coleção brasileira de microrganismos de ambiente e indústria cbmai divisão de recursos...
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Coleção Brasileira de Microrganismos
de Ambiente e Indústria
CBMAIDivisão de Recursos
MicrobianosCPQBA/UNICAMP
Locação Institucional Divisão de Recursos
Microbianos (DRM) CPQBA/UNICAMP Coord.: Gilson P.
Manfio suporte financeiro
UNICAMP FINEP/MCT FAPESP http://
www.cpqba.unicamp.br
Equipe Gilson P. Manfio, Ph.D
sistemática microbiana Valéria Maia de Oliveira, Dr.
biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de bactérias
Mônica M. de Sillos Castro, Ms. taxonomia e preservação de leveduras
Ana Paula M. Zibordi, Bióloga taxonomia e preservação de fungos filamentosos
Patrícia M. Zachelo, Técnica caracterização e preservação de microrganismos
Escopo Acervo
arqueas bactérias fungos filamentosos e leveduras plasmídios OGMs (certificação em andamento)
Grupo de risco P1 e P2
Atividades preservação depósito
público segurança
base de dados distribuição
identificação taxonomia
polifásica caracterização
convencional e molecular
tipagem treinamento pesquisa assessoria
Infra-estrutura Preservação
ultracongelador -80oC liofilizador centrífugo refrigeração 4oC (Castellani) N2 líquido (no projeto)
Identificação/autenticação microscopia kits rápidos sistema de fotodocumentação digital PCR grupo-específico (termocicladores) sequenciador automático sistema de eletroforese de DNA
Infra-estrutura
Informática acesso à rede do
CPQBA/UNICAMP servidor de rede
do CBMAI (no projeto)
Sistemas de Informação Intranet
gerenciamento de solicitações e serviços
BIS (Biodiversity Information System)
dados de catálogo gerenciamento e
manutenção do acervo
informação associada
Intranet CBMAI Sistema integrado para o
gerenciamento de solicitações de serviços solicitação on-line de serviços, formulários cadastro de clientes andamento de serviços resultados e relatórios diário de bordo (avisos ligados à rotina) rastreabilidade
Coleção de Culturas
Acervo
Bactérias: ~620 Bacillus isolados de processos industriais: 200 Actinomicetos de biomas brasileiros: 426
Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6 Culturas-referência para aplicação: 160
normas ASTM, BS, ABNT linhagens-tipo
Ampliação do acervo
Biota/FAPESP Ecologia molecular de
bactérias degradadores de
xenobióticos Acidithiobacillus spp. bactérias endofíticas
fixadores de nitrogênio Microrganismos
endofíticos Microrganismos
produtores de compostos bioativos
CTPETRO Microrganismos
associados a depósitos de petróleo
Projetos Genoma Crinipellis perniciosa
link para dados moleculares do Projeto
Pesquisadores Indústrias Outras Coleções
BIS - Biodiversity Information System
dados básicos de catálogo identificação, origem, depositante...
propriedades e aplicações propriedades específicas
ambiente e indústria aplicação em testes, ensaios e ensino utilização em processos industriais
caracterização molecular fingerprinting, seqüências dados quimiotaxonômicos
informações confidenciais
BIS - Tabelas básicas
Espécies Linhagens Lotes de
preservação
Referências Meios de cultivo
Tabela de espécies - campos Código da espécie Tipo de organismo Gênero Espécie Variedade Descrição da variedade Autor Ano Referências bibliográficas
Regulations Harzard group
Observação Observações Taxonomia
código da espécie referência
Estado alternativo código da espécie morfologia
Sinônimos código da espécie nomenclatura
Tabelas de linhagens - campos Código da Linhagem Acesso (público ou restrito) Código da Espécie Patente Observações Depositada como – cód. espécie Data do depósito Status (ativo, inativo) Preservação Histórico (outras coleções) Depositante
Nome e Código Data/Endereço
Coletor Nome e Código Data/Endereço
Identificador Nome e Código Data/Endereço
Meio Crescimento Temperatura Observações
Substrato Original Localização Geográfica
Local e GPS Patogenicidade
Referência Hospedeiro
Nome Popular Gênero / Espécie / Variedade Referência
Ecologia Referências
Propriedades Produção de Metabólitos Degradação Dados Quimiotaxonômicos Dados Moleculares Dados Confidenciais Referências
Exemplo de registro no BIS
Bacillus sporothermodurans Petterson et al.
0087 Roza, C.R. (158-1) =CCT 7094. Milk UHT. GO, Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025]
Medium BHI; 37oC - FR
BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker 100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2, strain CBMAI 0087
1 2
Exemplo de registro no BIS
Cyclothyrium Petrak
syn. Cytoplea Bizz. & Sacc.
alt. Thyridaria Sacc.
0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS 109850. Estuary sediment [058]. Cubatão SP, Brazil. Degr: Degradation of pyrene, phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060]
Medium MA2; 28oC - FR
Exemplo de registro no BIS
Streptomyces Waksman & Henrici
0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated with herbicide [130]. Campinas SP, Brazil. Morphology: photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of alachlor herbicide [131]. Tax: [133, 134]
Medium ISP3; 30oC - FR
Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207.
Bennet’s Agar. 7 days, 30oC
>CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence1 TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG51 GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC101 TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA151 TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA201 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA251 ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG301 ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC351 GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA401 TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA451 GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG501 CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG551 TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG601 GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA651 GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT701 GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT751 GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA801 AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA851 GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC901 GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG951 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT1001 TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG1051 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG1101 TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT1151 CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG1201 AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT