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Computação por Passagem de Mensagens

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Page 1: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Computação por Passagem de Mensagens

Page 2: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Multiprocessadores conectados por rede

• Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

C

P M

C

P M

C

P M

Computadores

Rede com ligações diretas entre computadores

Page 3: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Multiprocessadores conectados por rede

• Espaço de endereçamento compartilhado com acesso não uniforme– Ex: Cray Research T3E (2048), Sequent NUMA_Q (32 Pentium Pro), SGI

Origin 2000 (128 MIPS)

• Espaço de endereçamento compartilhado e uniforme– Ex: Sun Enterprise 10000 (64 Ultra Sparc 1)

Page 4: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Clusters

• Nós de multiprocessadores similares a computadores desktop

• Aumento da velocidade das redes locais• Aparecimento de clusters de computadores de

prateleira interligados por redes de alta velocidade• Exemplos:

– Sandia Cplant (592 Compaq XP100 workstations interconectadas pela Myrinet)

– IBM RS/6000 SP2 (512 nós, switch própria)

Page 5: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Topologia das redes

• Topologias entre total conexão e barramento único• Custo:

– número de switches– número de ligações de um switch para conectar na rede– número de bits por switch

• Desempenho:– latência para receber e enviar mensagem entre nós– número de mensagens por período de tempo– retardos por contenção no switch

Page 6: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Topologia de redes

Grade bidimensional

ou malha de 16 nós

Árvore n-cubo de 8 nós

Anel

Page 7: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Topologia de redes - Crossbar Switch

Rede não bloqueante

000

001

010

011

100

101

110

111

000

001

010

011

100

101

110

111

CPU

sMemórias

cruzamento fechado

cruzamento aberto

Page 8: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Topologia de redes - rede Ômega

P0

P1

P2

P3

P4

P5

P6

P7

A

B

C

D

Caixa comutadora da rede Ômega

Page 9: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Programação por passagem de mensagens

• Programação de multiprocessadores conectados por rede pode ser realizada:– criando-se uma linguagem de programação paralela especial – estendendo-se as palavras reservadas de uma linguagem seqüencial

existente de alto nível para manipulação de passagem de mensagens– utilizando-se uma linguagem seqüencial existente, provendo uma

biblioteca de procedimentos externos para passagem de mensagens

Page 10: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Biblioteca de rotinas para troca de mensagens

• Necessita-se explicitamente definir:– quais processos serão executados– quando passar mensagens entre processos concorrentes– o que passar nas mensagens

• Dois métodos primários:– um para criação de processos separados para execução em diferentes

processadores– um para enviar e receber mensagens

Page 11: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Modelo Single Program Multiple Data (SPMD)

• Diferentes processos são unidos em um único programa e dentro deste programa existem instruções que customizam o código, selecionando diferentes partes para cada processo por exemplo

Códigofonte

ExecutáveisCompila para

gerar executável para cada processador

Processador 0 Processador n-1

Page 12: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Modelo Multiple Program, Multiple Data (MPMD)

• Programas separados escritos para cada processador, geralmente se utiliza o método mestre-escravo onde um processador executa o processo mestre e os outros processos escravos são inicializados por ele.

tempo spawn();

Processo 1

Processo 2Inicia execuçãodo processo 2

Page 13: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

recv(&y, 1);

Rotinas básicas de envio e recebimento

send(&x, 2);

Processo 1x

Processo 2y

Page 14: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas síncronas

• Rotinas que somente retornam quando a transferência da mensagem foi completada

• Não necessita de buffer para armazenar a mensagem– uma rotina síncrona de envio pode esperar até que a mensagem completa

possa ser aceita pelo processo receptor antes de enviar a mensagem

• Uma rotina síncrona de recebimento espera até que a mensagem que ela está esperando chegue

• Rotinas síncronas intrinsicamente realizam duas ações: transferem dados e sincronizam processos

• Sugere a existência de alguma forma de protocolo de sinalização

Page 15: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas síncronas para recebimento e envio de mensagens usando protocolo de

sinalização

recv();send();

