núcleo de pesquisa em biodiversidade e computação biocomp

Núcleo de Pesquisa em Biodiversidade e Computação

BioComp

Reunião geral19/12/12

Biodiversidade e Computação

Núcleo de Apoio à Pesquisa - USP

Agenda proposta

9:00 - recepção e adoção da agenda 9:10 - apresentações (< 5´ cada) 10:00 - Perguntas e discussão sobre as

atividades propostas 10:40 - café 11:00 - Discussão sobre as atividades

propostas: consolidação e calendário 11: 30 - Informações gerais do BioComp 11:40 - Encerramento



Objetivos

Balanço das ações e resultados em 2012 Propostas para 2013 Reunião do Conselho



Objetivo do BioComp

Criar um fórum onde pesquisa, educação e extensão sobre conservação e uso sustentável da biodiversidade são realizadas segundo um enfoque multidimensional envolvendo Biologia, Computação, Engenharia, Agricultura, Economia, entre outras áreas.

Criar conhecimento e aplicá-lo para o benefício da sociedade é nossa meta final.



Fórum

Promover a interação entre as partes é o ponto principal

Novas idéias, propostas e parcerias Pesquisa e projetos Educação e orientação Publicações Extensão Treinamento Divulgação Eventos



Há muita atividade em curso !

Nem sempre amplamente visíveis Envolvendo grupos menores Apenas parte da equipe original

Mas com novas adesões BioComp = grupo consolidado

Pré-existência de projetos e atividades (contrapartida)

São parte do BioComp !



Desafios

Divulgar melhor as atividades Aumentar as interações e a

transdisciplinaridade Em pequena escala Em grande escala

Aumentar as atividades e a participação comprometimento ≠ envolvimento

Exemplos - projetos



Exemplos - projetos

Classificação de abelhas baseada em imagens Tiago, Anna, Fabiana, André

Modelagem de distribuição de espécies: estudos de caso Cris Giannini, André Acosta, Vera, Saraiva

Abordagem semântica para padrões de dados de biodiversidade Anarosa, Fabiana, Saraiva

Classificação de plantas baseada em imagens Carlos, Anna, Luis Otávio

Redes de interação biológicas e aplicações Tatiana, Juliana, Nancy, Saraiva



Exemplos - projetos

Inventário e gestão ambiental & RFId Márcia, Carlos, Kleber, Jade,

Digitalização de dados de biodiversidade Allan, Danilo, Lucas, Etienne, Saraiva

Qualidade de dados de biodiversidade Allan, Saraiva

Interação Abelha-planta Garófalo, Cláudia, Hipólito, Michelle



Exemplos - projetos

Sistemas de informação e redes de sensores Wilian, Fabiana, Carlos e Saraiva

Comunicação e divulgação Bruno Nunes Silva et all

Outros exemplos a relatar ??

Exemplos – pesquisadores visitantes



Pesquisadores visitantes

Friedrich Recknagel Universidade de Adelaide - AU 5 a 24/mar/2012

• Palestra “Área de pesquisa em Informática Ecológica: Estado da Arte e Desafios”, 8/3/12

• Disciplina de Pós-graduação - Tópicos Especiais em Computação e Biodiversidade

– 13 a 15/3/12• Interação com pesquisadores em SP• Preparação do ISEI 2012 (International Conference on

Ecological Informatics)




Rolf A. de By University of Twente – Netherlands Dept of Geoinformation Processing (GIP) ITC Faculty of Geo-information Science and Earth Observation 15/Junho/2012

• Seminário “Opportunities for research collaboration on biodiversity informatics

• Poli – SP Outros participantes

• Andrea Pignatari Drucker – Embrapa monitoramento ambiental• Laurindo Campos e Andrea Albuquerque - INPA• Dilvan Moreira -ICMC-USP• Pedro Correa e Antonio Saraiva




Lucas Garibaldi Universidade Nacional de Rio Negro – AR Julho/2012

• Palestra ‘Marginal contribution of ecosystem services to agricultural productivity’, 25/7/12

