindível para entender potenciais impactos da utilização destes compostos noambiente.

Prática; 1Gil Gonçalves ([email protected])


Efeitos neurotóxicos de extratos de plantas do género Psychotria no peixe zebra

O género Psychotria engloba algumas plantas utilizadas na preparação de Ayauasca, um chá usado devido aos seus efeitos psicoativos por povos indígenas da América do Sul e mais recentemente por gupos religiosos. Neste trabalho vamos avaliar estes efeitos usando o comportamento locomotor das larvas de peixe zebra (Danio rerio)

Prática; 1


Toxicidade de extratos de plantas em embriões de peixe zebra

Análise de efeitos comportamentais, bioquímicos e no desenvolvimento embrionário de peixe zebra, provocados por extratos brutos preparados a partir de diferentes espécies de plantas.

Prática;Teórica;


49Isabel [email protected]

Freshwater cnidarians as potential surrogates to assess effects on marine corals? From theory to practice.

With new restrictions and requirements to collect marine corals to be studied under laboratory conditions, it becomes apparent the need to provide other species that can be easily manipulated and that allow us to continue to understand which environmental conditions/changes put marine cnidarians at risk. This work intends to explore whether freshwater cnidarians could be a good option from a theoretical and practical point of view.

Teórica;Prática;

1 Cátia Venâncio


Adding perspectives on amphibians' tolerance to salinity under realistic environmental scenarios: permanent versus temporary water ponds

Many amphibians are dependent on aquatic systems to complete their life cycle. Many of these aquatic systems, that might be ephemeral or permanent, are subjected to salinization events. This work aims at understanding how young life stages of amphibians deal with both stressors (salinization and dryness).




Alternativas não‐animal para avaliar o impacto de contaminantes emergentes em anfíbios.

O presente trabalho pretende validar metodologias alternativas à experimentação animal para avaliar efeito de contaminantes emergentes (e.g. nanoplásticos) em anfíbios. Para tal, o trabalho prático envolverá a realização de ensaios de toxicidade com linhas celulares comerciais, embriões e girinos de Xenopus laevis, e diferentes contaminantes emergentes. Este trabalho será desenvolvido no âmbito do projecto de investigação GOGOFROG.

Prática; 1Miguel [email protected]


Use of naturally produced CuO nanomaterials for advanced oxidation of industrial effluents

CuO nanomaterials will be prepared from waste or natural resources and will be used for the real or synthetic effluents containing recalcitrant organic compounds and pollutants of emerging concerns (such as pharmaceuticals). The effects of various oxidation agents on the treatment process will be studied. The toxicity studies using algae, rotifers and hidra will be performed before and after treatment with nanomaterials and the effects of the various oxidation agents on the toxicity removal from the effluents will be studied. The involved mechanisms in the treatment process and the toxicity to the studied microorganisms will be studied and (based on the results achieved), measures will be taken to optimize the treatment process and to minimize the toxic effects.

Prática; 1

Mohammadreza [email protected]


Application of residue‐based carbonaceous materials for treatment of metal contaminated mine effluents

This project aims at using carbonaceous materials, produced from natural feedstock (by recycling residues such as the sludge from the activated sludge process), for the treatment of metal contaminated mine effluents. The chemical and ecotoxicological characterization of the effluent will be done before and after the treatment. Finally, the economic studies will be performed to explore the saelability of the developed treatment methods considering the results achieved from the ecotoxicological studies.

Prática; 1

Mohammadreza [email protected]

74Isbael [email protected]

Effect of lanthanide‐dopped nanoparticles on the fitness and behaviour of aquatic biota

The synthesis of lanthanide‐dopped nanoparticles has received much attention due to their potential use in bioanalysis and medical imaging. This work intends to assess if, once released into freshwater ecosystems, these nanoparticles may affect the fitness and behaviour of aquatic biota, through the performance of ecotoxicity assays with species of different functional levels.

Prática; 1 Anna Ekner‐Grzyb


194Joana Luísa Pereira, [email protected]

Avaliação ecotoxicológica integrada na avaliação de perigosidade ambiental de resíduos

Será efetuada a integração das respostas de organismos aquáticos a extratos de cinzas de incineração na avaliação da perigosidade ambiental deste resíduo, geralmente efetuada exclusivamente com base na composição química do mesmo. A avaliação de perigosidade de resíduos sólidos é um passo essencial condicionante da sua aplicação em diferentes áreas ou condução para aterro, pelo que a segurança ambiental destes destinos depende da otimização dos protocolos de classificação.

Prática; 1Margarida Quina (UC)


Efeitos da descarga de efluentes de estações de tratamento de águas residuais em organismos aquáticos

Nesta Dissertação será aplicada uma bateria de bioensaios para avaliar potenciais efeitos negativos de sedimentos contaminados (metais, pesticidas, fármacos, etc.) em diversos organismos. Estes sedimentos foram recolhidos em sistemas recetores de efluentes de estações de tratamento de águas residuais com processos de tratamento e dimensões distintas, sendo objetivo deste trabalho complementar uma avaliação abrangente do potencial impacto dos efluentes nos ecossistemas recetores.

Prática; 1Nelson Abrantes, [email protected]


Lagoa da Vela: Interações entre o valor socio‐cultural do ecossistema e o estado ecológico da água

Esta Dissertação enquadra‐se num projeto científico em execução (WinTherface) no âmbito do qual já foi recolhida informação relevante relacionada com a qualidade ecológica da água na Lagoa da Vela (Quiaios). Pretende‐se completar esse conjunto de dados e recolher informação sobre os diversos serviços proporcionados à população local por este ecossistema, para prever de que forma a melhoria no estado ecológico desta massa de água se refletiria no seu valor socio‐cultural.