Processo 1 Processo 2

Pede para enviarConfirmação

MensagemProcessosuspenso

Ambos continuam

tempo

recv();send();

Processo 1 Processo 2

Pede para enviar

ConfirmaçãoMensagem

Ambos continuam

tempo

Processo suspenso

Page 16: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas com bloqueio e sem bloqueio

• Com bloqueio: utilizadas para descrever rotinas que não retornam enquanto a transferência da mensagem não se completou– os termos com bloqueio e síncrona são sinônimos

• Sem bloqueio: utilizadas para descrever rotinas que retornam tendo sido ou não recebida a mensagem

• Definições utilizadas pelo MPI:– com bloqueio: retorna após ações locais terem sido executadas, mesmo que a

transferência da mensagem não esteja completa– sem bloqueio: retorna imediatamente; assume que área onde está a mensagem

não será modificada por instruções até que ocorra a transferência e deixa essa responsabilidade para o programador

Page 17: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Retorno das rotinas antes que transferência tenha sido efetuada

• Necessita de um buffer para guardar a mensagem

recv();

send();

Processo 1 Processo 2

tempoBuffer de

mensagens

Continua o processo

Lê buffer de mensagen

Page 18: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Índice da mensagem

• Utilizado para diferenciar os diversos tipos de mensagem que podem ser enviadas

• Exemplo:– Para enviar uma mensagem com dado x e índice 5 de um processo fonte 1 para um

processo destino 2, poderíamos tersend(&x, 2, 5);

no processo fonte erecv(&y, 1, 5);

no processo destino

• Utiliza-se um índice especial (wild card) quando não se requer casamento de índices das mensagens de modo que a rotina recv() aceitará mensagem enviada por qualquer rotina send()

Page 19: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Broadcast

• Envio da mesma mensagem para todos os processos• Multicast: envio da mesma mensagem para um grupo

de processos

bcast();

Processo 0dado

buf

bcast();

Processo 1dado

bcast();

Processo n-1dado

Código

Ação

Page 20: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Scatter

• Envio de cada elemento de uma matriz de dados do processo raíz para um processo separado; o conteúdo da i-ésima localização da matriz é enviado para o i-ésimo processo

scatter();

Processo 0dado

buf

scatter();

Processo 1dado

scatter();

Processo n-1dado

Código

Ação

Page 21: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Gather

• Um processo coleta dados de um conjunto de processos

gather();

Processo 0dado

buf

gather();

Processo 1dado

gather();

Processo n-1dado

Código

Ação

Page 22: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Reduce

• Operação de gather combinada com uma operação lógica ou aritmética específica. Ex: valores coletados e somados pelo processo raíz

reduce();

Processo 0dado

buf

reduce();

Processo 1dado

reduce();

Processo n-1dado

Código

Ação

+

Page 23: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Ferramentas de software que utilizam biblioteca de troca de mensagens

• PVM (Parallel Virtual Machine)– desenvolvida pelo Oak Ridge National Laboratories para utilizar um

cluster de estações de trabalho como uma plataforma multiprocessada – provê rotinas para passagem de mensagens entre máquinas homogêneas e

heterogêneas que podem ser utilizadas com programas escritos em C ou Fortran

• MPI (Message Passing Interface)– padrão desenvolvido por um grupo de parceiros acadêmicos e da indústria

para prover um maior uso e portabilidade das rotinas de passagem de mensagens

Page 24: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

PVM

• O programador decompõe o programa em programas separados e cada um deles será escrito em C ou Fortran e compilado para ser executado nas diferentes máquinas da rede

• O conjunto de máquinas que será utilizado para processamento deve ser definido antes do início da execução dos programas

• Cria-se um arquivo (hostfile) com o nome de todas as máquinas disponíveis que será lido pelo PVM

• O roteamento de mensagens é feito pelos processos daemon do PVM

Page 25: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Passagem de mensagens utilizando o PVMEstação de trabalhoDaemon

PVM

DaemonPVM

DaemonPVM

Estação de trabalhoEstação de trabalho

Mensagens enviadas através da

rede

Page 26: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Passagem de mensagens utilizando o PVMEstação de trabalho

