Ácidos nucleicos - aula 1

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Estrutura e Função de Ácidos Nucleicos Profa Dra Marisa A. Nogueira Diaz Disciplina: Fundamentos de Bioquímica

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Page 1: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Estrutura e Função de Ácidos Nucleicos

Profa Dra Marisa A. Nogueira Diaz

Disciplina: Fundamentos de Bioquímica

Page 2: Ácidos Nucleicos - Aula 1

A Importância do DNA

• O DNA é chamado de “molécula da vida” pois

contém o código para construção das proteínas em

todos os seres vivos;

• Nos procariontes encontra-se uma molécula de

DNA circular (cromossomo bacteriano) e outras

moléculas circulares chamadas plasmídeos;

Page 3: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Replicação

Transcrição

Tradução

Proteína

Ácido Desoxirribonucleico

Ácido Ribonucleico

Page 4: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Nucleoide (DNA compactado)

Pili

Flagelo

Envelope celular (membrana)

Célula procariótica (bactérias):

Não tem organelas (núcleo, mitocondrias, etc)

Material genético compactado no nucleóide (não compartimentalizado)

Cromossomo único, circular fechado (na maioria das bactérias, ex: Escherichia coli)

Nucleóide da Bactéria

Page 5: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Nos eucariontes, o DNA é encontrado no núcleo celular formando os cromossomos e também nas mitocôndrias e nos cloroplastos;

Page 6: Ácidos Nucleicos - Aula 1

• Chamamos de Gene a um segmento de DNA que contém informações para a síntese de uma ou mais proteínas.

Page 7: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Componentes dos ácidos nucleicos

Page 8: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Açúcar

Page 9: Ácidos Nucleicos - Aula 1

O HOH2C

H

H

H H H

OH

OH

Deoxiribose

3´ 2´

Ribose

O HOH2C

H

OH

H H H

OH

OH

3´ 2´

Açúcares

Page 10: Ácidos Nucleicos - Aula 1
Page 11: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Guanina

O

N

N N

H

N

N H

H

H

H

Purinas

Adenina

N

H

N

H N

H

N

N

H

H

Page 12: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Citosina

H

H N

H

O

N

N

H H

H N

H

O

O

N

H3C H

Timina

H N

H

O

O

N

H H

Uracila

Pirimidinas

Page 13: Ácidos Nucleicos - Aula 1
Page 14: Ácidos Nucleicos - Aula 1

O P P O O P -O

O O O

O- O- O-

Fosfato

Page 15: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Sítio de ligação

Page 16: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Nucleosídeos

O CH

H

H

H H H

O

H

Deoxiribose

Adenina NH2

N

H N

H

N

N

H

HO

H

2`-desoxi-adenosina

Page 17: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Nucleotídeos

O CH

2

H

H

H H H

O

H

Deoxiribose

O P P O O P -O

O O O

O-

Fosfato

O- O-

Adenina NH2

N

H N

H

N

N

H

2`-desoxi-adenosina 5`-fosfato

Page 18: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Ribonucleotídeo

Page 19: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Desoxirribonucleotídeos

Page 20: Ácidos Nucleicos - Aula 1
Page 21: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Pareamento de Bases

A C

G T

Page 22: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Pareamento de Bases

Page 23: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Bases são complementares.

Pontes de hidrogênio são formadas entre as bases:

A = T 2 pontes de hidrogênio

G C 3 pontes de hidrogênio

G C É MAIS ESTÁVEL

A = T

G C

Page 24: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Ligação de hidrogênio

CH2

O

OH

Guanina

O

N

N

N

H

N

N

H

H

H

O H2C

OH

Citosina

H

H

N O

N

N

H H

Pareamento de nucleotídeos

Page 25: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Pareamento de nucleotídeos

Ligação de hidrogênio

CH2

O

OH

Adenina N

H

N H

N

H

N

N

H

O H2C

OH

H N

O

O

N

H3C H

Timina

Page 26: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Parte externa

Parte interna

Page 27: Ácidos Nucleicos - Aula 1

DNA fita dupla: cadeias antiparalelas

Page 28: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Polimerização

OH

O H2C

P

O

O O

O

P P O

O

O

P O

O

O

O

O

O

O O H2C

OH

P

O

O O

O

DNA polimerases RNA polimerases

Page 29: Ácidos Nucleicos - Aula 1

P P O

O

O

P O

O

O

O

O

O

O O H2C

OH

P P O

O

O

P O

O

O

O

O

O

O O H2C

OH

P P O

O

O

P O

O

O

O

O

O

O O H2C

OH

Inicia-se com trifosfatos

de nucleotídeos

Page 30: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Pareamento de

fitas de DNA

OH

O H2C

P

O

O O

O

O H2C

P

O

O O

O

O H2C

P

O

O O

O

O H2C

P

O

O O

O

O H2C

P

O

O O

O

O H2C

OH

P

O

O O

O

Invertido e

Complementar

5`

1’

2’

4’

5`

Page 31: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Ligação Fosfodiester

Entre As

bases

Page 32: Ácidos Nucleicos - Aula 1
Page 33: Ácidos Nucleicos - Aula 1
Page 34: Ácidos Nucleicos - Aula 1

OBSERVE A COMPLEMENTAÇÃO DE BASES DO DNA

ADENINA

TIMINA

Se liga a Timina por

duas pontes de

hidrogênio.

