pedro arsÉnio 1 ; maria dalila espÍrito santo 2

GGlobal lobal BBiodiversity iodiversity IInformation nformation FFacilityacility Workshop Braga, 5 a 7 JulhoWorkshop Braga, 5 a 7 Julho

A experiência do Herbário João de Carvalho e A experiência do Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)Vasconcellos (LISI)

Pedro ARSÉNIOPedro ARSÉNIO11; ; Maria Dalila ESPÍRITO SANTOMaria Dalila ESPÍRITO SANTO22

11-Secção Autónoma de Arquitectura Paisagista-Secção Autónoma de Arquitectura Paisagista22-Departamento de Protecção de Plantas e Fitoecologia-Departamento de Protecção de Plantas e Fitoecologia

Instituto Superior de AgronomiaInstituto Superior de AgronomiaTapada da Ajuda 1349-017 LisboaTapada da Ajuda 1349-017 Lisboa

[email protected]@isa.utl.pt [email protected] [email protected]

GBIFGBIF - A experiência do Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

O projecto “O projecto “Spanish and Portuguese Platform Spanish and Portuguese Platform for Botanical Diversity Data Onlinefor Botanical Diversity Data Online””

O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)(LISI)

A informatização do HJCVA informatização do HJCV

Perspectivas FuturasPerspectivas Futuras


Herbarios não informatizadosInformatização em curso com HERBARInformatização em curso com outros programas

Iniciativa AHIM - 17 Iniciativa AHIM - 17 instituições associadas ao projecto instituições associadas ao projecto Dados de ≈400 000 espécimes na Internet em 18 mesesDados de ≈400 000 espécimes na Internet em 18 meses Dotação orçamental de 50.000 USDDotação orçamental de 50.000 USD

Madeira

1

6

11

16

0 5 10 15 20 25

HUAL

BIO

ABH

MA

SANT

ARAN

BCN

COA

FCO

GDA

JACAHGI

MAF

MADJ

SALA

VAL - Coordenação LISI

Instituições Instituições associadas associadas ao projectoao projecto

http://212.85.38.201/ahim/ahim_web.htm


Disponibilização pelaDisponibilização pela InternetInternet de de dadaddos os jájá informatizados informatizados

ValidacValidacãoão ee controlcontroloo de de ququalidadalidadee

TransformaTransformaçãoção de da de daddos os parpara a sistemas sistemas interintercompaticompativeisveis e e

recuperação de dados em sistemas obsoletosrecuperação de dados em sistemas obsoletos

FormaFormaçãoção

UniformizaçãoUniformização da nomenclatura da nomenclatura

AAvalvaliiaaçãoção ee registo dasregisto das “ “experiências adquiridasexperiências adquiridas””

ObjectivosObjectivos


Objectivos Objectivos

Grupos de plantas visados no projecto:Grupos de plantas visados no projecto:

Pteridophyta – todas as famílias;Pteridophyta – todas as famílias;

Gymnospermae – todas as famílias;Gymnospermae – todas as famílias;

Cistaceae;Cistaceae;

Cruciferae;Cruciferae;

Rosaceae;Rosaceae;

Leguminosae;Leguminosae;

Scrophulariaceae.Scrophulariaceae.


Projecto “Projecto “Spanish and Portuguese Platform for Botanical Spanish and Portuguese Platform for Botanical Diversity Data OnlineDiversity Data Online”” - Resultados - Resultados

Instituição Prometidos Disponíveis PortugalPortugal

LISI 14.040 11.209MADJ 2.500 ---

EspañaEspañaABH 11.031 11.111ARAN 17.635 12.338BCN 3.843 4.958BIO 12.500 9.158COA 11.620 22.140FCO 6.236 6.819GDA 47.500 44.896HGI 4.209 4.310HUAL 1.080 4.018JACA 39.900 50.939MA 177.916 190.347MAF 4.110 4.971SALA 27.290 26.756SANT 3.850 13.081VAL 35.997 39.545

TOTALTOTAL 421.258421.258 456.596456.596Fonte: GBIF-ES Nodo Nacional de Información sobre Biodiversidad


As potencialidades de As potencialidades de consulta são inúmeras, consulta são inúmeras, permitindo obter distribuições permitindo obter distribuições geográficas por taxóne e geográficas por taxóne e listagens várias.listagens várias.


