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Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza¸ ao U-curve Gustavo Estrela Novembro de 2017 Instituto de Matem´ atica e Estat´ ıstica Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinaliza¸c˜ ao Celular (CeTICS) Laborat´orio Especial de Ciclo Celular, Instituto Butantan

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Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas

de Posets para o Problema de Otimizacao

U-curve

Gustavo Estrela

Novembro de 2017

Instituto de Matematica e Estatıstica

Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalizacao Celular (CeTICS)

Laboratorio Especial de Ciclo Celular, Instituto Butantan

Page 2: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

O problema U-curve

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Modelos computacionais

Modelos computacionais sao criados para simular sistemas

complexos.

entrada −→ sistema −→ saıda

entrada −→ modelo −→ ∼ saıda

1

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Modelos computacionais

Modelos computacionais sao criados para simular sistemas

complexos.

entrada −→ sistema −→ saıda

entrada −→ modelo −→ ∼ saıda

1

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Modelos computacionais

Modelos computacionais sao criados para simular sistemas

complexos.

entrada −→ sistema −→ saıda

entrada −→ modelo −→ ∼ saıda

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Exemplo de modelo computacional

x1

x2

x3

x4 ...

Hiddenlayer

Outputlayer

Inputlayer

2

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O problema de selecao de caracterısticas

A selecao de caracterısticas e uma etapa da selecao de modelos.

Ela deve escolher quais sao as melhores caracterısticas para se

considerar no modelo.

Definicao

Dado um conjunto S de caracterısticas e uma funcao de custo c ,

ache o subconjunto de X ∈ P(S) tal que c(X ) e mınimo.

3

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O problema de selecao de caracterısticas

A selecao de caracterısticas e uma etapa da selecao de modelos.

Ela deve escolher quais sao as melhores caracterısticas para se

considerar no modelo.

Definicao

Dado um conjunto S de caracterısticas e uma funcao de custo c ,

ache o subconjunto de X ∈ P(S) tal que c(X ) e mınimo.

3

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O problema de selecao de caracterısticas

Podemos representar um conjunto X de caracterısticas por um

vetor de bits que chamamos de vetor caracterıstico.

Por exemplo, se S = {s1, s2, s3} e X = {s1, s3} entao o vetor

caracterıstico de X e 101.

4

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O problema de selecao de caracterısticas

Podemos representar um conjunto X de caracterısticas por um

vetor de bits que chamamos de vetor caracterıstico.

Por exemplo, se S = {s1, s2, s3} e X = {s1, s3} entao o vetor

caracterıstico de X e 101.

4

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O espaco de busca

Os algoritmos estudados neste trabalho representam o espaco de

busca com o reticulado Booleano (P(S),⊆).

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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O espaco de busca

Chamamos de cadeia uma sequencia de conjuntos adjacentes

X1,X2, . . . ,Xn tal que X1 ⊆ X2 ⊆ · · · ⊆ Xn.

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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1

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O espaco de busca

Chamamos de cadeia uma sequencia de conjuntos adjacentes

X1,X2, . . . ,Xn tal que X1 ⊆ X2 ⊆ · · · ⊆ Xn.

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

911111

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A funcao de custo

A funcao de custo c deve refletir a qualidade de um conjunto de

caracterısticas X a ser usado no modelo.

Nestas funcoes, um fenomeno conhecido em aprendizado de

maquina aparece. A funcao descreve curvas em U nas cadeias do

reticulado.

5

2a 4b 2c

3ab 3ac 1bc

4abc

;

1

1

2

3

4

5

c bc abc

c(X)

X

7

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A funcao de custo

A funcao de custo c deve refletir a qualidade de um conjunto de

caracterısticas X a ser usado no modelo.

Nestas funcoes, um fenomeno conhecido em aprendizado de

maquina aparece. A funcao descreve curvas em U nas cadeias do

reticulado.

5

2a 4b 2c

3ab 3ac 1bc

4abc

;

1

1

2

3

4

5

c bc abc

c(X)

X

7

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Funcoes decomponıveis em curvas U

Definicao

Uma funcao de custo c e dita decomponıvel em curvas U se

para toda cadeia maximal X1, ...,Xl , c(Xj) ≤ max{c(Xi ), c(Xk)}sempre que Xi ⊆ Xj ⊆ Xk , i , j , k ∈ {1, ..., l}.

