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Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast

Rafael Dias Mesquita

rdmesquita@iq.ufrj.br

Laboratório de Bioinformática

Departamento de Bioquímica Instituto de Química - UFRJ

NCBI

NCBI

NCBI - Exemplo

NCBI - Exemplo

NCBI - Exemplo

NCBI - Exemplo

NCBI - Exemplo

Que título é esse?

NCBI - Exemplo

Não é BRCA1 sozinha, é uma região genômica contendo BRCA1

NCBI - Recomeçando

NCBI – escolhendo um dos variantes

NCBI – baixando a proteína

NCBI – indo para o CDS

NCBI – baixando o CDS

NCBI – Voltando para o registro da proteína

NCBI – Entrando no registro do gene

NCBI – indo para a região genomica

NCBI – baixando a região genômica

NCBI –voltando para o gene e seguindo para os ESTs

NCBI – baixando os ESTs

NCBI – Voltando para a proteína, escolhendo BLAST

NCBI – Rodando Blast

NCBI – Resultado do BLAST

NCBI – Resultado do BLAST

NCBI – Resultado do BLAST

NCBI – Resultado do BLAST

NCBI – Resultado do BLAST

NCBI – Resultado Taxonômico do BLAST

Escolher a melhor sequência dos 5 organismos mais próximos taxonomicamente e baixar PTN, cDNA, região genômica, ESTs de todas.