protocolo citometria de fluxo

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PROTOCOLO CITOMETRO DE FLUXO Prof. Enrique R. Argañaraz Lab Virologia Molecular Faculdade de Ciências da Saúde Universidade de Brasília

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Protocolo de citometria

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  • PROTOCOLO

    CITOMETRO DE FLUXO

    Prof. Enrique R. Argaaraz Lab Virologia Molecular

    Faculdade de Cincias da Sade Universidade de Braslia

  • FLUXOGRAMA

    I. Iniciar Sistema

    1. Ligar o aparelho na seguinte ordem: Ligar o aparelho na seguinte ordem:

    Ligar estabilizador.

    Ligar o Citmetro de Fluxo.

    Ligar o Computador; deixar 5 a 10 (para atingir mxima potncia)

    2. Checagem de Reservatrios

    Vasilhame de Descarte gaveta esquerda (descartar o liquido e acrescentar 50-100 ml hipoclorito concentrado)

    - Observar se est em Standby (S assim o equipamento est pronto para uso).

    Vasilhame FACS FLOW Verificar presso ( puxar alavanca em direo ao operador) 1. Apertar bem a tampa 2. Encaixe do tubo Nota: No esquecer de desligar a presso ante de abrir o vasilhame

    Apertar RUN e HIGH Objetivo: para que o sistema se complete com o FACS flow novo. Nota: monitorar ate ausncia de bolhas na mangueira (tirar a mangueira do

    filtro e tirar as bolhas)

    Se as bolhas no desaparecerem, apertar HIGH e PRIME esperar voltar a Stanby. Objetivo: tirar bolhas e a soluo velha.

    3. Abrir o programa Cell Quest Pro.

    Fechar a folha em branco Untitle (Dont Save).

    Abrir a planilha, pode estar pronta : File Open Document Abrir a Planilha de Aquisio Open.

    File Document Size Criar uma Folha.

    4. Conectar o computador ao aparelho:

    Acquire Connect to Cytometer (ma + B) Ao conectar, a janela do Browser aparece automaticamente (Parameter Description).

    Iniciar Sistema

    Controle de Qualidade

    Ajustar Parmetros

    Gravar Dados

    Analisar Dados

    Desligar Sistema

  • Figura 1

    Ao conectar o computador ao FACS aparecer o menu aquisio Aquisio control

    Figura 2

    5. Nmero e Tipos de Eventos que sero Adquiridos)

    Clicar em Acquire mais uma vez;

    Clicar em Aquisio and Storage aparecer menu abaixo

    Figura 3

  • Neste menu se podem escolher os critrios para salvar e exibir os eventos.

    Aquisio Gate: quais eventos sero salvos ou rejeitados, os eventos podem compor uma dada populao (morfologica ou fenotpica)

    Nota: em geral se deixa como All para ter salvos todos os eventos e excluir apenas na anlise

    Collection Criteria: se define com que nmeros de eventos a aquisio ser encerrada ( seja de eventos totais ou uma dada populao);

    Storage Gate: os eventos que sero salvos se aconselha deixar em All ; Resolution: selecionar o valor 256;

    Parameters saved: quais parmetros sero salvos. Devem ser selecionados FSC, SSC ( morfologia, tamanho) e as fluorescncias

    Figura 4

    6. Identificao das Amostras ( nome e destino dos arquivos)

    Ao conectar o citmetro aparecera automaticamente o menu abaixo

    Figura 5

  • Folder: em que pasta sero gravados os dados, ex iniciais do operador.

    custom prefixmudar para simple ID

    File name prefix: nome do experimento

    File name suffix: se mantido enumerar de forma crescente

    Figura 6

    Ainda no parametr description se repete no item Sample ID: o nome do tubo ex. Mock;

    Se deve colocar dos eixos dos grficos: P1-FSC; P2-SSC; P3-FL1; P4-FL2; P5-FL3. Pode-se ainda se escolher outros eixos ex anti-CD3 FITC ao invez de FL1, como nome do eixo P1.

