workshop pubmed: informação em ciências da saúde

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PubMed Informação em ciências da saúde PubMed Abril 2011 – Bibliotecas da Universidade de Aveiro Informação em ciências da saúde Imagem: Stock.xchng

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Page 1: Workshop PubMed: Informação em Ciências da Saúde

PubMedInformação em ciências da saúde

PubMed

Abril 2011 – Bibliotecas da Universidade de Aveiro 

Informação em ciências da saúde

Imagem

: Stock.xchng

Page 2: Workshop PubMed: Informação em Ciências da Saúde

PubMedInformação em ciências da saúde

Sumário◌ O que é?◌ Conteúdos◌ Funcionalidades◌ A Medline◌ O thesaurus MeSH◌ O acesso◌ A pesquisa◌ Subscrição de Feeds RSS◌ Exportação para o EndNote◌ Exercícios

Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro 

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PubMedInformação em ciências da saúde

O que é?

A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada, com mais de 20 milhões de registos de literatura biomédica,  MEDLINE, revistas científicas e livros electrónicos. Abrange as áreas da medicina, enfermagem, veterinária, entre outras áreas relacionadas com as ciências da saúde. Tem também um conjunto de links de endereços electrónicos seleccionados e com relevância para a área, incluindo recursos de biologia molecular.

Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos, em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso àMedline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e faz ligação a todos os artigos que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo PubMedCentral (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B‐on (com acesso ua.pt). 

PubMedInformação em ciências da saúde

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Conteúdos

› A MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas;

› A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países;

› Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos 

pré‐prints e livros;

› São também incluídas desde logo na PubMed as citações in‐process e as citações 

fornecidas pelos editores;

PubMed MeSH Thesaurus 

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PubMedInformação em ciências da saúde

Conteúdos

› As citações avulsas compreendem as citações out‐of‐scope (por exemplo, de artigos sobre geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE,  cujos artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na MEDLINE (catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na MEDLINE, mas que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados positivamente pela NLM;

› As citações in‐process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH).

Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process].

À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE];

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PubMedInformação em ciências da saúde

“Research studies that involve patients. Each study is designed to findbetter ways to prevent, detect, diagnose, or treat diseases and to 

answer scientific questions.”

School of Medicine | University of Southern California

Conteúdos

› Clinical trials:Estudos biomédicos ou investigação relacionada com áreas da saúde, aplicados em seres humanos e que seguem protocolos pré‐definidos.

http://www.usc.edu/schools/medicine/departments/surgery/divisions/colorectal/about/index.html

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Funcionalidades

› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;

› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not)e termo composto ou pesquisa por frase (“ “);

› Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazemparte da B‐on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominioua.pt);

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Funcionalidades

› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;

› Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials;

› Thesaurus MeSH;

› Subscrição de feeds RSS;

› Exportação para EndNote;

› Espaço pessoal.

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A Medline

› A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed. 

› Inclui apenas artigos científicos com peer‐review nas áreas da biomedicina. As referências 

nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais consistente e todos os 

registos contêm descritores do thesaurus Mesh. 

› Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da máxima 

pertinência. 

› Está acessível para a UA, através da plataforma ISI Web of Knowledge

http://isiknowledge.com/MEDLINE

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O thesaurus MeSH

Vocabulário controlado da PubMed|Medline

O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para indexar os 

artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no thesaurus MeSH 

dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado assunto de uma forma 

sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para aquele tópico.

É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline pois 

diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão.

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O acesso

http://pubmed.gov (acesso universal e gratuito)

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PubMedInformação em ciências da saúde

A pesquisa◌ Pesquisa básica◌ Pesquisa avançada◌ Pesquisa por assunto◌ Pesquisa por autor◌ Pesquisa por título de revista◌ Pesquisa de uma referência em particular◌ Operadores boleanos◌ Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico◌ O texto integral dos artigos

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A pesquisa básicaPubMed 

MeSH Thesaurus 

12

3

1

2

3Certifique‐se que está na base PubMed

Coloque os termos no campo de pesquisa

Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional)

4

4 Se não obtiver resultados na pesquisa básica, opte pela pesquisa avançada

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A pesquisa avançadaPubMed 

MeSH Thesaurus 

12

3

1

2

6

Seleccione o campo a pesquisar (opcional)

Coloque os termos de pesquisa 

Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional)

4

5 6

3 Seleccione um dos operadores boleanos(aplica‐se quando há vários termos a combinar)

4

5

Adicione os termos à caixa de pesquisa “search box”

Verifique se a pesquisa está de acordo com o pretendido

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Pesquisa por assuntoPubMed 

MeSH Thesaurus Identifique os termos do assunto a pesquisar

› Os termos devem ser em língua inglesa; › Deve ter em conta os sinónimos, o plural, o singular e as abreviaturas;

Exemplo:Exemplo:O tratamento com 

Metotrexato nas crianças com artrite juvenil 

ideopática poliarticular.

