nome científico
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Nomes cientificasTRANSCRIPT
Por que classificar?
Após desenvolver a fala, o Homem quis organizar seu mundo e começou agrupar, ou classificar, todo em seu mundo
Descrição
= separar atributos
Caráter = um atributo (como o cor da pétala)
Estados de Caráter = duas ou mais formas de um caráter ( “branco,” “vermelho”).
Por que classificar?
Animais que nadam Animais que voam Animais que rasteam Animais que caminham com quatro
pernas Animais que mastigam sua comida Animais que engulam sua comida Animais que são tóxicos
Classificação
Colocando objetos, como seres vivos, em algum tipo de ordem.
Classificação fenotípica
– Baseada na similaridade geral
– Os objetos mais similares são classificados
mais próximos
Problema com a classificação fenotípica
Pode ser arbitrária, Como classificar essas formas?
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Confusão de Usar Nomes Diferentes
Existem mais de 50 nomes comunes parar o animal das últimas duas transparencias. Os nomes vulgares variam por região. Então, o que fazer?
Por que classificar?
Para ajudar o estudo da natureza
Para ajudar a organização das espécies descobertas . .
Classificação e Identificação
Classificação: A colocação de organismos em grupos de espécies com parentesco. Listas das características de organismos conhecidos.
Identificação: Comparando as características de um organismo desconhecido a listas de organismos conhecidos. – Identificação no Campo
– Identificação no laboratório
– Identificação no museu/herbário
– Identificação clínica
Identificação = associar um desconhecido com um
conhecido
Como? Somente uma: Decisões binárias
Chave taxonômica;
Árvore …………………………………….…………… 1
Folhas simples …….………………………… A
Folhas pentas …….………..…..…..…… B
Herbácea …………………………………….…………… 2
Flores vermelhas …….…………………………… A
Flores brancas …….…………………..…… B
Interpretação da Literatura
Diferencia entre identificação errada e sinônimo não sempre fica clara – Lista dos nomes de um nome taxonômico numa
revisão taxonômica as vezes tem ambos!
Autores diferentes usam classificações diferentes
Importância de uma base de dados inteligente, que ajuda interpretar os nomes – Precisa ter informação de sinônimo, variações…
Existem 13 bilhões de organismos conhecidos
Mas é somente 5% de todos os organismos que viveram!!!!!
Organismos novos ainda são descobertos e identificados
Espécies de Organismos
Por que classificar?
Para dar nome a cada espécie baseado num método padronizado de forma que os cientistas de países diferentes podem falar sobre o mesmo animal sem confusão
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O que é a Classificação?
A classificação é o arranjo de organismos em grupos ordenados a base de suas similaridades
A classificação também é chamada taxonomia
Os taxonomistas são cientistas que identificam e dão nomes aos organismos
Taxonomia
A ciência que lida com – Nomenclatura: dar nomes ‘científicos’ as espécies
• Regulado severamente, códigos diferentes para botânica, zoologia, bactéria
– Classificação: criar e nomear grupos, ‘taxa’
‘Sistemática’ é usado como equivalente
A Taxonomia é...
“A reclassificação perpétua de
espécies com nomes errados.”
“Um mal necessário.” - Randall Kosaki
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Taxonomistas Antigos
Há 2000 anos, o primeiro taxonomista foi Aristóteles Aristóteles dividiu os organismos em plantas e animais Os organismos eram classificados pelo seu habitat ---habitantes da terra, oceano, ou ar
Teofrasto (370-285 B.C.)
• Pai da Botânica, aluno de Aristóteles.