• Interação com pesquisadores em SP e RP, 19 a 27/7/12

28/novembro a 1/dezembro/2012• Disciplina de Pós-graduação - PCS-5026

– Regresion Lineal en el software R, 29 e 30/11/12• Interação com pesquisadores em SP




Jacobus Biesmeijer Naturalis Biodiversity Center, Leiden-

Netherlands Julho/2012

• Palestra “Changes in plant-flower visitor communities through time and space”

– Encontro sobre Abelhas – 25/7/12• Interação com pesquisadores em RP, 24 a 28/7/12




Andrew Townsend Peterson University of Kansas 9/agosto/2012

• Palestra “New Developments and Insights in Ecological Niche Modeling ”

• Interação com pesquisadores em SP• Discussão sobre proposta de projeto temático em

Modelagem de distribuição de espécies




Jesús Aguirre Gutiérrez, Naturalis Biodiversity Center, Leiden-

Netherlands 9/outubro/2012

• Palestra “Fit-for-purpose: Species distribution model performance depends on evaluation criteria: Dutch hoverflies as a case study”

– Eco-Encontros (IB-USP)• Interação com pesquisadores em SP (8 a 11/10/12)




Armando Geller Scensei, EUA 18/outubro/2012

• Palestra “Multiagent modeling and simulation for and with stakeholders in areas affected by armed conflict ”

– CCE-USP




Enrique Martínez-Meyer Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México 29/11 a 7/12/2012

• Palestra “The Use of Primary Biodiversity Data and Informatics Tools for Scientific Research and Decision Making”

– Poli - SP• Interação com pesquisadores em SP (29/11 a 1/12) • Participação no ISEI 2012 com apoio do BioComp



Eventos

Simpósio “Ferramentas computacionais para pesquisa em polinizadores” X Encontro sobre Abelhas, 25/Julho/2012

• Jacobus Biesmeijer– Changes in plant-flower visitor communities through time and space

• Humberto Ribeiro da Rocha– Avaliação dos serviços ambientais de polinização e qualidade do

habitat• Milton Cezar Ribeiro

– Modelos de simulação: Desafios e possibilidades para explorar efeitos da paisagem sobre as abelhas

• Lucas Alejandro Garibaldi– Marginal contribution of ecosystem services to agricultural

productivity• Antonio Mauro Saraiva / Tereza Cristina Giannini

– The Research Center on Biodiversity and Computing BioComp



Eventos

ISEI - International Conference on Ecological Informatics 3 a 7/dezembro/2012 Apoio à vinda de Enrique Martinez-Meyer Comissão Organizadora (Pedro L.P. Correa) participação de pesquisadores no evento



Disciplinas de Pós-graduação

Computação e Biodiversidade PCS – 5023 BIE – 5789 Oferecida em 2º sem 2011

Tópicos especiais em Computação e Biodiversidade PCS – 5026 Oferecida 2 vezes em 2012

• Fred Recknagel (1º sem)• Lucas Garibaldi (2º sem)

Outros eventos ou atividades ??



Administração

Técnico Procontes: Analista Administrativo Sra. Lourdes Keiko Nagae Takigami (Fev/12) Apoio administrativo / financeiro

• Execução e acompanhamento financeiros– Recursos Pró-Reitoria de Pesquisa - USP– Recursos de outras fontes (ex.: FUSP, FDTE)

• Apoio aos eventos locais, cursos, recepção visitantes• Organização do laboratório



GT NAPs

Grupo de trabalho dos Núcleos de Apoio à Pesquisa

Criado pela Pró-Reitoria de Pesquisa e Vice-Reitoria Executiva para Assuntos Administrativos Portaria CODAGE, nº 574, de 13.07.2012, DOE

18.07.2012



GT NAPs

“propor medidas para regular as formas de apoio à gestão dos projetos dos Núcleos de Apoio a Pesquisa, de modo a estabelecer procedimentos e rotinas, desburocratizados e eficientes, mais adequados à realização da atividade-fim”, abrangendo precipuamente as áreas tecnologia da informação e comunicação, organizacional e jurídica.