Prática; 1Nelson Abrantes, [email protected]

18João Pestana ( [email protected])

Poluição luminosa e sensibilidade de invertebrados aquáticos a pesticidas

Ensaios laboratoriais avaliarão efeitos combinados da poluição luminosa (luz artificial nocturna) e exposição a pesticidas em invertebrados aquáticos (Chironomus riparius e Girardia tigrina). Parâmetros de ciclo de vida (mortalidade, crescimento, reprodução, etc.) serão combinados com respostas bioquímicas (stress oxidativo, metabolismo energético, etc.) para avaliar de que modo a poluição luminosa e variações nos níveis da hormona melatonina alteram a tolerância à contaminação química.

Prática; ( duas

Trabalho a ser realizado no âmbito do projecto SLEEP‐ Shedding Light on freshwater Ecosystems under Environmental change and Pollution. (PTDC/CTA‐AMB/2518/2020)

Carla Quintaneiro ([email protected])


20João Pestana ( [email protected])

Poluição luminosa e aquecimento global: consequências para ecossistemas aquáticos

Ensaios laboratoriais avaliarão efeitos combinados da poluição luminosa (luz artificial nocturna) e aumento de temperatura (incluindo ondas de calor) em invertebrados aquáticos (insectos e planárias). Parâmetros de ciclo de vida (mortalidade, crescimento, reprodução, etc) serão combinados com respostas bioquímicas (stress oxidativo, metabolismo energético, imunologia, etc) para avaliar as consequências da poluição luminosa em ecossistemas aquáticos sob cenários previstos de aquecimento global.

Prática; (duas

Trabalho a ser realizado no âmbito do projecto SLEEP‐ Shedding Light on freshwater Ecosystems under Environmental change and Pollution. (PTDC/CTA‐AMB/2518/2020)

Isabel Lopes ( [email protected])

73João Serôdio ([email protected])

Fotocomportamento e produtividade: motilidade celular e otimização da fotossíntese de diatomáceas estuarinas

As diatomáceas são microalgas unicelulares de grande importância ecológica. Em estuários, formam biofilmes altamente produtivos dominados por espécies com acentuada motilidade. Este projeto aborda o papel da motilidade celular na capacidade de explorar os microgradientes do ambiente sedimentar e, ultimamente, explicar a produtividade destas comunidades. Serão usadas técnicas de imagiologia microscópica no estudo combinado do fotocomportamento e da fotossíntese de células em microgradientes.

Prática; 1Silja Frankenbach ([email protected])

50Johannes W. Goessling; [email protected]

Natural Photonic Crystals: Photo‐physiology and Productivity in Intertidal Flats

Single cell diatom algae are encased in silicon dioxide shells with unique nanometric patterning. Some diatoms evolved highly periodic structures resembling advanced photonic structures in their exoskeletons. This thesis will explore natural production dynamics of those photonic structures in diatoms in different habitats using field work based, and photo‐physiological measurements in the laboratory. The candidate should bring natural interest in sustainable and nature‐based technology.

Prática; 1João Serôdio; [email protected]

95Jörg Frommlet ‐ [email protected]

New tools to study photoprotective properties of endolithic habitats

Symbiolites are mineral deposits that encase symbiotic dinoflagellates as endolithic cells and that protect the endolithic cells from photodamage by absorbing UV‐radiation. The aim of this project is to develop new tools for the study of photoprotective properties that will allow the concurrent assessment of photophysiology and oxidative stress in endolithic cells based on active chlorophyll fluorescence and the fluorometric detection of reactive oxygen species at the microscopic level.

Prática; 1João Serôdio ‐ [email protected]


98Jörg Frommlet ‐ [email protected]

Chemotaxis of free‐living symbiotic dinoflagellates towards marine bacteria

Coral symbiotic dinoflagellates and marine bacteria can form calcifying biofilms that precipitate calcium carbonate and create endolithic microhabitats. The aim of this project is to assess if these calcifying communities are formed actively by the dinoflagellates by seeking out suitable bacterial communities. For this, chemotactic behaviour of coral symbionts to distinct isolates of marine bacteria will be studied using capillary assays and image analysis.

Prática; 1João Serôdio ‐ [email protected]

38Josman Dantas Palmeira

Oito décadas de resistência aos antibióticos ‐ Passado, presente e futuro nos diferentes nichos ecológicos

Levantamento bibliográfico da resistência bacteriana aos antibióticos nas últimas 8 décadas, desde a primeira descrição da resistência a penicilina, em 1940, até os dias atuais com os superbugs. A abordagem inclui um analise nos diferentes nichos ecológicos (humanos, animais (pets, produção alimentar e selvagens) e ambiente) com o intuito de estabelecer relações temporais, de praticas no uso de antibióticos, além das relações internichos (cadeia alimentar, poluição biológica, etc.). Esse problema é dos mais preocupantes para a saúde publica, de acordo com a OMS, visto que tem a previsão de aumentar a mortalidade de 700 mil casos em 2016, para 10 milhões em 2050.

Teórica; 2

233Liliana Santos; [email protected]

Novas tecnologias para a identificação de fungos

A quimiotaxonomia é uma ferramenta para classificar e identificar fungos de acordo com as suas diferenças e similaridades em relação à sua composição bioquímica. Este trabalho terá como objetivo a validação de uma técnica rápida de identificação de fungos, baseada na tipagem química por espectroscopia de infravermelho. Para isso, iremos obter uma coleção de fungos composta por isolados diferentes de cada género, otimizar os métodos de preparação das amostras e de identificação de fungos.

