O ABC da Seleção Genômica: Uma abordagem prática

Raysildo B. Lôbo

Luís Gustavo G. Figueiredo

Informação Genômica

Genômica: todo e qualquer estudo do Genoma.Genoma: material genético transmitido à sua prole (DNA).

Equação Fundamental da Seleção

G ={ Acc * IS* A} IG

Acurácia de Seleção

Intensidade de Seleção

Desvio Padrão Genético

Intervalo de Gerações

SNPPolimorfismos de nucleotídeo único que pode variar de

animal para animal

IDEAL

Alteração no SNP

Alteração Fenotípica

Animal 1 C/G: menor IPPAnimal 2 T/A: maior IPP

RARAMENTE UM ÚNCO SNP É RESPONSÁVEL POR VARIAÇÃO EM CARACTERÍSTICAS DE INTERESSE ECONÔMICO.

Avaliação Genômica

Irmãos

Filhos Gim de Garça

Dumu

Karvardi Imp.

Mara Imp.

Dahi

Survana Imp.

Cartomante

Netos

PEDIGREE

+FENÓTIPO

+PROGÊNIES E COLATERAIS

DEPG

+

VALOR MOLECULAR PREDITO – Clarifide Nelore 2.0

Development and implementation of genomic predictions in beef cattle

D.P. Berry,* J.F. Garcia,† and D.J. Garrick‡*Ireland,†Brazil, ‡USA

Jan. 2016, Vol. 6, No. 1

Impacto da Acurácia

Fonte: ANCP– MAIO/2016

Ganho Genético por ano (G)

∆𝑮

𝒕=𝑨𝒄𝒄 × 𝑰𝑺 × 𝝈𝑨

𝑰𝑮

Acurácia de Seleção Desvio Padrão Genético

Intervalo de Gerações

Intensidade de Seleção

CaracterísticaAcurácia Média

GanhoGenômica Tradicional

DIPP 56 27 107%

D3P 35 23 52%

MP120 46 29 59%

MP210 46 28 64%

DP210 61 34 79%

DP450 66 37 78%

DSTAY 47 23 104%

DPE365 65 34 91%

DPE450 57 33 73%

DAOL 60 33 82%

Fonte: Sumário de Machos Jovens – MAIO/2016

Impacto na AcuráciaMachos Jovens – Sumário Maio/2016

Ganho Genético por ano (G)Idade ao Primeiro Parto

• Característica: IPP• Intervalo de Gerações em Anos (IG): 3 anos• Desvio Padrão Genético Aditivo (σA): 1,45 meses• Porcentagem de indivíduos selecionados: 1%• Intensidade seletiva (i): 2,7

DEP Genômica DEP Tradicional

G = 0,73 meses/ano G = 0,35 meses/ano

107%

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟓𝟔 × 𝟐, 𝟕 × 𝟏, 𝟒𝟓

𝟑, 𝟎

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟐𝟕 × 𝟐, 𝟕 × 𝟏, 𝟒𝟓

𝟑, 𝟎

Ganho Genético por ano (G)Habilidade Maternal para Peso aos 120 Dias de Idade

• Característica: MP120• Intervalo de Gerações em Anos (IG): 3 anos• Desvio Padrão Genético Aditivo (σA): 4,39 kg• Porcentagem de indivíduos selecionados: 1%• Intensidade seletiva (i): 2,7

DEP Genômica DEP Tradicional

G = 1,82 kg/ano G = 1,15 kg/ano

59%

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟒𝟔 × 𝟐, 𝟕 × 𝟒, 𝟑𝟗

𝟑, 𝟎

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟐𝟗 × 𝟐, 𝟕 × 𝟒, 𝟑𝟗

𝟑, 𝟎

Ganho Genético por ano (G)Peso aos 450 Dias de Idade

• Característica: P450• Intervalo de Gerações em Anos (IG): 3 anos• Desvio Padrão Genético Aditivo (σA): 14,74 kg• Porcentagem de indivíduos selecionados: 1%• Intensidade seletiva (i): 2,7

DEP Genômica DEP Tradicional

G = 8,75 kg/ano G = 4,91 kg/ano

78%

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟔𝟔 × 𝟐, 𝟕 × 𝟏𝟒, 𝟕𝟒

𝟑, 𝟎

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟑𝟕 × 𝟐, 𝟕 × 𝟏𝟒, 𝟕𝟒

𝟑, 𝟎

Ganho Genético por ano (G)Área de Olho de Lombo

• Característica: AOL• Intervalo de Gerações em Anos (IG): 3 anos• Desvio Padrão Genético Aditivo (σA): 3,46 cm• Porcentagem de indivíduos selecionados: 1%• Intensidade seletiva (i): 2,7

DEP Genômica DEP Tradicional

G = 1,87 cm2/ano G = 1,03 cm2/ano

82%

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟔𝟎 × 𝟐, 𝟕 × 𝟑, 𝟒𝟔

𝟑, 𝟎

∆𝑮

𝒕=𝟎, 𝟑𝟑 × 𝟐, 𝟕 × 𝟑, 𝟒𝟔

𝟑, 𝟎

Impacto na AcuráciaMachos Jovens – Sumário Maio/2016

Fonte: Sumário de Machos Jovens – MAIO/2016

CaracterísticaAcurácia Média Número

Médio de ProgêniesGenômica Tradicional

DIPP 56 27 35

D3P 35 23 5

MP120 46 29 16

MP210 46 28 19

DP210 61 34 13

DP450 66 37 11

DSTAY 47 23 24

DPE365 65 34 10

DPE450 57 33 6

DAOL 60 33 9Fonte: Sumário de Machos Jovens – MAIO/2016

Número Médio de ProgêniesMachos Jovens – Sumário Maio/2016

Conclusões

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