publicação de - gbif · 2020. 4. 10. · curso de formação: publicação de dados de...

Curso de formação:

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF Rui Figueira

[email protected]

Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa

Introdução

Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF - OnlineAbril de 2020

Ima

gem

: C

ésa

r G

arci

a

BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL

1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF

1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF

1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos

1.4. Fluxo de publ icação de dados através do GBIF

SUMÁRIO


GBIF EM NÚMEROS

Dados de ocorrência

de espécies

Instituiçõespublicadoras

https://www.gbif.org/the-gbif-network

1 403 643 729

8 411 337

7 567 777

Global:

Para PT:

Por PT:

1 587

22

Global:

De PT:

59 países / 38 participantes associados


Ima

gem

: C

ésa

r G

arc

ia

GBIF A NÍVEL NACIONAL

NÓNACIONAL

UNIVERSI-DADES

UNIDADES DE I&D MUSEUS

CIÊNCIACIDADÃ

SECTORPRIVADO

INVESTI-GADORES

PUBLICAÇÃO / USO / FORMAÇÃOINST.

PÚBLICOS

USO / FORMAÇÃO RI

PORBIOTA

INFRAESTRUTURA PADRÕESFORMAÇÃO


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a

DADOS PUBLICADOS PELO GBIF Baseados em Observações

● Projectos científicos● Monitorização / amostragens / inventários● Ciência Cidadã

Baseados em Espécimes● Coleções biológicas (incluindo HN)● Bancos de germoplasma / coleções vivas

OCORRÊNCIAS E DADOS DE AMOSTRAGENS

CHECKLISTS

METADADOS


PORTAIS de DADOSNACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org


PUBLICAÇÃO POR INSTITUIÇÕES PORTUGUESAS


VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

● Plataforma global: dados padronizados → indexação → pesquisa

● Fácil citação do uso através de DOI

● Mais citações → Maior impacto

● Preservação dos dados

● Rastreamento e informação sobre o uso dos dados

● Dados mantém a propriedade original

● Licença padrão: CC0, CC-BY, CC-BY-NC


VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

INFORMAÇÃO DISPONIBILIZADA AO PUBLICADOR

● Número de citações em artigos científicos

● Nº de downloads onde foram incluídos registos do dataset

https://www.gbif.org/dataset/7fe3eb5c-42bd-49d7-a30b-82c353ef6575


http://www.biodiversityinformatics.org

ENQUADRAMENTO GLOBAL


O PANORAMA GLOBAL

GBIF coopera com outras organizações ou iniciativas internacionais, que desenvolvem actividade complementar:

- Catalogue of Life, Encyclopedia of Life, Biodiversity Heritage Library, BOLD, Plazi

- LifeWatch, DISSCO, CETAF;

- EEA

- CBD, IPBES, UNEP-WCMC

- comunidade: TDWG

- desenvolvimento de um curriculum académico em informática para a biodiversidade


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a





1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF

SUMÁRIO


PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?

https://www.mentimeter.com/s/20256177fd846417481ddff869241cbb/e5a864f1f5f3

www.menti.com

11 92 6

http://www.menti.com/



Aumentar o impacto



A disponibilidade dos dados da investigação científica decresce rapidamente com a idade

Vines, Timothy H et al.. 2014. “The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age.” Current Biology 24 (1): 94–97. doi:10.1016/j.cub.2013.11.014.

Assegurar a preservação e acessibilidade dos dados



Aumentar a visibilidade da colecção / bd



Requisito do financiador



Ciência cidadã / participação social


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Aumentar do impacto científico

Aumentar a exposição a nível global, valorizando

Facilitar a revisão das colecções por especialistas

Assegurar a preservação dos dados

Responder a compromissos internacionais

Responder ao interesse de comunidades específicas

Cumprir requisitos do financiador


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Executar a decisão política - adopção de acesso aberto