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O problema U-curve

Definicao (Problema U-Curve)

Dados um conjunto finito e nao-vazio S e uma funcao de custo c

decomponıvel em curvas U, encontrar um subconjunto X ∈ P(S)

tal que c(X ) e mınimo.

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Algoritmos baseados em florestas

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound (UBB) organiza o

espaco de busca em uma arvore.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

10

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

Este algoritmo busca o mınimo global ramificando na arvore como

em uma busca em profundidade e faz podas sempre que o custo

aumenta.

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

911111

1

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

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1

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

Este algoritmo busca o mınimo global ramificando na arvore como

em uma busca em profundidade e faz podas sempre que o custo

aumenta.

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

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710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

911111

1

Note que se a condicao de poda nunca e verdadeira, entao o

espaco de busca inteiro e percorrido.

12

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

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411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

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511110 811101 911011 810111 901111

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1

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710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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1

Note que se a condicao de poda nunca e verdadeira, entao o

espaco de busca inteiro e percorrido.

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O algoritmo U-Curve-Branch-and-Bound

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411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

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311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

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Note que se a condicao de poda nunca e verdadeira, entao o

espaco de busca inteiro e percorrido.

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Solucao: percorrer o espaco de busca em duas direcoes.

O algoritmo Poset-Fores-Search (PFS) pode fazer isso porque

decompoe o espaco em duas arvores.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Solucao: percorrer o espaco de busca em duas direcoes.

O algoritmo Poset-Fores-Search (PFS) pode fazer isso porque

decompoe o espaco em duas arvores.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Solucao: percorrer o espaco de busca em duas direcoes.

O algoritmo Poset-Fores-Search (PFS) pode fazer isso porque

decompoe o espaco em duas arvores.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

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11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

13

Page 28: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

O algoritmo Poset-Forest-Search

Problema: agora e necessario manter as duas arvores equivalentes,

ou seja, representando o mesmo espaco de busca.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

00000

10000 01000 00100 00010 00001

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11111

1

14

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Problema: agora e necessario manter as duas arvores equivalentes,

ou seja, representando o mesmo espaco de busca.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

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1

14

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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O algoritmo Poset-Forest-Search

Podemos resumir o funcionamento do PFS aos seguintes passos:

• Escolher uma direcao de percorrimento

• Percorrer uma cadeia da floresta escolhida

• Sempre que a condicao de poda for verdadeira:

• Podar a floresta de percorrimento

• Atualizar a floresta dual

15

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Melhoramentos ao

Poset-Forest-Search

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Melhoramentos na implementacao atual do PFS

O algoritmo implementado por Marcelo possui pontos que podiam

ser explorados para se ter melhor desempenho computacional.

16

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Mudancas na escolha de raızes

A implementacao de Marcelo escolhia arbitrariamente como raiz de

percorrimento a primeira quando ordenadas lexicograficamente.

Propomos duas estrategias de escolhas:

• escolha aleatoria e uniforme entre raızes;

• escolha da raiz com maior sub-arvore.

17

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Mudancas na escolha de raızes

A implementacao de Marcelo escolhia arbitrariamente como raiz de

percorrimento a primeira quando ordenadas lexicograficamente.

Propomos duas estrategias de escolhas:

• escolha aleatoria e uniforme entre raızes;

• escolha da raiz com maior sub-arvore.

17

Page 41: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Mudancas na escolha de raızes

A implementacao de Marcelo escolhia arbitrariamente como raiz de

percorrimento a primeira quando ordenadas lexicograficamente.

Propomos duas estrategias de escolhas:

• escolha aleatoria e uniforme entre raızes;

• escolha da raiz com maior sub-arvore.

17

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Resultados da mudanca de escolha de raızes

Chamamos a variacao do PFS que escolhe raızes de maneira

aleatoria e identicamente provavel de PFS-RAND.

Instancia Tempo de execucao medio (s) Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S| PFS PFS RAND PFS PFS RAND

15 32768 0.180 ± 0.076 0.453 ± 0.311 12958.1 ± 5654.0 12807.5 ± 5753.7

16 65536 0.406 ± 0.185 1.715 ± 1.400 27573.8 ± 12459.5 27036.9 ± 12687.5

17 131072 0.717 ± 0.397 5.416 ± 5.266 48176.2 ± 26938.3 47852.1 ± 26427.6

18 262144 1.325 ± 0.754 15.890 ± 17.726 84417.9 ± 48587.7 84025.0 ± 48882.4

19 524288 2.771 ± 1.603 69.600 ± 82.342 167659.1 ± 99686.7 164612.1 ± 102018.3

18

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Resultados da mudanca de escolha de raızes

Chamamos a variacao do PFS que escolhe raızes de maneira

aleatoria e identicamente provavel de PFS-RAND.

