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10. Modelos multi-estados
PPG Ecologia – USP – 2015 BIE 5703
10. Marcação-recaptura: multi-estados
Resumo
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10. Marcação-recaptura: multi-estados
1. Multi-estados
Ideia geral
Motivações
Parâmetros estimados
Premissas
Cormack-Jolly-Seber
São usadas para modelar diferentes taxas para dois ou
mais grupos (e.g., sexo, idade). Covariáveis categóricas
equivale à estratificação da população em grupos.
Lebreton et al. (1992)
Parâmetros específicos para machos e fêmeas de Cinclus cinclus
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Cormack-Jolly-Seber
Possibilidade de modelar covariáveis individuais,
temporais ou grupo-específicas.
Parâmetros como as probabilidades de captura e
sobrevivência como funções lineares de variáveis
explanatórias contínuas e categóricas. Função de ligação
restringe as variáveis resposta.
Lebreton et al. (1992)
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Cormack-Jolly-Seber
Covariáveis individuais fixas, não mudam ao longo do
tempo.
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Probabilidades de transição estocástica (ψ - psi)
entre categorias, fenótipos ou “estados”:
- Áreas
- Status reprodutivo
- Doença
- Peso/nutrição
Et cetera…
Modelo multi-estados
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Modelo multi-estados
Transições entre estados são
representadas por processos de Markov de
primeira ordem.
Cadeia de Markov
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Motivações
● Custo da reprodução em estudos sobre
evolução de histórias de vida.
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Motivações
● Meta-populações
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Movimentos entre três áreas
(meta-populações)
Exemplos de modelos: - Sobrevivência em função do tamanho - Transições em função da distância/isolamento
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Motivações
● Dispersão de doenças e efeitos sobre o fitness.
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Motivações
● Modelos de populações estruturadas em idades
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Regerh et al. (2010)
Modelo multi-estados
Histórico dos modelos:
1. Chapman & Junge (1956): Annals of Mathematical Statistics
- Dois estratos em uma população fechada
2. Arnason (1972): Researches of Population Ecology
- Três estratos em populações abertas
3. Schwarz et al. (1993) e Brownie et al. (1993): Biometrics
- k estratos em populações abertas
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Comparação com CJS
Lebreton & Pradel (2002)
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Parâmetros estimados
● 𝜓 = 𝑝𝑟𝑜𝑏𝑎𝑏𝑖𝑙𝑖𝑑𝑎𝑑𝑒 𝑑𝑒 𝑡𝑟𝑎𝑛𝑠𝑖çã𝑜 𝑒𝑛𝑡𝑟𝑒 𝑒𝑠𝑡𝑎𝑑𝑜𝑠
● 𝜙 = 𝑝𝑟𝑜𝑏𝑎𝑏𝑖𝑙𝑖𝑑𝑎𝑑𝑒 𝑑𝑒 𝑠𝑜𝑏𝑟𝑒𝑣𝑖𝑣ê𝑛𝑐𝑖𝑎
● 𝑝 = 𝑝𝑟𝑜𝑏𝑎𝑏𝑖𝑙𝑖𝑑𝑎𝑑𝑒 𝑑𝑒 𝑑𝑒𝑡𝑒çã𝑜
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Matriz de capturas
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Probabilidade de um histórico para
dois estados
1 2 0 1
𝜙11 𝜓1
12𝑝22[𝜙2
2𝜓221 1 − 𝑝3
1 𝜙31𝜓3
11 + 𝜙22𝜓2
22 1 − 𝑝32 𝜙3
2𝜓321]𝑝4
1
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Número de parâmetros
● CJS:
2 (k – 1)
● Multi-estados:
(s2 + 2s) (k – 1)
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Premissas
● Dentro de cada estado, probabilidade dos animais
sobreviverem, serem capturados e se movimentarem
(ou mudarem de estado) é igual
● Para estados geográficos, movimentos ocorrem antes
da ocasião de captura
● Marcas não afetam sobrevivência, não são perdidas
ou mudam com o tempo, e registradas corretamente
● Animais agem independentemente
● O estado é registrado corretamente e é observável
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Softwares
- Mark
- M-Surge
- MSSURVIV
- U-CARE (GOF para multi-estados)
- Pacotes R
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Leituras adicionais
- “A Gentle Introduction” of program Mark, de
Cooch & White.
- Seção no capítulo 17 de “Analysis and
management of animal populations” de
Williams et al. (2002).
- Capítulo 8 (Schwarz) do livro “Handbook of
Capture-Recapture Analysis” de Amstrup et al.
(2005).
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