Prática; 1

Catarina Moreirinha; [email protected]

245Liliana Santos; [email protected]

Meta‐analise do género Diaporthe para melhorar a sua delimitação de espécies

A Diaporthe é um género de fungos filamentosos que se encontra em diferentes organismos (plantas, humanos e animais). Tem mais de 2000 nomes de espécies. Este projecto pretende usar técnicas de meta‐analise, integrando a bioinformática, para melhorar a delimitação de espécies dentro deste género que neste momento está caótica. Pretendemos aliar à análise filogenética multi‐loci, o uso de métodos de delimitação de espécies com base coalescente, distâncias evolutivas e redes filogenéticas.

Teórica; 1

Interesse pela bioinformática; Interesse por trabalho de computador.

Ana Usié Chimenos; [email protected]


148Luis Souto [email protected]

Integration of Massive Paralel Sequencing methods in the analyses of forensic traces ‐ a comparative study

A introdução de novas tecnologias de sequenciação de ADN apresenta grande potencial no estudo de amostras forenses, nomeadamente em ADN mitocondrial.Com este trabalho pretende‐se testar variáveis determinantes para a obtenção de resultados de qualidade, comparando metodologias como método de Sanger em eletroforese capilar com novas plataformas de seqeunciação massiva paralela.

Prática;Teórica;

1

Implica estágio parcial nos laboratórios do Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses. Preferencialmente o aluno a selecionar deverá ter frequentado a UC Biologia e Genética Forense.

257Luísa Magalhães ([email protected])

Ocorrência e dinâmica de um agente patogénico emergente em bivalves da Ria de Aveiro

A ocorrência de Vibrio spp. (bactérias patogénicas) será avaliada em bivalves da Ria de Aveiro e relacionada com descritores bióticos a abióticos sazonais.

Prática; 1Parte do trabalho laboratorial será realizado no Porto (CIIMAR).

Sergio Boo Fernandez ([email protected])

265Luísa Magalhães ([email protected])

Comparação da resposta imunológica de bivalves à infeção por parasitas trematodes

Com recurso a exposições in vitro, a resposta imunológica de diferentes espécies de bivalves à infeção por parasitas vai ser avaliada para identificação de características que lhes conferem suscetibilidade ou resistência.

Prática; 1Parte do trabalho laboratorial será realizado no ECOMARE.

Rosa Freitas ([email protected])

46Maria Bordalo e Sá ([email protected])

Exposure to bioactive natural compounds produced by an invasive seaweed: effects on marine organisms / Exposição a compostos naturais bioativos produzidos por uma macroalga marinha invasora: efeitos em organismos marinhos

Avaliar o efeito da exposição a compostos naturais bioativos, produzidos por macroalgas, em espécies marinhas e compreender de que forma podem ser alterados em diferentes cenários (ex: alterações climáticas, poluição), considerando parâmetros comportamentais e bioquímicos. O trabalho envolve saídas de campo e experiências em laboratório e será desenvolvido no âmbito do projeto INSIDER financiado pela FCT.

Teórica;Prática;

2Hugo Vieira ([email protected])


Impact of environmental stressors on bivalves with commercial value / Impacto de stressores ambientais em bivalves de valor comercial

Bivalves de valor comercial irão ser usados como bioindicadores para avaliar os efeitos ecotoxicológicos de diferentes stressores ambientais. O trabalho envolve saídas de campo e experiências em laboratório e será desenvolvido no âmbito do projeto INSIDER financiado pela FCT.

Prática;Teórica;

2Hugo Vieira ([email protected])


Effects of a biobased insecticide under a climate change scenario / Efeitos de um inseticida de base biológica num cenário de alterações climáticas

Este trabalho pretender avaliar o efeito de um bioinsecticida (esporos de bactéria como ingrediente ativo) em insetos não‐alvo num cenário de alterações climáticas, nomeadamente alterações de temperatura.

Prática;Teórica;

1João Pestana ([email protected])



Does exposure to bio‐based insecticides interfere with predator‐prey interactions? / A exposição a inseticidas de base biológica interfere nas interações predador‐presa?

Avaliar o efeito da exposição a bioinseticidas à base de bactérias em interações bióticas, nomeadamente nas relações predador‐presa de organismos aquºaticos não alvo. Este trabalho vai ser desenvolvido no laboratório e poderá envolver saídas de campo.

Prática;Teórica;

1João Pestana ([email protected])


Multigenerational effects of bio‐based insecticides / Efeitos multigeracionais de exposição a bioinseticidas

Este trabalho pretende avaliar o efeito de um bioinsecticida à base de bactéria ao longo de várias gerações de uma espécie de inseto aquático.

Teórica;Prática;

1Diana Campos ([email protected])


Does the presence of microplastics change the effect of bioinsecticides? / A presença de microplásticos altera o efeito dos bioinseticidas?

Este trabalho irá avaliar o efeito combinado da exposição a microplásticos e bioinseticidas em macroinvertebrados dulçaquícolas.

Prática;Teórica;

1Diana Campos ([email protected])

183

Maria de Lourdes Pereira, DCM‐UA [email protected]

The protective role of antioxidants on rat Sertoli cells: Potential values for clinical settings

Antioxidants play a protective role on several endocrine dusruptors (ED) like carbamate pesticides, which adversely impact reproductive systems, namely somatic testicular Sertoli cells, the physical and nutritional support of spermatogenesis. Rat Sertoli cells exposed to different concentrations of the selected compound will be incubated with antioxidants (eg. curcumin, vitamin E) to evaluate possible recovery. Markers of oxidative damages in lipids, proteins and DNA will be measured. It is expected to obtain a significant contribution for further application in clinical samples.

Prática; 1O trabalho prático será desenvolvido na UA (DCM e DQ).

Pedro F. Oliveira, DQ, UA [email protected]

244Maria [email protected]

How do anticancer drugs alter the metabolic pathways of zebrafish embryos?

This project will assess the potential alterations of the metabolic pathways caused by anticancer drugs in zebrafish embryos. This study will be developed in the framework of the R&D projects EMPHASIS and VitroTOX.

