genética de populações de peixes migratórios da bacia do rio grande orientador: evanguedes...
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Genética de Populações de peixes migratórios da bacia do Rio Grande
Orientador: Evanguedes KalapothakisAluno: Artur Botelho Veloso
Instituto de Ciências BiológicasDepartamento de Biologia Geral
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
1 2 3 4 5 6
TH01
CSFPO
Linhas de pesquisa do laboratório
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores
Moleculares
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
DNA repetitivo:• Taxa de renaturação
elevada• Composição
nucleotídica diferente
• Muito susceptível a erros de alinhamento
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Separação desigual• Gradiente de CsCl = 1,660 + 0,00098 (% G•C)
g/cm3
• Picos – diferenças no conteúdo GC
• Satélites crípticos
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
DNA satélite nos cromossomos• Hibridização in situ• Sondas radioativas
• Heterocromatina• Centrômeros
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Mapeamento genético• Loci multivariáveis
• Taxa de mutação 10X maior
• Estudos de genética de populações
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Bacias Hidrográficas de Minas Gerais
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
FURNAS• 51% dos
domicílios• 61% do PIB• 12% da energia• 10 hidrelétricas• 2 termoelétricas
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Bacia do Rio Grande• 60% em MG• 67% da energia de
MG• 12 UHE
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Problemas
• Barragens Artificiais X Barragens Naturais
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Peixamentos
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Objetivo Geral:• Encontrar loci de microssatélites e utilizá-los em
estudos de populações de peixes de piracema da bacia do Rio Grande.
DouradoSalminus maxillosus
MandiPimelodus macultus
Curimba
Prochilodus lineatus
Jaú
Paulicea luetkeni
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Objetivo específico• Encontrar regiões de microssatélites em
Prochilodus lineatus
Curimba
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Materiais e Métodos• Biblioteca genômica• Sau3AI• Fragmentos: 500pb
CA(12)
TC(13)
CTT(9)
ACGA(6)
TA(12)
GGA(7) AAAG(6)
TATC(7)
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Seleção das colônias
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Seqüenciamento dos microssatélites• M 13-20: 5’ GTAAAACGACGGCCAGT 3’• M 13 VER:5’ GGAAACAGCTATGACCATG 3’
Laboratório de Evolução e Diversidade Molecular
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Eletroforese• Desenho dos primers• Padronização da PCR• Padronização do gel(acrilamida 6,5% ou 10%)• Construção de escada
alélica
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Resultados prévios• 32 clones seqüenciados• 7 regiões de microssatélites• 2 regiões foram usadas em estudos populacionais• 11 clones sem seqüências repetitivas
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Resultados prévios• AMOVA das populações
Laboratório de Biotecnologia e Marcadores Moleculares
Perspectivas• Padronização de novos loci de microssatélites• Utilização de mtDNA• Estudo de outras espécies