o benefício da dep genômica na seleção
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O benefício da DEP Genômica na seleção
Autores: Raysildo Barbosa Lôbo, Luís Gustavo Girardi Figueiredo, ANCP, Ribeirão Preto - SP, Email: [email protected], [email protected] , www.ancp.org.br.
Resumo: O objetivo deste trabalho é apresentar os efeitos da inclusão das informações do valor
molecular predito (MVP) nas estimativas de DEPs e acurácias, para as características de DEP materna
para peso aos 120 de idade (MP120), DEP direta para peso aos 365 dias de idade (DP365), DEP direta
para peso aos 450 dias de idade (DP450), DEP direta para perímetro escrotal aos 365 dias de idade
(DPE365), DEP direta para perímetro escrotal aos 450 dias de idade (DPE450), DEP direta para Idade
ao Primeiro Parto (DIPP) e DEP direta para Período de Gestação (DPG). As DEPs foram estimadas com
a inclusão das informações de MVPs (GEN) e sem a inclusão das informações de MVPs (TRAD). Os
ganhos médios de acurácia obtidos foram de 88,89% para MP120, 61,90% para DP365, 66,67% para
DP450, 109,83% para DPE365, 81,82% para DPE450, 132,00% para DIPP e 85,71% para DPG. O ganho
de acurácia obtido torna o processo de seleção mais eficaz, pois desta forma, pode selecionar-se os
futuros reprodutores mais precocemente, influenciando o ganho genético, através da redução do
intervalo de geração e através do aumento de precisão na escolha destes animais, quando as
informações de MVPs são incluídas nas estimativas das DEPs.
Introdução
A crescente demanda mundial de alimento impulsionada pelo crescimento da população, até
2050 serão 9,6 bilhões de pessoas no mundo, conjuntamente ao processo de transformação da
economia, propicia a abertura de novos mercados consumidores e a ampliação dos já existentes.
Nesse cenário futuro, o Brasil possui papel importante, pois é o segundo maior produtor e o
maior exportador mundial de carne bovina e um dos poucos países com condições climática, hídrica
e territorial para ampliar a produção de alimentos. Internamente o agronegócio tem grande
importância na economia brasileira por ser responsável por uma parcela significativa do PIB nacional
e na geração de empregos.
Para semanter neste lugar de destaque, a pecuária de corte brasileira tem investido em
ferramentas e tecnologias que aumentem a eficiência produtiva e a qualidade do produto, como o
melhoramento genético usado para a seleção de animais com maior potencial genético. A eficácia da
seleção destes animais está relacionada à acurácia do método de estimação de seus valores
genéticos, que vão demetodologias como as medidas fenotípicas sem quaisquer ajustes até as atuais
DEPs Genômicas (Figura 1).
Nível de Acurácia Método de Estimação do Valor Genético
Baixa
Avaliação visual (>1.000 anos)
Medições (pesos, dimensões, tempos, etc.) (>100 anos)
Medições ajustadas (>60 anos)
Índices (desvios de grupos, > 40 anos)
DEPs com baixa acurácia (“Quad. Mínimos”, >30 anos)
DEPs com média acurácia (“Modelos touro”, >25 anos)
DEPs com alta acurácia (“Modelos Animais”, ~10 anos)
DEPs Auxiliadas pela genômica (~3 anos)
Alta DEPs genômica (~6 meses) (Fonte: Adaptado de Ferraz, 2014, comunicação pesssoal)
Figura 1 – Comparação dos métodos de estimação do valor genéticos do animal em ordem crescente de acurácia.
O objetivo deste trabalho é apresentar os efeitos da inclusão das informações do valor
molecular predito (MVP) nas estimativas de DEPs e acurácias.
