estudo da velocidade da reação enzimática e como ela se ... · atividade enzimática é afetada...

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Estudo da velocidade da reação enzimática e como ela se altera em função de diferentes parâmetros

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Page 1: Estudo da velocidade da reação enzimática e como ela se ... · Atividade enzimática é afetada pelo pH O pH pode influenciar a atividade de uma enzima através de maneiras distintas

Estudo da velocidade da reação

enzimática e como ela se altera em

função de diferentes parâmetros

Page 2: Estudo da velocidade da reação enzimática e como ela se ... · Atividade enzimática é afetada pelo pH O pH pode influenciar a atividade de uma enzima através de maneiras distintas

Parâmetro mais importante para

comparar a atividade e o tipo de reação

das enzimas é a concentração do

substrato

Importante abordagem para o

entendimento do mecanismo de ação

de uma enzima.

Vários fatores afetam a atividade de uma

enzima – pH, temperatura e substrato

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Atividade enzimática é afetada pelo pH

O pH pode influenciar a atividade de uma enzima através de maneiras

distintas. Primeiramente, o pH pode levar à desnaturação proteica.

O pH também pode interferir na atividade de uma enzima alterando o

padrão de cargas de um determinado sítio ativo ou catalítico, ou alterando

a conformação geral da proteína.

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Atividade enzimática é afetada pela temperatura

O aumento de temperatura aumenta a taxa de reação enzimática devido

ao aumento de energia cinética das moléculas participantes da reação.

A temperatura pode interferir nas interações que mantém as estruturas

secundárias e terciárias (pontes de hidrogênio e interações hidrofóbicas),

podendo levar à desnaturação protéica.

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enzima

A concentração do substrato afeta a velocidade das

reações catalisadas por enzimas

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Curva que relaciona [S] e V0 é uma hipérbole

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Concentrações

baixas de

substrato ocorre

aumento linear

entre

Velocidade(V0) e o

Substrato [S]

[S] V0

aumenta cada vez

menos até atingir

um patamar (Vmax)

Curva relacionando [S] e V0 pode ser expressa algebricamente

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Constante de Michaelis

Equação de Michaelis-Menten

TAREFA – Fazer para entregar a dedução da equação de Michaelis-Menten

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O que é Km ? É a concentração do substrato

onde se obtém metade da

velocidade máxima da reação

TAREFA – Demonstrar algebricamente o que é Km usando a equação de

Michaelis-Mentem e a definição de Km.

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Km e a Vmax varia de enzima para enzima caracterizando-

as e pode variar também com o substrato

Km não é uma medida de afinidade da enzima

pelo substrato mas sim a concentração do

substrato onde se obtém a metade da

velocidade máxima da reação

Rubisco

•Km CO2 - 9μM

•Km O2 - 350 μM

Hexoquinase Glicose Km - 0,05 μM

Frutose Km -1,5 μM

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Transformações da equação de Michaelis-Menten

Equação de Lineweaver-Burk ou duplo-recíproco

Inversão dos dois lados da equação de Michaelis-Menten

Separação dos componentes do lado direito.

Equação de Michaelis-Menten

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Equação de Lineweaver-Burk ou duplo-recíproco

Km

1 y a x b = +

inverter

Separar

componentes e

resolver

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y

x

Com essa

transformação

matemática passa-se

a trabalhar com uma

reta e não com uma

hipérbole, mais fácil.

Várias informações

podem ser obtidas

com esse gráfico

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y=0

x = 0

a = coeficiente angular

b = coeficiente linear

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y = 0

x = 0

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Através da análise da cinética da reação pode-se descobrir qual

o mecanismo de ação da reação com relação ao substrato

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A atividade de todas as enzimas pode ser

inibida por determinadas moléculas

Inibidores enzimáticos

São moléculas que interferem com a

catálise diminuindo ou interrompendo a

reação enzimática

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Como são classificados os inibidores de

acordo com seu mecanismo de ação?

Reversíveis Irreversíveis

Inibição competitiva

Inibição incompetitiva

Inibição mista ou não competitiva

Como eles atuam?

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Reversíveis - Inibição competitiva

Inibidor tem estrutura molecular semelhante à do substrato

Inibidor compete com o substrato pelo sitio ativa da enzima

[S] deslocar inibidor do

sítio ativo e manter Vmax

V max é constante na presença do inibidor devido à

grande quantidade de substrato

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Reversíveis - Inibição incompetitiva

Inibidor se liga em um

sítio diferente do centro

ativo, impede a reação do

complexo ES.

Independente da concentração do substrato o Km e a

Vmax estão alterados

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Reversíveis - Inibição mista ou não competitiva

Inibidor se liga tanto ao

complexo ES como à

enzima, em um sítio

diferente do centro ativo

Independente da concentração do substrato o

Km e a Vmax estão alterados

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Inibição irreversível

Inibidor se liga de maneira estável ou covalente

com um grupo funcional importante para a

atividade enzimática

Utilizados experimentalmente para definir os

aminoácidos essenciais do centro ativo das

enzimas

Inativar determinadas enzimas em situações

biológicas importantes

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Reagem com o resíduo S1 de serino-enzimas, formando um complexo irreversível.

Uma das enzimas altamente sensível a esses compostos é a

acetilcolinesterase, responsável pela metabolização do neurotransmissor

acetilcolina em neurônios centrais e periféricos (envenenamento por

organifosforados)

Este é o mecanismos de ação dos inseticidas organofosforados, como o

malathion e o parathion.

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Salicina, extraída da casca do Salgueiro Branco ou Chorão (Salix alba) - hoje sintetizada

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No metabolismo celular

grupos de enzimas

trabalham em conjunto

onde o produto de uma é

o substrato da outra

Via metabólica

Nessas vias existe

sempre uma enzima que

determina a velocidade

com que o grupo vai

trabalhar – enzimas

reguladoras

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•Regulam a velocidade das reações metabólicas

•São reguladas por determinados sinais

•Tipos:

Enzimas alostéricas

Enzimas reguladas por modificações

covalentes reversíveis

Enzimas reguladas por proteólise

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Sofrem modificações

conformacionais em

resposta à ligação do

modulador (positivo ou

negativo)

Enzimas alostéricas

•Possui sítios reguladores

para a ligação do

modulador especifico

•Maiores e mais

complexas que as não

alostéricas (mais que uma

cadeia polipeptídica)

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Enzimas reguladas por modificações

covalentes reversíveis

•Diferentes grupos podem se ligar á

molécula enzimática e regular sua atividade

•Grupos ligados covalentemente e

removidos pela ação de outras enzimas

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Enzimas reguladas por proteólise

Enzimas proteolíticas – mecanismo de proteção

Bothrops (Jararacas)

87% acidentes no

Estado de SP – janeiro

a abril – sexo

masculino

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1 - Procurar o mecanismo de ação do

glifosato e descrever como esse

herbicida exerce sua função sobre a

atividade da 5-enolpiruvilshiquimato-3-

fosfato sintase (EPSPS), que tipo de inibição

é essa.

TAREFA

TAREFA – Fazer para entregar a dedução da equação de Michaelis-Menten

TAREFA – Demonstrar algebricamente o que é Km usando a equação de

Michaelis-Mentem e a definição de Km.