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Revisão Sistemática

Luís Gustavo Corbellini ([email protected])

Laboratório de Epidemiologia Veterinária (EPILAB, UFRGS)

Objetivos

Curso de Introdução a Avaliação de risco

Qualitativa

2

Os alunos devem compreender a importância dos dados

e das informações científicas disponíveis para a realização

de uma AvR;

Compreender o papel da Revisão Sistemática numa AvR;

Identificar as diversas fontes de informação para realizar

uma AvR.

Vamos pensar em uma avaliação de

risco microbiológica de alimentos

Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa3


Qualitativa

Trata-se de um processo que pode ir da fazenda à mesa;

Existem inúmeros pontos críticos com risco de contaminação

ao longo do processo;

> 200 agentes biológicos podem causar doenças transmitidas

por alimentos (Sargeant et al., 2006);

Para uma avaliação de risco, é necessário conhecer os perigos

específicos, o processo de produção, os dados de ocorrência

(prevalência e concentração de patógenos), dados de consumo,

preparação, transporte, etc...

4

Fontes de informações


Qualitativa

5

Documentação e coleta de dados é a parte mais

demorada de qualquer avaliação de riscos (AvR);

As fontes de dados podem ser (depende de cada caso):

OIE web site;

FAO EMPRES;

(http://www.fao.org/ag/againfo/programmes/en/empres/home.asp)

GLEWS (http://www.glews.net/);

Órgãos Oficiais (Serviço Veterinário Oficial, etc.);

Bases de dados científicas (indexadas ou não);

Informações de Especialistas (Experts).

http://www.fao.org/ag/againfo/programmes/en/empres/home.asp

http://www.glews.net/


Qualitativa

Muitas vezes a obtenção de dados ocorre por:

1. Revisão narrativa;

2. Revisão sistemática;

6

Por exemplo


Qualitativa

Qual a prevalência de rebanho do vírus BVDV no RS?

90% (Canal et al., 1988);

48% (Almeida et al., 2013);

24,3% (Machado et al., 2014).

7

Qual a razão de tanta variação?


Qualitativa

1. Validade interna (qualidade do estudo)

Delineamento;

Análise;

População envolvida;

Teste de diagnóstico empregado.

2. Validade externa

O quanto os resultados podem ser extrapolados para outros

indivíduos de uma população.

8

Revisão Narrativa (RN)


Qualitativa

Descrever e discutir o desenvolvimento de um

determinado assunto sob o ponto de vista teórico;

Não tem critérios de busca e especificação de métodos

de seleção dos estudos.

9

Revisão Sistemática (RS)


Qualitativa

Estratégia de busca objetiva e coordenada – responde a

uma pergunta específica;

Seleção de trabalhos através de uma análise crítica;

Auxiliar na obtenção de dados numéricos e ou descrição

qualitativa com menor viés.

Pode ser seguida de uma análise quantitativa (meta-

análise).

10

Etapas para conduzir uma revisão sistemática


Qualitativa

1• Formular a questão/problema a ser revisado.

2

• Desenvolver protocolo de busca.

• Principais bases de dados eletrônicas: Medline/PubMed, ScienceDirect, Agricola, etc.

3• Definir critérios para identificar estudos relevantes (resumo).

4

• Avaliação crítica dos estudos selecionados na etapa anterior:

• Objetivos do estudo, população envolvida, amostragem, diagnóstico, etc.

5• Definição dos dados a serem extraídos;

6• Prosseguir (ou não) para meta-análise;

11

Exemplo: Costa et al. (dados não publicados)


Qualitativa

1

• Estimativa de prevalência de suínos eliminando Salmonella sp. nas fezes.

• População de interesse composta de suínos industriais.

• Isolamento da bactéria das fezes ou intestino.

2

• Medline/PubMed, Agricola e CAB.

• Termos usados para busca: “Salmonella”; “isolation”; “swine”; “prevalence”; “feces”

3

• Suínos industriais;

• Excluiu revisões ou outras revisões sistemáticas;

• Inglês ou português;

• ≥ 1996

4• Tinha que estar descrito no artigo (check-list): população de estudo, amostra randomizada,

métodos laboratoriais, qualidade da descrição dos resultados.

5• Dados extraídos: autor, ano, país, número de positivos, total amostrado, prevalência, fase de

produção e quantidade de fezes na amostra.

6• Meta-análise para estimar a prevalência.