Prática;Teórica;

1


Mixture effects of anticancer drugs towards Danio rerio

This projects aims to assess the eco‐ and genotoxicity of a mixture of novel and clinical anticancer drugs on the zebrafish. This study will be developed in the framework of the R&D project EMPHASIS and VitroTOX.

Prática;Teórica;

1Susana [email protected]


How do anticancer drugs alter the metabolic pathways of zebrafish?

This project will assess the potential alterations of the metabolic pathways caused by anticancer drugs in zebrafish. This study will be developed in the framework of the R&D projects EMPHASIS and VitroTOX.

Prática;Teórica;

1Susana [email protected]


286Marija Prodana ([email protected])

Effects of Layered Double Hydroxides (LDHs) nanofertilizers on the life history traits of Enchytraeus crypticus

The use of Layered Double Hydroxides (LDHs) nanomaterials as nanofertilizers is regarded as a paradigm shift towards an increased sustainability. While these novel compounds imply considerable uncertainty, it is critical to assess how they affect soil health and functions. The aim of this work is to evaluate the effects of LDHs on populations of Enchytraeus crypticus. Population growth experiments will be conducted to understand the impact of LDHs on the life history traits of these organisms.

Prática;Teórica;


142Mário Pacheco ([email protected])

Impacts of exposure to emerging marine biotoxin Ciguatoxins (CTX) in carnivore fishes

Ciguatoxins (CTX) are emergent neurotoxins produced by Gambierdiscus sp., whose distribution is expanding, having reached the Mediterranean Sea, Canary and Madeira Islands. CTX can bioaccumulate in fish and be transferred through the trophic web, causing ciguatera fish poisoning in humans. The initial toxins are biotransformed, originating multiple compounds. However, there is an information gap regarding CTX bioaccumulation, transformation, and its physiological and genotoxic effects on fish.

Prática; 1Trabalho a elaborar em colaboração com o IPMA.

Ana Catarina Braga ‐ IPMA ([email protected])

197 Miguel OliveiraThe impacts of pharmaceuticals on memory

The work will assess the role of different pharmaceuticals on memory, based on behavioral, physiological and molecular responses of fish.

Prática; 1

80Miguel Oliveira ([email protected])

O estudo do proteoma na avaliação da toxicidade de contaminantes emergentes

Este trabalho desenvolvido em colaboração com o Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental visa avaliar mecanismos de resposta a contaminantes emergentes (e.g., nanomateriais e fármacos) com recurso à avaliação da expressão de diferentes proteínas.

Prática;Teórica;

1Parte do trabalho será desenvolvido na Universidade do Porto

Alexandre Campos ([email protected])


Differentiation of a hepatocellular cell line in a toxicology context

This work aims to evaluate several protocols for differentiation of a hepatocellular cell line to hepatocytes with a functional P450 complex

Prática; 1Monica Almeida ([email protected])


The impact of nanoplastics on humans: an in vitro approach

This work aims to understand the consequences of human exposure to nanoplastics and the potential mechanisms of action involved

Prática; 2Monica Almeida ([email protected])


Fish cell lines as tools to assess the impact of human pharmaceuticals and nanoplastics

This work aims to assess the effects of human pharmaceuticals and nanoplastics and the potential mechanisms of action involved.

Prática; 2Mónica Almeida ([email protected])



The effects of human pharmaceuticals on marine organisms

This work aims to assess the effects human pharmaceuticals, at different levels of biological organisation under environmentally relevant conditions

Prática; 1


Micro(Nano)plastics in the marine environment: Biological and societal considerations

This work aims to increase the understanding of the consequences of the presence of micro(nano)plastics in the environment. The students may choose between: 1) a plan that involves animal experimentation, sociological questionnaires, and environmental education based on obtained results or 2) review the scientific knowledge concerning sources and effects of plastics, and develop tools to more efficiently transmit knowledge to the general public, based on a sociological analysis.

Prática;Teórica;

2Isabel Miguel ([email protected])


Climate change: Biological and societal considerations

This work aims to increase the knowledge on the consequences of climate under realistic predictable scenarios. The students may choose between: 1) a plan that involves animal experimentation, sociological questionnaires, and environmental education based on obtained results or 2) review the scientific knowledge concerning sources and effects of plastics, and develop tools to more efficiently transmit knowledge to the general public, based on a sociological analysis.

Prática;Teórica;

2Isabel Miguel ([email protected])


Desenvolvimento de novos modelos celulares para avaliar a regeneração celular

O pressente trabalho pretende estudar os fatores que condicionam a capacidade dos animais se regenerarem. Para este efeito será estabelecido e validado uma linha celular animal.

Prática; 1 Adília Pires


Insect toolkit for cell cultureO presente estudo que envolve cultura de células animais, pretende avaliar potenciais aplicações de estruturas de insetos na manutenção das culturas.

Prática; 1Olga Ameixa ([email protected])


Insects bugged by micro(nano)plastics

O presente estudo que envolve o mapeamento da presença de plásticos nos insetos

Prática; 1Olga Ameixa ([email protected])


The role of beta‐blockers on cancer treatment

Beta‐Blockers (BBs) have been considered in the treatment of different pathologies, including cancer. However, little information is available regarding the potential anticancer mechanism of action. This work will involve the culture of human cells lines exposed to BB and the assessment of molecular and biochemicals responses.

Prática; 1

Maria de Lourdes Pereira ([email protected])



Cocktail: Effects of mixtures of environmental pollutants

The proposed work aims at assessing the effects of emerging contaminants of concern under environmentally relevant scenarios, the presence of other contaminants. The impact of multiple contaminants is not straightforward by simple adding the effects of the pollutants. The combined effects of pollutants may also have a synergistic or an antagonist effect that may vary with higher and/or lower concentrations of the pollutants in such a way that, again, no simple, straightforward hypothesis can be drawn. This project will deal with the need to investigate the impact of combined pollutants and to discover their effects in this unknown "puzzle of responses".