● Maximizar o reconhecimento pelo uso dos dados

● Potenciar nova investigação

● Promover a boa gestão de recursos naturais

Melhorar a qualidade dos estudos de impacte ambiental

Promover a capacitação


BARREIRAS À PUBLICAÇÃO DE DADOS

Psicológicas e culturais

– falta de conhecimento

– falta de vontade

– qualidade dos dados

Institucionais

– privacidade

– autorização

Capacidade e recursos

– tempo / planificação

– capacidade

Práticas

– fundos / RH

– infraestrutura

Sharon Grant. Foundations for the BID Workshop – Biodiversity Data Mobilization. Kigali 2016


Imag

em

: C

ésa

r G

arc

ia





1.4. Fluxo de publ icação de dados através do GBIF

SUMÁRIO


CIÊNCIA ABERTA / DADOS ABERTOS

http://www.ciencia-aberta.pt/

FACILITATE OPEN SCIENCE TRAINING FOR EUROPEAN RESEARCH


Ima

gem

: C

ésa

r G

arc

ia





1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF

PARTE 1.4


TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIFD

AR

PA

- D

efen

se A

dvan

ced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)

● Dados de ocorrênciaCORE: OCORRÊNCIA → espécime

● Dados baseados em eventos de amostragens ou inventários

CORE: EVENTO → amostragem

● Lista de espécies (Checklists)CORE: TAXON → espécie

● Metadados de recursos de dados


https://www.gbif.org/sampling-event-data

Dados baseados em eventos de amostragem ou inventários - estrutura


AR

PA

- D

efen

se A

dvan

ced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)


Fontes de dados:

- colecções zoológicas, de herbário, microbianas, de tecidos, de ADN, bancos de germoplasma, colecções vivas;

- dados de satélite, armadilhas, câmaras fotográficas ou vídeo automáticas;

- teses, relatórios, literatura;

- bases de dados de observações, programas de monitorização, estudos de impacte ambiental;

- projectos de ciência cidadã;

- listas de espécies, checklists, listas vermelhas.


AR

PA

- D

efen

se A

dvan

ced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)


QUEM PODE PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF

Os dados podem ser apenas publicados por INSTITUIÇÕES ou ORGANIZAÇÕES.

Os cidadãos podem publicar através de projectos de ciência cidadã

DA

RP

A -

Def

ense

Adv

ance

d R

esea

rch

Pro

ject

s A

genc

y (D

AR

PA

)


FLUXO DE PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

1. Estabelecer acordos/autorizações institucionais

2. Fazer o registo e solicitar o aval pelo Nó:https://www.gbif.org/become-a-publisher

- Tomar conhecimento do Acordo de Publicação de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-publisher - Tomar conhecimento do Acordo de Uso de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-user

3. Seleccionar as ferramentas de publicação e estabelecer a infraestrutura

Pode usar-se o serviço IPT.GBIF.PT para alojamento dos dados

4. Preparar os dados para publicaçãoFormatar segundo o padrão de dados, fazer verificação de qualidade

5. Seleccionar uma licença (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) (pode ser definida para cada dataset)

PASSOS INSTITUCIONAIS (1ª vez)

DA

RP

A -

Def

ense

Adv

ance

d R

esea

rch

Pro

ject

s A

genc

y (D

AR

PA

)

https://www.gbif.org/become-a-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-user


PREPARAÇÃO DE UM CONJUNTO DE DADOS

Dados Padronização(DwC)

Descrição(metadados)

Validação

Publicação de dados

Publicação de metadados

(Artigos de dados)


ACESSO AOS DADOS PUBLICADOS

NACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org

FONTE: e.g. http://ipt.gbif.pt(gerido autonomamente pelo publicador)

http://ipt.gbif.pt/

Obrigado pela atençãoNó Português do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbárioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa, Portugal

Tel: (+351) 213653165email: [email protected]://www.gbif.pt

O Nó Português é acolhido no ISA com o apoio da FCT.

Esta apresentação é publicada segundo a licença CC-BY-SA

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF

http://www.gbif.pt/

publicação de - gbif · 2020. 4. 10. · curso de formação: publicação de dados de...

Documents