nome científico

Ecologia de Populações

Prof. Dr. Harold Gordon Fowler popecologia@hotmail.com

Por que classificar?

Após desenvolver a fala, o Homem quis organizar seu mundo e começou agrupar, ou classificar, todo em seu mundo

Descrição

= separar atributos

Caráter = um atributo (como o cor da pétala)

Estados de Caráter = duas ou mais formas de um caráter ( “branco,” “vermelho”).

Por que classificar?

Animais que nadam Animais que voam Animais que rasteam Animais que caminham com quatro

pernas Animais que mastigam sua comida Animais que engulam sua comida Animais que são tóxicos

Classificação

Colocando objetos, como seres vivos, em algum tipo de ordem.

Classificação fenotípica

– Baseada na similaridade geral

– Os objetos mais similares são classificados

mais próximos

Problema com a classificação fenotípica

Pode ser arbitrária, Como classificar essas formas?

7

Confusão de Usar Nomes Diferentes

Existem mais de 50 nomes comunes parar o animal das últimas duas transparencias. Os nomes vulgares variam por região. Então, o que fazer?

Por que classificar?

Para ajudar o estudo da natureza

Para ajudar a organização das espécies descobertas . .

Classificação e Identificação

Classificação: A colocação de organismos em grupos de espécies com parentesco. Listas das características de organismos conhecidos.

Identificação: Comparando as características de um organismo desconhecido a listas de organismos conhecidos. – Identificação no Campo

– Identificação no laboratório

– Identificação no museu/herbário

– Identificação clínica

Identificação = associar um desconhecido com um

conhecido

Como? Somente uma: Decisões binárias

Chave taxonômica;

Árvore …………………………………….…………… 1

Folhas simples …….………………………… A

Folhas pentas …….………..…..…..…… B

Herbácea …………………………………….…………… 2

Flores vermelhas …….…………………………… A

Flores brancas …….…………………..…… B

Interpretação da Literatura

Diferencia entre identificação errada e sinônimo não sempre fica clara – Lista dos nomes de um nome taxonômico numa

revisão taxonômica as vezes tem ambos!

Autores diferentes usam classificações diferentes

Importância de uma base de dados inteligente, que ajuda interpretar os nomes – Precisa ter informação de sinônimo, variações…

Existem 13 bilhões de organismos conhecidos

Mas é somente 5% de todos os organismos que viveram!!!!!

Organismos novos ainda são descobertos e identificados

Espécies de Organismos

Por que classificar?

Para dar nome a cada espécie baseado num método padronizado de forma que os cientistas de países diferentes podem falar sobre o mesmo animal sem confusão

17

O que é a Classificação?

A classificação é o arranjo de organismos em grupos ordenados a base de suas similaridades

A classificação também é chamada taxonomia

Os taxonomistas são cientistas que identificam e dão nomes aos organismos

Taxonomia

A ciência que lida com – Nomenclatura: dar nomes ‘científicos’ as espécies

• Regulado severamente, códigos diferentes para botânica, zoologia, bactéria

– Classificação: criar e nomear grupos, ‘taxa’

‘Sistemática’ é usado como equivalente

A Taxonomia é...

“A reclassificação perpétua de

espécies com nomes errados.”

“Um mal necessário.” - Randall Kosaki

20

Taxonomistas Antigos

Há 2000 anos, o primeiro taxonomista foi Aristóteles Aristóteles dividiu os organismos em plantas e animais Os organismos eram classificados pelo seu habitat ---habitantes da terra, oceano, ou ar

Teofrasto (370-285 B.C.)

• Pai da Botânica, aluno de Aristóteles.