Instancia Tempo de execucao medio (s) Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S| PFS PFS RAND PFS PFS RAND

15 32768 0.180 ± 0.076 0.453 ± 0.311 12958.1 ± 5654.0 12807.5 ± 5753.7

16 65536 0.406 ± 0.185 1.715 ± 1.400 27573.8 ± 12459.5 27036.9 ± 12687.5

17 131072 0.717 ± 0.397 5.416 ± 5.266 48176.2 ± 26938.3 47852.1 ± 26427.6

18 262144 1.325 ± 0.754 15.890 ± 17.726 84417.9 ± 48587.7 84025.0 ± 48882.4

19 524288 2.771 ± 1.603 69.600 ± 82.342 167659.1 ± 99686.7 164612.1 ± 102018.3

18

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Resultados da mudanca de escolha de raızes

Chamamos a variacao do PFS que escolhe as raızes com maior

sub-arvore de PFS-LEFTMOST.

Instancia Tempo de execucao medio (s) Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S | PFS PFS LEFTMOST PFS PFS LEFTMOST

15 32768 0.196 ± 0.085 0.672 ± 0.274 13780.3 ± 6049.9 17071.6 ± 7005.1

16 65536 0.348 ± 0.189 1.271 ± 0.661 24106.5 ± 13159.9 30055.6 ± 15363.6

17 131072 0.785 ± 0.361 3.137 ± 1.476 52369.0 ± 24751.2 67585.6 ± 30978.4

18 262144 1.445 ± 0.657 6.146 ± 3.032 92095.9 ± 42566.6 120635.7 ± 58039.0

19 524288 3.298 ± 1.883 13.881 ± 7.595 199151.0 ± 112167.8 256078.6 ± 135958.4

19

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Resultados da mudanca de escolha de raızes

Chamamos a variacao do PFS que escolhe as raızes com maior

sub-arvore de PFS-LEFTMOST.

Instancia Tempo de execucao medio (s) Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S | PFS PFS LEFTMOST PFS PFS LEFTMOST

15 32768 0.196 ± 0.085 0.672 ± 0.274 13780.3 ± 6049.9 17071.6 ± 7005.1

16 65536 0.348 ± 0.189 1.271 ± 0.661 24106.5 ± 13159.9 30055.6 ± 15363.6

17 131072 0.785 ± 0.361 3.137 ± 1.476 52369.0 ± 24751.2 67585.6 ± 30978.4

18 262144 1.445 ± 0.657 6.146 ± 3.032 92095.9 ± 42566.6 120635.7 ± 58039.0

19 524288 3.298 ± 1.883 13.881 ± 7.595 199151.0 ± 112167.8 256078.6 ± 135958.4

19

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Melhoramentos na estrutura de armazenamento de raızes

Mudamos a implementacao de Marcelo para usar diagramas de

decisao binarios ordenados (OBDDs).

;

{a} {b} {c}

{a b} {a c} {b c}

{a b c}

1

a

b

c

N NIL

c

M NIL

b

c

R NIL

NIL

1

20

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Melhoramentos na estrutura de armazenamento de raızes

Mudamos a implementacao de Marcelo para usar diagramas de

decisao binarios ordenados (OBDDs).

;

{a} {b} {c}

{a b} {a c} {b c}

{a b c}

1

a

b

c

N NIL

c

M NIL

b

c

R NIL

NIL

1

20

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Resultados da mudanca de estrutura para armazenamento de

raızes

Chamamos de OPFS o algoritmo que usa OBDDs para

armazenamento de raızes.