12

Resultados


Qualitativa

Search:

146 articles found

Relevance Screening:

86 remain

Critical Appraisal:

9 articles utilized (15 trials)

60 excluded

Duplicated 60%

Before 1996 20%

Another POP 13.7%

Review/Note 6.6%

77 excluded

Pool 29.8%

Inoculate/Disease 27.2%

Treatment 20.77%

ELISA 6.4%

Another agent 3.9%

Data used before 3.8%

Not random 2.6%

Isolation not in feces 13%

13

Prevalência


Qualitativa

Prevalência: 14 %( CI 95% 7% - 25%)

14

Fontes de variação entre estudos


Qualitativa

Alta heterogeneidade foi encontrada em função de:

Quantidade de fezes coletada nos estudos;

Abate em comparação com terminação;

Ano do estudo e localidade não tiveram influencia;

15

Por que a revisão sistemática e meta-análise é uma

ferramenta aliada da avaliação de risco?

Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa16

Estratégia de busca


Qualitativa

As bases de dados científicos são inúmeras:

CABI, Agricola, Medline/PubMed, ScienceDirect, Scopus, etc.

Sintaxe: Operadores booleanos

AND, OR, and NOT

17

And


Qualitativa

Restringir a pesquisa;

Faz intersecção de trabalhos;

Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos:

Salmonella and isolation and swine and prevalence and feces

113 resultados no ScienceDirect;

169 resultados no PubMed;

18

Or

Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa

Agrupar termos

Amplia a pesquisa

a) sinônimos: swine or pork;

b) acrônimos: bovine viral diarrhea vírus or BVDV;

c) variantes: ovino or ovelha;

d) grafias diferentes: raios X or raios-X or raio X or raio-X;

e) relacionados: epidemia or epizootia;

Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos ou

porcos:

Salmonella and isolation and swine or Pork and prevalence and feces


176 resultados no PubMed;*

*Salmonella and isolation and (swine or Pork) and prevalence and feces

19

Not


Qualitativa

Serve para eliminar termos não pertinentes para o objeto ou

o tema da pesquisa;

Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos ou

porcos não realizado por ELISA:

Salmonella and isolation and swine or Pork and prevalence and feces

and not ELISA


152 resultados no PubMed;*

20

Resumo: operadores booleanos


Qualitativa

Operador Descrição Sintaxe da busca ScDirect PubMed

And Restringir a

pesquisa

Salmonella and isolation

and swine and prevalence

and feces

113 169

Or Agrupar termos

(ampliar)


and (swine or Pork) and

prevalence and feces

148 176

Not Eliminar termos

(restringe)


and swine or Pork and

prevalence and feces and

not ELISA

103 152

21

Pequeno exercício prático: Efetuar uma pesquisa booleana Science Direct*

com os termos pobreza, crime e género e preencher o quadro seguinte.


Qualitativa

Termos Pesquisados Número de resultados

Poultry

Feces

Waste

Contamination

Poultry and Feces

Poultry and Feces and Waste and

Contamination

“Poultry feces”

* Últimos 10 anos e apenas no Agricultural and biological Science

22

Guia para discussão


Qualitativa

Procure observar, de maneira geral, os resultados das

buscas. A ideia é vocês se familiarizarem com a sintaxe e

os retornos das buscas.

Observar o que ocorre nas buscas com operadores

booleanos, por exemplo:

Poultry and Feces – esta busca é eficaz caso você esteja

buscando o assunto relacionado a fezes de frangos? S/N

Porquê? Alguém tem alguma solução para restrição?

23

Resultado


Qualitativa

Termos Pesquisados Número de resultados

Poultry 13.317

Feces 8.513

Waste 41.647

Contamination 45.924

Poultry and Feces 992

Poultry and Feces and Waste and Contamination 91

“Poultry feces” 26

* Últimos 10 anos, apenas no Agricultural and biological Science e em Journals.

24

Em síntese


Qualitativa

A AvR é uma etapa que necessita de coleta de informações

Tanto na quantitativa como na qualitativa;

Muitos dos dados serão utilizados para

Definir parâmetros das distribuições de probabilidades (quantitativa);

Definir a escala de risco aplicada (qualitativa);

Pesquisa bibliográfica (sustentação científica da AvR) é

essencial:

A RS é um método que auxilia na identificação e sumarização de

dados disponíveis de forma objetiva, reduzindo possíveis vieses bem

como identificando áreas onde existe falta de informação.

25

É preciso salientar que...


Qualitativa

26

Nem sempre é necessário a realização de uma RS

Muitas vezes uma RN simples ou,

Apenas uma busca estratégia pode resolver.

Existem diversas fontes de informações para realização de

uma AvR.

Links úteis


Qualitativa

https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja97/ja97_pubmed.

html

http://libguides.mit.edu/c.php?g=175963&p=1158594

27

https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja97/ja97_pubmed.html

http://libguides.mit.edu/c.php?g=175963&p=1158594

www.ufrgs.br/epilab


Qualitativa

28

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