gabriel - bioinfo grad - aula 1 06-12-2014

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BioinformáticaHardware e Sistemas Operacionais

Gabriel da Rocha FernandesUniversidade Católica de Brasília

gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com

+Pré História

nMendel identifica caracteres hereditários.

nLinus Pauling descreve o DNA como uma hélice simples.

nWatson e Crick descrevem a dupla hélice do DNA.

nDogma central da biologia molecular.

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DNA$

mRNA$

Proteínas$

Variação$Normal$ou$Patológica$

+A era genômica

n1977 - Sanger sequencia um bacteriófago.

nAnos 90 - Automatização do processo através de sequenciadores capilares.

n1995 - Primeiro genoma completo (Haemophilus influenzae)

nComeça o projeto genoma humano.

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+A evolução

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+A evolução

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+A evolução

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+Novas tecnologias e a era pós-genômica

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+A explosão de sequências

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+NCBI

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National Instituteof Health

National Libraryof Medicine

+A análise bioinformática

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+Hardware

nComponentes do computador:n Processadoresn Memórian Discos

nDesempenha as funções da máquina.

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+Software

nParte lógica do computador.

nConjunto de instruções processados pelos hardwares.

nInteração entre usuário e máquina.

nTorna o computador útil.

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+Sistemas operacionais

nÉ um conjunto de programas que fazem a inteface do usuário e seus programas com o Hardware.

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Programas HardwareSistema Operacional

Linux, Windows, Mac

+Windows

nMicrosoft

nUser friendly.

nPopular.

nServiço de licenças

nLimitado.

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+MacOS

nApple

nVem de brinde nos Mac.

nSistema Unix.

nAmbiente gráfico => Windows.

nDesenvolvimento => Linux.

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+Porque usamos o Linux?

nÉ livre;

nÉ gratuito;

nNâo é vulnerável a vírus;

nRecebe apoio de grades empresas como IBM, HP, Sun etc;

nMultitarefa e Multiusuário;

nModularização, somente é carregado para memória o que usado durante o processamento;

nNão há necessidade de reinicar o sistemas após cada modificação;

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+Distribuições do Linux

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+Trabalhando com Linux

nTerminal

nDiretórios: organizam os seus arquivos “Case sensitive”

nDica: Não usamos “espaço” nos nomes de arquivos no Linux.

nComandos:n ls: lista o conteúdo da pastan pwd: vê o diretório em que você están cd nome_do_diretório: troca de diretórion mkdir nome_do_diretório: cria diretórion rmdir nome_do_diretório: remove diretórion cp arquivo_de_origem arquivo_de_destino: copia arquivon mv arquivo_de_origem diretório_de_destino: move arquivon rm nome_do_arquivo: remove arquivo

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+Trabalhando com Linux

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