O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI) 1910 – Fundação do ISA1910 – Fundação do ISA

– O herbário reúne então cerca de O herbário reúne então cerca de 3.800 3.800 espécimesespécimes da flora vascular espontânea da flora vascular espontânea portuguesa e 658 espécimes de plantas portuguesa e 658 espécimes de plantas cultivadas como ornamentais, sob a cultivadas como ornamentais, sob a coordenação do Prof. D. António Xavier coordenação do Prof. D. António Xavier Pereira Coutinho;Pereira Coutinho;

1926 – Entrada do Prof. João de Carvalho e 1926 – Entrada do Prof. João de Carvalho e Vasconcellos no Gabinete de Botânica do ISAVasconcellos no Gabinete de Botânica do ISA

– Os trabalhos executados por este botânico, Os trabalhos executados por este botânico, designadamente os estudos fitogeográficos designadamente os estudos fitogeográficos que se desenvolveram no Douro sobre a flora que se desenvolveram no Douro sobre a flora messícola, flora aquática e flora ribeirinhamessícola, flora aquática e flora ribeirinha, , propiciam o propiciam o rápido crescimentorápido crescimento da colecção da colecção natural do herbário do ISAnatural do herbário do ISA..


O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)O Herbário João de Carvalho e Vasconcellos (LISI)

19801980– A colecção de plantas vasculares portuguesas contava com cerca de A colecção de plantas vasculares portuguesas contava com cerca de

60.000 espécimes60.000 espécimes. Um grande avanço foi dado ao Herbário com as . Um grande avanço foi dado ao Herbário com as colheitas efectuadas pelo Prof. João do Amaral Franco e, mais colheitas efectuadas pelo Prof. João do Amaral Franco e, mais

tarde, também tarde, também pela Invª. Maria pela Invª. Maria da Luz Rocha da Luz Rocha

Afonso, com os Afonso, com os estudos para a estudos para a “Nova Flora de “Nova Flora de

Portugal”. Todos Portugal”. Todos os os holotypusholotypus

destes destes classificadores classificadores

encontram-se encontram-se aqui arquivados;aqui arquivados;



19901990– A contagem feita para o Index Herbariorum em 1990 aponta para A contagem feita para o Index Herbariorum em 1990 aponta para

96.500 espécimes96.500 espécimes, no total do material arquivado, número que reflecte , no total do material arquivado, número que reflecte bem o trabalho de colheita efectuado pelos actuais investigadores dabem o trabalho de colheita efectuado pelos actuais investigadores da

Secção de Secção de Fitoecologia e Fitoecologia e

Herbologia, Herbologia, principalmente principalmente

por Mário por Mário Lousã, Dalila Lousã, Dalila

Espírito Santo, Espírito Santo, José Carlos José Carlos Costa, Ilídio Costa, Ilídio

Moreira e Moreira e Teresa Teresa

Vasconcelos;Vasconcelos;



20002000– O herbário do ISA, único na O herbário do ISA, único na

Universidade Técnica de Lisboa, obtém Universidade Técnica de Lisboa, obtém o estatuto de “Unidade especial” do o estatuto de “Unidade especial” do

Instituto Superior de Agronomia, com o Instituto Superior de Agronomia, com o nome nome de “HERBÁRIO JOÃO DE de “HERBÁRIO JOÃO DE

CARVALHO E VASCONCELLOS”CARVALHO E VASCONCELLOS”..

A realização de projectos financiados A realização de projectos financiados pela Comunidade Europeia, de modo a pela Comunidade Europeia, de modo a

dar resposta a Convenções dar resposta a Convenções internacionais, permitiu que desde 1995 internacionais, permitiu que desde 1995

o Herbário sofresse novos incrementos. o Herbário sofresse novos incrementos.