• Classificou as plantas a base de forma. – Árvore

– Arbusto

– Subarbusto

– Herbácea

22

Taxonomistas Antigos

John Ray, botânico, foi o primeiro de usar Latim para nomear e foi o primeiro usar espécie

Seus nomes eram compridos com descrições sobre todo sobre a planta

Naturalistas Gregos e Romanos, herbalistas medievais; taxonomistas caipiras: nomes populares Os naturalistas antes de Lineu:

nomes em Latim nomina specifica; nome binominal, trinominal ou até polinominal (e.g. Iris perpusilla saxatilis Norbonensis a caulis ferme)

nomes inconsistentes e muitas vezes muito cumpridos (propósitos

de diagnoses, descrição e identificação)

Historia da Nomenclatura

Científica

Images: Biodiversity Heritage Library

Carolus Linnaeus 1707 – 1778

Taxonomista do século

Classificou os organismos pela sua estrutura

Desenvolveu o sistema de nomeclatura usada até hoje

Image: Wikimedia Commons

Carolus Linnaeus 1707-1778

Image: Biodiversity Heritage Library

Nomenclatura Binomial

Bi indicaa dois

Nomen é nome

A nomenclatura binomial é um sistema de classificação que usa dois nomes para identificar um organismo

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Carolus Linnaeus • O pai da taxonomia

• Desenvolveu o sistema de nomenclatura binomial

• Nome de duas palavras (Gênero e espécie)

• Os sistemas de classificação [Species plantarum (1753) e Systema naturae (1758)]

nomina trivialia; sempre com estrutura binomial

• Gênero e espécie.

• Exemplo. – Nepeta cataria L.

– “Nepeta floribus interrupte spicatus pedunculatis”

estilo diagnostico

• Necessidade de códigos universais

Nomes Científicos

No princípio, Latim ou nomes Latinizados Regulado pelos códigos:

– Códigos são escritos e mantidos por Comissões • International Code for Zoological Nomenclature • International Code for Botanical Nomenclature • International Code for Bacterial Nomenclature

– Comissões são juízes das disputas

Problema: muitos organismos unicelulares não são plantas ou animais e tem dois nomes – Alga verde azul = cianobactéria

Os Nomes Científicos estão em

Latim

Regras da gramatica Latim

Concordância no genro

Mastigocerca capucina Wierzejski e Zacharias, 1893

Rattulus capucinus : Jennings, 1903

Trichocerca capucina (Wierzejski e Zacharias, 1893) Harring, 1913

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Benefícios da Classificação

Identifica or organismos de forma precisa e padronizada

Evita nomes estúpidos Usa a mesma linguagem (Latim ou

Grego) para todos os nomes

”Cavalo” do mar??

Nomes são únicos

… mas não absolutamente – O nome botânico pode ser o mesmo do nome

zoológico

– Não existe um cadastro central (ainda), o que permite espaço amplo para erros • Nome ‘Já ocupado’

– Precisa ser substituído com outro nome – nome de ‘substituição’

Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)

Holacanthus bishopi Pomacanthus imperator

Nomes são únicos?

Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)

Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)

Pomacanthus imperator

= Holacanthus bishopi

Centropyge flavissima Centropyge flavissima

Nomes são únicos?

Nomes múltiplos para o mesmo Organismo (Sinônimos)

Mesmo nome para vários organismos (Homônomios)

Pomacanthus imperator

= Holacanthus bishopi

Centropyge flavissima Centropyge heraldi

= Centropyge flavissima

Nomes são únicos?

Pneumocystis jirovecii foi classificado como uma protozoa até a analise de DNA demonstrou que era um fungo. Isso tem importância de se um organismo é classificado como protozoa ou fungo?

Por que classificar?

A classificação pode mudar

Filogenia = estudo científico, – Resultados da pesquisa pode mudar nosso

entendimento – Interpretação dos fatos pode ser diferente entre

os cientistas

Difícil construir uma classificação completa e consistente

Pode levar a mudança de nomes – A espécie muda de um gênero a outro… – Quando o gênero tem outro genro

Monostyla closterocerca Schmarda, 1853

O que tem em um nome?

Com nome do sub-gênero:

Lecane (Monostyla) closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935 Curto:

Lecane (M.) closterocerca (Shmarda, 1853) Or: L. closterocerca

combinação nova: Lecane closterocerca (Schmarda, 1853) Edmondson, 1935

Com nome de subespécie: trinominal

Lecane (Monostyla) closterocerca amazonica Koste,

1972 Ou: L. closterocerca amazonica

O que tem num Nome?

