evoluÇÃo

1

EVOLUÇÃOEVOLUÇÃO

unesp Agronomia

Ilha Solteira, SP2º Semestre/2010

Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho"Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira

Departamento de Fitotecnia, Tecnologia de Alimentos e Sócio-Economia

Disciplina:

Prof. : Mario Luiz Teixeira de Moraes

COLABORADORES:

Alexandre Marques da SilvaMarcela Aparecida de Moraes

Selma Maria Bozzite Moraes

2

Aula: 29/10/2009

DISTÂNCIAS GENÉTICAS

3

DERIVA

BASE GENÉTICA

POPULAÇÃOPOPULAÇÃO

FLUXO GÊNICO

SELEÇÃO

BASE GENÉTICA

MUTAÇÃO

FATORES EVOLUTIVOS

4

ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICAATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA

ser métrica;

utilizar frequências alélicas para seu cálculo;

refletir predomínio dos fatores de NATUREZA

GENÉTICA sobre os fatores ambientais que estão sendo avaliados.

5

ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICAATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA

Medida de distância calculada a partir de dados fenotípicos pode ser de NATUREZA GENÉTICA

Magnitude dos coeficientes de herdabilidade ou repetibilidade poderá ser utilizada para inferir sobre a NATUREZA GENÉTICA ou não da medida de distância empregada

6

ATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICAATRIBUTOS DA DISTÂNCIA GENÉTICA

Natureza Genética depende:

Do tipo de dado empregado em seu cálculo (se fenotípico, isoenzimático ou de DNA);

Do modo como foram gerados esses dados (Distância Generalizada de Mahalanobis).

7

DISTÂNCIAS GENÉTICASDISTÂNCIAS GENÉTICAS

LOCO: LAP

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 = ?

B 42 0,78 0,22 = ?

75 = ? = ? = ?

= ? = ?

= ? = ?

1p

STST DHH

)1(

2

II

IST pp

F222

III pp

ID lnBA

AB

JJ

JI

.

em que:

em que:

2p2

1p 2

2p

2

1 2

2

AH

BH

TH

em que:

GGSTST = D = DSTST/H/HTT

8

DIVERSIDADE GENÉTICA

(NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = ?

B 42 0,78 0,22 BH = ?

75 1p = ? 2p = ? TH = ?

9

DIVERSIDADE GENÉTICA (NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = ?

B 42 0,78 0,22 BH = ?

75 1p = ? 2p = ? TH = ?

1p = [(33 x 0,47)+(42 x 0,78)]/75 1p = 0,64

2p = [(33 x 0,53)+(42 x 0,22)]/75 2p = 0,36

10

DIVERSIDADE GENÉTICA (NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = ?

B 42 0,78 0,22 BH = ?

75 1p = 0,64 2p = 0,36 TH = ?

TH = 1 – [(0,64)2 + (0,36)2] TH = 0,46

11

DIVERSIDADE GENÉTICA (NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = ?

B 42 0,78 0,22 BH = ?

75 1p = 0,64 2p = 0,36 TH = 0,46

AH = 1 – [(0,47)2 + (0,53)2] AH = 0,50

BH = 1 – [(0,78)2 + (0,22)2] BH = 0,34

12

DIVERSIDADE GENÉTICA

(NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = 0,50

B 42 0,78 0,22 BH = 0,34

75 1p = 0,64 2p = 0,36 TH = 0,46

HS =

DST = GST =

13

DIVERSIDADE GENÉTICA

(NEI, 1973)

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 AH = 0,50

B 42 0,78 0,22 BH = 0,34

75 1p = 0,64 2p = 0,36 TH = 0,46

HS = [(33 x 0,50) + (42 x 0,34)]/75 HS = 0,41

STST DHH

T

ST

ST H

DG

DST = HT – HS DST = 0,46 – 0,41 DST = 0,05

T

ST

ST H

DG GST = 0,05/0,46 GST = 0,11

14

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1973 de Nei, 1973 ((GGSTST = D = DSTST/H/HTT))

Variação GenéticaVariação Genética

Entre (11%) Dentro (89%)Dentro (89%)

15

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICA de Hedrick, 2005 de Hedrick, 2005

Variação GenéticaVariação Genética

Entre (26,29%) Dentro (73,71%)Dentro (73,71%)

SSSTST HHGG 11'

16

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972de Nei, 1972 ((D = -lnID = -lnI))