Prática; 1Nuno Ferreira ([email protected])


Effects of marine debris on aquatic organisms

This work will assess the effects of marine debris, namely aged microplastics, on aquatic organisms, assessing ecologically relevant endpoints like survival, reproduction and behavior.

Prática; 1Cátia Venâncio ([email protected])


The role of synthetic and natural surfactants on the toxicity of nanoplastics

The effects of nanomaterials is affected by the characteristics of the environment. The present work aims at understanding the role played by surfactants on the toxicity of nanoplastics on primary producers and consumers.

Prática; 1

Miguel Tamayo Belda ([email protected])


Development of nanoplastic isolation protocols for complex matrices

The proposed work aims to contribute a research priority in the micro(nano)plastics research field, the isolation of small plastic > particles in complex matrices. This work will be valuable for toxicity studies with environmental relevance

Prática; 1

Miguel Tamayo Belda ([email protected])


Avaliação da toxicidade e eficiência nanopesticidas

Este trabalho visa a síntese, caracterização e avaliação da ação toxica de nanopesticidas. A formulação deste compostos ativos visa uma maior eficiência e menor efeito em organismos não alvo.

Prática; 1Ricardo Pinto ([email protected])


Síntese e avaliação do efeitos de nanopartículas para a aplicação em aquacultura

Este trabalho visa o desenvolvimento de nanopartículas com base em polímeros naturais que aumentem a resistência de peixes a infeções e a produtividade de aquaculturas.

Prática; 1Ricardo Pinto ([email protected])


Epigenetica ‐ Desenvolvimento de ferramentas de análise de expressão de proteínas em espécies modelo em ecotoxicologia

Estudo de mecanismos de epigenética conservados dos invertebrados do solo aos vertebrados, possíveis aplicações em toxicologia humana. As espécies de estudo serão espécies modelo em ecotoxicologia de solo como o Enchytraeus crypticus (Oligochaeta), entre outros. Serão utilizadas técnicas moleculares para medir metilação de DNA, expressão génica (RT‐PCR) e a potencial aplicação na avaliação de risco de nanomateriais.

Prática;Teórica;

2Rita Bicho, [email protected]



Epigenética ‐ Desenvolvimento de ferramentas de análise de expressão de proteínas em espécies modelo em ecotoxicologia

Estudo de mecanismos de epigenética conservados dos invertebrados do solo aos vertebrados, possíveis aplicações em toxicologia humana. As espécies de estudo serão espécies modelo em ecotoxicologia de solo como o Enchytraeus crypticus (Oligochaeta), entre outros. Serão utilizadas técnicas moleculares como a expressão de proteínas por Western blot e imunohistoquímica e a potencial aplicação na avaliação de risco de nanomateriais.

Prática;Teórica;

2Rita Bicho, [email protected]


Avaliação do efeito de nanopesticidas: dos genes ao organismo

O objetivo é investigar os efeitos de nanopesticidas em invertebrados de solo, com recurso a ensaios padronizados e a ferramentas de biologia molecular (ex. expressão de genes e omicas relevantes, microarrays, qPCR).

Prática;Teórica;

2Susana Gomes, [email protected]


Avaliação de efeitos de poluentes em populações perturbadas ‐ desenvolvimento de ferramentas moleculares para ensaios padronizados.

Os efeitos de poluentes/stressores são avaliados em populações saudáveis. É necessário avaliar o impacto em indivíduos com níveis de perturbação variáveis (p.e. doentes crónicos, idosos, feridos) e desenvolver modelos para o ambiente com vista à padronização. A metodologia prevê utilização de técnicas de microinjeção, moleculares, expressão génica, ecotoxicologia e afins.

Prática;Teórica;


129Olga Ameixa; [email protected]

Gestão dos espaços verdes do Campus e efeitos na diversidade de plantas e insetos

Avaliação e monitorização de comunidades vegetais do Campus, bem como da Entomofauna associada, antes e após implementação diferentes técnicas de gestão dos espaços verdes. Inclui análise de amostras previamente recolhidas, no mesmo âmbito.

Prática;Teórica;

1Paula Maia; [email protected]

178Patricia Esquete Garrote ([email protected])

Adaptations of Isopoda to abyssal plains with polymetalic nodules: metal assimilation and accumulation

The student will use Micro‐computed tomography, 3d‐recontruction imaging and TEM microscopy for describing the biological traits of deep sea species and revealing the presence of metal accumulation.

Prática;Teórica;

1Marina R. Cunha ([email protected])

168Patricia Esquete Garrote, [email protected]

Biodiversity and integrative Taxonomy of deep sea Peracarida

Despite their great ecological relevance and abundance, the biodiversity of the deep sea Peracarida is remarkable but largely unknown. The student will be introduced in the discovery and descriptions of species new to science, by means of both morphology and molecular techniques

Prática;Teórica;

1Marina R. Cunha, [email protected]

131Paula Maia; [email protected]

Plantas invasoras e sua gestão no Campus

Levantamento, mapeamento e monitorização de populações de espécies invasoras no Campus. Pesquisa e elaboração de directrizes de gestão. Ensaio de controlo em espécies selecionadas.

Prática;Teórica;

1Olga Ameixa; [email protected]


42 Paulo Cardoso

On the ride of the hyphae: combined application of plant growth promoting bacteria and soil fungi to improve crop productivity

Plant growth promoting bacteria (PGPB) and soil fungi are capable of inducing plant growth and tolerance to stress and diseases. One of the shortcomings of PGBP is their limited dispersion, which can be aided by soil fungi hyphae. This work aims at taking advantage of these features to ameliorate crop production in degraded soils.


