Para fazer nova Para fazer nova camada com traços camada com traços ou áreasou áreas

Escolha “line” para linhaEscolha “line” para linha

Crie um nome para o arquivo que Crie um nome para o arquivo que será uma camada (um “shape”) será uma camada (um “shape”) no futurono futuro

Repare no quadrado Repare no quadrado tracejado, isso indica tracejado, isso indica que a área está que a área está pronta para edição!pronta para edição!

Selecionar linha para Selecionar linha para desenhardesenhar

Você deve fechar o Você deve fechar o polígono!polígono!

Para fazer terminar a Para fazer terminar a edição da camada edição da camada novanova

Salve as Salve as modificações da modificações da nova camada!nova camada!

Selecione o “t” com Selecione o “t” com etiqueta para nomear etiqueta para nomear cada áreacada área

Selecione a etiqueta para Selecione a etiqueta para saber que espécie está saber que espécie está registrada naquele pontoregistrada naquele ponto

S. platensisárea 1 1área 2 1

MATRIZ PARA APE

1) Comando de busca “bandb”;1) Comando de busca “bandb”;2) “Savetrees file=teste.tre” para 2) “Savetrees file=teste.tre” para salvar as árvores*;salvar as árvores*;3) Se houver mais de uma árvore, 3) Se houver mais de uma árvore, digitar “contree /savetree digitar “contree /savetree file=tcon.tre”.file=tcon.tre”.

*o arquivo será salvo no mesmo lugar em que a matriz se encontra!

Primeiro, abrir a matriz de dados que você criou;Quando procurar o arquivo, que deve ser umamatriz feita conforme o exemplo “matriz.txt”(com extensão .txt), existirão duas opções (editar ouexecutar)... Execute. Se existir erro, o programa avisará!

DEPOISDEPOIS

-a interpretação será feita a partir do conjunto de etapas mostrado na figura.

Esse é o mapa final!!!!

As áreas hachuradas (que você construirá) foram baseadas na amplitude de distribuição das espécies agrupadas pelo cladograma da anãlise de parcimônia de endemismos

Abrir o arquivo de dados (sua matriz “matriz.txt”)

Essa é a tela que aparecerá com a matriz podendo ser visualizadacaso você clique na figura indicada

Para abrir a árvore, você deve ter carregado a matriz antes. Após carregá-la, vá no local indicado e clique em “Make new tree blocks from” e depois “Use trees from separate Nexus file”. Só então aparecerá a janela abaixo pedindo o arquivo “tcon.tre” ou “teste.tre”, caso seja só uma árvore.

Se forem muitas árvores, ele vai perguntar se você quer visualizar todas elas...

...e quantas você quer ignorar; no caso, nenhuma é claro!

Aqui, o programa pergunta se você quer colocar as árvores em uma janela separada. Clique em “Separate”.

Diga “yes”!

Voilà!

Se você usar a ferramenta indicada nos ramos da árvore, ela ficará toda arrumadinha assim!!!

Para visualizar as espécies na árvore, clique em “Analysis” e “Trace character history”. Aparecerá essa janela, selecione “Stored characters”

Escolha agora “Parsimony Ancestral States”

Pronto, agora você tem cada caráter, quer dizer espécie, traçada em sua árvore. Lembre-se que a presença dela é 1 e ausência dela é 0!

Aqui você pode passear pelos caracteres!

Para escolher as espécies “boas”, você deve olhar o CI. Ele tem que ser igual a 1.0. Para tanto, vá em “Analysis” e selecione “Values for current trees”; depois escolha “Consistency index for character”, “stored characters”. Aí aparecerá

essa janelinha verde. Pronto! Clique na pequenina seta do lado direito. Lá você poderá passar os caracteres!