GT NAPs

MARIA PAULA DALLARI BUCCI Procuradora Designada para Assessoria Técnica do Gabinete

PETER GREINER JR. Diretor do Departamento de Finanças

LUIS CARLOS CORREA DE SANTANA Diretor do Departamento de Administração

LUIS NATAL ROSSI Professor da Escola Politécnica e Diretor do Departamento de Informática

LUIS MOREIRA GOMES Departamento de Informática

LUIZ ANTONIO TEIXEIRA Coordenador de Administração Geral

OSVALDO NAKAO Professor da Escola Politécnica e Assessor da Pró-Reitoria de Pesquisa

ANTONIO SARAIVA Presidente da Comissão de Pesquisa da Escola Politécnica e Membro do Conselho de Pesquisa



Apoio técnico

Edson de Souza Suzano Bitencourt Nilton do Carmo

Desenvolvimento dos Web sites Hospedagem de ferramentas (CCE) Compras de equipamentos Manutenção

Propostas para 2013



Pesquisadores visitantes e eventos

Lucas Garibaldi Cursos de estatística (cont) até modelos mistos Pesquisa – avaliação econômica

Jacobus Biesmeijer Treinamento em modelagem e análise de dados

(de polinizadores) Pesquisa Pós-docs / doc

• Luisa Carvalheiro• Chiara Polce• Jesus Aguirre




Rede de catálogos polínicos Cláudia Ines Reunião para discussão dos padrões e formação

da rede TDWG meeting

Firenze, Outubro/Nov 13 Sessão em qualidade de dados de

biodiversidade Allan, Etienne e Saraiva




Instituto de Estudos Avançados da USP Grupo de Serviços de Ecossistemas Vera L.I. Fonseca (coord) Reuniões

• Capítulo de Políticas Públicas e Polinizadores (mar)• Mudanças Climáticas e Polinizadores (1º e 2º sem)• Conservação de polinizadores: apoio de ferramentas

moleculares e de coleções biológicas para políticas públicas




Outros? Critérios

Interesse e aproveitamento mais amplo possível



Conselho

Cris Miyaki – IB Vera Fonseca – IB/UFERSA Pirani – IB Kleber – EP Vitor – EP Carlos – EP Tiago – EACH Garófalo – FFCLRP Lionel – FFCLRP/UFERSA Fabiana – UFABC



Divulgação

Web site (biocomp.org.br) Atualização

• Pessoas• Projetos• Instituições• Produção e atividades

Multilíngüe Relatórios Folder



Projetos de pesquisa: financiamento

Novos financiamentos para projetos Temático FAPESP – Open Modeller ?? FAPESP – rede de catálogos polínicos (p 2014)

Outros ??



Tema 1Redes de sensores aplicados à agrobiodiversidade

CoordenadoresCarlos Cugnasca - Escola PolitécnicaVera Fonseca - Instituto de Biociências



Tema 2Caracterização e estudo biológico e computacional de forma, comportamento e comunicação em seres vivos

CoordenadoresAnna Helena - Escola Politécnica Tiago Francoy - EACH



Tema 3Modelagem, análise e tomada de decisão em biodiversidade

CoordenadoresCris Arias - Instituto de Biociências Pedro Correa - Escola Politécnica



Tema 4Identificação de espécies e interações biológicas: abordagens moleculares e morfológicas

CoordenadoresCris Miyaki - Instituto de Biociências André Hirakawa - Escola Politécnica



Tema 5Diversificação, biogeografia e conservação da biota neotropical: uma abordagem integrativa

CoordenadoresTatiana Torres - Instituto de Biociências Liria Sato - Escola Politécnica

Boas Festas !

Um 2013 com muito mais sucesso e resultados !

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