LOCO: LAP

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53

B 42 0,78 0,22

75

ID lnBA

AB

JJ

JI

.em que:

17

DISTÂNCIA GENÉTICA de DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (Nei, 1972 (D = -lnID = -lnI))

_____________________

ALELOSALELOS

POP N 1 2POP N 1 2

A 33 0,47 0,53

B 42 0,78 0,22

75

BA

AB

J.J

JI

18

PROBABILIDADE DE ESCOLHA DE DOIS PROBABILIDADE DE ESCOLHA DE DOIS GENES IDÊNTICOS EM UMA POPULAÇÃOGENES IDÊNTICOS EM UMA POPULAÇÃO

iBiAAB

iBB

iAA

p.pJ

;pJ

;pJ2

2

19

JA = (0,47)2 + (0,53)2 JA = 0,5018

JB = (0,78)2 + (0,22)2 JB = 0,6568

JAB = (0,47).(0,78) + (0,53).(0,22) JAB = 0,4832

I = JAB/√(JA.JB) I = 0,8417

D = -lnln 0,8417 D = -(-0,1724) D = 0,1724

DISTÂNCIA GENÉTICA de DISTÂNCIA GENÉTICA de Nei, 1972 (Nei, 1972 (D = -lnID = -lnI))

20

DISTÂNCIAS GENÉTICASDISTÂNCIAS GENÉTICAS

LOCO: LAP

ALELOS

POP N 1 2

A 33 0,47 0,53 = ?

B 42 0,78 0,22 = ?

75 = ? = ? = ?

= ? = ?

= ? = ?

1p

)1(

2

II

IST pp

F222

III pp em que:

2p2

1p 2

2p

2

1 2

2

AH

BH

TH

em que:

21

DISTÂNCIA GENÉTICA de DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978Wright, 1978

)1(

2

II

IST pp

F

em que:

222

III pp

22

Média Ponderada do quadrado da Média Ponderada do quadrado da freqfrequência alélicauência alélica

_______________

ALELOSALELOS

POP N 1 2POP N 1 2

A 33 0,47 0,53

B 42 0,78 0,22

75

75

7804247033 22

2

1

,.,.p

437902

1 ,p

23

Média Ponderada do quadrado da Média Ponderada do quadrado da freqfrequência alélicauência alélica

_______________

ALELOSALELOS

POP N 1 2POP N 1 2

A 33 0,47 0,53

B 42 0,78 0,22

75

75

2204253033 22

2

2

,.,.p

150702

2 ,p

24

Variância de cada alelo entre as Variância de cada alelo entre as populaçõespopulações 222

III pp

02370

64360437902

1

22

1

2

1

2

1

2

1

,

,,

pp

25

Variância de cada alelo entre as Variância de cada alelo entre as populaçõespopulações 222

III pp

02370

35640150702

2

22

2

2

2

2

2

2

2

,

,,

pp

26

Soma das Variâncias de todos os Soma das Variâncias de todos os alelosalelos

04740

02370023702

2

,

,,

27

Cálculo deCálculo de ii pp 1

45880

2294022940

3564013564064360164360

111 2211

,

,,

,,,,

pppppp ii

28

DISTÂNCIA GENÉTICA de DISTÂNCIA GENÉTICA de Wright, 1978Wright, 1978

)1(

2

II

IST pp

F

1032,04588,0

0474,0 STST FF

29

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICAWEIR (1990) - ANOVAWEIR (1990) - ANOVA

AA = 5

Aa = 21

aa= 7

AA = 26

Aa = 14

aa = 2

Pop A Pop B

30

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICAWEIR (1990) - ANOVAWEIR (1990) - ANOVA

FVFV QMQM E(QM)E(QM)

POPULAÇÕES (POP) Q1

FAMÍLIAS(FAM)/POP Q2

INDIVÍDUOS(IND)/FAM/POP Q3

GEN/IND/FAM/POP Q42g

22 2 ig

21

22 2 fig k

23

22

22 2 pfig kk

31

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICAWEIR (1990) - ANOVAWEIR (1990) - ANOVA

22222 ˆˆˆˆˆ pfigt

32

DISTÂNCIA GENÉTICADISTÂNCIA GENÉTICAWEIR (1990) - ANOVAWEIR (1990) - ANOVA

2

2

ˆ

ˆˆt

pst

33

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICASREFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

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