• Classificou as plantas a base de forma. – Árvore
– Arbusto
– Subarbusto
– Herbácea
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Taxonomistas Antigos
John Ray, botânico, foi o primeiro de usar Latim para nomear e foi o primeiro usar espécie
Seus nomes eram compridos com descrições sobre todo sobre a planta
Naturalistas Gregos e Romanos, herbalistas medievais; taxonomistas caipiras: nomes populares Os naturalistas antes de Lineu:
nomes em Latim nomina specifica; nome binominal, trinominal ou até polinominal (e.g. Iris perpusilla saxatilis Norbonensis a caulis ferme)
nomes inconsistentes e muitas vezes muito cumpridos (propósitos
de diagnoses, descrição e identificação)
Historia da Nomenclatura
Científica
Images: Biodiversity Heritage Library
Carolus Linnaeus 1707 – 1778
Taxonomista do século
Classificou os organismos pela sua estrutura
Desenvolveu o sistema de nomeclatura usada até hoje
Image: Wikimedia Commons
Carolus Linnaeus 1707-1778
Image: Biodiversity Heritage Library
Nomenclatura Binomial
Bi indicaa dois
Nomen é nome
A nomenclatura binomial é um sistema de classificação que usa dois nomes para identificar um organismo
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Carolus Linnaeus • O pai da taxonomia
• Desenvolveu o sistema de nomenclatura binomial
• Nome de duas palavras (Gênero e espécie)
• Os sistemas de classificação [Species plantarum (1753) e Systema naturae (1758)]
nomina trivialia; sempre com estrutura binomial
• Gênero e espécie.
• Exemplo. – Nepeta cataria L.
– “Nepeta floribus interrupte spicatus pedunculatis”
estilo diagnostico
• Necessidade de códigos universais
Nomes Científicos
No princípio, Latim ou nomes Latinizados Regulado pelos códigos:
– Códigos são escritos e mantidos por Comissões • International Code for Zoological Nomenclature • International Code for Botanical Nomenclature • International Code for Bacterial Nomenclature
– Comissões são juízes das disputas
Problema: muitos organismos unicelulares não são plantas ou animais e tem dois nomes – Alga verde azul = cianobactéria
Os Nomes Científicos estão em
Latim
Regras da gramatica Latim
Concordância no genro
Mastigocerca capucina Wierzejski e Zacharias, 1893
Rattulus capucinus : Jennings, 1903
Trichocerca capucina (Wierzejski e Zacharias, 1893) Harring, 1913
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Benefícios da Classificação
Identifica or organismos de forma precisa e padronizada
Evita nomes estúpidos Usa a mesma linguagem (Latim ou
Grego) para todos os nomes
”Cavalo” do mar??
Nomes são únicos
… mas não absolutamente – O nome botânico pode ser o mesmo do nome
zoológico
– Não existe um cadastro central (ainda), o que permite espaço amplo para erros • Nome ‘Já ocupado’
– Precisa ser substituído com outro nome – nome de ‘substituição’
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Holacanthus bishopi Pomacanthus imperator
Nomes são únicos?
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)
Pomacanthus imperator
= Holacanthus bishopi
Centropyge flavissima Centropyge flavissima
Nomes são únicos?
Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)
Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)
Pomacanthus imperator
= Holacanthus bishopi
Centropyge flavissima Centropyge heraldi
= Centropyge flavissima
Nomes são únicos?
Pneumocystis jirovecii foi classificado como uma protozoa até a analise de DNA demonstrou que era um fungo. Isso tem importância de se um organismo é classificado como protozoa ou fungo?
Por que classificar?
A classificação pode mudar
Filogenia = estudo científico, – Resultados da pesquisa pode mudar nosso
entendimento – Interpretação dos fatos pode ser diferente entre
os cientistas
Difícil construir uma classificação completa e consistente
Pode levar a mudança de nomes – A espécie muda de um gênero a outro… – Quando o gênero tem outro genro
Monostyla closterocerca Schmarda, 1853
O que tem em um nome?
Com nome do sub-gênero:
Lecane (Monostyla) closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935 Curto:
Lecane (M.) closterocerca (Shmarda, 1853) Or: L. closterocerca
combinação nova: Lecane closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935
Com nome de subespécie: trinominal
Lecane (Monostyla) closterocerca amazonica Koste,
1972 Ou: L. closterocerca amazonica
O que tem num Nome?