DaemonPVM

Programada aplicação (executável)

DaemonPVM

Programada aplicação (executável)

DaemonPVM

Programada aplicação (executável)

Estação de trabalhoEstação de trabalho

Mensagens enviadas através da

rede

Page 27: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas básicas do PVM

• Todas as rotinas são sem bloqueio (ou assíncronas na terminologia PVM) enquanto que rotinas de recebimento podem ser com bloqueio (síncronas) ou sem bloqueio

• Utiliza um índice para mensagem (message tag) e tem índice wild card

• pvm_psend() e pvm_precv()– rotinas utilizadas quando dados sendo transmitidos são todos do mesmo

tipo

Page 28: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

pvm_precv() e pvm_psend()

pvm_psend();

Processo 1Array com

dados

Continuao processo

pvm_precv();

Processo 2Array para

receberdados

Espera pormensagem

Pack

Buffer de envio

Page 29: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Envio de mensagem com dados de vários tipos

• Os dados são empacotados em um buffer antes de enviá-los

• O receptor tem que desempacotá-los e acordo com o formato em que foram empacotados

• Rotinas específicas para empacotamento e desempacotamento para cada tipo de dados

Page 30: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Envio de mensagem com dados de vários tipos

pvm_initsend();

pvm_pkint(.. &x ..);pvm_pkstr( …&s …);pvm_pkfloat( … &y …);pvm_send(processo_2 ...);

processo_1

Buffer deenvio

pvm_recv(processo_1 …); pvm_pkint(.. &x ..); pvm_pkstr( …&s …); pvm_pkfloat( … &y …);

processo_2

Buffer derecepção

xsy

Page 31: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Broadcast, multicast, scatter, gather e reduce

• Operações utilizadas com grupo de processos (pvm_bcast(), pvm_scatter(),pvm_gather() e pvm_reduce()) com exceção de multicast (pvm_mcast)

• Um processo se junta a um grupo através da rotina pvm_joingroup()

• pvm_bcast envia mensagem para cada membro do grupo• pvm_gather() coleta valores de cada membro do grupo

Page 32: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Mestre#include <stdio.h> #include <stlib.h>#include <pvm3.h>#define SLAVE ``spsum´´#define PROC 10#define NELEM 1000main() { int mytid, tids[PROC] int n=NELEM, nproc =PROC; int no, i, who, msgtype; int data[NELEM],result[PROC],tot=0; char fn[255]; FILE *fp; mytid=pvm_mytid(); no=pvm_spawn(SLAVE,(char **)0,0,`` ``,nproc,tids); if (no < nproc) { printf(``Erro em disparar escravo\n``); for (i=0; i<no; i++) pvm_kill(tids[i]); pvm_exit(); exit(1); } strcpy(fn,getenv(``HOME´´)); strcat(fn,´´/pvm3/src/rand_data.txt´´); if ((fp=fopen(fn,``r´´))==NULL) { printf(``Nao posso abrir arquivo %s \n´´,fn); exit (1); } for (i=0; i<n; i++) fscanf(fp,”%d”,&data[i]);

Escravo#include <stdio.h> #include <pvm3.h>#define PROC 10#define NELEM 1000main() { int mytid, tids[PROC] int n,me, i,msgtype; int x, nproc,master; int data[NELEM],sum; int x, low, high;

mytid=pvm_mytid();

Page 33: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Mestre pvm_initsend(PvmDataDefault); msgtype=0; pvm_pkint(&nproc,1 ,1); pvm_pkint(tids, nproc, 1); pvm_pkint(&n,1,1); pvm_pkint(data, n, 1); pvm_mcast(tids, nproc, type);

msgtype = 5; for (i=0; i<nproc; i++) { pvm_recv(-1, msgtype); pvm_upkint(&who, 1, 1); pvm_upkint(&result[who], 1, 1); printf(“%d de %d \n”,result[who],who); }

for (i=0;i<nproc;i++) tot +=result[i]; printf (“O total e %d. \n \n”,tot);