43Paulo [email protected]

On the ride of the hyphae: combined application of plant growth promoting bacteria and soil fungi to improve crop productivity

Plant growth promoting bacteria (PGPB) and soil fungi are capable of inducing plant growth and tolerance to stress and diseases. One of the shortcomings of PGBP is their limited dispersion, which can be aided by soil fungi hyphae. This work aims at taking advantage of these features to ameliorate crop production in degraded soils.

Prática; 1Cátia Venâ[email protected]

11Ramiro Almeida ([email protected])

Neurotoxicity of insecticides: using a mamalian nervous system model

Neste projeto será avaliada a neurotoxicidade de alguns pesticidas que podem ser encontrados em alimentos num modelo de sistema nervoso. O trabalho deorrerá maioritariamente no iBiMED, no departamento de ciências médicas.


235Rita Silva ([email protected])

Avaliação da eficácia de tratamento de águas residuais: uma abordagem ecotoxicológica.

Uso de ferramentas ecotoxicológicas com o intuito de avaliar a eficácia da técnica de precipitação química no tratamento de diferentes águas residuais nacionais. Nos testes ecotoxicológicos serão usadas espécies modelo avaliando a sua sensibilidade a águas residuais tratadas e não tratadas. Trabalho realizado no âmbito do projeto NETA: Novas Estratégias no Tratamento de Águas‐Residuais.


141Roberto Martins, [email protected]

Deteção em tempo‐real de nanomateriais em organismos marinhos

O aluno estará envolvido no desenvolvimento de um sistema para a deteção em tempo‐real da internalização de nanomateriais inovadores em organismos marinhos. Nesse âmbito, o aluno de mestrado será responsável pela avaliação da sua eficácia e ecotoxicidade dos nanosensores em organismos marinhos.As atividades decorrerão nos departamentos de Biologia e Física e estão enquadrados no projeto "NANOGREEN ‐ Nova geração de aditivos sustentáveis de base nanotecnológica para revestimentos anti‐corrosivos marítimos: uma abordagem multidisciplinar no espaço Atlântico" (CIRCNA/BRB/0291/2019)".

Prática; 1

Carlos Marques, [email protected] Dep. Física e Laboratório Associado I3N


283Rui Morgado ([email protected])

DNA damage and repair in Porcellionides pruinosus: how much is too much?

DNA damage is one of the most critical damages induced by chemicals at molecular level, leading to effects at higher organization levels. The capacity of soil organisms to repair after exposure to genotoxic compounds is a key trait. Comet assay is used to measure DNA damage in ecotoxicology, but damage repair rates are less often explored in the field. Here, an integrated approach combining DNA damage accumulation and repair is proposed to understand how P.pruinosus copes with genotoxic chemicals.

Prática;Teórica;


284Rui Morgado ([email protected])

DNA damage and repair in Porcellionides pruinosus: how much is too much?

DNA damage is one of the most critical damages induced by chemicals at molecular level, leading to effects at higher organization levels. The capacity of soil organisms to repair after exposure to genotoxic compounds is a key trait. Comet assay is used to measure DNA damage in ecotoxicology, but damage repair rates are less often explored in the field. Here, an integrated approach combining DNA damage accumulation and repair is proposed to understand how P.pruinosus copes with genotoxic chemicals.

Prática;Teórica;


211Salomé Almeida ([email protected])

Impact of urbanization on algal communities

Most urban streams in Mediterranean countries are highly degraded after centuries of intensive and disorganized urbanization and of the poor value attributed by governments and local authorities and population. It is thus urgent to prevent further degradation and improve the ecological quality of urban streams. The aim of this project is thus to assess the impact of urbanization on algal communities associated to streams of the city of Coimbra by comparison with non‐impacted streams.

Prática;Teórica;

1Maria João Feio ([email protected])

157Sérgio Marques ([email protected])

Extração e identificação de pigmentos provenientes de bactérias do microbioma da pele de anfíbios e avaliação da sua atividade antimicrobiana e antioxidante.

A nível industrial o uso de pigmentos naturais tem aumentado, uma vez que apresentam diversas vantagens em relação aos pigmentos sintéticos. Atualmente, também é reconhecido o papel que as bactérias do microbioma da pele dos anfíbios desempenham para o seu sistema imunitário. Tendo em conta que muitas vezes apresentam pigmentos, o objetivo deste trabalho é extrair, identificar e avaliar a atividade antioxidante e antimicrobiana de pigmentos provenientes de bactérias do microbioma de anfíbios.

Prática; 1Sónia Ventura ([email protected])

160Sérgio Marques ([email protected])

Efeito das cinzas associadas aos incêndios florestais na eficácia do sistema imunitário dos anfíbios

Neste trabalho, pretende‐se avaliar os efeitos dos contaminantes associados às cinzas, nomeadamente metais e compostos aromáticos policíclicos, na eficácia da atividade antimicrobiana de bactérias do microbioma de anfíbios.

Prática; 1


161 Silja Frankenbach Photosymbioses under stress

Symbiotic relationships are one of the main drivers of evolution. The target of this work is to investigate the physiological differences between two different types of the so‐called ‘photosymbiosis’ under diverse environmental stressors. Therefore, the stable symbiosis between the dinoflagellate Symbiodinum and the anemone Exaiptasia will be compared with the instable relationship of Symbiodinum with the nudibranch Berghia Stepahnieae using Chl a fluorescence and molecular techniques.

Prática; 1 João Serôdio

163Silja Frankenbach ([email protected])

Photosymbioses under stress

Symbiotic relationships are one of the main drivers of evolution. The target of this work is to investigate the physiological differences between two different types of the so‐called ‘photosymbiosis’ under diverse environmental stressors. Therefore, the stable symbiosis between the dinoflagellate Symbiodinum and the anemone Exaiptasia will be compared with the instable relationship of Symbiodinum with the nudibranch Berghia Stepahnieae using Chl a fluorescence and molecular techniques.

