O benefício da DEP Genômica na seleção

Autores: Raysildo Barbosa Lôbo, Luís Gustavo Girardi Figueiredo, ANCP, Ribeirão Preto - SP, Email: raysildo@ancp.org.br, pesquisa@ancp.org.br , www.ancp.org.br.

Resumo: O objetivo deste trabalho é apresentar os efeitos da inclusão das informações do valor

molecular predito (MVP) nas estimativas de DEPs e acurácias, para as características de DEP materna

para peso aos 120 de idade (MP120), DEP direta para peso aos 365 dias de idade (DP365), DEP direta

para peso aos 450 dias de idade (DP450), DEP direta para perímetro escrotal aos 365 dias de idade

(DPE365), DEP direta para perímetro escrotal aos 450 dias de idade (DPE450), DEP direta para Idade

ao Primeiro Parto (DIPP) e DEP direta para Período de Gestação (DPG). As DEPs foram estimadas com

a inclusão das informações de MVPs (GEN) e sem a inclusão das informações de MVPs (TRAD). Os

ganhos médios de acurácia obtidos foram de 88,89% para MP120, 61,90% para DP365, 66,67% para

DP450, 109,83% para DPE365, 81,82% para DPE450, 132,00% para DIPP e 85,71% para DPG. O ganho

de acurácia obtido torna o processo de seleção mais eficaz, pois desta forma, pode selecionar-se os

futuros reprodutores mais precocemente, influenciando o ganho genético, através da redução do

intervalo de geração e através do aumento de precisão na escolha destes animais, quando as

informações de MVPs são incluídas nas estimativas das DEPs.

Introdução

A crescente demanda mundial de alimento impulsionada pelo crescimento da população, até

2050 serão 9,6 bilhões de pessoas no mundo, conjuntamente ao processo de transformação da

economia, propicia a abertura de novos mercados consumidores e a ampliação dos já existentes.

Nesse cenário futuro, o Brasil possui papel importante, pois é o segundo maior produtor e o

maior exportador mundial de carne bovina e um dos poucos países com condições climática, hídrica

e territorial para ampliar a produção de alimentos. Internamente o agronegócio tem grande

importância na economia brasileira por ser responsável por uma parcela significativa do PIB nacional

e na geração de empregos.

Para semanter neste lugar de destaque, a pecuária de corte brasileira tem investido em

ferramentas e tecnologias que aumentem a eficiência produtiva e a qualidade do produto, como o

melhoramento genético usado para a seleção de animais com maior potencial genético. A eficácia da

seleção destes animais está relacionada à acurácia do método de estimação de seus valores

genéticos, que vão demetodologias como as medidas fenotípicas sem quaisquer ajustes até as atuais

DEPs Genômicas (Figura 1).

Nível de Acurácia Método de Estimação do Valor Genético

Baixa

Avaliação visual (>1.000 anos)

Medições (pesos, dimensões, tempos, etc.) (>100 anos)

Medições ajustadas (>60 anos)

Índices (desvios de grupos, > 40 anos)

DEPs com baixa acurácia (“Quad. Mínimos”, >30 anos)

DEPs com média acurácia (“Modelos touro”, >25 anos)

DEPs com alta acurácia (“Modelos Animais”, ~10 anos)

DEPs Auxiliadas pela genômica (~3 anos)

Alta DEPs genômica (~6 meses) (Fonte: Adaptado de Ferraz, 2014, comunicação pesssoal)

Figura 1 – Comparação dos métodos de estimação do valor genéticos do animal em ordem crescente de acurácia.

O objetivo deste trabalho é apresentar os efeitos da inclusão das informações do valor

molecular predito (MVP) nas estimativas de DEPs e acurácias.