Anthias
Pseudanthias
Anthias (Pseudanthias)
Anthias ventralis
Anthias hawaiiensis
Anthias (Pseudanthias) ventralis
Anthias (Pseudanthias) hawaiiensis
Pseudanthias ventralis
Pseudanthias hawaiiensis
Pseudanthias ventralis ventralis
Pseudanthias ventralis hawaiiensis
Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis ventralis
Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis hawaiiensis
“Nome” num texto: 13
“Nome” sensu Zoologia: 4
Anthias Pseudanthias ventralis hawaiiensis
O que é um Nome?
“Nome” sensu Botânica: 9
Requerimentos Formais do ICZN
O nome ou ato de nomenclatura precisa ser publicado;
Os nomes científicos precisam ser escritos usando as 26 letras do Alfabeto Latim;
A derivação: um nome pode ser derivado de qualquer idioma, ou ainda de uma combinação arbitraria de letras se foi formada para ser usada como uma palava (não cbafdg);
=> muita liberdade!
Exemplos….
Diferencia de uma letra: Tortricidae (Moths, Northern Mexico: (Kearfott, 1907)
Eucosma fandana Eucosma gandana Eucosma handana Eucosma landana Eucosma mandana Eucosma nandana Eucosma pandana Eucosma sandana Eucosma wandana
Mas também:
Cydia candana
Epiblema tandana Epinotia xandana Epinotia zandana
Pelochrista randana Pelochrista vandana
Brincando com Latim: • Stupidogobius Aurich, 1938 (peixe estúpido)
Localidades: • Panama canalia Marsh, 1993 (Braconidae) • Belgica antarctica (Chironomide) • Mexico (besouro e virus) • Texas (Pentatomidae e vírus) • Neotiglossa (Texas) californica Bliven, 1958
Mithologia: • Zeus Linnaeus, 1758 (peixe) • Kali Lloyd, 1909 (peixe) • Satan Hubbs & Bailey, 1947 (peixe),…
Exemplos….
De novo… • Cyclocephala nodanotherwon Ratcliffe (Scarabidae) • Ochisme, Polychisme, Dolichisme, Peggichisme Kirkaldi, 1904 • Iyaiyai Evenhuis, 1994 • Agra vation Erwin, 1983 • Notnops, Taintnops, e Tisentnops Platnick, 1994 (aranhas
originalmente no gênero Nops MacLeay, 1839
Pessoas (“honorificas”): • Cartwrightia cartwrighti Cartwright, 1967 (Scarabidae) • Hoia hoi (copepode parasitico), para Ju-Shey Ho • Leonardo davincii Bleszynski, 1965 (Pyralidae) Mas também (“horrorificas”): • Dyaria Neumoegen, 1893 (Liparidae) para Mr. Dyar.
Exemplos….
Hierarquia: níveis
Reino: Animalia, Plantae… Filo: Arthropoda, Echinodermata… Classe: Crustacea, Insecta… Ordem: Decapoda, Amphipoda, Isopoda… Família: Xanthidae, Diogenidae… Gênero: Xantho, Progeryon… Espécie: Xantho granulicarpus, Xantho
hydrophilus…
Níveis Taxonômicos Acima do
Nível da Espécie
• Espécie: Apis mellifera • Gênero: Apis • Família: Apidae • Ordem: Hymenoptera • Classw: Insecta • Filo: Artrópode • Com exceção da espécie, esses níveis não
têm base biológica clara, mas devem ser monofileticas
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Taxons
A maioria dos gêneros contêm um número de espécies similares
Como poucos, o gênero Homo faz parte da exceção (somente incluía o Homem moderno)
A classificação tem base nas relações evolutivas
Classificação
• 1,700,000 nomes! É necessário ter um sistema para organizar essa informação – Classificação hierarquia
• Classificação se baseia na filogenia (descendência comum) – Hipótese: a vida originou somente uma vez;
todos os organismos evoluíram de um ancestral comum
– Base da objetividade da classificação
Nomenclatura Científica
Nomes vulgares – Variam com as idiomas
– Variam com a geografia
• Nomenclatura Binomial (Gênero + espécie) – Usado mundialmente
– Escherichia coli
– Homo sapiens
Qualquer organismo leva
dois nomes • Canis lupus e o nome científico do lobo cinza.