Instancia Tempo de execucao medio (s) Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S| PFS OPFS PFS OPFS

19 524288 2.612 ± 1.869 4.818 ± 3.355 156150.5 ± 107369.8 156021.8 ± 107516.8

20 1048576 6.085 ± 3.900 11.550 ± 7.661 344144.1 ± 212627.1 343229.2 ± 212624.4

21 2097152 11.416 ± 8.296 21.818 ± 16.269 616936.2 ± 436491.2 613526.2 ± 438580.0

22 4194304 19.950 ± 17.799 42.112 ± 45.109 960842.2 ± 785137.2 959905.4 ± 783257.3

23 8388608 42.792 ± 35.622 87.262 ± 90.579 2053472.4 ± 1690882.1 2060184.5 ± 1682011.0

21

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Paralelizacao do PFS

Implementamos tambem uma versao paralela do algoritmo PFS.

Entretanto, a etapa de atualizacao da floresta dual e complicada e

pode gerar condicoes de corrida, o que deixou a paralelizacao

complicada.

22

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Paralelizacao do PFS

Implementamos tambem uma versao paralela do algoritmo PFS.

Entretanto, a etapa de atualizacao da floresta dual e complicada e

pode gerar condicoes de corrida, o que deixou a paralelizacao

complicada.

22

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O algoritmo UBB-PFS

Este algoritmo e uma nova alternativa paralela que e dividida em

duas partes:

• Percorrimento sequencial: identico ao UBB deve criar

sub-arvores no espaco enquanto faz uma ramificacao do tipo

busca em profundidade.

• Solucao em paralelo: cada sub-arvore gerada na etapa de

ramificacao deve ser resolvida por uma chamada do PFS.

23

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O algoritmo UBB-PFS

Este algoritmo e uma nova alternativa paralela que e dividida em

duas partes:

• Percorrimento sequencial: identico ao UBB deve criar

sub-arvores no espaco enquanto faz uma ramificacao do tipo

busca em profundidade.

• Solucao em paralelo: cada sub-arvore gerada na etapa de

ramificacao deve ser resolvida por uma chamada do PFS.

23

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O algoritmo UBB-PFS

Este algoritmo e uma nova alternativa paralela que e dividida em

duas partes:

• Percorrimento sequencial: identico ao UBB deve criar

sub-arvores no espaco enquanto faz uma ramificacao do tipo

busca em profundidade.

• Solucao em paralelo: cada sub-arvore gerada na etapa de

ramificacao deve ser resolvida por uma chamada do PFS.

23

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Resultados do UBB-PFS

O UBB-PFS foi mais rapido do que o PFS.

Instancia Tempo de execucao medio (s)

|S | 2|S| UBB PFS UBB-PFS

20 1048576 1.312 ± 0.970 5.007 ± 3.302 2.478 ± 1.547

21 2097152 2.494 ± 1.893 11.125 ± 6.749 5.458 ± 3.294

22 4194304 4.589 ± 4.122 19.085 ± 15.147 8.832 ± 6.846

23 8388608 12.228 ± 7.922 40.323 ± 29.649 18.891 ± 12.786

24 16777216 24.273 ± 16.277 113.332 ± 76.688 67.178 ± 46.516

24

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Resultados do UBB-PFS

E computou menos a funcao custo do que o UBB.

Instancia Numero medio de calculos de custo

|S | 2|S| UBB PFS UBB-PFS

21 2097152 1172641.6 ± 879148.5 691991.3 ± 413262.9 704790.2 ± 407143.8

22 4194304 2099973.2 ± 1863285.8 1133395.1 ± 874492.0 1156564.2 ± 862152.0

23 8388608 5435778.8 ± 3468245.3 2276694.5 ± 1621342.2 2345648.2 ± 1558258.5

24 16777216 10146842.9 ± 6673018.3 5527504.2 ± 3413432.3 5609052.7 ± 3337059.1

25

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O algoritmo

Parallel-U-Curve-Search

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Ideia do Parallel-U-Curve-Search (PUCS)

Um algoritmo de facil paralelizacao e pouco entrelace de linhas de

processamento,

e que tambem distribua o trabalho em partes de

tamanho parecido.

Fazemos isso ao definir um particionamento do espaco.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

00000

00100 00010 00001

00110 00011 00101

00111

01000

01100 0101001001

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10101 1011010011

10111

11000

11100 11001 11010

11110 11101 11011

11111

1

26

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Ideia do Parallel-U-Curve-Search (PUCS)

Um algoritmo de facil paralelizacao e pouco entrelace de linhas de

processamento, e que tambem distribua o trabalho em partes de

tamanho parecido.

