abordagem teÓrico-metodolÓgica na organizaÇÃo de imagens em patologia

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ABORDAGEM TERICO-METODOLGICA NA ORGANIZAO DE IMAGENS EM PATOLOGIA

Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza - [email protected] Elan Cardozo Paes de Almeida [email protected]

Universidade Federal Fluminense UFF


Introduo

Projeto de iniciao cientfica desenvolvido no mbito do Departamento de Cincia da Informao (GCI) , do Instituto de Arte e Comunicao Social (IACS) e do Departamento de Cincias Bsicas (FCB), do Campus de Nova Friburgo, da Universidade Federal Fluminense (UFF).



Objetivo

Investigar princpios de organizao de imagens biomdicas de cortes histopatolgicos com fins de armazenamento e recuperao em bancos de imagens com objetivos acadmico-cientficos, a fim de possibilitar futuras aplicaes profissionais e educacionais na rea de Patologia.



Justificativa

Uso de recursos visuais na formao biomdica nos currculos dos cursos de graduao.

Predominncia da utilizao de imagens nas aulas expositivas e laboratoriais exposio do contedo descrio morfolgica para a obteno de

diagnstico das leses comuns a diferentes doenas.

Organizao de bancos de imagens biomdicas.

Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza - [email protected]

Elan Cardozo Paes de Almeida [email protected]


Patologia


Cincia que estuda as causas das doenas, os mecanismos que as produzem, as sedes [localizao] e as alteraes morfolgicas e funcionais que apresentam (BRASILEIRO FILHO, 2006, p.1).

nome do pesquisador email do pesquisador Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza - [email protected]


Fonte: BRASILEIRO FILHO, 2006, p.2.


Material


Imagens de lminas histopatolgicas de processos patolgicos gerais confeccionadas para as aulas prticas da disciplina de Patologia Geral, do Departamento de Cincias Bsicas (FCB) do Campus Universitrio de Nova Friburgo da Universidade Federal Fluminense (UFF).

A disciplina de Patologia Geral atende anualmente 190 alunos dos cursos de Biomedicina, Fonoaudiologia e Odontologia


Uso da Imagem na Patologia


Anlise histopatolgica identificao de padres morfolgicos - localizao, tamanho, forma, durao, distribuio e intensidade nas amostras, indicando a confirmao e a gravidade da doena.

Bancos de imagens de lminas histopatolgicas como recurso didtico - promover a discusso de casos clnicos e de conceitos para o bom entendimento do discente da rea biomdica.



http://patogeralpunf.wix.com/punfuff


Material



Macroscopia



Microscopia



ESTUDO DE CASO CLNICO



Questes

Como organizar o acervo de imagens digitalizadas de lminas histopatolgicas?

O que devemos destacar na imagem?

Como garantir a recuperao da imagem pelo usurio do sistema?



Organizao e Recuperao de Imagens Biomdicas na Web


Informtica biomdica campo interdisciplinar que estuda e desenvolve

dados, informaes e conhecimentos para a pesquisa cientfica e definio de diagnsticos em sistemas de informao em sade (HSU et al., 2013, p. 1010).




Biomedical imaging informatics (BMII) - Informtica de imagens biomdicas

subcampo responsvel pelo processamento otimizao e uso de imagens e sua aplicao em pesquisas clnicas diversas.

A BMII tem como finalidade estudar formas de recuperao da informao nos bancos de imagens biomdicas, a partir da "interpretao da imagem" (AMERICAN MEDICAL INFORMATICS ASSOCIATION, 2014).




AMIA (American Medical Informatics Association)

anlise das imagens com base nas caractersticas de nvel baixo: atributos intrnsecos como cor, forma, histograma, regies homogneas ou textura, promovendo a indexao de imagens baseada em contedo.

Kothari et al. (2013), Machado (2002), Carro (2003), Hasegawa e Aires (2007) Metadados contextuais: paciente, diagnstico,

patologia, rgo, MeSH, CID-10, entre outros.




