dna seqüenciamento alinhamento 1 - introdução usuário cenário atual 2 - problema nossa...

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BASES

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• Resposta aproximada• Rápido

BLAST

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Interface voltada para biólogos

rápido saída do

alinhamento personalizada

Disponível na web Smith-Waterman Custo-benefício

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7,5 GB

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Interface Complexa Penalidades Saída pouco legível Blast

Informatas Servidor Blast

Informatas Desktop Limitado a um

usuário

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BD

WEB

FPGAs

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de Requisitos

Escolher algoritmo 31/08 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

Escolher interface de comunicação FPGA-PC

31/08 - Equipe de Desenvolvimento de Hardware

Escolher FPGA 31/08 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoAlgoritmo 16/08 30/09 Algoritmo

possui detalhes específicos da implementação.Plano corretivo: Continuar estudando.

Bernardo ReisPedro Bello

Estudar Stratix II 16/08 - Diogo LagesThiago Lessa

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoProcessador Nios II

16/08 30/09 Realocação de pessoal causou atrasos.Plano corretivo: Tutorial com o pessoal do HPCin, mais alocação de tarefas para o novo pessoal.

André FelipeLeyla Manoella

Protocolo de comunicação

16/08 30/09 Protocolo bastante complicado.Plano corretivo: Continuar estudando.

Diogo LagesThiago Lessa

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemArquitetura paralela do Smith-Waterman

23/09 - Pedro Bello

Arquitetura do sistema em FPGA

23/09 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

Implementação e Teste de Protótipo

23/09 - Pré-requisito: Aquisição da Placa

Bernardo ReisPedro Bello

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Tarefa Prazo Previsto Responsável

Implementar protótipo do algoritmo segundo Byang

07/10 Bernardo ReisPedro Bello

Estudar módulo Ethernet para NIOS II

07/10 Diogo LagesThiago Lessa

Implementar NIOS II customizado

07/10 André FelipeLeyla Manoella

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Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo

Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoFerramentas de Bancos de Dados

21/09 André e Thiago

Modelagem do Banco de Dados das Cadeias de DNA

21/09 25/09 Reunião com os Clientes Adiada.

André e Thiago

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosEscolha do Servidor

21/09 30/09 Devido a realocação.

André e Thiago

Pesquisa com os clientes

21/09 25/09 Reunião com os Clientes Adiada.

André e Thiago

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Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemImplementação do Servidor

11/10 André e Thiago

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Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosEscolher da linguagem

31/08 30/09 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Viabilidade de ferramentas e material de estudo

31/08 30/09 Equipe de Desenvolvimento de Interface

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Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoApi das linguagens web e linguagem padrão: CSS, HTML

20/08 30/09 Devido a realocação

Paulo OrlandoJonathan

Estudo da linguagem do servidor

20/08 - Dependência da escolha do servidor

Paulo OrlandoJonathan

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Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemCriar prototipagem 1.0

16/9 21/09 Paulo OrlandoJonathan

Criar prototipagem 2.0

28/9 - Paulo OrlandoJonathan

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Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosAnalisa os requisitos com o cliente

21/09 30/09 Problema de reunião

Paulo OrlandoJonathan

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Tarefa Prazo Previsto Responsável

Teste de ferramentas/Testes das APIS

06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Reuniões com os clientes 06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Prototipagem 2.0 06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

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Software de Imagens: Adobe Fireworks Corel Drawn MovieGear4

Linguagens de Programação Ajax JavaScript HTML CSS

Adobe FlexBuilder Professional/Aptana/DreamweaverCS4 – IDES

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IDES Adobe FlexBuilder Professional Aptana DreamweaverCS4

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Uma Interface organizada. Respostas Organizadas Entradas que aceitem mais de um contig Privacidade no Banco de Dados Usar formato FASTA Velocidade de análise das sequências de

DNAS Sem penalidades temporais

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Melhora no fluxo da informação Interface com Diversos Bancos de

Dados Atualização automática do Banco de

Dados Mundial Colocar dados Estatísticos

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10 horas semanais