Anthias

Pseudanthias

Anthias (Pseudanthias)

Anthias ventralis

Anthias hawaiiensis

Anthias (Pseudanthias) ventralis

Anthias (Pseudanthias) hawaiiensis

Pseudanthias ventralis

Pseudanthias hawaiiensis

Pseudanthias ventralis ventralis

Pseudanthias ventralis hawaiiensis

Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis ventralis

Pseudanthias (Pseudanthias) ventralis hawaiiensis

“Nome” num texto: 13

“Nome” sensu Zoologia: 4

Anthias Pseudanthias ventralis hawaiiensis

O que é um Nome?

“Nome” sensu Botânica: 9

Requerimentos Formais do ICZN

O nome ou ato de nomenclatura precisa ser publicado;

Os nomes científicos precisam ser escritos usando as 26 letras do Alfabeto Latim;

A derivação: um nome pode ser derivado de qualquer idioma, ou ainda de uma combinação arbitraria de letras se foi formada para ser usada como uma palava (não cbafdg);

=> muita liberdade!

Exemplos….

Diferencia de uma letra: Tortricidae (Moths, Northern Mexico: (Kearfott, 1907)

Eucosma fandana Eucosma gandana Eucosma handana Eucosma landana Eucosma mandana Eucosma nandana Eucosma pandana Eucosma sandana Eucosma wandana

Mas também:

Cydia candana

Epiblema tandana Epinotia xandana Epinotia zandana

Pelochrista randana Pelochrista vandana

Brincando com Latim: • Stupidogobius Aurich, 1938 (peixe estúpido)

Localidades: • Panama canalia Marsh, 1993 (Braconidae) • Belgica antarctica (Chironomide) • Mexico (besouro e virus) • Texas (Pentatomidae e vírus) • Neotiglossa (Texas) californica Bliven, 1958

Mithologia: • Zeus Linnaeus, 1758 (peixe) • Kali Lloyd, 1909 (peixe) • Satan Hubbs & Bailey, 1947 (peixe),…

Exemplos….

De novo… • Cyclocephala nodanotherwon Ratcliffe (Scarabidae) • Ochisme, Polychisme, Dolichisme, Peggichisme Kirkaldi, 1904 • Iyaiyai Evenhuis, 1994 • Agra vation Erwin, 1983 • Notnops, Taintnops, e Tisentnops Platnick, 1994 (aranhas

originalmente no gênero Nops MacLeay, 1839

Pessoas (“honorificas”): • Cartwrightia cartwrighti Cartwright, 1967 (Scarabidae) • Hoia hoi (copepode parasitico), para Ju-Shey Ho • Leonardo davincii Bleszynski, 1965 (Pyralidae) Mas também (“horrorificas”): • Dyaria Neumoegen, 1893 (Liparidae) para Mr. Dyar.

Exemplos….

Hierarquia: níveis

Reino: Animalia, Plantae… Filo: Arthropoda, Echinodermata… Classe: Crustacea, Insecta… Ordem: Decapoda, Amphipoda, Isopoda… Família: Xanthidae, Diogenidae… Gênero: Xantho, Progeryon… Espécie: Xantho granulicarpus, Xantho

hydrophilus…

Níveis Taxonômicos Acima do

Nível da Espécie

• Espécie: Apis mellifera • Gênero: Apis • Família: Apidae • Ordem: Hymenoptera • Classw: Insecta • Filo: Artrópode • Com exceção da espécie, esses níveis não

têm base biológica clara, mas devem ser monofileticas

47

Taxons

A maioria dos gêneros contêm um número de espécies similares

Como poucos, o gênero Homo faz parte da exceção (somente incluía o Homem moderno)

A classificação tem base nas relações evolutivas

Classificação

• 1,700,000 nomes! É necessário ter um sistema para organizar essa informação – Classificação hierarquia

• Classificação se baseia na filogenia (descendência comum) – Hipótese: a vida originou somente uma vez;

todos os organismos evoluíram de um ancestral comum

– Base da objetividade da classificação

Nomenclatura Científica

Nomes vulgares – Variam com as idiomas

– Variam com a geografia

• Nomenclatura Binomial (Gênero + espécie) – Usado mundialmente

– Escherichia coli

– Homo sapiens

Qualquer organismo leva

dois nomes • Canis lupus e o nome científico do lobo cinza.