pvm_exit(); return(0);}

Escravo msgtype=0; pvm_recv(-1,msgtype); pvm_upkint(&nproc,1,1); pvm_upkint(tids, nproc, 1); pvm_upkint(&n, 1,1 ); pvm_upkint(data, ,n,1); for (i=0;i<nproc;i++) if (mytid ==tids[i]) {me=i;break;}

x=n/proc; low=me*x; high=low+x; for (i=low;i<high;i++) sum+=data[i];

pvm_initsend(PvmDataDefault); pvm_pkint(&me, 1, 1); pvm_pkint(&sum,1,1); msgtype=5; master=pvm_parent; pvm_send(master,msgtype); pvm_exit(); return(0);}

Broadcast

Recebe resultados

Page 34: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

MPI

• Criação e execução de processos– Propositalmente não são definidos e dependem da implementação– MPI versão 1

• Criação estática de processos: processos devem ser definidos antes da execução e inicializados juntos

• Utiliza o modelo de programação SPMD

• Communicators– Define o escopo das operações de comunicação– Processos têm posições definidas associadas ao communicator– Inicialmente todos os processos participam de um communicator universal

chamado MPI_COMM_WORLD e cada processo possui uma única posição (0 a n-1) , onde n é o número total de processos

– Outros communicators podem ser estabelecidos para grupo de processos

Page 35: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Utilizando o modelo SPMD

main (int argc, char *argv[]){ MPI_Init(&argc, &argv); . . MPI_Comm_Rank(MPI_COMM_WORLD, &myrank); if (myrank ==0) master(); else slave(); . . MPI_Finalize();}

Page 36: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Variáveis locais e globais

• Qualquer declaração global será duplicada em cada processo

• Para não haver duplicação de variável, deve-se declará-la dentro do código executado somente pelo processo

• Exemplo:MPI_Comm_rank(MPI_COMMWORLD, &myrank);if (myrank==0) { int x, y; . .else if (myrank==1) {int x, y; . .}

Page 37: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Modo não seguro de envio de mensagens Processo 0

lib()

Processo 1

send(…,1,…);

send(…,1,…);

Destino

Fonte

lib()recv(…,0,…);

recv(…,0,…);

Processo 0

lib()

Processo 1

send(…,1,…);

send(…,1,…);

Destino

Fonte

lib()recv(…,0,…);

recv(…,0,…);

Page 38: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Solução MPI

• Communicators– utilizados em todas comunicações ponto-a-ponto e coletivas– domínio de comunicação que define um grupo de processos que podem se

comunicar entre si– o domínio de comunicação da biblioteca pode ficar separado do domínio

do programa do usuário– cada processo tem uma posição definida (rank) dentro de um

communicator, um inteiro que varia de 0 a n-1, onde n é o número de processos

Page 39: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Tipos de communicator

• Intracommunicator– comunicação dentro de um grupo

• Intercommunicator– comunicação entre grupos

• Um processo tem um único rank em um grupo, que varia de 0 a m-1, onde m é o número de processos pertencentes a um grupo

• Um processo pode ser membro de mais de um grupo• Intracommunicator default: MPI_COMM_WORLD

– é o primeiro communicator de todos os processos da aplicação– conjunto de rotinas MPI para formar novos communicators

Page 40: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Comunicação ponto-a-ponto

• Índices para as mensagens– MPI_ANY_TAG: para não especificar índice

• Para receber de qualquer fonte: MPI_ANY_SOURCE

• Tipo de dados é enviado como parâmetro na mensagem• Rotinas com bloqueio

– retornam quando estão completas localmente (local utilizado para guardar a mensagem pode ser utilizado novamente sem afetar envio da mensagem

• Rotinas com bloqueio– retornam imediatamente mesmo que o local utilizado para guardar a

mensagem não possa ser utilizado novamente sem afetar seu envio

Page 41: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas com bloqueio

MPI_Send (buf, count, datatype, dest, tag, comm)

