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Aula2: Replicação do DNA

O estabelecimento da estrutura do DNA já sugeriu um mecanismo de replicação

A replicação do DNA é semi-conservativa: o experimento de Meselson-Stahl:

A replicação do DNA é bidirecional, à partir de uma origen de replicação

A iniciação da replicação do DNA necessita a abertura da dupla fita: a ação das helicases

A forquilha de replicação “move” através da fita de DNA

O problema topologico de replicar DNA enovelado: a ação de topoisomeases

A adição de um novo nucleotídeo à fita nascente:

A remoção do pirofosfato “dirige” a reação no sentido da incorporação de nucleotídeos

A adição de um novo nucleotídeo é catalisada por enzimas chamadas DNA polimerases

The Klenow fragment of DNA polymerase I has a shape somewhat like a right hand.

A replicação do DNA é bastante fiel:

•Em E. coli, a fidelidade de replicação é da ordem de 1/106 – 109 nucleotídeos adicionados

•Quais fatores contribuem para isso?

1. Geometria dos pares de bases

Pares corretos

Pares incorretos

2. “Proof-reading” das polimerases

O proof-reading das DNA-polimerase também

contribui para a obrigatoriedade da

direcionalidade da síntese do 5’ - 3’

Se os novos nucleotídeos são sempre adicionados ao terminal 3’OH, como as duas fitas são sintetizadas ao mesmo tempo?

1 2

3 4

5 6

DNA ligases catalisam a ligação dos fragmentos de Okazaki já procesados

A forquilha de replicação eucariótica

Analogia entre proteínas de replicação de pró e eucariotos

As origens de replicação são seqüência de DNA bastante conservadas em cada espécies

oriC de E. coli

A mecanismo de replicação por “rolling circle”

Replicação do DNA mitocondrial por “strand-displacement” ou “duplex bubble”

O problema de end-replication

As pontas de cromossomos lineares se arranjam em T-loops para proteger a porção 3’ fita simples

Telomerase extende a porção 3’ fita simples das pontas dos cromossomos lineares

O conceito de DNA polimerases de “Lesion bypass”

A técnica de “polymerase chain reaction” (PCR)

Doug and Bill’s cars

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