• Canis é o nome do gênero

• lupus é o nome da espécie

Gênero Um gênero consiste de um grupo de espécies

com parentesco próximo Outros membros do grupo de Canis são os

cachorros e coiotes O nome do gênero sempre escreve em letras

maiúsculas

Canis lantans Canis lupus Canis lupus familaris

Espécie Uma espécie consiste de animais que podem

cruzar e produzir proles férteis Somente o lobo cinza tem o nome de lupus. O nome da espécie é sempre escrito em

minúsculos

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Nomes Padronizados

A nomenclatura binomial é usada

Gênero espécie •Latim ou Grego

Harpia harpyja Tyrannus tyrannus

Atropa belladonna

Nomes Científicos

Binomial (dois nomes) Gênero primeiro e a primeira letra em maiúscula seguida pela espécie em minúscula – Nome do gênero, nome da espécie – Homo sapiens – – Homo troglodytis (Seu ex-namorado?) – Canis familiaris – Seu cachorrinho – Felis domesticus – Seu gatinho (algumas pessoas

esquisitas precisam ter Felis leo ou Felis tigris) – Canis latrans – Convida seu gatinho para jantar – Canis lupus - ____________? aparece

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Nomenclatura Binomial

Qual par tem mais parentescod?

Ailuropoda melanoleuca

Ursus maritmus

Ursus arctos

Binomial Científico

Fonte do nome do Gênero

Fonte do Nome da Espécie

Klebsiella pneumoniae

Em homenagem a Klebs

A doença

Pfiesteria piscicida Em homenagem a Lois Pfiester

Doença em peixes

Salmonella typhimurium

Em homenagem a Daniel Salmon

estupor (typh-) em ratos (muri-)

Streptococcus pyogenes

Cadeias de células (strepto-)

Forma pus (pyo-)

Penicillium chrysogenum

Como mecha (penicill-)

Produz um pigmento amarelo (chryso-)

Trypanosoma cruzi Como saca rolha (trypano-, borer; soma-, corpo)

Em homenagem a Oswaldo Cruz

Nomes Científicos

Nomes de Micoorganismos Nomenclatura binomial (científica) Da a cada micróbio dois nomes:

– Gênero - substantivo, sempre começa com letra maiúscula

– espécie - adjetive, sempre escrito no minúsculo

Ambos em itálicos – Staphylococcus aureus (S. aureus) – Bacillus subtilis (B. subtilis) – Escherichia coli (E. coli)

Nomenclatura

Publicação – Para ser válido, o nome precisa ser

publicado numa revista aceita pelo código

O nome precisa ser único dentro do domínio do código – Os nomes zoológicos e botânicos podem ser

os mesmos

Tipificação – O nome precisa ter um tipo como prova

Formato de nomes taxonômicos

Os nomes de gêneros e taxa inferiores são escritos em italicos – Exemplos: ‘Homo’ e ‘Homo sapiens’

O subgênero se escreve entre { } após o gênero e o epíteto da espécie

– Holothuria (Thymiosicya) impatiens

O subgênero e níveis superiores são escritas com a letra inicial em maiuscula

O nome do Gênero é frequentemente abreviado a primeira em referencias posteriore – Exemplo: H. sapiens

Epíteto Específico

Segunda parte do nome de uma espécie

Geralmente é um adjetivo – Toma o genro do nome do gênero (que sempre é um

substantivo)

Não precisa ser um adjetivo – Substantivo em aposição

– Localidade

– Nomeado em homenagem a uma pessoa • genitivo

61

Os Nomes em Latim são entendidos

por cientistas

Mudança de Nome

O Epíteto específico é frequentemente um adjetivo, precisa ter declinação segundo as regras da gramática latim – Turbo littoreus Linnaeus, 1758 – Littorina littorea (Linnaeus, 1758)

O Epíteto específico pode ser um substantivo, que tem seu próprio genro – Tellina (Moerella) pygmaeus Lovén, 1846 – Taxonomistas, e especialmente outros usuários de

nomes taxonômicos, fazem erros! • Tellina pygmaea: errado!!

Por que os nomes mudam?

