introdução publicação de - gbif · curso de formação: publicação de dados de biodiversidade...

Curso de formação:

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF

Rui Figueira

[email protected]

Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa

Introdução

Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFPorto, Junho de 2019

Imag

em:

Cés

ar G

arci

a

BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL

1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF

1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF

1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos

1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF

SUMÁRIO


GBIF EM NÚMEROS Dados de

ocorrência de espécies

Instituiçõespublicadoras

https://www.gbif.org/the-gbif-network

1 304 825 2427 869 6757 095 889

Global:

Para PT:

Por PT:

1 40820

Global:

De PT:

59 países / 38 participantes associados


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a

GBIF A NÍVEL NACIONAL

NÓNACIONAL

UNIVERSI-DADES

UNIDADES DE I&D MUSEUS

CIÊNCIACIDADÃ

SECTORPRIVADO

INVESTI-GADORES

PUBLICAÇÃO / USO / FORMAÇÃOINST.

PÚBLICOS

USO / FORMAÇÃO

RIPORBIOTA

INFRAESTRUTURA PADRÕESFORMAÇÃO


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a

DADOS PUBLICADOS PELO GBIF

Baseados em Observações● Projectos científicos● Monitorização / amostragens /

inventários● Ciência Cidadã

Baseados em Espécimes● Coleções biológicas (incluindo HN)● Bancos de germoplasma / coleções

vivas

OCORRÊNCIAS E DADOS DE AMOSTRAGENS

CHECKLISTS

METADADOS


PORTAIS de DADOSNACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org


PUBLICAÇÃO PORINSTITUIÇÕES PORTUGUESAS


VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

● Plataforma global: dados padronizados → indexação → pesquisa

● Fácil citação do uso através de DOI

● Mais citações → Maior impacto

● Preservação dos dados

● Rastreamento e informação sobre o uso dos dados

● Dados mantém a propriedade original

● Licença padrão: CC0, CC-BY, CC-BY-NC


USO DOS DADOS

Palavras-chave de ~1900 artigos que citam o GBIFhttp://www.mendeley.com/groups/1068301/gbif-public-library/

6400 artigos científicos (link)

151 para autores com afiliação portuguesa

2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170

20

40

60

80

100

120

Portugal

2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170

50010001500200025003000350040004500

Global

nº

art

igo

sIm

agem

: C

ésa

r G

arc

ia

https://www.gbif.org/resource/search?contentType=literature&peerReview=true


http://www.biodiversityinformatics.org

ENQUADRAMENTO GLOBAL


O PANORAMA GLOBAL

GBIF coopera com outras organizações ou iniciativas internacionais, que desenvolvem actividade complementar:

- Catalogue of Life, Encyclopedia of Life, Biodiversity Heritage Library, BOLD, Plazi

- LifeWatch, DISSCO, CETAF;

- EEA

- CBD, IPBES, UNEP-WCMC

- comunidade: TDWG

- desenvolvimento de um curriculum académico em informática para a biodiversidade


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a






SUMÁRIO


PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?

https://www.mentimeter.com/s/1d4715d90494592c51ff62bd286f81ce/377d8d914219

www.menti.com

27 89 34

https://www.mentimeter.com/s/1d4715d90494592c51ff62bd286f81ce/377d8d914219

http://www.menti.com/



Aumentar o impacto



A disponibilidade dos dados da investigação científica decresce rapidamente com a idade

Vines, Timothy H et al.. 2014. “The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age.” Current Biology 24 (1): 94–97. doi:10.1016/j.cub.2013.11.014.

Assegurar a preservação e acessibilidade dos dados



Aumentar a visibilidade da colecção / bd


PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?Potenciar investigação inovadora



Requisito do financiador



Compromisso assumido por Portugal, através da Declaração do Rio de Janeiro (2003),durante a cimeira de MCT da CPLP, de partilha e disponibilização, por via digital, do patrimóniocientífico nacional com origem nos países da CPLP.

