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Trabalhos sobre Processamento de Imagem e Geometria Computacional 2006-2009 Daniel Lopes (51462) [email protected] IST, 8 de Abril de 2009

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Trabalhos sobre Processamento de Imagem e

Geometria Computacional

2006-2009

Daniel Lopes (51462)[email protected]

IST, 8 de Abril de 2009

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Reconstrução 3D de estruturas ósseas a partir de imagens de Tomografia Computarizada (CT)

Modelação geométrica da articulação da anca a partir de imagens Ressonância Magnética Artrográfica (MRa)

Modelação de estruturas anatómicas com superfíces quádricas para análise de sistemas multicorpo

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Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

Image and Mesh Pipeline

IMAGE RESTORATION AND ENHANCEMENT

Anisotropic DiffusionGaussian FilterWiener FilterMedian Filter

IMAGE SEGMENTATION

Active Contour MethodsIntensity Region FilterManual Segmentation

VOLUME MESHPROCESSING

GenerationMesh Quality

SURFACE MESHPROCESSING

Generation

SURFACE MESHPROCESSING

SmoothingDecimationSmoothing

Imagens Médicas → Malhas EF volúmicas

Pipeline de software

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IMAGE RESTORATION AND ENHANCEMENT

Anisotropic DiffusionGaussian FilterWiener FilterMedian FilterHistogram Strectching

IMAGE SEGMENTATION

Active Contour MethodsManual Segmentation

SURFACE MESHPROCESSING

Generation

SURFACE MESHPROCESSING

SmoothingSimplification

VOLUME MESHPROCESSING

GenerationMesh Quality

MATLAB®

ITK-SNAP

BLENDER

PARAVIEW

GMSH

ABAQUS®

MATLAB®

BLENDER

MATLAB®

*.DCM

*.HDR

*.IMG

*.OBJ

*.DCM

*.STL

*.PLY

*.INP

*.STL

*.MSH

Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

Software Pipeline

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Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

),,( ),,(),,(

2),,(

tyxIedivtyxIttyxI

tyxI

http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/14995

Image Enhancement & Restoration– Anisotropic Diffusion Filter –

Perona & Malik

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Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

Image Segmentation- Bone Tissue Extraction -

Snake Initialization

I = 0

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I = 30

Image Segmentation- Bone Tissue Extraction -

Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

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I = 290

ATTENTION:Over-SegmentationSub-Segmentation

Final Iteration

Image Segmentation- Bone Tissue Extraction -

Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

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Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

Mesh Adjustments

Marching Cubes Suavização Simplificação

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Real Bone Smooth S → QC → S

Reconstrução 3D a partir de imagens CTReconstrução 3D a partir de imagens CT

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Modelação geométrica da articulação da ancaModelação geométrica da articulação da anca

Impingement tipo “cam” - femoral

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Modelação geométrica da articulação da ancaModelação geométrica da articulação da anca

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Modelação geométrica da articulação da ancaModelação geométrica da articulação da anca

3D Reconstruction with Radial Basis Functions

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Modelação de estruturas anatómicas com QuádricasModelação de estruturas anatómicas com Quádricas

3D modeling based on medical images (e.g., articular cartilages and body segments).

calculate the superquadric parameters that best fit a point cloud or polygonal representation of the anatomical structure: minimizing the deviation distance from each point to the most representative superquadric surface