As palavras chave são:Methotrexate

ePolyarticular juvenileidiopathic arthritis

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Pesquisa por assuntoPubMed 

MeSH Thesaurus Ao colocar os termos na caixa de pesquisa, analise as sugestões de termos apresentadas, estas dão indicações dos termos mais correctos a usar.

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PubMed MeSH Thesaurus 

Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH.O MeSH está acessível através do link http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

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2

3

1

2 Seleccione um dos termos propostos (opcional)

Coloque o termo de pesquisa 

3 Inicia a sua pesquisa em “Search”

Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)

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PubMed MeSH Thesaurus 

Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH.

1

1 Seleccionar o termo de assunto

Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)

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Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)

11 Seleccione um dos termos de assunto 

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Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH)

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4

5

1

2 Termos a adicionar à pesquisa (opcional)

Termo de assunto já seleccionado 

3 Adicione os termos à caixa da pesquisa “Add to search buider”

6

4

5 Para juntar mais termos à pesquisa seleccione um dos operadores boleanos (opcional)

Valide o termo 

6 Lance a sua pesquisa na PubMed

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Use o MeSH quando: Não use o MeSH quando:

› pretende efectuar uma pesquisa exaustiva e precisa sobre um determinado tópico (os documentos ainda não indexados não serão apresentados).

› pretende informação sobre um conceito médico novo ou emergente, para o qual ainda não existe um termo MeSH.

› necessita de efectuar uma pesquisa elaborada, combinando vários aspectos de diferentes tópicos ou assuntos.

› quer obter registos de artigos publicados recentemente. Uma pesquisa por termo MeSH não consegue recuperar citações com a indicação «Pubmed – in process», às quais ainda não foram associados termos MeSH.

› quer encontrar rapidamente um aspecto específico de um tópico genérico.

› suspeita de que há pouca informação publicada relativa ao tópico que lhe interessa.

Pesquisa por assunto : quando usar e quando não usar o MeSH…

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PubMedInformação em ciências da saúde

Pesquisa por autorDigite na caixa de pesquisa, o último nome do autor, mais as iniciais sem pontuação.

PubMed MeSH Thesaurus 

Exemplo:Exemplo:DePinho RADePinho R

Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o nome do autor e seccione a opção autor do menu “All fields”.

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Pesquisa por título de revistaPubMed 

MeSH Thesaurus 

Exemplo:Exemplo:Lancet

Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de dados.

Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o título da revista e seccione a opção autor do menu “journal”.

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Pesquisa por título de revistaPubMed 

MeSH Thesaurus 

Exemplo:Exemplo:Lancet

Para obter informações sobre uma revista, aceda à NLM Catalog: Journals referenced in the NCBI Databases ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog/journals

1

12

4

Digite o título da revista 

2 “Search”

3

3 Seleccione a revisa 

4 Dados estruturados da publicação 

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PubMedInformação em ciências da saúde

Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes.Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcherpara localizar o artigo ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/citmatch. 

Pesquisa de uma referência em particular

Exemplo:Exemplo:Moniz, E. (1950). [Contribution of the 

Portuguese school to the development of neurosurgery]. Minerva Med, 41(35), 47‐49.

1

2

31 Preencha os campos de acordo com a referência 

2 Inicie a pesquisa com “Go”

3 Consulte o registo do artigo na PubMed 

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PubMedInformação em ciências da saúde

PubMed MeSH Thesaurus Os operadores boleanos na pesquisa

and

or

not

Psychology and forensicsResultados PubMed ‐ 5184 

Psychology or forensicsResultados PubMed ‐ 910388 

Psychology not forensicsResultados PubMed ‐ 824935

A pesquisa booleana permite a combinação de diferentes termos numa única pesquisa, através do uso dos  operadores and, or, not.

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PubMedInformação em ciências da saúde

PubMed MeSH Thesaurus Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico

Após a pesquisa, a PubMed apresenta uma lista com vários resultados (20 por página), ordenados cronológicamente e que podem ser de registos de artigos científicos ou capítulos de livros. 

Título

Em processo de indexação. Ainda não está na Medline

Autores

Título da revista

Não está indexado com descritores MeSH

Na Medline

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Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico

Volume e número

Ano de publicação Páginas

Link para o texto integral

Capítulo de livro

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PubMed MeSH Thesaurus Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico

Os registos bibliográficos são apresentados de uma forma estruturada – título, autor(es), afiliação, resumo/abstract, revista, ano de publicação, volume, número e páginas, link para o texto integral, editor, os termos de assunto do thesaurus MeSH, entre outros.

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PubMedInformação em ciências da saúde

PubMed MeSH Thesaurus Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico

Os termos de assunto com * são considerados os mais relevantes do artigo

Tipo de publicação / artigo de uma revistas

Termos de assunto indexados com base no MeSH

Ligações ao texto integral

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Subscrição de feeds RSSPubMed 

MeSH Thesaurus 

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PubMed MeSH Thesaurus 

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Subscrição de feeds RSS

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Exportação para EndNote PubMed 

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PubMed MeSH Thesaurus Exportação para EndNote 

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sbidm serviços de biblioteca, informação documental e museologia

universidade de aveiro sbidm serviços de biblioteca, informação documental e museologia

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