Material e Métodos

O conjunto de dados contendo as diferenças esperadasna progênie (DEPs) e as respectivas

acurácias foram cedidas pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). As

características incluídas nesta análise foram: DEPs materna para peso aos 120 de idade (MP120), DEP

direta para peso aos 365 dias de idade (DP365), DEP direta para peso aos 450 dias de idade (DP450),

DEP direta para perímetro escrotal aos 365 dias de idade (DPE365), DEP direta para perímetro

escrotal aos 450 dias de idade (DPE450), DEP direta para Idade ao Primeiro Parto (DIPP) e DEP direta

para Período de Gestação (DPG), estimadas com a inclusão das informações de MVPs (GEN) e sem a

inclusão das informações de MVPs (TRAD).

As estimativas destas DEPs e suas respectivas acurácias foram estimadas por meio da

metodologia dos modelos misto, sob modelo animal (Lôbo et al., 2013), as comparações entre as

DEPs e acurácias foram realizadas através dos procedimentos PROC SQL do programa Statistical

Analysis System, versão 9.0 (SAS, 2002).

Resultados e Discussão

Verifica-se que há variações nas acurácias das DEPs estimadas com ou sem a informação dos

MVPs. A Figura 2 mostra que a média das acurácias para todas as características tiveram aumento,

quando houve a inclusão da informação de MVPs.

Figura 2 – Ganho médio de acurácia nas estimativas de DEPs com a inclusão de MVPs.

Os aumentos nas acurácias são superiores aos encontrados por Lôboet al., 2011 que variou

de 19% a 62%e aos encontrados por MacDeil et al., 2010, que relatou um acréscimo variando de 36%

a 85% para marmoreio na raça Angus. A inclusão dos MVPs tornou as estimativas de DEPs mais

precisa.

Os ganhos de acurácia após a inclusão do MVP são proporcionais as acurácias de cada

animal, ou seja, quanto maior a acurácia menor a ganho com o MVP. A Figura 3 exemplifica esse fato,

na faixa de acurácia de 0 a 10 são obtidos os maiores ganhos e na faixa de 91 a 100 os ganhos não

são significativos.

Figura 3 – Relação entre a faixa de acurácia e os ganhos obtidos com a inclusão do MVP.

Na Figura 4 são apresentados os ganhos obtidos por animais de baixa acurácia (0 a 10) para

as características analisadas, estes variaram de 455 a 712% de ganho, demonstrando a importância

da inclusão destas informações na estimação das DEPs de animais jovens.

Figura 4 – Ganho médio de acurácia nas estimativas de DEPs com a inclusão de MVPs, para

animais com até 10% de acurácia.

Conclusão

Os ganhos de acurácia obtidos com a inclusão do MVP na estimativa das DEPs propiciam uma

seleção mais eficaz, pois atuam em dois fatores de grande impacto para a obtenção de maiores

ganhos genéticos: a seleção de animais jovens geneticamente superiores com maior precisão e a

redução do intervalo de gerações.

Implicação

O impacto econômico da inclusão das informações de MVPs é muito importante, pois com a

redução do ciclo de produção bem como a seleção dos novos reprodutores mais precocemente,

tornam o sistema mais eficiente economicamente, trazendo maior rentabilidade ao produtor. A

seleção de animais superiores pode ser antecipada em vários anos, o que acarreta uma economia ao

produtor, além de facilitar as alterações nos objetivos e critérios de seleção.

Referência Bibliográfica

LÔBO, R. B. et al. Implementation of DNA Markers to Produce Genomically - Enhanced EPDs in Nellore Cattle. Acta Scientiae Veterinariae, Porto Alegre, n. 39 (Suppl1):, p.s23-s27, 2011.

LÔBO, R. B. et al. Sumário de Touros Nelore, Guzerá, Brahman e Tabapuã: Edição Julho de 2013. Ribeirão Preto: ANCP, 2013. 122 p.

MacNeil, M.D. et al. Genetic evaluation of Angus cattle for carcass marbling using ultrasound and genomic indicators. Journal Of Animal Science., Champaign, v. 2, n. 88, p.517-22, fev. 2010.

SAS Institute Inc. (2002) Statistical Analysis System user's guide.Version 9.0. Cary, Statistical Analysis System Institute. 513p.