coleção brasileira de microrganismos de ambiente e indústria cbmai divisão de recursos...

Coleção Brasileira de Microrganismos

de Ambiente e Indústria

CBMAIDivisão de Recursos

MicrobianosCPQBA/UNICAMP

drm@cpqba.unicamp.br

Locação Institucional Divisão de Recursos

Microbianos (DRM) CPQBA/UNICAMP Coord.: Gilson P.

Manfio suporte financeiro

UNICAMP FINEP/MCT FAPESP http://

www.cpqba.unicamp.br

Equipe Gilson P. Manfio, Ph.D

sistemática microbiana Valéria Maia de Oliveira, Dr.

biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de bactérias

Mônica M. de Sillos Castro, Ms. taxonomia e preservação de leveduras

Ana Paula M. Zibordi, Bióloga taxonomia e preservação de fungos filamentosos

Patrícia M. Zachelo, Técnica caracterização e preservação de microrganismos

Escopo Acervo

arqueas bactérias fungos filamentosos e leveduras plasmídios OGMs (certificação em andamento)

Grupo de risco P1 e P2

Atividades preservação depósito

público segurança

base de dados distribuição

identificação taxonomia

polifásica caracterização

convencional e molecular

tipagem treinamento pesquisa assessoria

Infra-estrutura Preservação

ultracongelador -80oC liofilizador centrífugo refrigeração 4oC (Castellani) N2 líquido (no projeto)

Identificação/autenticação microscopia kits rápidos sistema de fotodocumentação digital PCR grupo-específico (termocicladores) sequenciador automático sistema de eletroforese de DNA

Infra-estrutura

Informática acesso à rede do

CPQBA/UNICAMP servidor de rede

do CBMAI (no projeto)

Sistemas de Informação Intranet

gerenciamento de solicitações e serviços

BIS (Biodiversity Information System)

dados de catálogo gerenciamento e

manutenção do acervo

informação associada

Intranet CBMAI Sistema integrado para o

gerenciamento de solicitações de serviços solicitação on-line de serviços, formulários cadastro de clientes andamento de serviços resultados e relatórios diário de bordo (avisos ligados à rotina) rastreabilidade

Coleção de Culturas

Acervo

Bactérias: ~620 Bacillus isolados de processos industriais: 200 Actinomicetos de biomas brasileiros: 426

Fungos filamentosos: 19 Arqueas halofílicas: 6 Culturas-referência para aplicação: 160

normas ASTM, BS, ABNT linhagens-tipo

Ampliação do acervo

Biota/FAPESP Ecologia molecular de

bactérias degradadores de

xenobióticos Acidithiobacillus spp. bactérias endofíticas

fixadores de nitrogênio Microrganismos

endofíticos Microrganismos

produtores de compostos bioativos

CTPETRO Microrganismos

associados a depósitos de petróleo

Projetos Genoma Crinipellis perniciosa

link para dados moleculares do Projeto

Pesquisadores Indústrias Outras Coleções

BIS - Biodiversity Information System

dados básicos de catálogo identificação, origem, depositante...

propriedades e aplicações propriedades específicas

ambiente e indústria aplicação em testes, ensaios e ensino utilização em processos industriais

caracterização molecular fingerprinting, seqüências dados quimiotaxonômicos

informações confidenciais

BIS - Tabelas básicas

Espécies Linhagens Lotes de

preservação

Referências Meios de cultivo

Tabela de espécies - campos Código da espécie Tipo de organismo Gênero Espécie Variedade Descrição da variedade Autor Ano Referências bibliográficas

Regulations Harzard group

Observação Observações Taxonomia

código da espécie referência

Estado alternativo código da espécie morfologia

Sinônimos código da espécie nomenclatura

Tabelas de linhagens - campos Código da Linhagem Acesso (público ou restrito) Código da Espécie Patente Observações Depositada como – cód. espécie Data do depósito Status (ativo, inativo) Preservação Histórico (outras coleções) Depositante

Nome e Código Data/Endereço

Coletor Nome e Código Data/Endereço

Identificador Nome e Código Data/Endereço

Meio Crescimento Temperatura Observações

Substrato Original Localização Geográfica

Local e GPS Patogenicidade

Referência Hospedeiro

Nome Popular Gênero / Espécie / Variedade Referência

Ecologia Referências

Propriedades Produção de Metabólitos Degradação Dados Quimiotaxonômicos Dados Moleculares Dados Confidenciais Referências

Exemplo de registro no BIS

Bacillus sporothermodurans Petterson et al.

0087 Roza, C.R. (158-1) =CCT 7094. Milk UHT. GO, Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025]

Medium BHI; 37oC - FR

BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker 100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2, strain CBMAI 0087

1 2

Exemplo de registro no BIS

Cyclothyrium Petrak

syn. Cytoplea Bizz. & Sacc.

alt. Thyridaria Sacc.

0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS 109850. Estuary sediment [058]. Cubatão SP, Brazil. Degr: Degradation of pyrene, phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060]

Medium MA2; 28oC - FR

Exemplo de registro no BIS

Streptomyces Waksman & Henrici

0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated with herbicide [130]. Campinas SP, Brazil. Morphology: photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of alachlor herbicide [131]. Tax: [133, 134]

Medium ISP3; 30oC - FR

Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207.

Bennet’s Agar. 7 days, 30oC

>CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence1 TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG51 GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC101 TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA151 TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA201 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA251 ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG301 ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC351 GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA401 TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA451 GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG501 CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG551 TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG601 GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA651 GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT701 GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT751 GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA801 AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA851 GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC901 GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG951 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT1001 TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG1051 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG1101 TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT1151 CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG1201 AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT