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Download PubMed e o sistema Entrez - Instru§µes PubMed, op§µes de mostrar na tela (display), salvar, imprimir e enviar por email os resultados de uma pesquisa

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  • PubMed e o sistema Entrez - Instrues PubMed, opes de mostrar na tela (display), salvar, imprimir e enviar por email os resultados de uma pesquisa. Esta parte do curso uma demonstrao em PowerPoint e um tour guiado sobre como pesquisar no PubMed. Esta parte off-line e para ser usada como material de referncia. MDULO 4 Como usar PubMed
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  • Bem-vindos pgina eletrnica do PubMed Esta parte do mdulo mostrar a interface de pesquisa, as opes de mostrar na tela (display) as referncias, as opes de acesso s referncias e como enviar por email dos resultados.
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  • Barra de bases de dados NCBI A barra preta acima da caixa de pesquisa contem links para outras bases de dados NCBI. As bases de dados destacadas acima so: PROTEIN, OMIM e revistas do PubMed. Para mudar entre as bases de dados clique no nome da base de dados.
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  • NCBI base de dados OMIM Aqui esta a base de dados OMIM. Para voltar ao PubMed clique no link que est na barra de base de dados.
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  • Menu do lado esquerdo do PubMed Do lado esquerdo da pgina eletrnica do PubMed h links para outros recursos do PubMed, como por exemplo, uma viso geral do PubMed (overview) ajuda e perguntas mais frequentes (help & FAQ), um Tutorial e notcias. Abaixo, do lado esquerdo da pgina do PubMed esto tambm links para outras facilidades do PubMed como a base de dados de revistas, a base de dados MeSH (Medical Subject Headings), pesquisas clnicas, LinkOut e funes de citaes.
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  • Caixa de pesquisa do PubMed A caixa de pesquisa no PubMed est ativada. Digite neste espao o assunto de sua busca.
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  • Pesquisa simples no PubMed Neste exemplo ns entramos com a busca malaria infections in Africa na caixa de pesquisa. Para processar a busca clique no boto Go.
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  • Resultados display padro Os resultados da busca so listados no corpo da pgina.
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  • O link Details (detalhes) Para ver como o PubMed processou a busca, pode-se clicar no link Details (detalhes) destacado abaixo da caixa de pesquisa.
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  • Pgina do Details (detalhes) PubMed usa um mapeamento automtico de termos. O details (detalhes) mostra como o software do PubMed divide em partes o assunto da busca. Neste exemplo o PubMed buscou por Malaria como uma palavra do texto (text word) e como um termo MeSH devido a identificao automtica de termos. Africa e Infections so tambm buscadas como palavras do texto e como termos MeSH (descritores de assunto).
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  • Resultados opes de apresentao (display) Destacados abaixo da caixa de pesquisa esto as opes de mostrar na tela os resultados encontrados - display. Os registros so apresentados em formato resumido, de 20 em 20 de um total de 1599, mostrados e ordenados pelo nmero de identificao do registro no PubMed PubMed ID number.
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  • Formato de apresentao (display) H diferentes formatos disponveis para mostrar na tela os resultados da busca. A partir da lista de opes da funo display pode-se ver os possveis formatos de escolha. No PubMed pode-se selecionar tanto o formato Summary (resumido), Brief (curto), Abstract (resumo), Citation (citao), como o formato Medline. Os demais formatos so para outras bases de dados do NCBI. Normalmente, usa-se como padro, o formato Summary. Para mudar o formato, clique no boto Display e selecione o formato desejado.
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  • Formato Resumido Summary O formato resumido (Summary) mostra os nomes dos autores, o ttulo do artigo, a fonte de publicao da citao mostrada e o nmero de identificao do registro no PubMed - PubMed ID number.
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  • Formato curto (brief) 1 A partir das opes da funo Display pode-se selecionar o formato curto para apresentao dos registros - Brief.
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  • Formato curto (Brief) 2 O formato curto (brief) mostra o nome do primeiro autor, parte do ttulo do artigo e o nmero de identificao do registro no PubMed - ID number.
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  • Formato Resumo (abstract) 1 O formato Abstract est destacado dentre as opes de display.
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  • Formato resumo (Abstract) links para o texto completo A opo do formato resumo (abstract) traz links para os sites das editoras que podem ter o texto completo do artigo disponvel. Neste exemplo ns temos o link para a editora Elsevier Science e ao lado deste est o cone do HINARI, que identifica o direito de acesso ao texto completo para as instituies que so registradas no HINARI.