• Canis é o nome do gênero
• lupus é o nome da espécie
Gênero Um gênero consiste de um grupo de espécies
com parentesco próximo Outros membros do grupo de Canis são os
cachorros e coiotes O nome do gênero sempre escreve em letras
maiúsculas
Canis lantans Canis lupus Canis lupus familaris
Espécie Uma espécie consiste de animais que podem
cruzar e produzir proles férteis Somente o lobo cinza tem o nome de lupus. O nome da espécie é sempre escrito em
minúsculos
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Nomes Padronizados
A nomenclatura binomial é usada
Gênero espécie •Latim ou Grego
Harpia harpyja Tyrannus tyrannus
Atropa belladonna
Nomes Científicos
Binomial (dois nomes) Gênero primeiro e a primeira letra em maiúscula seguida pela espécie em minúscula – Nome do gênero, nome da espécie – Homo sapiens – – Homo troglodytis (Seu ex-namorado?) – Canis familiaris – Seu cachorrinho – Felis domesticus – Seu gatinho (algumas pessoas
esquisitas precisam ter Felis leo ou Felis tigris) – Canis latrans – Convida seu gatinho para jantar – Canis lupus - ____________? aparece
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Nomenclatura Binomial
Qual par tem mais parentescod?
Ailuropoda melanoleuca
Ursus maritmus
Ursus arctos
Binomial Científico
Fonte do nome do Gênero
Fonte do Nome da Espécie
Klebsiella pneumoniae
Em homenagem a Klebs
A doença
Pfiesteria piscicida Em homenagem a Lois Pfiester
Doença em peixes
Salmonella typhimurium
Em homenagem a Daniel Salmon
estupor (typh-) em ratos (muri-)
Streptococcus pyogenes
Cadeias de células (strepto-)
Forma pus (pyo-)
Penicillium chrysogenum
Como mecha (penicill-)
Produz um pigmento amarelo (chryso-)
Trypanosoma cruzi Como saca rolha (trypano-, borer; soma-, corpo)
Em homenagem a Oswaldo Cruz
Nomes Científicos
Nomes de Micoorganismos Nomenclatura binomial (científica) Da a cada micróbio dois nomes:
– Gênero - substantivo, sempre começa com letra maiúscula
– espécie - adjetive, sempre escrito no minúsculo
Ambos em itálicos – Staphylococcus aureus (S. aureus) – Bacillus subtilis (B. subtilis) – Escherichia coli (E. coli)
Nomenclatura
Publicação – Para ser válido, o nome precisa ser
publicado numa revista aceita pelo código
O nome precisa ser único dentro do domínio do código – Os nomes zoológicos e botânicos podem ser
os mesmos
Tipificação – O nome precisa ter um tipo como prova
Formato de nomes taxonômicos
Os nomes de gêneros e taxa inferiores são escritos em italicos – Exemplos: ‘Homo’ e ‘Homo sapiens’
O subgênero se escreve entre { } após o gênero e o epíteto da espécie
– Holothuria (Thymiosicya) impatiens
O subgênero e níveis superiores são escritas com a letra inicial em maiuscula
O nome do Gênero é frequentemente abreviado a primeira em referencias posteriore – Exemplo: H. sapiens
Epíteto Específico
Segunda parte do nome de uma espécie
Geralmente é um adjetivo – Toma o genro do nome do gênero (que sempre é um
substantivo)
Não precisa ser um adjetivo – Substantivo em aposição
– Localidade
– Nomeado em homenagem a uma pessoa • genitivo
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Os Nomes em Latim são entendidos
por cientistas
Mudança de Nome
O Epíteto específico é frequentemente um adjetivo, precisa ter declinação segundo as regras da gramática latim – Turbo littoreus Linnaeus, 1758 – Littorina littorea (Linnaeus, 1758)
O Epíteto específico pode ser um substantivo, que tem seu próprio genro – Tellina (Moerella) pygmaeus Lovén, 1846 – Taxonomistas, e especialmente outros usuários de
nomes taxonômicos, fazem erros! • Tellina pygmaea: errado!!
