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UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS

GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA

GENÔMICA II

Cleomar, Eduarda, Natália Bona

GENOMA DO CÂNCER

O câncer é uma doença causada por mutações no DNA de uma determinada parte do corpo, podem ocorrer em diversos genes em

um único caso.

Por serem completamente heterogêneas, as células tumorais são diferentes mesmo em um mesmo paciente.

Como saber em quais genes o câncer se manifestou?

OBJETIVO DO SEQUENCIAMENTO:

Isolar e sequenciar o DNA genômico tumoral.

Também é obtido uma melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na oncogênese e que podem auxiliar no

diagnóstico, tratamento e prevenção do câncer.

PROJETOS: SEQUENCIAMENTO DOS GENOMAS TUMORAIS:

The Genome Intitute

O INSTITUTO DO GENOMA – Tem como principal objetivo avançar no campo emergente da genômica do cancro. Em 2008 eles foram os primeiros a sequenciar o genoma completo de um paciente com leucemia, traçando desde a sua doença até as raízes genéticas da mesma.

Wellcome Trust Sanger Institute

Wellcome Trust Sanger Institute: Um dos maiores centros de sequenciamento do mundo. Descobrem a base de doenças genéticas e infecciosas, tendo assim como objetivo proporcionar resultados que podem ser traduzidos em diagnósticos, tratamentos ou terapias que reduzem os encargos de saúde global.

The Cancer Genome Atlas

O ATLAS DO GENÔMA DO CÂNCER – Cientistas de renomadas instituições de pesquisa E Tem como objetivo identificar e catalogar mutações genéticas envolvidas nos tipos de tumor mais comuns com o intuito de desenvolver drogas mais precisas para o tratamento.

Pediatric Cancer Genome Project

PROJETO GENOMA DO CÂNCER PEDIÁTRICO – Parceria do Hospital de Pesquisa Infantil com a Faculdade de Medicina de Washington, têm como objetivo identificar as mudanças genéticas que dão origens à alguns dos cânceres infantis mais mortais do mundo. Decodificaram o genoma de mais de 600 pacientes com câncer de infância.

Ludwig Institute for Cancer Research

INSTITUTO LUDWIG PARA PESQUISA DO CÂNCER - combina a pesquisa básica com a capacidade de traduzir suas descobertas e conduzir estudos clínicos para acelerar o desenvolvimento de novos diagnósticos e terapias contra o câncer.

Histórico:DÉC. 80 CONSÓRCIO DO GENOMA HUMANO:O objetivo era construir uma sequência contínua de cada um dos 24 cromossomos e o delineamento de todos os genes humanos.

1997 CONSÓRCIO ONSA NO BRASIL:

Uma iniciativa histórica no Brasil, lançado pela FAPESP, com o objetivo de executar um projeto genoma nacional, numa área de alta competitividade no mundo científico.

PROJETO GENOMA HUMANO DO CÂNCER

Lançado em 1999 pela rede ONSA, com o objetivo inicial de produzir meio milhão de ESTs (expressed sequence tags), de tecido tumoral

humano. O projeto HCGP é uma parceria financeira entre a FAPESP e o Instituto Ludwing para pesquisa sobre o câncer, envolveu o

trabalho conjunto de cerca de 29 laboratórios paulistas, por 2 anos.

PRIMEIRO GENOMA TUMORAL SEQUENCIADO

Foi realizado na Universidade de Washington em 2008.

Resultado: Foram encontrados 10 genes que estão “transformados” nas células cancerosas, 2 deles já eram conhecidos de esforços anteriores, os outros 8 são completamente novos e é certo que

estão envolvidos no desenvolvimento da doença.

Câncer de mama

MASTECTOMIA

Por que ela fez isso?Descobriu ter um "defeito" no gene chamado BRCA1.

Os médicos disseram que ela tinha 87% de chances de desenvolver um câncer de mama, e 50% de ter um câncer no ovário.