Endereço do buffer de envio

Número de ítensa enviar

Tipo de dadosde cada item

Rank do processodestino

Índice damensagem

Communicator

MPI_Recv (buf, count, datatype, src, tag, comm,status)

Endereço do buffer de recepção

Número máximo de ítens a receber

Tipo de dadosde cada item

Rank do processofonte

Índice damensagem

Communicator

Status apósoperação

Page 42: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Exemplo de rotina com bloqueio

MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myrank); if (myrank ==0) { int x; MPI_Send(&x, 1, MPI_INT, 1, msgtag, MPI_COMM_WORLD); } else if (myrank ==1) { int x; MPI_Recv(&x, 1, MPI_INT, 0, msgtag, MPI_COMM_WORLD, status); }

Envio de um inteiro x do processo 0 para o processo 1

Page 43: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Rotinas sem bloqueio

• MPI_Isend: retorna imediatamente antes do local da mensagem estar seguro

• MPI_Irecv: retorna mesmo que não tenha mensagem a receber

• Formatos:– MPI_Isend(buf, count, datatype, dest,tag, comm, request)– MPI_Irecv(buf, count, datatype, source, tag, comm, request)

• MPI_Wait(): retorna somente após término da operação• MPI_Test(): retorna com um flag indicando se a operação já

foi completada• Parâmetro request indica operação a ser verificada

Page 44: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Exemplo de rotina sem bloqueio

MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myrank); if (myrank ==0) { int x; MPI_Isend(&x, 1, MPI_INT, 1, msgtag, MPI_COMM_WORLD,req1); processa(); MPI_Wait(req1, status); } else if (myrank ==1) { int x; MPI_Recv(&x, 0, MPI_INT, 1, msgtag, MPI_COMM_WORLD, status); }

Envio de um inteiro x do processo 0 para o processo 1

Page 45: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Modos de envio

• Standard:– Não assume a existência de uma rotina correspondente de recebimento– Quantidade de memória para bufferização não definida– Se existe bufferização, envio pode ser completado antes de ocorrer a

rotina de recebimento

• Bufferizado– O envio pode ser inicializado e retornar antes de uma rotina

correspondente de recebimento– A utilização do buffer deve ser especificada via as rotinas

MPI_Buffer_attach() e MPI_Buffer_detach()

Page 46: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Modos de envio

• Síncrono:– As rotinas de envio e recebimento podem iniciar seus procedimentos uma antes da

outra mas têm que finalizá-los juntas

• Pronto (ready):– O envio da mensagem só pode ser iniciado se existe uma rotina de recebimento

correspondente

• Os quatro modos podem ser aplicados para rotinas de envio com e sem bloqueio

• O modo standard é o único disponível para rotinas de recebimento com e sem bloqueio

• Qualquer tipo de rotina de envio pode ser utilizada com qualquer tipo de rotina de recebimento

Page 47: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Comunicação coletiva

• Realizada em um conjunto de processadores definido por um intracommunicator

• Não existem índices• MPI_Bcast(): envio do processo raíz para todos os outros• MPI_Gather(): coleta valores para um grupo de processos• MPI_Scatter(): espalha buffer de dados em partes para um

grupo de processos• MPI_Alltoall():envia dados de todos os processos para

todos os processos

Page 48: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Comunicação coletiva

• MPI_Reduce(): combina valores de todos os processos em um único valor

• MPI_Reduce_scatter: combina valores e espalha resultado

• MPI_Scan: calcula reduções de prefixo de dados dos processos

Page 49: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Exemplo de rotina coletiva

int data [10]; . MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myrank); if (myrank ==0) { MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&grp_size); buf=(int *) malloc(grp_size*10*sizeof(int)); } MPI_Gather(data, 10, MPI_INT, buf, grp_size*10, MPI_INT,0,MPI_COMM_WORLD); }

Coletar dados de um grupo de processos no processo 0

Page 50: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Barreira (barrier)

• Em todos os sistemas de passagem de mensagens existe uma maneira de sincronizar os processos

