bioinformática apresentação da unidade curricular...
TRANSCRIPT
Bioinformática
Paulo Fazendeiro
Universidade da Beira Interior
1
Apresentação da Unidade Curricular 2010/11 Objectivos, Programa, Critérios de Avaliação, Bibliografia,...
Bioinformática Bioinformática
2 P. Fazendeiro 12/02/2011 2
Conteúdo
• Objectivos
• Programa
• Planeamento
• Critérios de Avaliação
• Bibliografia
• Atendimento
Bioinformática Bioinformática
3 P. Fazendeiro 3
Objectivos
• Familiarização com algoritmos e técnicas computacionais utilizadas
actualmente em Bioinformática e respectiva aplicação à resolução
de problemas em biologia e medicina.
• Exploração de ferramentas computacionais e bases de dados de
interesse para a resolução de problemas em Bioinformática.
• Identificação de direcções para investigação em Bioinformática.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
4 P. Fazendeiro 4
Programa Mínimo
• Introdução à Bioinformática e aos algoritmos em Bioinformática .
• Bases de dados de interesse biológico.
• Alinhamento de sequências de ADN e procura de motivos em ADN.
• Microarrays e análise de dados de expressão genética.
• Previsão da estrutura e função de proteínas.
• Árvores filogenéticas.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
Planificação
P.Fazendeiro
Semana Aula Teórica Aula Prática
14/02/2011 Apresentação. Critérios de Avaliação.
22/02/2011 Introdução à Bioinformática e aos algoritmos em Bioinformática. Bases de dados de interesse biológico.
01/03/2011 Alinhamento de sequências de DNA. Bases de dados de interesse biológico.
15/03/2011 Alinhamento de sequências de DNA. Alinhamentos simples.
22/03/2011 Alinhamentos múltiplos. Alinhamentos simples.
29/03/2011 Freq. Alinhamentos múltiplos.
05/04/2011 Procura de motivos em DNA. Alinhamentos múltiplos.
12/04/2011 Procura de motivos em DNA. Motivos.
26/04/2011 Microarrays e análise de dados de expressão genética. Motivos.
03/05/2011 Microarrays e análise de dados de expressão genética. Análise de dados de expressão genética.
10/05/2011 Freq. Análise de dados de expressão genética.
17/05/2011 Previsão da estrutura e função de proteínas e RNA. Análise de dados de expressão genética.
24/05/2011 Previsão da estrutura e função de proteínas e RNA. Proteínas.
31/05/2011 Árvores filogenéticas. Proteínas. 07/06/2011 Freq. Árvores filogenéticas.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
6 P. Fazendeiro 6
Critérios de Avaliação
• Avaliação periódica
• Duas componentes:
• Teórica (3 mini-testes)
• 14 valores
• T1 29 de Mar. (4val.); T2 10 de Maio (5val.); T3 7 de Junho (5val.)
• Prática (relatórios)
• 6 valores, cada relatório é cotado com 6/(#relatórios) valores
• Presença obrigatória em 70% das aulas
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
7 P. Fazendeiro 7
Critérios de Avaliação
• Componente teórica
• Os testes são escritos e individuais.
• Os testes são cotados para 20 valores.
• Qualquer tipo de fraude implica a classificação de NÃO
ADMITIDO/REPROVADO.
• Componente prática
• Os mini-relatórios são propostos em aula, poderão ser
individuais ou colectivos de acordo com a indicação do
docente
• Só serão efectuados arredondamentos na nota final. 12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
8 P. Fazendeiro 8
Critérios de Avaliação 1. Concessão de Frequência
• O aluno só poderá ser admitido a exame se a nota final do
período de ensino-aprendizagem for igual ou superior a 6
valores (em vinte possíveis)
0.2 T1 + 0.25 T2 + 0.25 T3 + 0.3 P >= 6
• e além disso tiver uma assiduidade às aulas práticas igual ou
superior a 70%.
• Qualquer tipo de fraude implica a classificação de REPROVADO.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
9 P. Fazendeiro 9
Critérios de Avaliação
1. Regime de Assiduidade
• É obrigatória a frequência de 70% das aulas práticas.
• A assiduidade nas aulas teóricas não será tida em conta na
concessão de FREQUÊNCIA.
• Os estudantes em regimes especiais estão dispensados deste
regime de assiduidade segundo o disposto nas regras gerais de
avaliação de conhecimentos (Despacho Nº 28/2006 - B).
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
10 P. Fazendeiro 10
Critérios de Avaliação
O aluno que não cumpra os critérios 1 e 2 terá a
classificação de NÃO ADMITIDO no período de ensino-
aprendizagem.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
11 P. Fazendeiro 11
Critérios de Avaliação
• Exame
• O exame é cotado para 20 valores.
• O exame engloba toda a matéria leccionada no período de
ensino-aprendizagem.
• Qualquer tipo de fraude implica a classificação de
REPROVADO.
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
12 P. Fazendeiro 12
Critérios de Avaliação
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
13 P. Fazendeiro 13
Critérios de Avaliação
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
14 P. Fazendeiro 14
Critérios de Avaliação
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
15 P. Fazendeiro 15
Bibliografia
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
16 P. Fazendeiro 16
Bibliografia
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
17 P. Fazendeiro 17
Contacto
• Contacto
• Docente: [email protected]
• Alunos
• Enviar e-mail para o docente com o seguinte assunto e conteúdo:
• Assunto (subject) - Bioinformática: Contacto
• Conteúdo
Nº de aluno Nome Curso E-mail de contacto
• Página Web
http://www.di.ubi.pt/~pandre/bioinformatica
12/02/2011
Bioinformática Bioinformática
18 P. Fazendeiro 18
Atendimento
• Horário de Atendimento
• Terça das 15-17h no gabinete do docente (gab. 4.12, Bloco 6, 3ºpiso)
• Em horário a combinar com o docente em aula ou por e-mail.
12/02/2011