Material e Métodos
O conjunto de dados contendo as diferenças esperadasna progênie (DEPs) e as respectivas
acurácias foram cedidas pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). As
características incluídas nesta análise foram: DEPs materna para peso aos 120 de idade (MP120), DEP
direta para peso aos 365 dias de idade (DP365), DEP direta para peso aos 450 dias de idade (DP450),
DEP direta para perímetro escrotal aos 365 dias de idade (DPE365), DEP direta para perímetro
escrotal aos 450 dias de idade (DPE450), DEP direta para Idade ao Primeiro Parto (DIPP) e DEP direta
para Período de Gestação (DPG), estimadas com a inclusão das informações de MVPs (GEN) e sem a
inclusão das informações de MVPs (TRAD).
As estimativas destas DEPs e suas respectivas acurácias foram estimadas por meio da
metodologia dos modelos misto, sob modelo animal (Lôbo et al., 2013), as comparações entre as
DEPs e acurácias foram realizadas através dos procedimentos PROC SQL do programa Statistical
Analysis System, versão 9.0 (SAS, 2002).
Resultados e Discussão
Verifica-se que há variações nas acurácias das DEPs estimadas com ou sem a informação dos
MVPs. A Figura 2 mostra que a média das acurácias para todas as características tiveram aumento,
quando houve a inclusão da informação de MVPs.
Figura 2 – Ganho médio de acurácia nas estimativas de DEPs com a inclusão de MVPs.
Os aumentos nas acurácias são superiores aos encontrados por Lôboet al., 2011 que variou
de 19% a 62%e aos encontrados por MacDeil et al., 2010, que relatou um acréscimo variando de 36%
a 85% para marmoreio na raça Angus. A inclusão dos MVPs tornou as estimativas de DEPs mais
precisa.
Os ganhos de acurácia após a inclusão do MVP são proporcionais as acurácias de cada
animal, ou seja, quanto maior a acurácia menor a ganho com o MVP. A Figura 3 exemplifica esse fato,
na faixa de acurácia de 0 a 10 são obtidos os maiores ganhos e na faixa de 91 a 100 os ganhos não
são significativos.
Figura 3 – Relação entre a faixa de acurácia e os ganhos obtidos com a inclusão do MVP.
Na Figura 4 são apresentados os ganhos obtidos por animais de baixa acurácia (0 a 10) para
as características analisadas, estes variaram de 455 a 712% de ganho, demonstrando a importância
da inclusão destas informações na estimação das DEPs de animais jovens.
Figura 4 – Ganho médio de acurácia nas estimativas de DEPs com a inclusão de MVPs, para
animais com até 10% de acurácia.
Conclusão
Os ganhos de acurácia obtidos com a inclusão do MVP na estimativa das DEPs propiciam uma
seleção mais eficaz, pois atuam em dois fatores de grande impacto para a obtenção de maiores
ganhos genéticos: a seleção de animais jovens geneticamente superiores com maior precisão e a
redução do intervalo de gerações.
Implicação
O impacto econômico da inclusão das informações de MVPs é muito importante, pois com a
redução do ciclo de produção bem como a seleção dos novos reprodutores mais precocemente,
tornam o sistema mais eficiente economicamente, trazendo maior rentabilidade ao produtor. A
seleção de animais superiores pode ser antecipada em vários anos, o que acarreta uma economia ao
produtor, além de facilitar as alterações nos objetivos e critérios de seleção.
Referência Bibliográfica
LÔBO, R. B. et al. Implementation of DNA Markers to Produce Genomically - Enhanced EPDs in Nellore Cattle. Acta Scientiae Veterinariae, Porto Alegre, n. 39 (Suppl1):, p.s23-s27, 2011.
LÔBO, R. B. et al. Sumário de Touros Nelore, Guzerá, Brahman e Tabapuã: Edição Julho de 2013. Ribeirão Preto: ANCP, 2013. 122 p.
MacNeil, M.D. et al. Genetic evaluation of Angus cattle for carcass marbling using ultrasound and genomic indicators. Journal Of Animal Science., Champaign, v. 2, n. 88, p.517-22, fev. 2010.
SAS Institute Inc. (2002) Statistical Analysis System user's guide.Version 9.0. Cary, Statistical Analysis System Institute. 513p.