Por que os nomes mudam?
Aumento de entendimento científico (descobrimentos; mudanças no conceito de espécie (sensu lato) e entendimento filogenético)
Aplicação coreta dos códigos de nomenclatura (correção de erros; homônimos;…)
Mudança de Nome
Se uma espécie é transferido de um gênero a outro, o nome da espécie muda
Zoologia: o nome do autor original é colocado entre ( ) – Spongia aurea Montagu, 1818 – Hymeniacidon aurea (Montagu, 1818)
Botânica: parênteses + autor da ‘combinação’ nova – Halophila stipulacea (Forsskål) Ascherson
Por que os nomes mudam?
Toda mudança é governada por convenções legais e neutras cientificamente: os códigos de nomenclatura
Exemplo.: o ICZN (1999; http://www.iczn.org/iczn/index.jsp) consiste de:
Preâmbulo 90 Artigos, agrupados em 18 capítulos
Uma ou mais provisão mandatória Recomendações não mandatórias Exemplos
Glossário
A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Ridley 16060 K
Coletor nativo 2224 PNH
A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Ridley 16060 K
Coletor nativo 2224 PNH
A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
? Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Ridley 16060 K
Coletor nativo 2224 PNH
A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
? Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Ridley 16060 K J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915)
Coletor nativo 2224 PNH J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc. 77 (1917)
A União de Dois Taxa do Mesmo Nível
Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Alyxia angustifolia Ridl.
Alyxia pachyphylla Merr.
Ridley 16060 K J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915)
Coletor nativo 2224 PNH J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc. 77 (1917)
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria
Hunteria gracilis A.DC.
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria
Hunteria gracilis A.DC.
Gynopogon
K. Schum.
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
?
Hunteria
Hunteria gracilis A.DC.
Gynopogon
K. Schum.
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Hunteria Gynopogon
Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.
Hunteria gracilis A.DC.
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.
Gynopogon
Hook. f.
Alyxia
Mudanças de Nome Resultantes das
Mudanças na Colocação Taxonômica
Alyxia gracilis (A.DC.) Hook. f.
Gynopogon
Hook. f.
Alyxia
Tipos de sistemas de
informação taxonômica
• ‘Nomenclatores’: lista de nomes • Taxonômicos
– Lista de nomes, mais informação taxonômica (autor, referencia da publicação da descrição…)
– Who’s valid??
• Bancos de Dados de Espécies – Informação da biologia, identificação…
• Distribuição – Para um grupo de espécies ou para uma região
Nomenclatores
• Índice Fungorum
• Animais – Nomenclator Zoologicus (nível do gênero)
– Index Animalium
• Plantas – International Plant Names Index
Bases de Dados Taxonômicos
• Global – Integrated Taxonomic Information System (ITIS) – Species 2000 – Systema Naturae 2000 – UNESCO Register of Marine Organisms
• Regional – Species 2000 Europe, European Register of Marine
Species (ERMS) – Marine Species Database for Eastern Africa
(MASDEA) • Taxonômico
– Fungi…
Bases de dados biogeográficos
• Global Biodiversity Information Facility (GBIF)
• OBIS – E seus nodos regionais
Os nomes taxonômicos não sempre estão integrados
Bancos de Dados de Espécies
• FishBase
• Hexacorallia, Algaebase, CephBase, Brachnet, NeMys…
• www.marinespecies.org
• Projeto árvore da vida – http://tolweb.org/tree/phylogeny.html
International Journal of
Systematic and Evolutionary
Microbiology
Artigos com evidencia de
espécies ou classificação
novas
Bergey’s Manual of Systematic
Bacteriology
Proporciona informação filogenética de bactéria e arqueia
Approved Lists of Bacterial
Names
Alista as espécies
conhecidas de procariontes
a base de artigos publicados
Referencias
Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology Proporciona esquemas de identificação para identificar bactéria e arqueis
Morfologia, coloração diferencial, e testes bioquímicos
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology Proporciona informação filogenética de bactéria e arqueia
Baseada no sequenciamento de rRNA
Referencias