    Nota: possvel s se existe um tipo de Ac conjugado a FITC. Fechar, no tem ok

    7. Abrir as 4 janelas (maa 1,2,3,4) ou Cytometer abrir as seguintes janelas:

    i. Detectors/Amp (ma + 1) (mudar para log FL1,2 e3) ii. Threshold (ma + 2).

    iii. Compensation (ma + 3). iv. Status (ma + 4)

    v. Instrument Settings Open Procurar uma Compensao

    (Feita com as Beads ou CD3-CD4-CD8) Set Done.

    Figura 7

  • Detectors/ Amp: FSC e SSC devem ser mantidos em Linear e as fluorescncias em Log; Pode-se ligar o seh]gundo laser four color (635 nm-vermelho)

    Compensation usado se houver 2 ou mais marcaes

    Threshold: usado para tirar debris

    8. Na pagina principal abrir Plot

    Figura 8

    Em Plot Source: selecionar Axquisition e em seguida parecero X e Y parameters que foram previamente selecionados parameters saved;

    Escolher os eixos desejados: ex para 3 fluorescencias FSC x SSC; FL1 x FL2, FL1 x FL3 e FL2 x FL3.

    Pode-se escolher No Gate ou apenas os eventos que interessam, selecionando uma regio de interesse. Nota: Mesmo que selecione um gate todos os eventos estaro sendo salvos

    como determinado em Aquisio & Store

    Para abrir Histogramas selcioanr plots e depois Histogram

    Neste ponto poder ser adquiridas as amostras controles para ajustar os parmetros. Sempre com o item Setup selecionado Figura 2

  • 0 200

    400

    600

    800

    1000

    0

    200

    400

    600

    800

    1000

    Linfcitos

    Moncitos

    Neutrfilos

    II. Ajuste de Parmetros ( Settings)

    Deve ser seguido o roteiro abaixo

    A. Ajuste de morfologia

    - Passar a amostra Mock e no plot de Foward / Side- Sacatter; - Mexer no Detector / Amp para distribuir a populao e distinguir as diferentes

    populaes, vide exemplo

    Figura 9 - Em A a voltagem SSc esta muito alta e B a de FSC esta alta, permitindo a aquisio de

    debris o que diminuir os eventos plauciveis de serem analizados.

    - A voltagem de FSC deve ser mantida em E00 e como em B tem muito debris o valor de FSc deve ser diminudo ou mesmo para SSC, at ficarem satisfatrios como figura abaixo

    . Figura 10

    Passos da otimizao Amostras para otimizao

    A. Ajustar as voltagens de FSC e SSC.

    B. Ajustar threshold.

    C. Seleo de populao de interesse gate.

    D. Ajustar as voltagens dos PMT.

    Controle No Marcado

    E. Compensao.

    Controle com FITC Controle com PE Controle com PerCP

  • FSC-H

    0 200

    400

    600

    800

    1000

    0

    200

    400

    600

    800

    1000

    DEBRIS

    B. Ajustar o Threshold -Excluso do Debris

    Existem duas formas de excluir o debris: a) Baixar a voltagem do FSC b) Aumentando o Threshold, at que o debris deixe de ser visualizada

    Figura 11

    C. Seleo de populao de interesse gate.

    D. Ajuste de voltagens (FSC e SSC)

    Fazer gate na populao de interesse e ajustar as voltagens dos PMT.

    Objetivo: evitar falso positivo e falso negativo clulas no marcadas como controle

    SSC-H

    Em qual parmetro

    usa-se o treshold?

    Sem ajuste Com ajuste

  • E. Compensao- Vazamento

    Muitas fluorescncias apresentam superposio-vazamento para outros canais, pelo que tem que ser realizada a compensao

    Sobreposio de Espectros

    a) Passar os controles (+) para cada fluorescncia e compensar, ou seja aumentar as diferencias entre as fluorescencias para tirar o vazamentoi-sobreposio das fluorescencias.