Fazemos isso ao definir um particionamento do espaco.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

00000

00100 00010 00001

00110 00011 00101

00111

01000

01100 0101001001

0101101101 01110

01111

1001010001

10000

10100

10101 1011010011

10111

11000

11100 11001 11010

11110 11101 11011

11111

1

26

Page 59: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Ideia do Parallel-U-Curve-Search (PUCS)

Um algoritmo de facil paralelizacao e pouco entrelace de linhas de

processamento, e que tambem distribua o trabalho em partes de

tamanho parecido.

Fazemos isso ao definir um particionamento do espaco.

00000

10000 01000 00100 00010 00001

11000 100101000110100 01100 0101001001 00110 00011 00101

11100 11001 1101010101 10110100110101101101 00111 01110

11110 11101 11011 10111 01111

11111

1

00000

00100 00010 00001

00110 00011 00101

00111

01000

01100 0101001001

0101101101 01110

01111

1001010001

10000

10100

10101 1011010011

10111

11000

11100 11001 11010

11110 11101 11011

11111

1

26

Page 60: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Particionamento do espaco de busca

Para particionar o espaco, escolhemos um conjunto arbitrario de

variaveis S ′.

Agora, definimos a relacao de equivalencia para os conjuntos de

caracterısticas:

X ∼ Y ⇐⇒ (X ∩ S ′) = (Y ∩ S ′)

27

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Particionamento do espaco de busca

Para particionar o espaco, escolhemos um conjunto arbitrario de

variaveis S ′.

Agora, definimos a relacao de equivalencia para os conjuntos de

caracterısticas:

X ∼ Y ⇐⇒ (X ∩ S ′) = (Y ∩ S ′)

27

Page 62: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Estrutura recursiva do problema

Se representamos cada parte por um subconjunto de caracterısticas

de S ′, entao temos um reticulado Booleano de partes. Chamamos

este reticulado de reticulado externo.

Se representamos, cada no de uma parte por um subconjunto de

caracterısticas de S − S ′, entao temos um reticulado Booleano de

nos de uma parte. Chamamos este reticulado de reticulado interno.

28

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Estrutura recursiva do problema

Se representamos cada parte por um subconjunto de caracterısticas

de S ′, entao temos um reticulado Booleano de partes. Chamamos

este reticulado de reticulado externo.

Se representamos, cada no de uma parte por um subconjunto de

caracterısticas de S − S ′, entao temos um reticulado Booleano de

nos de uma parte. Chamamos este reticulado de reticulado interno.

28

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Estrutura recursiva do problema

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

29

Page 65: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Dinamica

Podemos resumir a dinamica deste algoritmo nos passos:

• passeio aleatorio no reticulado externo, com podas;

• solucao de partes nao podadas;

• uniao de respostas das partes.

30

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Pontas de um reticulado

Se X e um conjunto maximal em um reticulado Booleano, isto e,

Y ⊇ X ⇐⇒ X = Y , entao X e ponta de cima do reticulado.

Se X e conjunto minimal, isto e, Y ⊆ X ⇐⇒ X = Y , entao X e

ponta de baixo do reticulado.

31

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Pontas de um reticulado

Se X e um conjunto maximal em um reticulado Booleano, isto e,

Y ⊇ X ⇐⇒ X = Y , entao X e ponta de cima do reticulado.

Se X e conjunto minimal, isto e, Y ⊆ X ⇐⇒ X = Y , entao X e

ponta de baixo do reticulado.

31

Page 68: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Condicoes de poda

Sejam P e Q duas partes adjacentes, sendo que Q ⊆ P.

Definicao (Condicao de poda inferior do PUCS)

Se o custo da ponta de cima de Q e maior do que a ponta de cima

de P, entao nenhuma das partes abaixo de Q contem o mınimo

global.

Definicao (Condicao de poda superior do PUCS)

Se o custo da ponta de baixo de P e maior do que a ponta de

baixo de P, entao nenhuma das partes acima de Q contem o

mınimo global.

32

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Condicoes de poda

Sejam P e Q duas partes adjacentes, sendo que Q ⊆ P.

Definicao (Condicao de poda inferior do PUCS)

Se o custo da ponta de cima de Q e maior do que a ponta de cima

de P, entao nenhuma das partes abaixo de Q contem o mınimo

global.

