1- organismo: s- schistosoma; h- humano; l- leishmania 2-estagio ciclo de vida/tecido/linhagem

1
1- Organismo: S- Schistosoma; H- Humano; L- Leishmania 2-Estagio ciclo de vida/Tecido/Linhagem Para Schisto: M- Macho; F- Fêmea; E- Ovo; S- esquistosomulo Para Humano: L- LNCaP IP de Ash1 em LNCaP- LAsh1 IP de IgG/Ash1 em LNCaP- LAsh1IgG Para Leishmania: MET- Metacíclica Cepa ET MNSL- Metacíclica Cepa NSL PET- Procíclica Cepa ET PNSL- Procíclica Cepa NSL 3- Condições de tratamento N0- Sem tratamento No caso de tratamento por andrógeno pro exemplo: A0- Amostra só com o veiculo, A1- Andrógeno a concentração 1nM; A2- Andrógeno a concentração 10 nM, etc... 4- Metodologia utilizada 1- kit da Roche General Library Prep 2- kit da Roche Rapid Library Prep 3-amplificação por PCR e sequenciamento a partir do 3’ 4-amplificação por PCR 10 ciclos e sequenciamento a partir do 5’ 5- amostra sem amplificação e sequenciamento a partir do 5’ 5- Fita sequenciada N- Sem informação de fita P- fita + M- Fita – 6- Numeração sequencial. Neste caso cada organismo deveria ter a sua numeração que seria independente das condições da biblioteca (ou seja, a primeira biblioteca feita para aquele organismo é 1 a segunda 2 etc.., independente do tecido, metodologia e outros fatores) 7- Numero da corrida Como a mesma biblioteca pode ser sequenciada varias vezes este numero se referiria ao numero da corrida e a letra a região do gasket, para diferenciar os dois lados de uma corrida. 8- Número de regiões da placa utilizadas em determinada corrida 2 -2 regiôes 4 -4 regiôes 8 - 8 regiôes 16 - 16 regiôes S-M-N0-2-M-001-1A-2 1 2 3 4 5 6 7 8

Upload: bairn

Post on 11-Jan-2016

27 views

Category:

Documents


1 download

DESCRIPTION

S-M-N0-2-M-001-1A-2. 7. 8. 1- Organismo: S- Schistosoma; H- Humano; L- Leishmania 2-Estagio ciclo de vida/Tecido/Linhagem Para Schisto : M- Macho; F- Fêmea; E- Ovo; S- esquistosomulo Para Humano: L- LNCaP IP de Ash1 em LNCaP- LAsh1 IP de IgG/Ash1 em LNCaP- LAsh1IgG Para Leishmania: - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: 1- Organismo: S- Schistosoma; H- Humano; L- Leishmania 2-Estagio ciclo de vida/Tecido/Linhagem

1- Organismo: S- Schistosoma; H- Humano; L- Leishmania

2-Estagio ciclo de vida/Tecido/LinhagemPara Schisto: M- Macho; F- Fêmea; E- Ovo; S- esquistosomuloPara Humano:L- LNCaPIP de Ash1 em LNCaP- LAsh1IP de IgG/Ash1 em LNCaP- LAsh1IgGPara Leishmania: MET- Metacíclica Cepa ETMNSL- Metacíclica Cepa NSLPET- Procíclica Cepa ETPNSL- Procíclica Cepa NSL

3- Condições de tratamentoN0- Sem tratamentoNo caso de tratamento por andrógeno pro exemplo:A0- Amostra só com o veiculo, A1- Andrógeno a concentração 1nM; A2- Andrógeno a concentração 10 nM, etc...

4- Metodologia utilizada1- kit da Roche General Library Prep2- kit da Roche Rapid Library Prep3-amplificação por PCR e sequenciamento a partir do 3’4-amplificação por PCR 10 ciclos e sequenciamento a partir do 5’5- amostra sem amplificação e sequenciamento a partir do 5’

5- Fita sequenciada N- Sem informação de fitaP- fita +M- Fita –

6- Numeração sequencial.Neste caso cada organismo deveria ter a sua numeração que seria independente das condições da biblioteca (ou seja, a primeira biblioteca feita para aquele organismo é 1 a segunda 2 etc.., independente do tecido, metodologia e outros fatores)

7- Numero da corrida Como a mesma biblioteca pode ser sequenciada varias vezes este numero se referiria ao numero da corrida e a letra a região do gasket, para diferenciar os dois lados de uma corrida.

8- Número de regiões da placa utilizadas em determinada corrida2 -2 regiôes 4 -4 regiôes 8 - 8 regiôes 16 - 16 regiôes

S-M-N0-2-M-001-1A-21 2 3 4 5 6 7 8