Prática; 1João Serôdio ([email protected])

133

Sofia Caçoilo CorticeiroEmail: [email protected]

Impacte do uso de fogo controlado na produtividade do eucalipto

No âmbito deste tema de mestrado pretende‐se que o aluno estude o impacte do uso de fogo controlado na fisiologia e no crescimento do eucalipto, através da avaliação dendrométrica das árvores e da medição de parâmetros como o potencial hídrico, as trocas gasosas e a condutância estomática. O estudo inclui uma componente de trabalho de campo, que irá decorrer em eucaliptais da zona Centro de Portugal. Este tema será desenvolvido no âmbito do Projeto FirEProd, em parceria com o Instituto RAIZ.

Prática; 1

Glória Catarina PintoEmail: [email protected]

134

Sofia Caçoilo CorticeiroEmail:[email protected]

Eficácia do uso do fogo controlado no controlo da vegetação espontânea

No âmbito deste tema de mestrado pretende‐se que o aluno estude o efeito do uso de fogo controlado assim como de outros métodos de controlo da vegetação espontânea: 1) na riqueza e abundância da vegetação de sobcoberto e 2) na redução do risco de incêndio em povoamentos de eucalipto. O estudo inclui uma componente forte de trabalho de campo, que irá decorrer em eucaliptais da zona Centro de Portugal. Este tema será desenvolvido no âmbito do Projeto FirEProd, em parceria com o Instituto RAIZ.

Prática; 1

Paula Alexandra Aquino MaiaEmail: [email protected]


202Sofia [email protected]

Understanding the mechanisms underlying the interaction of ionic liquids with DNA, using the model organism Drosophila melanogaster

The aim of this work is to study the mechanisms involved in the possible appearance of genetic damage caused by ionic liquids frequently used in the industry, adopting the commonly used model organism for biomedical science Drosophila melanogaster (fruit fly), in order to stablish possible risks to humans.

Research will be developed in collaboration with the Centro de Química Estrutural of the Faculty of Sciences of the University of Lisbon, under the project ILGerants, that aims to search new IL working fluids for refrigeration.

Prática; 1 (uma)Mário [email protected]


Evaluation of beneficial effects related to the consumption of Timorese fens ‐ possible anti‐genotoxic potential for the model organism Drosophila melanogaster

The aim of this work is to evaluate the potential anti‐genotoxic effects of Timorese fens on Drosophila melanogaster, in order to understand any beneficial effects of its consumption for humans

Prática; 1Helena [email protected]


Search for biological pesticides as natural alternatives to the use of traditional chemical pesticides ‐ evaluation of effects on DNA integrity of the model organism Drosophila melanogaster.

This work is intended to evaluate candidates for potential replacement of commonly used chemical pesticides. This study will be based on an understanding of the mechanistic associated with candidate effects on the DNA integrity of Drosophila melanogaster.

Prática; 1Ana [email protected]

213Sofia P. Ramalho ([email protected])

Megafaunal communities from the Gorringe bank (NE Atlantic)

Este trabalho terá como objectivo estudar a distribuição das comunidades de invertebrados bentónicos do monte submarino de Gorringe, nomeadamente dos picos Gettysburg e Ormonde, entre os 60 e os 3015 metros de profundidade. O trabalho incluirá a catalogação e anotação de imagens recolhidas com auxílio do veículo submersível operado remotamente (ROV) Hercules, caracterização geomorfológica dos fundos marinhos e análise de dados, incluindo analises uni‐ e multivariadas.

Prática; 1Marina R. Cunha ([email protected])



Metazoan meiofauna from shallow and deep cold seeps off Svalbard

Este trabalho terá como objectivo estudar pela primeira vez a biodiversidade das comunidades de meiofauna que habitam as fontes frias ricas em metano ao longo da margem continental do arquipélago de Svalbard (78ºN). O trabalho incluirá triagem, identificação taxonómica (clássica e recorrendo a métodos moleculares se necessário), descrição de características funcionais da fauna presente, bem como análise avançada de dados estatísticos.

Prática; 1

O tema será desenvolvido em colaboração com estudantes e investigadores da Arctic University of Norway (UiT), em Tromsø, Noruega.

Giuliana Panieri ([email protected])


Metazoan meiofauna from shallow and deep cold seeps from the Barents Sea

Este trabalho terá como objectivo estudar a biodiversidade das comunidades de meiofauna que habitam as fontes frias ricas em metano ao longo da margem continental da Noruega no Mar de Barents. O trabalho incluirá triagem, identificação taxonómica (clássica e recorrendo a métodos moleculares se necessário) e descrição de características funcionais da fauna presente, bem como de análise de dados estatísticos, incluindo análises uni‐ e multivariadas.

Prática; 1

O tema será desenvolvido em colaboração com estudantes e investigadores da Arctic University of Norway (UiT), em Tromsø, Noruega.

Giuliana Panieri ([email protected])

57Sónia [email protected]

Avaliação do potencial efeito disruptor endócrino de químicos presentes em pó doméstico

O pó doméstico pode conter misturas complexas de compostos químicos capazes de produzir vários efeitos adversos no biota, incluindo disrupção endócrina. O presente trabalho pretende avaliar efeitos de disrupção endócrina provocados por esses compostos em estádios de desenvolvimento aquático de anfíbios.

Prática; 2Isabel [email protected]


Avaliação do efeito de nanomateriais: dos genes ao organismo

O objetivo é investigar os efeitos de nanomateriais em invertebrados de solo, com recurso a ensaios padronizados e a ferramentas de biologia molecular (ex. expressão de genes e omicas relevantes).