    Compensao do FITC ( +FITC/-PEC)

    Sem ajuste Com ajuste

    Relative

    Intensity

    500nm

    550nm

    600nm

    650nm

    700nm Wavelength (nm)

    FITC

    530/3

    0

    PE

    585/42

    Aumente o

    valor

    0.0

    PERCP

    670nm

  • Compensao PEC (- FITC/+ PEC)

    Compensao (-FITC / - PEC) Ajustar as populaes para que a populao fique no quadrante duplo

    negativo. Salvar

    Aquire ---- Adquisio store: - definir R1 e o nmero de eventos Parmeter description--- Sample ID---nome de cada tubo passar os controles novamente clicando no settting para que grave Onde os valores de parmetros ficam armazenados?

    II. Aquisio das Amostras

    c) Salvar Aquire ---- Adquisio store: - definir R1 e o nmero de eventosParmeter description--- Sample ID---nome de cada tubo

    Sem ajuste Com ajuste

    Relative

    Intensity Aumente o valor

    1.2

    Wavelength

    (nm)

    PE

    585/42 PERCP

    670nm

    FITC

    530/3

    0

    PE-Cy7

    780/60

  • Apndice I. Calibrao automtica por beads - FACS comp.

    1. Preparar os seguintes tubos a) 1 ml de FACS Flow + 1 gota de beads no marcados b) 3 ml de FACS Flow + 1 gota de cada fluorescncia

    2. Abrir o FACS Comp a) defenir o tipode clula: se lavada ou no b) Cdigos: colocar os cdigos de cada beads c) Se vai se gravar ou no

    II. Para puxar uma calibrao anterior

    a) Uma calibrao anterior Abrir Citometer---- Instrument setting---Open----Puxar a calibrao anterior

    b) Calibrao do FACS Comp Abrir FACS station-----BD files---- Instrument setting----Calibration files--- ---- Open--- set----Done

    III. Imprimir relatrio

    Abrir FACS station-----BD files ---FACS comp files--- Pasta do dia---- cliques

    OBSERVAOES IMPORTANTES

    Limpeza do filtro de ar. Lavar periodicamente com detergente neutro, deixando ele secar e recolocando na grade do filtro, sempre lembrando com a proteo metlica para baixo.

    Limpeza do tanque de isoton Para a retirada da sonda tomar cuidado para no rodar toda a sonda, rodar somente a parte branca que envolve a sonda, pois pode levar a quebrar o fio que leva a informao para o aparelho se o isoton esta cheio ou vazio

    Nvel dos tanques A importncia de verificar o nvel dos tanques: se o isoton estiver abaixo do nvel mnimo a coluna de ar ser maior que a de lquido, levando a adquirir muito ar podendo prejudicar as amostras.

    Enchendo o tanque de isoton No momento em que for encher o tanque de isoton tomar cuidado com a limpeza do funil e do Becker, que poder a levar a cair partculas de sujeira que

  • acarretara no mal uso do citmetro podendo levar ate o entupimento do aparelho.

    Tanque de waste O tanque de waste quando estive cheio descartar na pia, e depois colocar 100ml de hipoclorito concentrado e levar de volta ao citmetro.

    Kit bsico importante ter um kit bsico na sala de citometria, que composto por um esguicho de gua bi destilada,de hipoclorito a 1% e outro de isoton, com uma observao importante, o hipoclorito no pode ficar em um frasco transparente por que s ira durar 1 dia e a gua tem que ser trocada diariamente por que pode criar alga.

    Entupimento do citmetro Caso ocorra o entupimento do citmetro, temos 3 procedimentos que poderamos fazer para resolver. O 1 dando o prime no prprio aparelho com a gua no SIP, este procedimento ira provocar uma presso para o lado de fora do SIP tentando limpar o sugador. 2 passo usando uma seringa com um cano de plstico que ira ligar ao SIP que atravs da presso exercida que ser maior que a do prime para o desentupimento do SIP. 3 passo utilizando um fio muito fino que colocaremos dentro do SIP e empurrando de um lado e puxando do outro para desobstruir o SIP.