bioinfo - grad - aula 6
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BioinformáticaAnálise Funcional
Gabriel da Rocha FernandesUniversidade Católica de Brasília
gabrielf@ucb.br - fernandes.gabriel@gmail.com
+Objetivos
2
nIdentificar as funções dos genes.
nCaracterizar os processos celulares.
nMapear em vias metabólicas.
nElucidar o funcionamento do organismo.
+Ferramentas
nFerramenta de alinhamento:n BLASTn HMMER
nBase de dados:n COGn KEGG Orthologyn PFamn Gene Ontology
3
+Dicas
nProcurar por Hits que tenham descrição clara.n Evitar: hypothetical protein, putative..
nBuscar em várias bases de dados.n Aumentar a quantidade de entradas anotadas.n Hits não identificados em uma base podem ser anotados por outra.
nObservar a cobertura do alinhamento.n BLAST faz alinhamento local.n Não classificar uma proteína como um todo baseado apenas em
alinhamento a um unico domínio.
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