Que são os genes BRCA1 e BRCA2?

Breast Cancer 1 ou 2 são genes humanos que pertencem à classe de genes conhecida como genes supressores de tumor, que regulam o ciclo celular e previnem a proliferação descontrolada. Eles codificam proteínas que estão envolvidas no reparo de quebras da molécula do DNA.

Linda Southern

Convive com o câncer desde que nasceu,

a doença já se manifestou quatro vezes.

Na primeira vez tinha 18 meses. Osteossarcoma

Outros de seus sarcomas surgiram aos 14 anos.Sofreu varia plásticas e intervenções cirúrgicas.Se casou e teve 3 filhos.

Porém quando teve ser terceiro filho aos 32 anos, o câncer reapareceu no seu peito esquerdo.

RAS (gene)

A proteína Ras participa da transmissão recebida por um receptorque é uma cinase de tirosina levando a informação, através devários estágios, até o interior do núcleo celular para estimular adiferenciação e a multiplicação da célula.

Nos tecidos normais, as células se multiplicam somente em certosmomentos, mas nas células cancerígenas a multiplicação édesordenada, pois os mecanismos que levam a proliferação dacélula estão ativados de modo permanente

APLICAÇÕES Importante aplicação clínica no câncer como biomarcadores no

diagnóstico prognóstico, tratamento e resistência a drogas.

Melhor classificação do câncer .

Ajuda com as escolhas da terapia correta.

Previsão da resistência ou da resposta do tratamento.

Análise de diferenciação de clones do tumor.

Monitoramento do DNA do tumor.

Análises das metástases.

Genes FGFR1, MYB e anormal ativação da rota MAPK/ERK (divisão celular).

17 países investindo em sequenciamento de genomas através do International Cancer Genome Consortium (ICGC), com o intuito de sequenciar mais de 25mil amostras de tumores.

ARTIGO:

- Sequenciamento Completo de Exoma (mais popular), porém baixa sensibilidade a tumores de

baixa pureza.

- Sequenciamento de RNA faz uma cobertura com maior profundidade a nível de expressão

gênica, pois analisa perfil do transcriptoma (conjunto completo de transcritos em uma célula)

- RNA-seq proporciona a observação da sequência fundamental de DNA do tumor, via

transcrição, e pode ser usado para detectar variações de sequência.

- Programa UNCeqR = União dos dois sequenciamentos

- Aplicado a uma grande corte (n=871) de câncer de pulmão e mama.

- Conclusão: a integração dos dois tipos de sequenciamento aumentou significativamente a

detecção de mutações em tumores de baixa pureza. Entretanto, nos de alta pureza a diferença não

foi tão acentuada.

REFERÊNCIAS:

http://scienceblogs.com.br/rnam/2010/04/o_cancer_e_uma_doenca/http://www.humanasaude.com.br/novo/materias/2/chegou-a-hora-de-decifrar-o-genoma-do-c-ncer_8661.htmlhttp://g1.globo.com/Noticias/Ciencia/0,,MUL850855-5603,00-CIENTISTAS+FAZEM+PRIMEIRA+SEQUENCIA+COMPLETA+DE+GENOMA+DO+CANCER.htmlhttp://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0004-27302002000400003https://www.sanger.ac.uk/research/projects/cancergenome/http://genome.wustl.edu/projects/category/cancer-genomics/http://cancergenome.nih.gov/http://www.pediatriccancergenomeproject.org/site/http://cancergenome.nih.gov/cancergenomics/impacthttp://genome.wustl.edu/articles/detail/dna-sequencing-lays-foundation-for-personalized-cancer-treatment/http://www.ligacontraocancer.com.br/novidades/liga-participa-de-pesquisa-sobre-os-genes-brca1-e-brca2/853/http://g1.globo.com/pop-arte/cinema/noticia/2013/05/com-receio-de-cancer-angelina-jolie-retira-os-seios.html

OBRIGADA!