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  • Formato Resumo (abstract) informao de afiliao O formato resumo (abstract) tambm mostra informao da afiliao. Esta informao referente ao primeiro autor listado no artigo, e NO de todos os autores.
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  • Formato Citao 1 A opo de formato Citation (citao) similar ao formato resumo (abstract), mas mostra algumas informaes adicionais, como termos MeSH e nomes de substncias.
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  • Formato Citao Informao MeSH Aqui pode-se ver os termos MeSH (descritores de assunto) designados para este registro na indexao feita pela National Library of Medicine (NLM).
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  • Formato MEDLINE 1 Aqui, selecionou-se a opo do formato MEDLINE.
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  • Campos identificadores do MEDLINE O formato MEDLINE mostra todos os campos de um registro MEDLINE com o identificador do campo em cada linha. Este formato o melhor para ser usado na exportao de registros para um software de gerenciamento de referncias.
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  • Nmero de registros listados H algumas opes de quantidade de referncias a serem mostradas por pgina, ( de 5 a 500 referncias). aconselhvel listar o mximo de referncias possveis por pgina para economizar tempo na mostra dos resultados, eliminando a necessidade de passar por inmeras pginas. Aqui o exemplo a opo 200 selecionada na caixa. Para re-listar os resultados de registros por pgina, clique no boto Display.
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  • Pginas de Resultados A pgina de resultados est agora listando os registros de 1 a 200 dos 1599 registros encontrados na busca. Agora tem-se somente 8 pginas de resultados para ver.
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  • Opes de ordenamento (Sort) A ordem padro pr-determinada (default) de apresentao dos resultados pelo nmero de identificao PubMed que o PubMed ID. Os resultados podem ser ordenados alfabeticamente por autor ou por ttulo da revista, ou ainda pela data de publicao. Neste exemplo usou-se a opo Journal (revista). Para re-listar os registros considerando o ordenamento por revista, clique no boto da funo Display.
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  • Ordenando pelo ttulo da revista Pode-se ver os resultados de 1-200 mostrados em ordem alfabtica pelo ttulo da revista.
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  • Selecionando referncias 1 Para selecionar referncias a partir dos resultados, marca-se o quadrado que aparece ao lado esquerdo dos registros.
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  • Selecionando referncias 2 Os resultados de 1 a 4 desta pgina foram marcados e esto selecionados.
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  • Envio em formato de Texto 1 Os resultados selecionados podem agora ser formatados para impresso selecionando a opo text a partir das opes da funo send to (enviar para).
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  • Envio em formato de Texto 2 Esta uma boa opo de formato de impresso.
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  • Envio para um arquivo 1 Para salvar os resultados selecionados em um disquete ou em seu computador, selecione a opo file a partir do menu da funo send to
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  • Envio para um arquivo 2 Selecione um endereo para salvar o arquivo e altere o tipo do arquivo de fcgi document para all files (todos os arquivos).
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  • Envio para um arquivo 3 Escolha um nome para seu arquivo e acrescente a extenso.txt (de texto). Para salvar o arquivo clique no boto save
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  • Enviando por Email 1 Para enviar os resultados selecionados por email escolha a opo email a partir do menu da funo send to.
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  • Enviando por Email 2 A partir desta tela pode-se escolher um formato e a forma de ordenar os resultados selecionados, e ainda acrescentar um texto de observao na mensagem que ser enviada com os resultados.
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  • Enviando por Email 3 Digite um endereo de email na linha oferecida frente do item E-mail.
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  • Enviando por Email 4 Para processar o envio do email clique no boto Mail
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  • Enviando por Email 5 Ao retornar tela dos resultados, aparecer uma barra de mensagem informando que o email foi enviado do servidor do PubMed para o endereo de email de um usurio.
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  • Enviando para rea de trabalho 1 Os resultados selecionados tambm podem ser enviados para uma rea de trabalho. Selecione a opo Clipboard a partir do menu da funo Send to.
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  • Enviando para rea de trabalho 2 Uma barra de informao aparecer indicando o nmero de itens enviados para a rea de trabalho, o limite de tempo que ficaro disponveis at serem apagados e o nmero mximo de itens permitidos na rea de trabalho.
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  • Enviando para rea de trabalho 3 Para recuperar os itens colocados na sua rea