1 ANCP – 15MAY2015

USO APLICADO DAS TECNOLOGIAS DE

GENOTIPAGEM NA PREDIÇÃO DO

MERITO GENÉTICO EM NELORE

Jason B. Osterstock, DVM, PhD

Director, Global Genetics Technical Services

2 ANCP – 15MAY2015

Aumente a sua Lucratividade

3 ANCP – 15MAY2015

A carteira de quem vc vai escolher?

• Você pode escolher de acordo com a reputação

das pessoas nesse auditório...

4 ANCP – 15MAY2015

A carteira de quem você via escolher?

• Vc pode escolher com base no grossura da

carteira…

5 ANCP – 15MAY2015

A carteira de quem vc vai escolher?

• Vc pode escolher olhando o que tem dentro

dela…

6 ANCP – 15MAY2015

Tecnologias Genômicas

Aumentar a acurácia na seleção

Muitos tipos de informação contribuem para a acurácia das nossas predições – pedigree, desempenho, progenie & genomica. Predições mais acuradas suportam decisões mais precisas e acelerado ganho genético

Fornecer estimativas na fase inicial (animais jovens)

Quanto mais cedo identificarmos animais superiores, mais cedo poderemos implementar estratégias de melhoramento genético. A genômica fornece informações valiosas sobre caracteristicas que não podem ser medidas antes da vida adulta (i.e., fertilidade e longevidade), e carcterísticas que não podem ser mensuradas em vida (i.e., carcassa )

Características de difícil mensuração

Para algumas características, coletar fenótipo para informar as predições genéticas podem ser muito difícil e de alto custo (i.e., ingestão de comida e longevidade). A genômica ajuda a informar sobre o potencial gen´tico para essas características, mesmo nos animais em que não é possível observar o fenótipo.

7 ANCP – 15MAY2015

Uso das Avaliações Genômicas

Canada

Angus, Holstein, Jersey,

Brown Swiss, Ayrshire

Argentina

Holstein

Oceania

Angus, Holstein, Jersey

USA

Angus, Holstein, Jersey,

Brown Swiss, Ayrshire,

Hereford, Simmental,

Red Angus, Brangus,

Gelbvieh, Santa

Getrudis, Limousin…

Europe

Holstein, Irish Beef

Brazil

Nelore

8 ANCP – 15MAY2015

Melhoramento Genético - Simplificado

Quais

animais devo

manter ou

comprar, e

quais

descartar?

Qual touro

deveria

servir essa

novilha ou

vaca?

Quantos

filhos eu

quero ter

dessa matriz

no ano?

A genômica consegue fornecer informações no

momento adequado e isso ajuda a acertar nas

decisões de seleção que resultarão maior rentablidade

no futuro.

9 ANCP – 15MAY2015

Exemplo – Three Trees Ranch, Georgia, USA

10 ANCP – 15MAY2015

0

20

40

60

80

100

120

140

2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013

Idad

e d

os P

ais

(M

eses)

Year de Nascimento do Touro

Sire

Dam

Idades dos Pais dos Touros HO nos EUA

Wiggans, China Emerging Markets Seminar, 2013

11 ANCP – 15MAY2015

Progresso Genético em gado HO nos EUA

Início do

uso da

genômica

(parte do

rebanho)

Todas as

bezerras

testadas

12 ANCP – 15MAY2015

Equilibrandro o valor da Tecnologia

Como encontrar o

equilíbrio entre a

necessidade de aumentar

a acurácia com o custo

efetivo da solução?

Genotipagem com

plataformas de alta

densidade tem alto custo.

Vale a pena usá-las?

13 ANCP – 15MAY2015

Influência do número de marcadores na

confiabilidade

Confiabilidade esperada de acordo com o número de touros na população de

referência usando chips com 3.000, 50.000 or 500.000 marcadores

VanRaden, et al. Genetics Selection Evolution 2011 43:10

14 ANCP – 15MAY2015

Influência do número de marcadores na

correlação genética

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0,8

IPP PPP STAY P120 P210 P365 P450

Co

rrela

ção

Gen

éti

ca

Validação Externa

50Kv2 Calibration 770K Calibration

Boddhireddy et al. J Anim Sci 2013 Vol. 91, E-Suppl. 2.

15 ANCP – 15MAY2015

Genotipagem de baixa densidades e

Imputação

• Estimar a genotipagem de um

animal em alta densidade,

partindo de uma com menor

densidade:

– Otimiza o equilibrio entre custo

da genotipagem e a acurácidade

nas predições

– Proporciona um melhor

custo/benefício, permitindo que

os produtores tenham mais

animais testados para tomar

decisões de seleção.

é como ler uma

frase com letras

que faltam

16 ANCP – 15MAY2015

A eficiência da imputação

90

92

94

96

98

100

0 20 40 60 80

Acu

rácid

ad

e n

a I

mp

uta

ção

(%

)

Número de marcadores no Chip

Carvalheiro et al. Genet Sel Evol 2014 46:69.

• A acurácia na imputação depende parcialmente da densidade do

chip.

• O ponto chave é ter uma imputação referência que seja validada

com uma boa quantidade de animais importantes.

17 ANCP – 15MAY2015

Produtos genômicos no

Angus USA

18 ANCP – 15MAY2015

A genômica no gado comercial…

19 ANCP – 15MAY2015

Resumindo

• O uso da informação genômica na avaliação

genética está se tornando comum mundialmente.

– ANCP está bem posicionada para liderar esses avanços na

raça Nelore.

– Plataformas de genotipagem com bom custo/benefício

combinado com a imputação estão agregando valor à

genômica.

– Criadores estão usando a genômica de forma mais intensa

em seus rebanhos: • Menos marketing / Mais melhorias nas estratégias de melhoramento

–Criando novas oportunidades para rebanhos comerciais • Seleção de novilhas de reposição complementando o uso que é

feito nos touros de rebanhos registrados/selecionados.