Os espécimes herborizados encontram-se distribuídos pelas colecções:Os espécimes herborizados encontram-se distribuídos pelas colecções:

Plantas Espontâneas da Península IbéricaPlantas Espontâneas da Península Ibérica, , reunindo as plantas espontâneasreunindo as plantas espontâneas de Portugal continentalde Portugal continental,, Espanha continental e as provenientes das Espanha continental e as provenientes das exsiccataexsiccata anuais da Associação Ibero-Macaronésica de Herbários.anuais da Associação Ibero-Macaronésica de Herbários.

Plantas dos AçoresPlantas dos Açores, proveniente em 80% das colheitas efectuadas pelo Eng.º , proveniente em 80% das colheitas efectuadas pelo Eng.º Siv. Ilídio Botelho Gonçalves, com cerca de 5000 espécimes, distribuídos por Siv. Ilídio Botelho Gonçalves, com cerca de 5000 espécimes, distribuídos por 1131 taxa.1131 taxa.

Plantas da MadeiraPlantas da Madeira, colecção recentemente enriquecida pelas colheitas , colecção recentemente enriquecida pelas colheitas efectuadas por J. C. Costa e Mário Lousã.efectuadas por J. C. Costa e Mário Lousã.

Plantas Cultivadas e OrnamentaisPlantas Cultivadas e Ornamentais, de que se destaca a contribuição de Lisete , de que se destaca a contribuição de Lisete Caixinhas.Caixinhas.

““Herbário mundialHerbário mundial”, para o qual contribuem as excursões ”, para o qual contribuem as excursões geobotânicas efectuadas durante as reuniões internacionais e geobotânicas efectuadas durante as reuniões internacionais e uma colecção de plantas de Timor herborizada por Ruy Cinatti.uma colecção de plantas de Timor herborizada por Ruy Cinatti.


Considera-se o actualmente o Considera-se o actualmente o quarto maior herbário nacionalquarto maior herbário nacional, , a seguir aos importantes herbários do Instituto Botânico Júlio a seguir aos importantes herbários do Instituto Botânico Júlio Henriques da Universidade de Coimbra, do Centro de Henriques da Universidade de Coimbra, do Centro de Botânica do Instituto de Investigação Científica Tropical Botânica do Instituto de Investigação Científica Tropical (apenas de plantas da África tropical) e do Herbário, Jardim (apenas de plantas da África tropical) e do Herbário, Jardim Botânico e Museu da Faculdade de Ciências de Lisboa, sendo Botânico e Museu da Faculdade de Ciências de Lisboa, sendo certamente dos mais actualizados em plantas vasculares de certamente dos mais actualizados em plantas vasculares de Portugal continental. Portugal continental.



Anteriores experiências de informatização do HJCVAnteriores experiências de informatização do HJCV 1993-19941993-1994

– Sob a supervisão da Eng.ª Teresa Vasconcelos procede-se à Sob a supervisão da Eng.ª Teresa Vasconcelos procede-se à informatização do herbário com recurso ao aplicativo informatização do herbário com recurso ao aplicativo FileMaker Pro FileMaker Pro vs. 2.0vs. 2.0 (para Macintosh), totalizando 50.412 registos. Carregamento (para Macintosh), totalizando 50.412 registos. Carregamento directo na tabela de registos, nenhum tipo de customização.directo na tabela de registos, nenhum tipo de customização.

19981998– Informatização da colecção dos AçoresInformatização da colecção dos Açores.. Constituição de uma base de Constituição de uma base de

dados em dados em MS Access 97MS Access 97 com cerca de 4.948 registos. Interfaces de com cerca de 4.948 registos. Interfaces de carregamentos de dados preparadas, mas rudimentares.carregamentos de dados preparadas, mas rudimentares.

Os registos acima referidos foram recuperados na totalidade (55.360 registos) Os registos acima referidos foram recuperados na totalidade (55.360 registos) e encontram-se e encontram-se parcialmenteparcialmente carregados no aplicativo HERBAR vs 3.4g carregados no aplicativo HERBAR vs 3.4g (12.866 registos), com o qual se trabalha actualmente.(12.866 registos), com o qual se trabalha actualmente.