• MPI_Barrier():– processos ficam bloqueados até todos os processos terem atingido essa

instrução no programa

Page 51: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

#include <stdio.h> #include <math.h>#include `` mpi.h ´´#define MAXSIZE 1000void main(int argc, char *argv) { int myid, numprocs; int data[MAXSIZE],i,x,low,high,myresult,result; char fn[255]; FILE *fp; MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid); if (myid==0) { strcpy(fn,getenv(``HOME´´)); strcat(fn,´´/MPI/src/rand_data.txt´´); if ((fp=fopen(fn,``r´´))==NULL) { printf(``Nao posso abrir arquivo %s \n´´,fn); exit (1); } for (i=0; i<MAXSIZE; i++) fscanf(fp,”%d”,&data[i]); } MPI_Bcast(data, MAXSIZE, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD); x=MAXSIZE/numprocs; low=myid*x; high=low+x; for (i=low;i<high;i++) myresult+=data[i]; printf(``Obtive %d de %d \n´´, myresult, myid); MPI_Reduce(&myresult, &result, 1, MPI_INT, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD); if (myid==0) printf (``A soma é %d. \n´´, result);MPI_Finalize();}

Page 52: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Construções em pseudo-código

• Envio de uma mensagem com um inteiro x e um float y por um processo chamado mestre para um processo chamado escravo, que recebe os dados em a e b– Mestre: send (&x, &y, Pescravo);– Escravo: recv(&a, &b, Pmestre);

• Envio de uma mensagem para o i-ésimo processo Pi e índice da mensagem data_tag– send(&x, P2, data_tag);

• Rotinas de envio e recebimento com bloqueio, para diferenciar outras formas utiliza-se prefixo– envio síncrono: ssend(&data1, Pdestino);

Page 53: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Tempo de execução paralela

• Composto de duas partes:– tcomp : parte de computação

– tcomm : parte de comunicação

– tp= tcomp + tcomm

• Tempo de computação estimado como em algoritmo seqüencial

• Tempo de comunicação:– tcomm= tstartup + ntdata

– tstartup : tempo para enviar uma mensagem sem dados

– tdata : tempo para transmitir uma palavra de dados– n: número de palavras a transmitir

Page 54: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Tempo teórico de comunicação

Número de itens de dados (n)

Tem

po

Tempo tstartup

Page 55: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Interpretação das eqüações

• Utilizadas para dar uma idéia do desempenho de um algoritmo

• Tempo de execução paralela é normalizado para ser medido em unidades de uma operação aritmética que vai depender da máquina utilizada

• Assume-se que processadores homogêneos e que todas as operações aritméticas requerem o mesmo tempo

• Conta-se número de passos de computação de um processador ou daquele que precisa do maior número de passos

Page 56: Computação por Passagem de Mensagens. Multiprocessadores conectados por rede Processadores conectados por uma rede estática com passagem de mensagens

Interpretação das eqüações

• Tempo de comunicação também medido em passos de computação

• Assume-se o mesmo tempo para o envio de um inteiro e de um float

• tcomm= q(tstartup+ ntdata), para q mensagens com n itens• Exemplo:

– IBM SP-2 : tstartup= 35s, tdata=230ns, tempo de operação aritmética=4.2ns

• normalizando: tstartup = 8333 e tdata=55

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Como superar o gasto de tempo no envio de mensagens?

• Suponha uma máquina que pode operar a 200 MFLOPS e cujo tempo tstartup seja 1s:– podem ser executadas 200 operações de ponto flutuante no tempo gasto para o início

de envio de uma mensagem

• Manter o processador ocupado enquanto a comunicação é efetuada

• Rotinas de envio sem bloqueio• Mapeamento de múltiplos processos em um processador

utilizando uma técnica de tempo compartilhado que gerencia os processos de modo que quando um processo está parado esperando a comunicação, outro processo passa a ser executado utilização de threads

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Complexidade no tempo

• Pode-se utilizar o cálculo de complexidade para programas seqüenciais O( )

• Estimativa do número de passos computacionais, considerando que as operações lógicas e aritméticas gastam o mesmo tempo