Definicao (Condicao de poda superior do PUCS)

Se o custo da ponta de baixo de P e maior do que a ponta de

baixo de P, entao nenhuma das partes acima de Q contem o

mınimo global.

32

Page 70: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Condicoes de poda

Sejam P e Q duas partes adjacentes, sendo que Q ⊆ P.

Definicao (Condicao de poda inferior do PUCS)

Se o custo da ponta de cima de Q e maior do que a ponta de cima

de P, entao nenhuma das partes abaixo de Q contem o mınimo

global.

Definicao (Condicao de poda superior do PUCS)

Se o custo da ponta de baixo de P e maior do que a ponta de

baixo de P, entao nenhuma das partes acima de Q contem o

mınimo global.

32

Page 71: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Simulacao de execucao

900000

710000 601000 800100 800010 500001

411000 710010710001610100 601100 501010801001 700110 500011 500101

311100 811001 411010810101 610110710011901011801101 600111 501110

511110 811101 911011 810111 901111

911111

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

33

Page 72: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Simulacao de execucao

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

34

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Simulacao de execucao

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

34

Page 74: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Simulacao de execucao

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

00

8

1

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

11XX1abc

10

8

01

8

11

7

00

9

10

6

01

7

11

6

00

7

10

6

01

5

11

5

00

6

10

5

01

5

11

6

00

5

10

3

01

4

11

5

00

4

10

8

01

7

11

8

00

7

10

8

01

9

11

9

00

8

10

8

01

9

11

9

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Simulacao de execucao

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Simulacao de execucao

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11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

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Simulacao de execucao

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

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Simulacao de execucao

00XX0

10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

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Simulacao de execucao

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10XX0a 01XX0b 00XX1c

11XX0ab 10XX1ac 01XX1bc

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Parametros de funcionamento

O PUCS tem parametros que controlam seu funcionamento:

• p controla a quantidade de variaveis fixas;

• l controla a quantidade de chamadas recursivas do algoritmo;

• um algoritmo base que deve resolver as partes.

36

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Parametros de funcionamento

O PUCS tem parametros que controlam seu funcionamento:

• p controla a quantidade de variaveis fixas;

• l controla a quantidade de chamadas recursivas do algoritmo;

• um algoritmo base que deve resolver as partes.

36

Page 82: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Parametros de funcionamento

O PUCS tem parametros que controlam seu funcionamento:

• p controla a quantidade de variaveis fixas;

• l controla a quantidade de chamadas recursivas do algoritmo;

• um algoritmo base que deve resolver as partes.

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Page 83: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Parametros de funcionamento

O PUCS tem parametros que controlam seu funcionamento:

• p controla a quantidade de variaveis fixas;

• l controla a quantidade de chamadas recursivas do algoritmo;

• um algoritmo base que deve resolver as partes.

36

Page 84: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Parametros de funcionamento

Os parametros p e l influenciam no tempo de execucao do

algoritmo.

Quanto maior o valor dos parametros, maior o tempo de execucao.

37

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Parametros de funcionamento

Os parametros p e l influenciam no tempo de execucao do

algoritmo.

Quanto maior o valor dos parametros, maior o tempo de execucao.

37

Page 86: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Parametros de funcionamento

Quando o algoritmo base utilizado e otimo, entao o PUCS tambem

e otimo.

Caso contrario, o PUCS torna-se um heurıstica em que os

parametros p e l influenciam na qualidade da solucao.

38

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Parametros de funcionamento

Quando o algoritmo base utilizado e otimo, entao o PUCS tambem

e otimo.

Caso contrario, o PUCS torna-se um heurıstica em que os

parametros p e l influenciam na qualidade da solucao.

38

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Resultados do PUCS

Em instancias pequenas, usamos parametros que deixam o

algoritmo otimo.