Dentro das famílias incluídas no projecto AHIM, Dentro das famílias incluídas no projecto AHIM, foram ainda inseridos foram ainda inseridos 371 novos registos371 novos registos


Percentagem do financiamento atribuída

ABH3% ARAN

4%

BCN2%

BIO3%

COA3%

FCO3%

GDA8%

HGI2%

HUAL2%

JACA7%

LISILISI4%4% ≈≈ 1.900 €1.900 €MA

27%

MADJ2%

MAF2%

SALA6%

SANT2%

VAL19%

A presente experiência de informatização do HJCV A presente experiência de informatização do HJCV

Adopção do software Adopção do software HerbarHerbar, indicado como , indicado como standardstandard para a para a informatização dos informatização dos Herbários da Península Herbários da Península IbéricaIbérica

Aquisição de equipamento Aquisição de equipamento informático (pc);informático (pc);

Recurso a um Bolseiro FCT Recurso a um Bolseiro FCT para carregamento de para carregamento de dados (2004);dados (2004);

Recuperação e integração Recuperação e integração dos dados presentes em dos dados presentes em anteriores iniciativas de anteriores iniciativas de informatização;informatização;


Resultados Resultados

Informatização do HJCV em curso:Informatização do HJCV em curso:

13.239 registos actualmente 13.239 registos actualmente inseridos no aplicativoinseridos no aplicativo

Recuperação de informação Recuperação de informação retida em formatos obsoletos retida em formatos obsoletos ainda decorreainda decorre

Participação regular em Participação regular em programas de formaçãoprogramas de formação

Colaboração com a GBIF.es, Colaboração com a GBIF.es, assegurando a salvaguarda assegurando a salvaguarda da proveniência nacional dos da proveniência nacional dos dadosdados


Dificuldades Dificuldades Número de Herbário: três séries de números em vigor Número de Herbário: três séries de números em vigor

–1910-1944; 1910-1944; –1944-1999;1944-1999;– 2000-?2000-?

Recuperação de informação dificultada pela mudança do sistema Recuperação de informação dificultada pela mudança do sistema operativo (Macintosh operativo (Macintosh Windows) Windows)

Exemplo:Exemplo:–‘‘Desdobramento’ do nome científico dos ficheiros antigos (conflitos com Desdobramento’ do nome científico dos ficheiros antigos (conflitos com codepagecodepage))

Completagem do catálogo de nomesCompletagem do catálogo de nomes(Scrophulariaceae)(Scrophulariaceae)

Exportação para DarwinCore v2.0Exportação para DarwinCore v2.0

Tradução do aplicativo (prevista)Tradução do aplicativo (prevista)


Perspectivas Perspectivas futurasfuturas

Constituição de um Constituição de um banco de imagens banco de imagens

dos espécimes dos espécimes depositados no depositados no

HJCV, com HJCV, com prioridade para os prioridade para os

HolotyposHolotypos;;


Perspectivas Perspectivas futurasfuturasGeoreferenciação das colheitasGeoreferenciação das colheitas

– Em que tipo de coords?Em que tipo de coords?Geodésicas vs. cartográficasGeodésicas vs. cartográficas

– Sobre que Sobre que datumdatum??WGS84; Dt73; DtLxWGS84; Dt73; DtLx


Perspectivas Perspectivas futurasfuturasCatálogo de nomesCatálogo de nomes


Perspectivas Perspectivas futurasfuturas

Expansão a outros herbários Expansão a outros herbários nacionaisnacionais

Reforço da colaboração e circulação Reforço da colaboração e circulação de informação (gestão de de informação (gestão de empréstimos)empréstimos)


Perspectivas Perspectivas futurasfuturasColecções vivasColecções vivas

– Jardins botânicosJardins botânicos– Index SeminumIndex Seminum– Bancos de GermoplasmaBancos de Germoplasma–……


À Universidade do Minho, pelo conviteÀ Universidade do Minho, pelo convite

À GBIF.es, pelo apoio prestadoÀ GBIF.es, pelo apoio prestado

A toda a equipa do HJCVA toda a equipa do HJCV

Agradecimentos:Agradecimentos:


Obrigado pela atenção Obrigado pela atenção dispensadadispensada

pedro arsÉnio 1 ; maria dalila espÍrito santo 2

Documents