• Expressão para o número de passos computacionais é derivada em termos do número de itens de dados manipulados pelo algoritmo

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Exemplo de cálculo de complexidade no tempo para um algoritmo paralelo

• Dois computadores somam n números da seguinte maneira:1. Computador 1 envia n/2 números para o computador 22. Ambos somam os n/2 números simultaneamente3. Computador 2 envia resultado parcial para o computador 14. Computador 1 soma as somas parciais e produz resultado final

• Tempo de computação (para os passos 2 e 4)– tcomp=n/2+1– complexidade O(n)

• Tempo de comunicação (para os passos 1 e 3)– tcomm= (tstartup+ n/2tdata)+ (tstartup+ n/2tdata)=2 tstartup+( n/2 + 1)tdata

– complexidade O(n)

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Algoritmos com custo ótimo

• Custo é considerado ótimo quando o custo de resolver um problema é proporcional ao tempo de execução em um único processador utilizando o mais rápido algoritmo seqüencial conhecido

– Custo = tp n = k ts

• Em termos de análise de complexidade, um algoritmo paralelo é um algoritmo com custo ótimo quando

– Complexidade do algoritmo paralelo número de processadores = complexidade do algoritmo seqüencial

– Exemplo: • Melhor algoritmo seqüencial: O(n log n)• Algoritmo paralelo com custo ótimo: n processadores executando um algoritmo paralelo com

complexidade O(log n)• Algoritmo paralelo não ótimo: n2 processadores executando um algoritmo paralelo com

complexidade O(1)

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Complexidade para operações de broadcast

• Considere uma operação de broadcast do nó 000 para todos os outros nós em um hipercubo

• Complexidade O(log n), onde n é o número de nós do hipercubo: ótima porque diâmetro do hipercubo é log n

10. passo

20. passo

30. passo000

100

110

001

111

011

101

010

000 001

000 010001 011

000 100001 101010 110011 111

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Complexidade para operações de broadcast

• Envio de uma mensagem do processador mais em cima à esquerda em uma arquitetura mesh com n nós

1 2 3

32 4 4

43 5 5

54 6 6

2(n-1) passos O(n)

Diâmetro da mesh = 2(n-1)

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Complexidade para operações de broadcast

• Broadcast em um cluster interconectado por Ethernet: O(n) para n itens de dados

• PVM: uma mensagem de broadcast que chega no daemon PVM é convertido em várias mensagens para cada um dos N destinos: O(N)

Fonte Destinos

Mensagem

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Depurando e avaliando os programas paralelos

• Diagrama de espaço-tempo

Processo 1

Processo 2

Processo 3

Processando

Esperando

Rotina do sistema para passagem de mensagem

Mensagem

Tempo

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Estratégias de depuração

• Sugestão de Geist et al. Para depuração de programas paralelos:1. Execute o programa como um único processo e depure como um programa

seqüencial (se possível)2. Execute o programa utilizando dois ou quatro processos em uma mesma

máquina e verifique se mensagens estão sendo enviadas de forma correta (erros são comuns nos índices e destinos das mensagens)

3. Execute o programa utilizando os mesmos dois ou quatro processos em várias máquinas para tentar descobrir problemas na sincronização e temporização no programa que podem aparecer devido a atrasos na rede

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Avaliando programas empiricamente

• Medindo tempo de execução

L1: time(&t1);..L2: time(&t2);.elapsed_time = difftime (t2,t1);printf(“Elapsed_time = %5.2f segundos”, elapsed_time);

• Rotina MPI_ Wtime() provê hora em segundos

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Avaliando programas empiricamente

• Medindo tempo de comunicação pelo método ping-pongP0

L1: time(&t1);send(&x, P1);recv(&x, P1);L2: time(&t2);elapsed_time = 0.5 * difftime (t2, t1);printf(“Elapsed_time = %5.2f segundos”, elapsed_time);P1

.recv(&x, P0); send(&x, P0);.

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Profiling

1 2 3 4 5

Número das instruções ou regiões do programa

Núm

ero

de r

epet

içõe

s ou

tem

po

6 7 8 9 10