rede specieslink e a gestão de dados sobre biodiversidade · melhoria da qualidade de dados...
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Dora Ann Lange Canhos
Centro de Referência em Informação Ambiental - CRIA
Rede speciesLink e a gestão de dados sobre biodiversidade
splink.cria.org.br
CRIA
• fundada em dezembro de 2000
• associação sem fins lucrativos de interesse público
• missão: disseminação do conhecimento científico visando contribuir para a conservação e utilização sustentável dos recursos naturais e a formação da cidadania
Coleções Biológicas
o que, onde, quando
Coleções biológicas como infraestrutura básica para o conhecimento científico
o quê? onde? quando?
Registros de ocorrências de espécies
Banco de dados da
coleção
Expedição
N° catálogo
Armário
Família
Espécie
Gênero
País
Localidade
Habitat
Observação
Map
eam
en
to d
os
cam
po
s
Mo
de
lo d
e d
ado
s D
arw
inC
ore catalog number
genus
family
species
country
notes
Registros on-line
(Todos de acesso
público)
Filtro para dados sensíveis
Acesso livre e aberto a dados não sensíveis
locality
spLinker: mapeamento dos campos
BLOQUEADOLat/long
speciesLink site
Camada de apresentação
Portal DiGIR(Java)
Perl
Conectividade baixa ou instável, falta de equipamento e pessoal
Conectividade rápida e estável,
hardware, software, humanware adequados
DadosspLinker
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção C
Repositório
de Dados
DadosspLinker
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção B
Repositório
de Dados
DadosProvedor PHP
Sistema de
Gerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção A
PostgresProvedor PHP
SOAP Server
SQL
Servidor Regional
arquitetura
Produtos
Indexador
iDigBio
Regional SP
Repositório Central
spLinker
TapirLink
Fiocruz
Taxonline SIColNet UFES …
Network Manager
openModeller
BioGeo
Lacunas
Interface de busca
IPT
TapirLink
Serviços Web
mapCRIA
TapirLink
Exsiccatae
Indicadores
Data Cleaning
Dicionáriostaxonômicos
IPT
Feedback
• 143 instituições nacionais 471 conjuntos de dados
• 31 instituições do exterior• 4 fototecas
Parceiros
16
302
42
12
2854
103
0 10 20 30 40 50 60
Empresa Privada
Instituto de Pesquisa
Museu
Rede de Pesquisa
Universidade Estadual
Universidade Privada
provedores de dados
e-infraestrutura de dados sobre biodiversidade
o quê? onde? quando?para quê?
◦ Melhoria da qualidade de dados
◦ Lacunas taxonômicas e geográficas
◦ Indicadores
Maior visibilidade, reconhecimento
◦ Cyber-taxonomy
◦ Ensino, estudos taxonômicos
◦ Modelos de distribuição de espécies
◦ Recuperação de áreas degradadas
◦ Estudos de impacto ambiental
◦ Processos de tomada de decisão
◦ Formulação de políticas públicas
Desenvolvimento mais sustentável
Banco de Dados
Serviços Web Interface de Busca
A importância das e-Infrastruturas locais
Rede Social
Centro de Inovação
Avanços em TIC
Banco de dados
• dados de ocorrência de espécies• imagens (vouchers, plantas vivas, pólen)• mapas, gráficos, sínteses, catálogos (dinâmico)
• dados de ocorrência de espécies• Imagens
Ferramentas
• qualidade dos dados• indicadores• uso
Serviços Web
• dados• imagens• mapas• modelagem de nicho ecológico
Interface de busca
• Cibertaxonomia• Sistema de Anotação• Lacunas• BioGeo
speciesLink e o Herbário Virtual
Qualidade dos dados
• Existe uma série de aplicativos que produzem o relatório denominado dataCleaning
• Objetivo: • Destacar registros suspeitos• Destacar a falta de padronização• Destacar problemas como a falta de completude
dos dados
• Os dados somente são alterados na origem!
splink.cria.org.br/dc
Interface de busca
Agregando valor ao dado
94%
Infraestrutura para pesquisa e educação e uso dos dados (convergência política)
Canhos DAL, Sousa-Baena MS, de Souza S, Maia LC, Stehmann JR, et al. (2015) The Importance of Biodiversity E-infrastructures for Megadiverse Countries. PLoS Biol 13(7): e1002204. doi:10.1371/journal.pbio.1002204http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=info:doi/10.1371/journal.pbio.1002204
Uso - www.splink.org.br/showUsage
2 milhões de registros utilizados por dia
Equipamentos do CRIA em regime de colocationcontrole ambiental, energia, conectividade, segurança
Sistemas de informação de interesse público
- speciesLink- dataCleaning, indicadores- Flora brasiliensis online- HV Saint-Hilaire, Glaziou- Bioline Publications- Lacunas, BioGeo
serviços web- mapCRIA- Exsiccatae
servidores regionais- nordeste, sudeste, etc.
backup server
backup server
9 servers2 storages
25 VMs
Sistemas internos
AdministrativoDesenvolvimentoTratamento de imagens7 servers
11 VMs1 tape library
40GB 10GB
Brasília, DF
Campinas, SP
Topologia da rede CRIA
Desafios
• Grandes instituições resilientes a mudanças
• Como tornar dados úteis e utilizáveis para outras comunidades
• Governança de institutos virtuais
• Sustentabilidade de e-infrastruturas: apoio a projetos a suporte de longo prazo
Mensagem final
• Compartilhamento de dados não depende somente da vontade de compartilhar dados
• Depende da organização, digitação, uso de padrões e protocolos, desenvolvimento das TICs, trabalhoscontínuos com a qualidade e atualização dos dados, …
• Avanços nas TICs abrem novas possibilidades, novascombinações, novas avaliações, diferentes formas de pensar, novas demandas …
• e-infrastruturas requerem financiamento contínuo e de longo prazo
Caminho para o futuro …
Obrigada!
Dora Canhos ([email protected])speciesLink (splink.cria.org.br)
Dimorphandra mollis Benth. (speciesLink, 2016)