Responder à missão da instituição/ Responsabilidade social



Ciência cidadã / participação social


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Aumentar do impacto científico

Aumentar a exposição a nível global, valorizando

Facilitar a revisão das colecções por especialistas

Assegurar a preservação dos dados

Responder a compromissos internacionais

Responder ao interesse de comunidades específicas

Cumprir requisitos do financiador


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Executar a decisão política - adopção de acesso aberto

● Maximizar o reconhecimento pelo uso dos dados

● Potenciar nova investigação

● Promover a boa gestão de recursos naturais

Melhorar a qualidade dos estudos de impacte ambiental

Promover a capacitação


BARREIRAS À PUBLICAÇÃO DE DADOS

Psicológicas e culturais

– falta de conhecimento

– falta de vontade

– qualidade dos dados

Institucionais

– privacidade

– autorização

Capacidade e recursos

– tempo / planificação

– capacidade

Práticas

– fundos / RH

– infraestrutura

Sharon Grant. Foundations for the BID Workshop – Biodiversity Data Mobilization. Kigali 2016


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a






SUMÁRIO


CIÊNCIA ABERTA / DADOS ABERTOS

FAIR

Findable, Accessible, Interoperable, Reusable.

http://www.ciencia-aberta.pt/

FACILITATE OPEN SCIENCE TRAINING FOR EUROPEAN RESEARCH


Imag

em:

Cés

ar G

arci

a






PARTE 1.4


TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF

DA

RP

A -

De

fen

se A

dva

nced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)

● Metadados de recursos de dados

● Lista de espécies (Checklists)

● Dados de ocorrênciaCORE: OCORRÊNCIA

● Dados baseados em eventos de amostragens ou inventários

CORE: EVENTO

Os dados podem ser apenas publicados por INSTITUIÇÕES ou ORGANIZAÇÕES.

Os cidadãos podem publicar através de projectos de ciência cidadã



DA

RP

A -

De

fen

se A

dva

nced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)

Fontes de dados:

- colecções zoológicas, de herbário, microbianas, de tecidos, de ADN, bancos de germoplasma, colecções vivas;

- dados de satélite, armadilhas, câmaras fotográficas ou vídeo automáticas;

- teses, relatórios, literatura;

- bases de dados de observações, programas de monitorização, estudos de impacte ambiental;

- projectos de ciência cidadã;

- listas de espécies, checklists, listas vermelhas.



DA

RP

A -

De

fen

se A

dva

nced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)

https://www.gbif.org/sampling-event-data

Dados baseados em eventos de amostragem ou inventários - estrutura


FLUXO DE PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

DA

RP

A -

De

fen

se A

dva

nced

Res

earc

h P

roje

cts

Age

ncy

(DA

RP

A)

1. Estabelecer acordos/autorizações institucionais

2. Fazer o registo e solicitar o aval pelo Nó:https://www.gbif.org/become-a-publisher

- Tomar conhecimento do Acordo de Publicação de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-publisher - Tomar conhecimento do Acordo de Uso de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-user

3. Seleccionar as ferramentas de publicação e estabelecer a infraestrutura

Pode usar-se o serviço IPT.GBIF.PT para alojamento dos dados

4. Preparar os dados para publicaçãoFormatar segundo o padrão de dados, fazer verificação de qualidade

5. Seleccionar uma licença (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) (pode ser definida para cada dataset)

PASSOS INSTITUCIONAIS (1ª vez)

https://www.gbif.org/become-a-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-user


PREPARAÇÃO DE UM CONJUNTO DE DADOS

Dados Padronização(DwC)

Descrição(metadados)

Validação

Publicação de dados

Publicação de metadados

(Artigos de dados)


ACESSO AOS DADOS PUBLICADOS

NACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org

FONTE: e.g. http://ipt.gbif.pt(gerido autonomamente pelo publicador)

http://ipt.gbif.pt/

Obrigado pela atençãoNó Português do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbárioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa, Portugal

Tel: (+351) 213653165email: [email protected]://www.gbif.pt

O Nó Português é acolhido no ISA com o apoio da FCT.

Esta apresentação é publicada segundo a licença CC-BY-SA

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF

http://www.gbif.pt/

introdução publicação de - gbif · curso de formação: publicação de dados de biodiversidade...

Documents