A = T

GUANINA

CITOSINA

Se liga a citosina por

três pontes de

hidrogênio.

G C

Page 35: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Observe a complementação de uma fita de DNA.

A T A C A T G G G C T A G A A

T T T T T T G G C C C C A A A

Sempre com a adenina se ligando a timina através de duas pontes de hidrogênio e a

guanina se ligando a citosina por três pontes de hidrogênio.

Page 36: Ácidos Nucleicos - Aula 1

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P

P P

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A estabilidade da dupla fita: as pontes de hidrogênio

Page 37: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Dupla hélice de DNA:

Watson-Crick, 1953

Sulco maior

Sulco menor

Page 38: Ácidos Nucleicos - Aula 1

DNA

Page 39: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Há 10,5 pares de bases por volta Completa da dupla hélice *

*

Page 40: Ácidos Nucleicos - Aula 1

DNA natural pode existir de três formas:

Giram para direita

Giram para esquerda

Predomina em

solução aquosa

Predomina em

solução apolar

Encontrado em todos os DNAs

Page 41: Ácidos Nucleicos - Aula 1

A transição entre as formas de DNA pode desempenhar um papel importante na regulação da expressão genética.

Page 42: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Absorbância do DNA sob luz UV

Comprimento de onda (nm)

Absorbância

Efeito hipercrômico

Fita simples

Dupla fita aumenta a

absorção

Page 43: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Interação intima (dipolo-dipolo e Vander Waals)

entre as bases empilhadas

diminui a absorção

No UV.

Page 44: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Timina no Lugar de uma Uracila no DNA Por quê?

Page 45: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Para prevenir mutações potencialmente letais !

N

N

NH2

O

HN

N

NH2

O

H

HN

NO

O

H

H2ONH3

CitosinaUracila

Citosina Citosina Uracila

C

G

U

A

Tautomerismo

ERRO

Page 46: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Existem enzimas que reconhecem o erro no DNA e

trocam Uracila por Timina impedindo que uma base seja

incorporada erroneamente...

Se Uracila existisse normalmente no DNA as enzimas não

saberiam reconhecer uma Uracila normal de uma vinda de

desaminação da citosina.

Gasta-se muita energia para SINTETIZAR Timina e como RNA

é constantemente degradado e ressintetizado a partir do DNA

não vale a pena gastar energia para incorporar Timina no RNA.

HN

NO

O

H

CH3

Page 47: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Desnaturação e Renaturaçãodo

DNA (1961 -Marmure Doty descobriram a

RENATURAÇÃOdo DNA)

•As duas fitas da dupla hélice podem ser reversivelmente

separadas quando as PONTES DE HIDROGÊNIO são

rompidas:

Page 48: Ácidos Nucleicos - Aula 1

A dupla hélice de DNA pode ser desnaturada reversívelmente:

Aumento de temperatura

ou Extremos de pH (usamos pH alcalino para separar as fitas)

Page 49: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Desnaturação e Renaturação da fita dupla de DNA

Cada espécie de DNA possui

uma temperatura característica,

ou Ponto de fusão. Quanto maior

o número de bases, com três

ligações de H maior a T.

G C

Pois requer maior energia térmica.

Page 50: Ácidos Nucleicos - Aula 1

DNA parcialmente desnaturado

Bolhas de DNA onde ocorreu a desnaturação

Ricas em A=T

Page 51: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Desnaturados pelo

aquecimento

Mistura e resfria Hibridos: DNAs de espécies diferentes formam regiões de bases pareadas:

Reflete herança evolucionária comum

Page 52: Ácidos Nucleicos - Aula 1

ATP : O trasportador de energia na Célula

A cada dia o ser humano gasta o equivalente a seu peso corporal de ATP.

A sua energia é atribuida a grande quantidade de energia liberada na sua hidrolise.

Page 53: Ácidos Nucleicos - Aula 1

ADP

Mais estável

Reação exergônica = libera muita energia!!!

Ligação de alta energia

Page 54: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Em pH = 7,0

ATP = 3,3 de carga negativa ADP = 2,8 AMP = 1,1 ATP tem maior repulsão eletrotática

O P P O O P -O

O O O

O- O- O-

Acomoda melhor a carga negativa

Page 55: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Co-fator enzimático

Transferência do grupo acila

Page 56: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Co-fator enzimático

Page 57: Ácidos Nucleicos - Aula 1

Co-fator enzimático

Page 58: Ácidos Nucleicos - Aula 1