Prática;Teórica;


250Susana Loureiro ‐ [email protected]

Desenvolvimento de ensaios ecotoxicológicos usando a oligoqueta aquática Lumbriculus variegatus em exposições simultâneas a contaminantes e diferentes temperaturas.

Avaliação da toxicidade de contaminantes a diferentes temperaturas através de ensaios ecotoxicológicos usando a Lumbriculus variegatus. Este tema de mestrado pretende explorar a capacidade de regeneração desta espécie (reprodução assexuada) para desenvolver protocolos para novos e inovadores ensaios ecotoxicológicos.

Prática; 1Diogo Cardoso ‐ [email protected]


Ecotoxicity of nanomaterials to Daphnia magna: adapting protocols to accurately assess effects

Avaliação da toxicidade de nanomateriais com diferentes características, utilizando diferentes metodologias em Daphnia magna. Trabalho a executar no âmbito do projeto europeu NANOHARMONY (Horizonte 2020).

Prática; 1



Ecotoxicidade de negro de fumo após lixiviação ou escorrência de solos para sistemas aquáticos

Este tema de mestrado envolve o estudo ecotoxicológico de um material originado na pirólise de borracha de pneus em fim‐de‐vida, o negro de fumo recuperado, onde as componentes ecológicas, toxicológicas e químicas serão abordadas de uma forma integrada.Para isso, será simulada uma lixiviação ou escorrência de solos contaminados com negro de fumo recuperado, e a ecotoxicidade em organismos dulçaquícolas (ex. dáfnias, lemnas, peixe zebra) será avaliada. As análises químicas ao material lixiviado será igualmente parte integrante do estudo.

Prática; 1 Sónia Rodrigues (DAO)Sónia Rodrigues ([email protected])


Avaliação da toxicidade de novos nanofungicidas em organismos edáficos

Este trabalho vai ser desenvolvido no âmbito do projeto AgriTarget (http://www.cesam.ua.pt/index.php?menu=198&language=eng&tabela=projectosdetail&projectid=1015) e tem como objetivo avaliar a toxicidade de nanofungicidas à base de cobre em organismos de solo, tendo em conta a matrizes poliméricas usadas na encapsulação de cobre e as propriedades do solo.

Prática; 1 Sónia Rodrigues (DAO)Sónia Rodrigues ([email protected])


85Teresa Amaro ‐ [email protected]

The effect of mining on benthic deep‐sea ecosystem functioning

In‐situ experiments were performed to assess the transfer of matter and energy in the benthic food webs, following the pulse‐chase approach in the Clarion Clipperton Zone (CCZ) (3). Four open mesocosms were deployed in an area populated with dominant holothurian megafaunal specimens in the CCZ during 5 days. Only one‐time treatment was considered due to lack of time. One holothurian organism was put into each open chamber. Labelled particulate organic material (13C algae ‘POM’) were added to the chambers and after 5 days, the holothurian organism and 3 sediment push cores were collected. Upon recovery, each core was divided in 5 layers: 0‐1, 1‐3, 3‐5, 5‐10 (2, 3) where meio and macrofaunal components, as well as analysis of phytopigments and lipids (OM) will be analysed. For OM compounds, each layer was deep‐frozen at ‐ 80ºC (2, 1). Meio and macrofauna samples were preserved in 100% ethanol. Upon retrieval, each holothurian was transferred immediately into a temperature‐controlled laboratory at 4ºC. The processing of the in‐situ sediment samples will be done as follows: 1. Meio‐ and macrofauna sampling and community structure will be sorted into major taxa and then identified to species level whenever possible. Species abundance will be determined and densities will be calculated as the pooled number of individuals in relation to the area sampled and expressed as individuals per m2 (8). All the laboratory work will be performed at CESAM. Food web structure will be investigated using C and N stable isotopic ratios (δ13C and δ15N), as they provide time‐and space‐integrated insights into trophic relationships among organisms, and thus can be used to develop models of trophic structure. The results of the in‐situ experiments will be used to assess the transfer of C and energy flow in the benthic food webs by taxa of all size classes with special emphasis on megafaunal surface deposit‐feeders (holothurians).

Prática; 1Marina Cunha ‐ [email protected]

187Vera L. Maria; [email protected]

Estudo dos potenciais efeitos tóxicos de (nano)materiais de elementos raros da Terra em peixes‐zebra (larvas versus adultos).

As propriedades físico‐químicas únicas dos elementos raros da Terra (ERTs) têm permitido a sua ampla aplicação como e.g. aditivos para fertilizantes e rações. Este extenso uso tem potencializado a contaminação em larga escala de ERTs no meio ambiente. O objetivo principal deste estudo é avaliar os possíveis desequilíbrios no sistema antioxidante, nervoso e nos conteúdos energéticos do peixe‐zebra. O estádio de desenvolvimento dos peixes poderá condicionar o tipo de resposta biológica à exposição dos ERTs.

Prática; 1

Ana Capitão; [email protected]Ângela Barreto; [email protected]


269Victor Manuel Fernandes Galhano ([email protected])

Avaliação dos efeitos ecotoxicológicos de um stressor abiótico (NaCl) e químico (SLESnS‐LAS) em organismos aquáticos

Estudo de efeitos ecotoxicológicos de um stressor abiótico (salinidade) e químico [complexos micelares formados por combinações de surfactantes de éter sulfato (SLEnS) e linear alquil benzeno sulfonato de sódio (LAS)] em Raphidocelis subcapitata e Daphnia magna. Preparação e manutenção de culturas; testes de toxicidade; avaliação do efeito dos stressores na: i) evolução da biomassa e crescimento (algas); e ii) imobilização/sobrevivência (dafnídeos); análise estatística; relatório científico.

Prática;Teórica;

1

Isabel Maria Cunha Antunes Lopes ([email protected])


mestrado em biologia aplicada

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