Aumento de entendimento científico (descobrimentos; mudanças no conceito de espécie (sensu lato) e entendimento filogenético)

Aplicação coreta dos códigos de nomenclatura (correção de erros; homônimos;…)

Mudança de Nome

Se uma espécie é transferido de um gênero a outro, o nome da espécie muda

Zoologia: o nome do autor original é colocado entre ( ) – Spongia aurea Montagu, 1818 – Hymeniacidon aurea (Montagu, 1818)

Botânica: parênteses + autor da ‘combinação’ nova – Halophila stipulacea (Forsskål) Ascherson

Por que os nomes mudam?

Toda mudança é governada por convenções legais e neutras cientificamente: os códigos de nomenclatura

Exemplo.: o ICZN (1999; http://www.iczn.org/iczn/index.jsp) consiste de:

Preâmbulo 90 Artigos, agrupados em 18 capítulos

Uma ou mais provisão mandatória Recomendações não mandatórias Exemplos

Glossário

A União de Dois Taxa do Mesmo Nível

Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Ridley 16060 K

Coletor nativo 2224 PNH

A União de Dois Taxa do Mesmo Nível

Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Ridley 16060 K

Coletor nativo 2224 PNH

A União de Dois Taxa do Mesmo Nível

? Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Ridley 16060 K

Coletor nativo 2224 PNH

A União de Dois Taxa do Mesmo Nível

? Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Ridley 16060 K J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915)

Coletor nativo 2224 PNH J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc. 77 (1917)

A União de Dois Taxa do Mesmo Nível

Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Alyxia angustifolia Ridl.

Alyxia pachyphylla Merr.

Ridley 16060 K J. Fed. Malay States Mus. 6 (1915)

Coletor nativo 2224 PNH J. Straits Branch Roy. Asiat. Soc. 77 (1917)

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

Hunteria

Hunteria gracilis A.DC.

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

Hunteria

Hunteria gracilis A.DC.

Gynopogon

K. Schum.

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

?

Hunteria

Hunteria gracilis A.DC.

Gynopogon

K. Schum.

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

Hunteria Gynopogon

Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.

Hunteria gracilis A.DC.

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

Gynopogon gracilis (A.DC.) K. Schum.

Gynopogon

Hook. f.

Alyxia

Mudanças de Nome Resultantes das

Mudanças na Colocação Taxonômica

Alyxia gracilis (A.DC.) Hook. f.

Gynopogon

Hook. f.

Alyxia

Tipos de sistemas de

informação taxonômica

• ‘Nomenclatores’: lista de nomes • Taxonômicos

– Lista de nomes, mais informação taxonômica (autor, referencia da publicação da descrição…)

– Who’s valid??

• Bancos de Dados de Espécies – Informação da biologia, identificação…

• Distribuição – Para um grupo de espécies ou para uma região

Nomenclatores

• Índice Fungorum

• Animais – Nomenclator Zoologicus (nível do gênero)

– Index Animalium

• Plantas – International Plant Names Index

Bases de Dados Taxonômicos

• Global – Integrated Taxonomic Information System (ITIS) – Species 2000 – Systema Naturae 2000 – UNESCO Register of Marine Organisms

• Regional – Species 2000 Europe, European Register of Marine

Species (ERMS) – Marine Species Database for Eastern Africa

(MASDEA) • Taxonômico

– Fungi…

Bases de dados biogeográficos

• Global Biodiversity Information Facility (GBIF)

• OBIS – E seus nodos regionais

Os nomes taxonômicos não sempre estão integrados

Bancos de Dados de Espécies

• FishBase

• Hexacorallia, Algaebase, CephBase, Brachnet, NeMys…

• www.marinespecies.org

• Projeto árvore da vida – http://tolweb.org/tree/phylogeny.html

International Journal of

Systematic and Evolutionary

Microbiology

Artigos com evidencia de

espécies ou classificação

novas

Bergey’s Manual of Systematic

Bacteriology

Proporciona informação filogenética de bactéria e arqueia

Approved Lists of Bacterial

Names

Alista as espécies

conhecidas de procariontes

a base de artigos publicados

Referencias

Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology Proporciona esquemas de identificação para identificar bactéria e arqueis

Morfologia, coloração diferencial, e testes bioquímicos

Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology Proporciona informação filogenética de bactéria e arqueia

Baseada no sequenciamento de rRNA

Referencias