Carrare et al. (2006) Biblioteca Virtual de Imagens em Medicina

(BVIM).

dos 11 repositrios analisados somente um oferecia consulta por metadados, assunto e categoria (ilustrao, radiologia ou patologia).

Os autores analisados no explicitam os princpios usados na organizao de imagens biomdicas na web, se detendo nos metadados para recuperao.


Fundamentao terica

Cincia da Informao - reflexo sobre a organizao e recuperao da imagem biomdica e seu potencial comunicacional.

Teoria da Imagem - imagem biomdica e seu papel como cone por apresentar semelhana com a realidade, apresentando qualidade representativa para o patologista.

Teorias da Classificao Facetada e do Conceito - identificao de categorias para a organizao das imagens de lminas histopatolgicas.



ANLISE DO SITE

http://patogeralpunf.wix.com/punfuff




Tab Aulas Primeiro corte classificatrio pelo contedo programtico da disciplina de Patologia Geral

Imagens organizadas segundo a forma de observao



Imagens organizadas pelo contedo das aulas, que corresponde classificao das leses, segundo alteraes morfolgicas e funcionais que surgem nos tecidos aps agresses.


Imagem classificada como Leso

Irreversvel - Necrose de coagulao

(2)

Inflamao aguda (1) uma resposta

leso (necrose)

Infarto um tipo de Distrbio

Hemodinmico

Uma mesma imagem apresenta diferentes aspectos para anlise, podendo ser classificada em diferentes subclasses.


SUBCLASSES DIFERENTES


Consideraes finais

A partir da definio de Patologia foram identificados os aspectos relevantes para organizao do domnio: causas, mecanismos, localizao, alteraes morfolgicas e funcionais.

Na atual organizao do site da disciplina de Patologia Geral, o contedo exibido de forma unidimensional.



Consideraes finais

As teorias da Classificao Facetada e do Conceito proporcionam multidimensionalidade com o arranjo sistemtico, permitindo ao usurio fazer as conexes entre os diferentes aspectos da Patologia.

A adoo de um princpio para organizao das imagens de lminas histopatolgicas no banco de imagens permitir ampliar a comunidade usuria, uma vez que estaro acessveis aos demais pesquisadores.



Referncias AMERICAN MEDICAL INFORMATICS ASSOCIATION. Working Group Biomedical Imaging

Informatics. 2014. Disponvel em: . Acesso em: 4 de jul. 2014.

BRASILEIRO FILHO, G. Bogliolo Patologia. 7. ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2006.

CARRARE , A. P. et al. Uma proposta para gerenciamento e preservao de imagens em medicina na EPM/Unifesp. Cincia da Informao, Braslia, v. 35, n. 3, p. 201-208, set./dez. 2006.

CARRO, S. A. Um modelo de metadados para a indexao e recuperao de imagens mdicas na web. 2003. 97 f. Dissertao (Mestrado em Computao) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2003.

HASEGAWA, F. M.; AIRES, J. P. Proposta de um padro de metadados para imagens mdicas. Guarapuava, PR: Escola Regional de Informtica, 2007.

HSU, W. et al. Biomedical imaging informatics in the era of precision medicine: progress, challenges, and opportunities. Journal of the American Medical Informatics Association, [S.l.], v. 20, p.10101013, nov. 2013.

KOTHARI , S. et al. Pathology imaging informatics for quantitative analysis of whole-slide images. Journal of the American Medical Informatics Association, [S.l.], v. 20, p.10991108, nov. 2013.

MACHADO, M. S. Modelo de metadados para armazenamento de recuperao de imagens estticas no formato DICOM. 2002. 126 f. Dissertao (Mestrado em Computao) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, 2002.

UNIVERSIDADE FEDERAL FLUMINENSE. Faculdade de Odontologia de Nova Friburgo. O que patologia, 2014. Disponvel em: . Acesso em: 6 mar. 2014.



Obrigada!

Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza [email protected]


abordagem teÓrico-metodolÓgica na organizaÇÃo de imagens em patologia

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