Instance Total time (sec)

|S | 2|S| UBB PFS UBB-PFS PUCS

18 262144 0.319 ± 0.228 1.512 ± 0.764 0.751 ± 0.338 0.680 ± 0.592

19 524288 0.684 ± 0.464 2.875 ± 1.554 1.387 ± 0.707 1.492 ± 1.323

20 1048576 1.249 ± 0.975 5.295 ± 3.509 2.594 ± 1.569 2.701 ± 2.908

21 2097152 2.671 ± 1.948 11.136 ± 6.947 5.460 ± 3.392 6.118 ± 5.961

22 4194304 5.420 ± 4.202 19.825 ± 14.519 9.709 ± 7.319 11.729 ± 11.613

39

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Resultados do PUCS

Instance # Calls of cost function

|S | 2|S| UBB PFS UBB-PFS PUCS

16 65536 43529.6 ± 25318.9 26447.0 ± 13446.1 28783.6 ± 12934.2 26001.3 ± 21699.6

17 131072 65301.0 ± 56215.8 49694.5 ± 27621.8 51032.5 ± 29984.3 50145.2 ± 46799.0

18 262144 145594.5 ± 103597.8 105603.1 ± 52652.2 110538.0 ± 51589.7 111296.6 ± 84922.4

19 524288 313096.0 ± 209913.1 194572.5 ± 104802.3 204604.5 ± 100305.4 233717.7 ± 186182.0

20 1048576 578319.0 ± 445912.2 340052.5 ± 221271.6 362007.0 ± 207411.2 387082.0 ± 389417.4

40

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Resultados do PUCS

Em experimentos sub-otimos, comparamos o PUCS com as

heurısticas Sequential Forward Floating Search (SFFS) e

Best-First Search (BFS).

30 40 50 60 70 80 90 100Tamanho de instância

0

5

10

15

20

25

Tem

po m

édio

de

exec

ução

SFFSBFSPUCS

30 40 50 60 70 80 90 100Tamanho de instância

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Prop

orçã

o de

mel

hor s

oluç

ão e

ncon

trada

SFFSBFSPUCS

41

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Aplicacoes instancias reais

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Selecao de caracterısticas em selecao de modelos

Aplicamos selecao de caracterısticas na construcao de modelos de

aprendizado para conjuntos de dados do UCI Machine Learning

Repository.

42

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Modelos de aprendizado

Os modelos que utilizamos para o treinamento e classificacao sao

do tipo Support Vector Machine.

hiperplano

43

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Conjuntos de dados testados

Fizemos o treinamento e validacao de modelos de aprendizado nos

seguintes conjuntos de dados:

• Iris

• Wine

• Thoracic Surgery

• Zoo

• Breast Cancer

• Lung Cancer

• Promoters

44

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Validacao cruzada

Para avaliar a selecao de caracterısticas fizemos a validacao

cruzada de modelos com todas caracterısticas e a de modelos

apenas com caracterısticas selecionadas.

45

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Resultados

O numero de caracterısticas selecionadas e, de fato, menor do que

o conjunto inteiro.

Iris

Thora

cic

Promote

rsWine Zoo

Lung C

ancer

Breast

Cancer

Conjunto de dados

0

10

20

30

40

50

60

70

80

Núm

ero

méd

io d

e ca

ract

eríst

icas s

elec

iona

das todas características

características do pucs

46

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Resultados

O numero de caracterısticas selecionadas e, de fato, menor do que

o conjunto inteiro.

Iris

Thora

cic

Promote

rsWine Zoo

Lung C

ancer

Breast

Cancer

Conjunto de dados

0

10

20

30

40

50

60

70

80

Núm

ero

méd

io d

e ca

ract

eríst

icas s

elec

iona

das todas características

características do pucs

46

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Resultados

Alem disso, a qualidade dos modelos nao e afetada.

Iris

Thora

cic

Promote

rsWine Zoo

Lung C

ancer

Breast

Cancer

Conjunto de dados

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Erro

méd

io d

e va

lidaç

ão c

ruza

da

características do pucstodas características

47

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Resultados

Alem disso, a qualidade dos modelos nao e afetada.

Iris

Thora

cic

Promote

rsWine Zoo

Lung C

ancer

Breast

Cancer

Conjunto de dados

0.0

0.2

0.4

0.6

0.8

1.0

Erro

méd

io d

e va

lidaç

ão c

ruza

da

características do pucstodas características

47

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Revisao

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

Page 113: Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para ...gustavoem/mac0499/presentation.pdf · Projeto de Algoritmos Baseados em Florestas de Posets para o Problema de Otimiza˘c~ao

Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48

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Revisao dos resultados deste trabalho

Ao longo deste trabalho apresentamos

• Modificacoes no PFS.

• Escolha de raızes.

• Estrutura de dados para armazenamento de raızes.

• Uma paralelizacao do PFS.

• O algoritmo UBB-PFS.

• O algoritmo PUCS.

• Testes com instancias reais.

48