serviços de genotipagem em plataforma iscan / illumina : colaboração entre a deoxi &...

Serviços de genotipagem em plataforma Serviços de genotipagem em plataforma iScan/Illumina: colaboração entre a iScan/Illumina: colaboração entre a

DEOXI & EMBRAPADEOXI & EMBRAPA

Rodrigo AlonsoRodrigo AlonsoDeoxi BiotecnologiaDeoxi Biotecnologia

Diretor ExecutivoDiretor Executivo

Empresa Privada – Fundada em Araçatuba/SP – Out/2008Empresa Privada – Fundada em Araçatuba/SP – Out/2008

““Spin Off” Spin Off” Campus de Araçatuba

NOSSA MISSÃO NOSSA MISSÃO Desenvolver produtos e processos inovadores em Desenvolver produtos e processos inovadores em

biotecnologia, através da integração do conhecimento biotecnologia, através da integração do conhecimento científico, tecnologias avançadas e gestão estratégica.científico, tecnologias avançadas e gestão estratégica.

ServiçosServiços

Soluções em Genômica

Coleta

Armazenamento

Extração de DNA

Rastreabilidade

Elaboração e Gerenciamento

de Projetos

Análises Genômicas

Bioinformática

Teste de Paternidade

por SNP

Farmacogenômica

Diagnóstico Genético Pré -Implantacional

iScan - Illumina

GoldenGate

Infinium

MiSeq (NGS)

LaboratóriosLaboratórios

Histórico de P&DHistórico de P&D

• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (Fase I e II)- Diagnóstico genético pré-implantacional em embriões bovinos produzidos in vitro.

• Programa PRIME – Primeira Empresa Inovadora – FINEP- Aplicação da seleção assistida por marcadores moleculares nos programas detransferência de embriões bovinos.

• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – PIPE/FAPESP (FASE I)- Desenvolvimento de teste de DNA para seleção de touros de alta fertilidade.

• Subvenção Econômica - FINEP- DNAids: Diagnóstico rápido da predisposição genética aos efeitos adversos em pacientes HIV+ submetidos à terapia anti-retroviral.

Histórico de P&DHistórico de P&DHistórico de P&DHistórico de P&D

• RHAE – Pesquisador na Empresa – CNPq- Desenvolvimento de “NanoChips Genômicos” para aplicação em saúde humana, agropecuária e meio ambiente.

• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas – Subvenção 2012 PAPPE/PIPE – FAPESP/FINEP – Desenvolvimento de linhagem congênica de bovinos da raça Nelore com mutação no gene da miostatina.

• Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (PIPE – FAPESP)- Uso de arrays genômicos de alta resolução e “Next Generation Sequencing” no diagnóstico de deficiência intelectual e anomalias congênitas – PIPE Fase II.

Clientes: Genômica AnimalClientes: Genômica Animal

Clientes: Genômica HumanaClientes: Genômica Humana

Low to mid-plex molecular testing.

BeadXpress

Sequencing-compatible array

instrument.

HiScan

Dedicated array

instrument.

iScan

Two proven technologies.One powerful platform.

HiScanSQ

Plataformas Illumina…Plataformas Illumina…

Bead Arrays

Tecnologia Bead Array…Tecnologia Bead Array…

Tecnologia Bead Chip…Tecnologia Bead Chip…

iScanBeadArray Technology

INFINIUM GOLDENGATE

INFINIUMGOLDENGATE

Painéis CustomizadosPainéis CustomizadosDe 96 – 3072 SNPsDe 96 – 3072 SNPs

Diversos produtos prontos Diversos produtos prontos para serem utilizadospara serem utilizados

De 3K – 5 milhões SNPsDe 3K – 5 milhões SNPs

Golden Gate X InfiniumGolden Gate X Infinium

Alta SensibilidadeAlta Sensibilidade

Alto limite de detecçãoAlto limite de detecção

Alta reprodutibilidadeAlta reprodutibilidade

Dados de alta qualidadeDados de alta qualidade

Call Rate > 99%Call Rate > 99%

Plataforma robustaPlataforma robusta

Aplicações no AgronegócioAplicações no Agronegócio

PorcineSNP60 BeadChip- 62,163 informative SNP markers

OvineSNP50 BeadChip- 54,241 informative SNP markers

CanineHD- 170,000 SNP markers

Maize SNP50 BeadChip- 56,110 informative SNP markers

Qual a vantagem de terceirizar Qual a vantagem de terceirizar serviços de genotipagem?serviços de genotipagem?

Alto Custo dos EquipamentosAlto Custo dos Equipamentos

Alta capacidade de análiseAlta capacidade de análise

Mão de obra especializadaMão de obra especializada

Comprometimento com o resultadoComprometimento com o resultado

Comprometimento com prazosComprometimento com prazos

Poder de negociaçãoPoder de negociação

Custo-benefícioCusto-benefício

PARCERIA DE SUCESSO!!!PARCERIA DE SUCESSO!!!

- Marcos Vinícius Barbosa da Silva- Maria Gabriela Peixoto- Marta Martins- Marco Antônio Machado- João Cláudio Panetto

- Monica Correa Ledur- Ricardo Zanella- Rodrigo Torres (BRF)

- Fernando Flores Cardoso- Fabiane Siqueira- Andrea do Egito

““Next-Generation Sequencing”Next-Generation Sequencing”MiSeq/IlluminaMiSeq/Illumina

www.deoxi.com.br

rodrigo@deoxi.com.br